β-1,6 N-乙酰氨基葡萄糖转移酶2在胃癌组织中的表达及其临床意义

目的:探讨β-1,6 N-乙酰氨基葡萄糖转移酶2(GCNT2)基因在胃癌(GC)组织中的表达及其在GC发生、发展和诊断及预后中的作用。方法:利用TIMER、GEPIA2、Oncomine和UALCAN等数据库数据,以及2018年1月至2019年12月滨州医学院附属医院手术切除的25例GC患者的癌和配对癌旁组织标本,分析GCNT2基因在GC组织中的表达及其在GC诊断和预后中的价值,利用LinkedOmics、GSEA和ssGSEA分析GCNT2所涉及的主要信号通路及其与免疫浸润之间的相关性。将pc-GCNT2及其阴性对照质粒转染进胃癌SGC-7901和BGC-823细胞,用克隆形成实验和Transwell实验检测GCNT2对GC细胞增殖和侵袭的影响,WB法检测细胞中GCNT2、STAT3和PD-L1蛋白的表达水平。结果:GCNT2 mRNA在GC组织中的表达水平显著低于癌旁组织(P<0.05或P<0.01),其表达水平与患者预后显著相关(P<0.05),其对GC诊断有较高的价值。GCNT2在GC组织中的甲基化状态显著高于癌旁组织,GCNT2基因参与的生物过程主要是参与细胞形态发生的成分、细胞间黏附、多细胞生物信号和突触传递等。单基因GSEA分析发现,GCNT2在GC中主要抑制IL-6/JAK/STAT3、IL-2/STAT5信号通路和炎症反应、α/γ干扰素响应与NF-κB表达等。GCNT2的表达与GC组织的免疫浸润具有显著相关性。过表达GCNT2可显著抑制GC细胞的增殖和侵袭能力(均P<0.01),降低细胞中STAT3和PD-L1的表达水平(均P<0.01)。结论:GCNT2基因在GC组织中低表达,与GC的诊断及预后显著相关,其主要通过抑制IL-6/JAK/STAT3和免疫相关致癌信号通路而在GC的发生、发展中发挥重要的作用。

红细胞血型I抗原研究进展

2010年之后,红细胞抗原的基因、分子生物学、免疫血型学等方面的研究有了很大的进展。本文就红细胞血型I抗原在近几年来的研究成果,做一简略概述。红细胞血型I抗原是系统抗原,国际输血协会(ISBT)命名的编号027001,命名的抗原命名为I1,确认该系只有一个抗原,这个抗原是1956年发现的,2002年确认为系统抗原。而相关的i抗原,是1990年发现,2002年确认命名,目前仍属于集合抗原,ISBT的抗原命名为i2,编号207002。I抗原是在i抗原的基础上转化而来,i抗原是直链糖链,I抗原是枝链糖链。本文主要介绍I抗原〔1-4〕。

基于生物信息学分析结肠癌的预后相关基因及其与免疫细胞的相关性

目的探索结肠癌的预后相关基因及其与免疫细胞的相关性。方法通过GEO数据库筛选差异表达基因(DEGs),使用R“clusterprofiler”包进行功能富集分析。筛选出预后相关基因,并通过qPCR实验验证预后相关基因的表达。使用cibersort算法分析预后相关基因与免疫细胞的相关性。结果对GSE21510、GSE18105和GSE20916数据集进行分析并取交集,获得50个共同上调DEGs和130个共同下调DEGs,即180个交集基因。在GO功能富集分析方面,交集基因主要富集在细胞对无机物质的反应、锌离子反应、细胞锌离子稳态、铜离子解毒、对铜离子的应力响应等生物学过程(BP)上;在细胞组成(CC)方面,交集基因主要富集在细胞顶端部分、顶端质膜、质膜的外侧、基底质膜等;在分子功能(MF)方面,交集基因主要富集在离子跨膜转运体的活性、G蛋白-偶联受体结合、金属肽酶活性、羧酸跨膜转运体的活性等。在KEGG功能富集方面,交集基因主要参与矿物吸收,胆汁分泌,病毒蛋白与细胞因子及细胞因子受体的相互作用,PPAR信号通路等。GCNT2与结肠癌预后相关,在结肠癌中低表达。免疫细胞相关性分析发现,GCNT2与幼稚B细胞、调节性T细胞、活化性自然杀伤细胞、滤泡辅助性T细胞呈正相关,与静息性自然杀伤细胞呈负相关。结论GCNT2与结肠癌预后相关,其可能通过调节免疫细胞的活性参与结肠癌的发展。