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基于Oncomine和TCGA数据库分析GABRE在结肠癌组织中的表达及生物学意义 被引量:2
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作者 杨佳妮 白怡冰 +3 位作者 崔瑛 连洁 吴峰 张艳桥 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期1399-1405,共7页
目的:通过挖掘Oncomine和TCGA等数据库信息分析GABRE基因在结肠癌中的表达及其生物学意义。方法:利用Oncomine、TCGA数据库分析GABRE基因在结肠癌组织中的表达及其与患者预后的关系;运用TargetScan、starBase、mirDIP和miRWalk寻找靶向G... 目的:通过挖掘Oncomine和TCGA等数据库信息分析GABRE基因在结肠癌中的表达及其生物学意义。方法:利用Oncomine、TCGA数据库分析GABRE基因在结肠癌组织中的表达及其与患者预后的关系;运用TargetScan、starBase、mirDIP和miRWalk寻找靶向GABRE基因的上游miRNA,并分析其在结肠癌中的表达及其与预后的关系。进一步利用LinkedOmics数据库寻找GABRE共表达基因,并进行GO富集分析及KEGG通路分析。结果:数据库数据分析显示,GABRE在结肠癌组织中高表达且预示着患者预后较差(均P<0.05)。韦恩图显示,hsa-miR-370-3p靶向GABRE,并在正常组织中的表达显著升高(P<0.01)。GABRE基因与OGT、FAM156A基因等表达呈正相关(P<0.05),与ATP5A1、MPDU1基因等表达呈负相关(P<0.05)。GO生物功能及KEGG通路富集分析提示,GABRE基因可能参与蛋白脱烷基化和周期蛋白依赖性蛋白激酶活性调节等生物学过程,并在牛磺酸代谢和NF-κB信号通路等方面富集。结论:GABRE基因在结肠癌患者中高表达且预示着患者预后较差,提示该基因是结肠癌的诊断和治疗的潜在新靶点。 展开更多
关键词 gabre基因 结肠癌 Oncomine数据库 TCGA数据库 预后 生物标志物
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miR-224-5p靶向GABRE对人结肠癌细胞系SW480增殖的影响
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作者 王丽华 吕建峰 +1 位作者 刘颖 丛培芳 《解剖科学进展》 CAS 2022年第2期169-172,共4页
目的 探讨miR-224-5p通过靶点GABRE对结直肠癌细胞系增殖的抑制作用和可能的调控机制。方法 从基因表达综合数据库(GEO)中检索并筛选GPL18058的microRNA(miRNA)表达阵列,筛选出结直肠癌与正常组织差异表达的miR-224-5p后,通过Target Sca... 目的 探讨miR-224-5p通过靶点GABRE对结直肠癌细胞系增殖的抑制作用和可能的调控机制。方法 从基因表达综合数据库(GEO)中检索并筛选GPL18058的microRNA(miRNA)表达阵列,筛选出结直肠癌与正常组织差异表达的miR-224-5p后,通过Target Scan Human数据库预测其下游靶点GABRE,并利用UALCAN分析GABRE在结直肠癌组织中的表达情况和结直肠癌预后关系。利用实时定量PCR(qRT-PCR)检测结直肠癌细胞系中的miR-224-5p和GABRE的表达水平。在结直肠癌细胞系SW480中,沉默miR-224-5p后,CCK-8法与克隆形成实验分析其增殖情况。RT-PCR和Western blot检测miR-224-5p对GABRE表达的影响。在SW480细胞中低表达GABRE,评估其对结直肠癌调节中的miR-224-5p的选择性作用。结果 在结直肠癌组织和细胞系中,miR-224-5p的表达异常上调,抑制其表达后,SW480细胞的增殖能力降低(P<0.05)。在结直肠癌组织和细胞系的基因和蛋白质水平上,miR-224-5p正调控GABRE(P<0.05)。GABRE低表达抑制SW480细胞增殖(P<0.05)。结论 miR-224-5p促进结直肠癌中SW480细胞系的增殖,并通过正调控GABRE发挥作用。 展开更多
关键词 结直肠癌 SW480 miR-224-5p gabre
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MicroRNA-502-3p regulates GABAergic synapse function in hippocampal neurons 被引量:4
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作者 Bhupender Sharma Melissa MTorres +2 位作者 Sheryl Rodriguez Laxman Gangwani Subodh Kumar 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2024年第12期2698-2707,共10页
Gamma-aminobutyric acid(GABA)ergic neurons,the most abundant inhibitory neurons in the human brain,have been found to be reduced in many neurological disorders,including Alzheimer's disease and Alzheimer's dis... Gamma-aminobutyric acid(GABA)ergic neurons,the most abundant inhibitory neurons in the human brain,have been found to be reduced in many neurological disorders,including Alzheimer's disease and Alzheimer's disease-related dementia.Our previous study identified the upregulation of microRNA-502-3p(miR-502-3p)and downregulation of GABA type A receptor subunitα-1 in Alzheimer's disease synapses.This study investigated a new molecular relationship between miR-502-3p and GABAergic synapse function.In vitro studies were perfo rmed using the mouse hippocampal neuronal cell line HT22 and miR-502-3p agomiRs and antagomiRs.In silico analysis identified multiple binding sites of miR-502-3p at GABA type A receptor subunitα-1 mRNA.Luciferase assay confirmed that miR-502-3p targets the GABA type A receptor subunitα-1 gene and suppresses the luciferase activity.Furthermore,quantitative reve rse transcription-polymerase chain reaction,miRNA in situ hybridization,immunoblotting,and immunostaining analysis confirmed that overexpression of miR-502-3p reduced the GABA type A receptor subunitα-1 level,while suppression of miR-502-3p increased the level of GABA type A receptor subunitα-1 protein.Notably,as a result of the overexpression of miR-502-3p,cell viability was found to be reduced,and the population of necrotic cells was found to be increased.The whole cell patch-clamp analysis of human-GABA receptor A-α1/β3/γ2L human embryonic kidney(HEK)recombinant cell line also showed that overexpression of miR-502-3p reduced the GABA current and overall GABA function,suggesting a negative correlation between miR-502-3p levels and GABAergic synapse function.Additionally,the levels of proteins associated with Alzheimer s disease were high with miR-502-3p overexpression and reduced with miR-502-3p suppression.The present study provides insight into the molecular mechanism of regulation of GABAergic synapses by miR-502-3p.We propose that micro-RNA,in particular miR-502-3p,could be a potential therapeutic to rget to modulate GABAergic synapse function in neurological disorders,including Alzheimer's disease and Alzheimer's diseaserelated dementia. 展开更多
关键词 Alzheimer's disease GABAergic synapse gamma-aminobutyric acid type A receptor subunitα-1(GABRα1) microRNA-502-3p(miR-502-3p) miRNA in situ hybridization PATCH-CLAMP
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非均匀光照下人脸眼睛的定位方法 被引量:5
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作者 尹方平 赖剑煌 阮邦志 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期12-15,共4页
考虑非均匀光照下人脸眼睛的检测问题 ,提出了一种利用高频信息模板匹配方法从复杂图像中定位人脸眼睛的方法。选取 80幅光线较好的人脸图像 ,对它们做光线规范化 ,提取Gabor高频特征 ,构造模板。利用统计模式识别的原理 ,在眼睛的大致... 考虑非均匀光照下人脸眼睛的检测问题 ,提出了一种利用高频信息模板匹配方法从复杂图像中定位人脸眼睛的方法。选取 80幅光线较好的人脸图像 ,对它们做光线规范化 ,提取Gabor高频特征 ,构造模板。利用统计模式识别的原理 ,在眼睛的大致区域进行模板匹配 ,突出眉毛与眼睛这一整体的大致位置 ,然后进行二值投影 ,最终确定人眼的准确位置。大量实验表明 ,该算法具有很高的精度和很强的鲁棒性。 展开更多
关键词 眼睛检测 Gabr滤波 模式识别
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基于维度调制的准二维蓝色钙钛矿发光二极管 被引量:2
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作者 张志清 罗忠明 +4 位作者 朱明超 蓝茜 邵志良 叶方浩 李贵君 《发光学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1013-1022,共10页
金属卤化物钙钛矿(MHP)作为一种新兴的半导体材料,目前已在光电应用中表现出优异的性能。其中,基于MHP的发光二极管(PeLED)发展迅猛,红光和绿光器件的效率已达到商用水平。然而,蓝光PeLED的效率还远落后于红、绿光器件,这在很大程度上... 金属卤化物钙钛矿(MHP)作为一种新兴的半导体材料,目前已在光电应用中表现出优异的性能。其中,基于MHP的发光二极管(PeLED)发展迅猛,红光和绿光器件的效率已达到商用水平。然而,蓝光PeLED的效率还远落后于红、绿光器件,这在很大程度上阻碍了PeLED在全彩显示领域中的应用。本文通过调节混合卤素阴离子的比例以及准二维钙钛矿组分来实现基于维度调制的准二维蓝色PeLED制备。首先,我们采用在CsPbBr_(3)∶PEABr准二维钙钛矿中添加苯乙基氯化胺(PEACl)逐步替换苯乙基溴化胺(PEABr),实现了发光峰从502 nm到476 nm的可调制发射。然而,随着PEACl的增加,薄膜中的缺陷及n=1低维相逐渐增多,导致器件效率降低。我们将溴化胍(GABr)引入到CsPbBr_(3)∶PEACl准二维钙钛矿中,n=1低维相得到了显著的抑制,这有利于激子能量的转移,最终蓝光范围内准二维PeLED性能得到了显著提升。本工作为实现高效蓝光PeLED提供了新的思路。 展开更多
关键词 钙钛矿发光二极管 维度调制 蓝光 PEACl掺杂 GABr掺杂
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cry8E启动子指导的非晶体蛋白GabR在苏云金芽胞杆菌HD73菌株中的表达 被引量:2
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作者 刘春霞 武建博 +4 位作者 彭琦 曲宁 邱丽丽 张杰 宋福平 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期290-296,共7页
【目的】利用cry8E基因启动子指导的高效表达载体pHT315-8E21b,构建一个能够在苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis,简称Bt)中正确表达非晶体蛋白GabR的重组菌株。【方法】将苏云金芽胞杆菌中的功能基因gabR装载到cry8E基因启动子指... 【目的】利用cry8E基因启动子指导的高效表达载体pHT315-8E21b,构建一个能够在苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis,简称Bt)中正确表达非晶体蛋白GabR的重组菌株。【方法】将苏云金芽胞杆菌中的功能基因gabR装载到cry8E基因启动子指导的高效表达载体pHT315-8E21b上,转入到HD73-无晶体突变株后获得重组菌株HD-8E-gabR。通过SDS-PAGE和凝胶阻滞等方法对GabR蛋白的表达和功能进行分析。【结果】通过SDS-PAGE及蛋白定量等方法首次证明了在Bt表达体系中cry8E基因启动子指导的高效表达载体能够表达非晶体蛋白GabR,且通过碱裂解的方法可以提高GabR蛋白在Bt系统中的溶解性。进一步凝胶阻滞试验证明GabR能与其调控启动子PgabT结合。【结论】证明了cry8E基因启动子指导的Bt表达系统具有大量表达非晶体类蛋白的能力。 展开更多
关键词 苏云金芽胞杆菌 cry8E启动子 GabR蛋白 表达载体
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