巨轴索神经病临床、神经病理和GAN基因变异特点(附1家系报告)

目的探讨巨轴索神经病的临床、神经病理和GAN基因变异特点。方法回顾性分析1例巨轴索神经病患者及其家系的临床资料。结果先证者7年前因双下肢进行性力弱,EMG示重度周围神经轴索病变。3年前双下肢无力加重,并出现双上肢无力,6个月前先证者出现肢体感觉异常,头颅MRI示双侧额、顶叶多发白质病变。腓肠神经活检拟诊巨轴索周围神经病。患者弟弟有类似临床症状,5岁时出现渐进性四肢无力,智力反应较同龄人差。先证者及其弟弟均检测到GAN基因复合杂合突变,家系遗传分析提示c.323C>T来自父亲,c.407_410del来源于母亲。结论巨轴索神经病临床表型具有多样性,常伴CNS受累。腓肠神经活检和基因检测是确诊的重要依据,c.323C>T和c.407_410del为GAN基因新发的突变位点。

五例Keishi-Bukuryo-Gan综合征患儿临床及遗传学特征分析

目的:分析5例Keishi-Bukuryo-Gan综合征(KBG综合征)患儿的临床及遗传学特征,以提高临床医生对该罕见遗传性疾病的诊治能力。方法:回顾性分析郑州大学附属儿童医院2018年11月至2020年9月收治的5例KBG综合征患儿,对其临床特征、基因突变及治疗结果进行归纳总结。结果:5例患儿均为男性,来自4个家系,5例均有三角脸、浓眉、薄上唇、前囟大或闭合延迟、骨骼发育异常;4例有生长发育迟缓、大耳、耳唇厚等表现;3例有中切牙大;2例伴先天性心脏病;2例存在皮肤改变;2例存在生殖器改变;2例出现性格异常。所有患儿肝肾功能、甲状腺功能、血气分析、电解质等均在正常范围;行骨龄检查的3例患儿均显示存在不同程度落后;2例头颅磁共振成像显示为白质髓鞘化落后。全外显子组测序检出5例患儿均存在ANKRD11基因杂合突变,其中c.6836_6837delTG、c.5866C>T、c.6270delT为新发突变位点。所有患儿的父母均未发现携带突变。2例患儿应用重组人生长激素治疗后实现身高追赶及认知能力的提高。结论:KBG综合征表型谱广,前囟大或闭合延迟、耳大耳唇厚可能是该病婴幼儿期的主要表现,ANKRD11基因突变多为自发突变,早期应用生长激素治疗可实现身高追赶及认知能力提高,且无明显不良反应。

自发性高血压大鼠肝阳上亢证模型肾上腺组织的酪氨酸羟化酶基因表达研究

目的 :研究自发性高血压大鼠 (SHR)肝阳上亢证模型的酪氨酸羟化酶 (TH)基因表达水平及潜阳方对其影响。方法 :采用免疫组织化学方法和原位杂交法分别测定该模型肾上腺组织TH蛋白质及mRNA表达。结果 :SHR肝阳上亢证模型TH蛋白质及mRNA表达均明显增强 ,经用具有平肝熄风作用的潜阳方治疗后 ,其表达水平下降。提示 :SHR肝阳上亢证模型具有肾上腺组织TH表达增强的特点。

甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫疫源地鼠疫菌耐链霉素rpsL基因突变位点的检测

目的 通过检测甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫疫源地鼠疫菌耐链霉素rpsL基因位点,掌握该地区鼠疫菌对链霉素的敏感性,以期为今后该地区鼠疫的治疗及临床用药提供参考依据。方法 根据鼠疫菌rpsL基因序列及我国发现的耐链霉素菌株(S19960127)突变位点分别设计非突变菌株FAM(128∶A)和突变菌株VIC(128∶G)两种MGB探针,通过TaqMan-MGB探针法对1962—1991年分离自甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地的49株代表性鼠疫菌进行耐链霉素rpsL基因突变位点检测。结果 被试菌株对应检测rpsL(128∶A),49株FAM染料RFU峰值均为阳性,其RFU峰值>2 000,阴性<200;对应检测rpsL(128∶G)未检测到VIC染料RFU峰值阳性菌株,RFU峰值均<200,阳性对照>1 000,该疫源地分离的鼠疫菌未发现耐链霉素菌株。结论 甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫疫源地49株鼠疫菌对链霉素均敏感。TaqMan-MGB探针荧光定量PCR体系具有较高灵敏性、特异性,可应用于鼠疫菌耐药性监测。

基于生成对抗网络的基因数据生成方法

在深度学习中,随着卷积神经网络(CNN)的深度不断增加,进行神经网络训练所需的数据会越来越多,但基因结构变异在大规模基因数据中属于小样本事件,导致变异基因的图像数据十分匮乏,严重影响了CNN的训练效果,造成了基因结构变异检测精度差、假阳性率高等问题。为增加基因结构变异样本数量,提高CNN识别基因结构变异的精度,提出了一种基于生成对抗网络(GAN)进行基因图像数据扩增的方法——GeneGAN。首先,利用Reads堆叠方法生成初始基因图像数据,将变异基因图像数据与非变异基因图像数据分为两个数据集;然后,为了平衡正负样本数据集,使用GeneGAN对变异图像样本进行扩充;最后,通过CNN对平衡前后数据集进行检测,并对精确率、召回率与F1值进行对比。实验结果显示,与传统扩增方法、生成对抗网络扩增方法、特征提取方法相比,GeneGAN对基因结构变异检测的F1值提升了1.94~17.46个百分点,说明使用GeneGAN进行基因数据生成能够有效提高使用CNN进行基因图像分类的精确率。

一例巨轴索神经病患者中发现GAN基因两种新型致病突变

目的寻找1例疑似巨轴索神经病患者的致病突变位点，为疾病诊断提供科学资料。方法应用目标序列捕获测序技术对患者进行遗传筛查，找到巨轴突蛋白基因（Gigaxonin，GAIN）的可疑致病突变位点，并提取患者父母的外周血DNA，进行Sanger测序验证。同时对200名正常人的400个GAN基因进行Sanger测序。此外，应用生物信息学软件Polyphen对突变巨轴突蛋白进行了功能预测。结果在患者GAN基因中鉴定出2种新型突变：c．778G〉T（p．Glu260Ter）和c．277G〉A（p．Gly93Arg），为复合杂合突变；Sanger测序证实c．778G〉T（p．Glu260Ter）突变源于父方，c．277G〉A（P．Gly93Arg）突变则与母亲相同。在200名正常人GAN基因中未检测到同样的突变，排除其为多态性。生物信息学分析预测这两种新型GAN突变均可引发巨轴突蛋白功能异常。结论研究鉴定出了患者GAN的两种新型突变，它们均可能引起巨轴突蛋白结构和功能的异常，从而导致疾病的发生，为日后类似疾病的诊断提供了依据。

巨轴索神经病1例临床表现及基因突变分析并文献复习

回顾性分析2022-11-05昆明市儿童医院癫痫中心收治的1例染色体16q23.2区域部分纯合缺失巨轴索神经病(GAN)患者的临床资料及其他辅助检查资料,对患儿及其父母进行基因检测,总结已报道的中国GAN患者的临床表型及基因突变特征,为巨轴索神经病的疾病诊断以及遗传咨询提供参考依据结果发现患儿男性,7岁6月龄,步态异常呈“鸭步”,曾有癫痫发作等情况。基因检测发现患儿16q23.2区域发生>115.8kb的纯合性片段缺失,基因片段检测提示该缺失分别来自患儿父亲和母亲,该患儿诊断为巨轴索神经病。结合12例已报道具有GAN致病基因突变中国患儿的文献复习发现,患儿的临床表现均以儿童早期下肢无力,步态异常,行走障碍为首发症状,发现平均发病年龄为3岁,除本研究患者为基因片段缺失致病外,其余患者均为点突变,广泛分布于GAN基因的3个结构域。由此得出,GAN基因片段缺失为患儿巨轴索神经病的致病原因,研究进一步丰富了GAN的基因突变谱,并归纳分析了国内GAN患者的临床表型与基因突变特征,为GAN的临床诊断和遗传咨询提供参考依据。

芍甘多苷对四氯化碳亚急性肝损伤大鼠肝脏基因表达谱的影响

目的 研究芍药甘草汤提取物芍甘多苷对四氯化碳（CC14）亚急性肝损伤大鼠血清转氨酶、肝脏病理及肝脏基因表达谱的影响.方法 60只SD大鼠完全随机分6组（n=10）,即正常组、模型组、阳性对照组（联苯双酯100 mg/kg）和芍甘多苷低、中、高3个剂量组（88、264、528 mg/kg）.采用CCl4诱发大鼠亚急性肝损伤,然后给予不同剂量的芍甘多苷灌胃,观察药物对血清丙氨酸转氨酶（ALT）、天冬氨酸转氨酶（AST）、肝脏组织病理的影响；并运用基因表达谱芯片技术,研究其对肝脏基因表达谱的影响.结果 与模型组比较,芍甘多苷高、中剂量灌胃给药均能显著降低CCl4亚急性肝损伤大鼠血清ALT[ （218.37± 114.59,234.59± 109.33） U/L比（389.12±142.57） U/L,P＜0.05]；且高剂量芍甘多苷可以显著降低肝脏组织学评分（2.42±0.52比3.92±0.84,P＜0.05）.芍甘多苷能上调和（或）下调与肝损伤相关的多种基因的表达.结论 芍甘多苷有明显的肝脏保护作用,其机制与调节与肝损伤相关的多种基因的表达有关,是多靶点作用药物.

ANKRD11基因变异所致KBG综合征临床表现的性别差异

目的探讨2例KBG综合征(Keishi-Bukuryo-Gan syndrome,KBGS)患儿临床表现的性别差异。方法分析2例不同性别KBGS患儿的临床表现,应用二代测序进行基因检测,总结治疗并随访预后。结果2例患儿均有特殊体貌:巨齿、毛发分布异常、手部改变等,存在语言发育落后,基因测序结果证实ANKRD11基因致病性变异,分别自第635位赖氨酸和第1638位脯氨酸开始发生移码,为c.1903_1907del和c.4911delT。女性患儿合并中枢性性早熟,使用亮丙瑞林治疗23个月联合重组人生长激素治疗1个月,身高增长13 cm,性征回退。结论对比2例不同性别的患儿并总结既往病例报道,发现男性KBGS的特殊面容(三角脸、连眉、眼距宽)以及椎体异常较女性明显,癫痫、智力障碍、自闭症、先天性心脏病、免疫性血小板减少症等并发症的发病率均高于女性。男性常累及多系统,女性更需早期识别特殊体貌,避免漏诊,改善预后。

糖脂代谢病肝病传脾基因本质研究

目的基于非酒精性脂肪肝(NAFLD)与糖调节受损(IGR)研究代谢病肝病传脾的基因本质。方法108只血糖正常SD大鼠,按体重分层、血糖随机分为对照组(饲以常规饲料)、模型组、预防组(饲以高糖饲料),建立NAFLD及IGR模型。预防组同步用痰瘀同治的丹瓜方干预。共12周。观察NAFLD和IGR的发病率、相关指标,做肝组织HE、MASSON及油红O染色。以Illumina Hiseq2500仪做转录组全基因表达及isoform对照分析。结果与对照组比较,模型组超声检测脂肪肝发病率显著增高及肝重增加(P<0.01),肝CT值、CT值肝/脾和肝/肾比值显著降低(P<0.05),病理形态肝细胞排列较混乱,肝小叶结构不清晰,出现大量红色脂滴,汇管区纤维化并沿着肝小叶节段性延伸。模型组OGTT 0 h及2 h血糖、2 h血浆胰岛素水平(P2INS)、葡萄糖曲线下面积(G-AUC)、胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)、IGR发病率较对照组显著升高(P<0.05,P<0.01);胰岛素分泌指数(HOMA-β)、胰岛素敏感指数(HOMA-ISI)显著下降(P<0.01)。基因表达分析结果显示模型组在17032个基因中有257个发生显著性差异表达,其中包括成脂基因9个,能量代谢基因15个,胰岛功能基因7个,胰岛素抵抗基因21个。与模型组比较,预防组脂肪肝发病率显著降低,肝重减轻(P<0.05),CT值肝/肾比值升高(P<0.01),病理显著改善;同时OGTT 2 h血糖、G-AUC、IGR发病率,P2INS、糖负荷后HOMA-IR显著降低(P<0.05,P<0.01);糖负荷后HOMA-ISI显著升高(P<0.01),并恢复了四类基因中大部分异常表达的基因。结论代谢病肝病传脾存在成脂基因、能量代谢基因、胰岛功能基因、胰岛素抵抗基因的异常表达,干预这些基因的表达阻滞了肝病传脾的发展,这些异常表达的基因可能在代谢病肝病传脾的演变机制中起到了一定的作用。

慢性乙型病毒性肝炎脾胃湿热证与肝郁脾虚证的microRNA差异表达的初步研究

目的探讨慢性乙型病毒性肝炎(慢性乙肝)脾胃湿热证与肝郁脾虚证之间的microRNA差异表达谱。方法运用基因芯片技术对采集的慢性乙肝脾胃湿热证组(3例)、肝郁脾虚证组(3例)患者及健康志愿者(正常组,3名)的血液标本进行microRNA检测,运用SAS系统对microRNA进行筛选及功能分析。结果脾胃湿热证组和正常组筛选出差异表达的microRNA共有77条,60条上调,17条下调;其靶基因功能主要与转录因子、气体交换、逆境刺激、酶活性调节、免疫系统的发展、肌动蛋白丝化进程等有关。肝郁脾虚证组和正常组筛选出差异表达的microRNA共41条,32条上调,9条下调;靶基因的功能主要与核苷酸或染色质的结合、转录的抑制与激活、生物的合成过程、代谢过程的调控、酶活性的调节、肌动蛋白丝化进程、调节免疫系统发展与进程、IL-12等有关。脾胃湿热证组和肝郁脾虚证组共筛选出6条差异表达的microRNA,其中上调1条,下调5条;其靶基因功能主要与跨膜转运、转录的调节、激素代谢、免疫系统的发育、肌动蛋白丝化进程、代谢过程的调节、对外部刺激的反应等有关。结论慢性乙肝脾胃湿热证与肝郁脾虚证患者血浆中存在差异表达microRNA(谱)。