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牛疱疹病毒gD-PCR鉴别检测方法的建立 被引量:3
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作者 王冰 张敏敏 +2 位作者 刘正飞 陈焕春 郭爱珍 《中国奶牛》 2010年第12期3-6,共4页
建立一种PCR技术,既能快速检测疱疹病毒1型成员牛传染性鼻气管炎病毒(bovine infectious rhinotracheitisvirus,IBRV),又能区分牛疱疹病毒5型和伪狂犬病毒。根据基因库中牛传染性鼻气管炎病毒的gD基因序列,应用primer 5.0软件设计了gD ... 建立一种PCR技术,既能快速检测疱疹病毒1型成员牛传染性鼻气管炎病毒(bovine infectious rhinotracheitisvirus,IBRV),又能区分牛疱疹病毒5型和伪狂犬病毒。根据基因库中牛传染性鼻气管炎病毒的gD基因序列,应用primer 5.0软件设计了gD PCR引物,建立PCR方法,反应条件是:94℃预变性5min,94℃1min,58℃1min,72℃1min,30个循环,72℃7min,4℃5min。该方法能从IBRV阳性样本和参考毒株中扩增出372bp的目的片段,而从同属的牛疱疹病毒5型中扩增出440bp和206bp两条目的片段,从同属的伪狂犬病毒中扩增出303bp的目的片段,但不能从非疱疹病毒属成员猪呼吸与繁殖综合征病毒中扩增出目的条带。该PCR检测IBRV的灵敏度可达1PFU/mL以上。鉴于其灵敏度高、特异性好,可望在牛疱疹病毒感染快速鉴别检测方面发挥重要作用。 展开更多
关键词 牛传染性鼻气管炎病毒 牛疱疹病毒1型 牛疱疹病毒5型 PCR GD 诊断
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基因芯片对人乳头瘤病毒的快速检测和分型 被引量:50
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作者 黄庆 府伟灵 +3 位作者 周玉 张雪 黄君富 陈斌 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期476-478,共3页
目的 针对HPV DNA亚型的异质性,建立HPV DNA亚型的基因芯片快速检测方法,为HPV感染病例提供诊断依据。方法 18 种HPV DNA亚型(HPV6、16、18、31、33、35、39、11、45、51、52、53、56、58、42、59、66、68)特异性探针,固定于硝酸纤维... 目的 针对HPV DNA亚型的异质性,建立HPV DNA亚型的基因芯片快速检测方法,为HPV感染病例提供诊断依据。方法 18 种HPV DNA亚型(HPV6、16、18、31、33、35、39、11、45、51、52、53、56、58、42、59、66、68)特异性探针,固定于硝酸纤维素膜制备成基因芯片,生物素标记引物经通用引物介导PCR(GD PCR)扩增HPV DNA, PCR产物与基因芯片经反向点杂交检测HPV亚型;同时采用荧光定量PCR检测HPV6、11、16 和18亚型。结果 31 例标本中,基因芯片的阳性检出率为74.2%,其中HPV6/18、HPV11/16、HPV33/58 和HPV6/11/33多重感染各1 例(3.2%);荧光定量PCR 阳性检出率为67.7%,与前种方法相比较,漏诊率为6.5%。结论 HPV分型基因芯片可1次检测HPV多种亚型,灵敏度高和特异性强,有利于对HPV多重感染的诊断。 展开更多
关键词 HPV 基因芯片 gd-pcr 反向点杂交
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gD基因在生殖器疱疹PCR诊断中的研究 被引量:5
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作者 杨慧兰 李明 +3 位作者 廖元兴 吴锦银 江悦华 杨太成 《临床皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 1998年第5期292-294,共3页
依据国外已发表的疱疹病毒(HSV)糖蛋白D基因(gD基因)的核苷酸保守区序列设计了一对引物,建立了用疱疹病毒gD基因做疱疹病毒诊断基因的PCR方法。对48例拟诊为疱疹病毒感染的临床标本进行病毒细胞培养和PCR检测。结... 依据国外已发表的疱疹病毒(HSV)糖蛋白D基因(gD基因)的核苷酸保守区序列设计了一对引物,建立了用疱疹病毒gD基因做疱疹病毒诊断基因的PCR方法。对48例拟诊为疱疹病毒感染的临床标本进行病毒细胞培养和PCR检测。结果表明,PCR对HSV2感染的敏感性为84%(20/24),特异性为91%(22/24)。经标准株及限制性内切酶的酶切证实和序列分析,表明该方法特异。 展开更多
关键词 单纯疱疹病毒 聚合酶链反应 糖蛋白 GD基因
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虎源传染性鼻气管炎病毒gD基因重组真核表达载体的构建 被引量:5
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作者 张晓明 胡俊 +1 位作者 彭仕明 陈武 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2014年第9期70-73,共4页
根据从虎气管组织扩增获得的猫传染性鼻气管炎病毒相关核酸序列,设计扩增编码虎源猫传染性鼻气管炎病毒gD蛋白基因片段的引物,通过PCR扩增出gD基因片段,并成功插入到pMD18-T Simple载体中,筛选获得重组质粒,命名为18T-gD。重组质粒通过H... 根据从虎气管组织扩增获得的猫传染性鼻气管炎病毒相关核酸序列,设计扩增编码虎源猫传染性鼻气管炎病毒gD蛋白基因片段的引物,通过PCR扩增出gD基因片段,并成功插入到pMD18-T Simple载体中,筛选获得重组质粒,命名为18T-gD。重组质粒通过HindⅢ和XhoⅠ酶切后,插入pcDNA 3.1(+)真核表达载体构建出gD基因的重组真核表达质粒pcDNA-gD。用脂质体将重组真核表达质粒pcDNA-gD转染293T细胞,通过RT-PCR和Western blot检测,结果显示gD基因在真核细胞中得到正确转录和表达,所表达蛋白分子质量约为42.29ku,为虎源猫传染性鼻气管炎基因疫苗的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 虎源传染性鼻气管炎病毒 GD基因 聚合酶链反应 真核表达
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伪狂犬病病毒湖北株糖蛋白gD基因的克隆及序列测定 被引量:2
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作者 王家富 张楚瑜 +3 位作者 丁建华 周荣 温淑娟 黄镇华 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期65-69,共5页
According to the sequence of gD gene of PRV Rice strain, the primers of 22bp were designed.Using PRV genomic DNA of Hubei and Shuangcheng virus strains which infected BHK 21 cell separately as template, the gD... According to the sequence of gD gene of PRV Rice strain, the primers of 22bp were designed.Using PRV genomic DNA of Hubei and Shuangcheng virus strains which infected BHK 21 cell separately as template, the gD gene of PRV was amplified sucessfully by PCR and cloned into pGEM T vector. Restriction enzyme analysis showed that the cloned gD gene at SmaⅠ,SalⅠ,KpnⅠ,PvuⅡ sites was the same as that of PRV Rice strain. The gD gene consisted of 1,263 nucleotides including an open reading frame spanning 1,197 nucleotieds which could encode a protein of 398 amino acids. The ORF didn′t include an amino acid sequence directing N linked glycosylation (NXT or NXS). Comparison of our complete Hubei strain gD gene sequence with the Rice strain gD gene sequence showed that the nucleotide and deduced amino acid homology were about 97% and there was an 12 basepair deletion in 835 846 nucleotide sites that coded Arg Pro Arg Pro. A region of the amino acid sequence and the positions of the cysteine residues of PRV HB gD were homologous to HSV I glycoprotein D. This work laid foundation for PRV gene immunization and studying PRV sub unit vaccine. 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 GD基因 PCR扩增 基因克隆 序列
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鉴别猪伪狂犬病病毒gE基因缺失疫苗和野毒感染的二重PCR诊断方法的建立和应用 被引量:4
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作者 赵雪丽 闫若潜 +6 位作者 吴志明 曹伟伟 王淑娟 谢彩华 马震原 周兵强 王东方 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第4期865-870,共6页
为建立猪伪狂犬病病毒(PRV)gE基因缺失疫苗和野毒感染的快速鉴别诊断方法,本研究根据猪伪狂犬病野毒具有gD表面抗原基因和gE毒力基因,而基因缺失疫苗只有gD基因无gE基因的特性,针对gD/gE基因的5′端核苷酸序列自行设计引物,建立鉴别PRVg... 为建立猪伪狂犬病病毒(PRV)gE基因缺失疫苗和野毒感染的快速鉴别诊断方法,本研究根据猪伪狂犬病野毒具有gD表面抗原基因和gE毒力基因,而基因缺失疫苗只有gD基因无gE基因的特性,针对gD/gE基因的5′端核苷酸序列自行设计引物,建立鉴别PRVgE基因缺失疫苗和野毒感染的二重PCR诊断方法,并进行了特异性、敏感性和重复性试验;利用所建立的检测方法对临床疑似样品进行了检测。结果表明,成功建立了鉴别PRV gE基因缺失疫苗和野毒感染的二重PCR诊断方法,该方法灵敏度高,最低检出限为100拷贝/μL;重复性好;特异性强,可特异性地扩增出PRV细胞毒中的gD和gE基因及gE基因缺失疫苗毒中的gD基因,但对PK-15细胞和猪流行性腹泻病毒等其他8种病原扩增不出任何条带;自835份临床疑似PRV感染病料中共检测出PRVgD和gE基因双阳性样品即野毒感染阳性样品267份,PRVgD基因单阳性样品28份,选取该方法检测出的26份PRV野毒感染阳性样品用于病原分离培养,两种方法的符合率为96.1%。说明本试验建立的二重PCR鉴别诊断方法快速、灵敏、特异,对于临床上疫苗毒和野毒感染的快速鉴别诊断具有重要意义。 展开更多
关键词 猪伪狂犬病病毒 gE基因缺失疫苗 gD/gE基因 二重PCR 鉴别诊断
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鉴别伪狂犬病毒gE基因缺失疫苗毒与野毒套式PCR方法的建立 被引量:4
7
作者 朱小甫 吴旭锦 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2016年第4期26-30,共5页
为建立一种能够鉴别伪狂犬病毒gE基因缺失疫苗毒与野毒套式PCR方法,根据GenBank上发表的伪狂犬病毒gD、gE基因序列,设计并合成了4对引物,对反应体系和条件进行优化,建立复合套式PCR方法。通过灵敏性试验、特异性试验、病料中PRV检测对... 为建立一种能够鉴别伪狂犬病毒gE基因缺失疫苗毒与野毒套式PCR方法,根据GenBank上发表的伪狂犬病毒gD、gE基因序列,设计并合成了4对引物,对反应体系和条件进行优化,建立复合套式PCR方法。通过灵敏性试验、特异性试验、病料中PRV检测对比等方法验证建立方法的适用性。结果表明,该方法检测的极限为2.78×10^(-4)pg/L,并且仅能从PRV野毒株扩增出354、217 bp目的条带,PRV疫苗扩增出了217bp单条带,其他5种常见感染猪的病毒均为阴性。 展开更多
关键词 伪狂犬病毒 GD基因 GE基因 鉴别诊断 套式PCR
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Y染色体A10 STR基因座在中国汉族群体中的多态性
8
作者 郑秀芬 季安全 +2 位作者 陈俊峰 吴微微 纪贵金 《刑事技术》 2001年第5期27-28,共2页
目的获得A10基因座在中国汉族人群的多态性资料。方法用Chelex100方法提取100名无关个体汉族男性血痕DNA,利用荧光标记引物进行PCR扩增结合ABD377测序仪检测扩增产物。结果在A10基因座中国汉族人群发现6个等位基因,等位基因频率为0.01~... 目的获得A10基因座在中国汉族人群的多态性资料。方法用Chelex100方法提取100名无关个体汉族男性血痕DNA,利用荧光标记引物进行PCR扩增结合ABD377测序仪检测扩增产物。结果在A10基因座中国汉族人群发现6个等位基因,等位基因频率为0.01~0.48,GD值为0.6505。 展开更多
关键词 A10基因座 PCR GD 中国 汉族 群体 多态性 法医学 人类学
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HSV-2DNA疫苗诱导小鼠免疫应答研究
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作者 洪艳 杨连华 +3 位作者 陈勇 经络 蒋骏航 王怡婷 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2003年第9期1079-1080,共2页
目的 探讨含有单纯疱疹病毒Ⅱ型 (HSV - 2 )糖蛋白D全基因序列的重组质粒作为DNA疫苗的可能性。方法 采用PCR方法获得HSV - 2 gD片段 ,构建含HSV -gD片段的重组质粒 pcDNA3- gD。重组质粒作为DNA疫苗免疫小鼠 ,观察其对小鼠免疫效果... 目的 探讨含有单纯疱疹病毒Ⅱ型 (HSV - 2 )糖蛋白D全基因序列的重组质粒作为DNA疫苗的可能性。方法 采用PCR方法获得HSV - 2 gD片段 ,构建含HSV -gD片段的重组质粒 pcDNA3- gD。重组质粒作为DNA疫苗免疫小鼠 ,观察其对小鼠免疫效果及保护作用。结果 重组质粒 pcCDNA3-gD免疫小鼠后可产生特异性抗体 ,可保护小鼠免受HSV - 2的致死性攻击 ,存活率达 75 %。结论 重组质粒 pcDNA3- gD可诱导小鼠产生特异性免疫反应 ,可以作为HSV的候选DNA疫苗。 展开更多
关键词 单纯疱疹病毒 DNA疫苗 聚合酶链反应 糖蛋白D
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牛传染性鼻气管炎病毒SYBR GreenⅠ荧光定量PCR检测方法的建立及应用 被引量:12
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作者 任亚初 楚会萌 +8 位作者 程凯慧 解晓莉 张亮 孙阳阳 杨美 杨宏军 唐月新 刘文浩 李开荣 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期1032-1036,共5页
为快速定量检测牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV),本研究根据IBRV的 D基因保守序列,设计合成一对特异性引物,建立了能够快速检测IBRV的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法。特异性试验结果显示,该方法与引起牛消化道和呼吸道疾病的其它几种病毒均... 为快速定量检测牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV),本研究根据IBRV的 D基因保守序列,设计合成一对特异性引物,建立了能够快速检测IBRV的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法。特异性试验结果显示,该方法与引起牛消化道和呼吸道疾病的其它几种病毒均无交叉反应,特异性较强;敏感性试验结果显示,该方法对质粒标准品的最低检出限达6.1×10~1拷贝/μL,敏感性较高且高于普通PCR方法;重复性实验结果显示,批内、批间变异系数均小于3.0%,重复性良好。利用该方法检测了3个规模化奶牛场送检的47份奶牛鼻拭子样品,结果显示检出了12份阳性样品,与常规PCR检测方法的相比,总符合率为97.87%。本研究建立的检测IBRV的SYBR GreenⅠ荧光定量PCR方法准确可靠,为IBRV的早期快速检测和定量分析提供了技术支撑。 展开更多
关键词 牛传染性鼻气管炎 荧光定量PCR GD基因 诊断
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虎源传染性鼻气管炎病毒巢式PCR检测方法的建立 被引量:3
11
作者 李林翔 韦增晖 +2 位作者 张晓明 彭仕明 陈武 《野生动物学报》 北大核心 2015年第4期369-372,共4页
为了建立虎源传染性鼻气管炎病毒巢式PCR(nested PCR)的快速鉴定方法,根据虎源传染性鼻气管炎病毒(FHV-1)的gD蛋白基因序列设计套式引物,进行特异性、敏感性和重复性实验,特异性试验表明,该方法可以特异扩增出FHV-1的gD基因片断,从猫泛... 为了建立虎源传染性鼻气管炎病毒巢式PCR(nested PCR)的快速鉴定方法,根据虎源传染性鼻气管炎病毒(FHV-1)的gD蛋白基因序列设计套式引物,进行特异性、敏感性和重复性实验,特异性试验表明,该方法可以特异扩增出FHV-1的gD基因片断,从猫泛白细胞减少症病毒、猫支原体和阴性对照的VERO细胞均未扩增出该条带,敏感性试验表明,nested PCR检测极限是1×10~2 copies/μl,而一步法PCR的有效扩增最低极限是1×10~5 copies/μl,前者的敏感性明显高于后者,重复性实验表明,不同情况下3次重复性试验,结果相同。用nested PCR对疑似感染FHV-1的样品进行检测,实验结果与病毒分离鉴定结果一致。本研究建立的nested PCR适用于野生猫科动物FHV-1感染的快速诊断与流行病学调查。 展开更多
关键词 虎源传染性鼻气管炎病毒 巢式PCR 一步法PCR GD基因
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一种新型单纯疱疹病毒II型DNA疫苗的构建及其初步研究 被引量:4
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作者 何方 洪艳 陈勇 《中国卫生检验杂志》 CAS 2008年第6期997-999,共3页
目的:构建新型的含单纯疱疹病毒II型糖蛋白D基因(gD)的卡那霉素抗性真核表达质粒pgD,并探讨其作为DNA疫苗的可能性。方法:通过PCR扩增、酶切、连接及克隆筛选从质粒pET-28a(+)和质粒pcDNA3获得新型真核表达质粒载体pcDNAkan。再通过PCR... 目的:构建新型的含单纯疱疹病毒II型糖蛋白D基因(gD)的卡那霉素抗性真核表达质粒pgD,并探讨其作为DNA疫苗的可能性。方法:通过PCR扩增、酶切、连接及克隆筛选从质粒pET-28a(+)和质粒pcDNA3获得新型真核表达质粒载体pcDNAkan。再通过PCR从重组真核表达质粒pcDNA3-gD上扩增出HSV-2糖蛋白D全基因序列(gD),最后克隆重组获得含gD的重组质粒pgD。pgD作为DNA疫苗免疫小鼠,观察其对小鼠的免疫效果及保护作用。结果:pgD免疫小鼠后能产生特异性抗体,与对照组相比较具有显著性差异(P<0.01),在HSV-2病毒致死性攻毒实验中,pgD组存活率达75%。结论:重组质粒pgD能诱导小鼠产生特异性免疫应答,可为HSV的DNA疫苗研制提供科学依据。 展开更多
关键词 单纯疱疹病毒 DNA疫苗 PCR 糖蛋白D
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哈尔滨圈养东北虎FHV-1的巢式PCR检测及gD基因序列分析
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作者 石龙艳 黄舒萍 +9 位作者 郭琳 李祥 王贤 陆雨欣 苏雨晴 徐海涛 周晓禹 李大鹏 宫明 王亚君 《野生动物学报》 北大核心 2022年第3期810-815,共6页
东北虎(Panthera tigris altaica)是世界上体型较大的猫科(Felidae)动物,是我国一级保护动物。疾病防控对东北虎保护与繁育工作至关重要,目前关于东北虎重要病毒病的流行病学资料寥寥无几。传染性鼻气管炎是由猫疱疹病毒Ⅰ型(Feline her... 东北虎(Panthera tigris altaica)是世界上体型较大的猫科(Felidae)动物,是我国一级保护动物。疾病防控对东北虎保护与繁育工作至关重要,目前关于东北虎重要病毒病的流行病学资料寥寥无几。传染性鼻气管炎是由猫疱疹病毒Ⅰ型(Feline herpesvirus type 1,FHV-1)感染引起的一种上呼吸道疾病,且现有疫苗免疫后多出现再感染现象,对猫科动物健康造成一定危害。本研究采集50只东北虎全血样本,利用巢式PCR进行FHV-1检测,结果有10份样本扩增出明显目的条带,阳性率为20%;随机选取其中2株扩增FHV-1 gD基因全序列,获取的1125 bp序列与FHV-1参考株同源性为99.16%~99.56%,相比FHV-1参考株,获取序列有5个碱基位点发生了突变。研究结果丰富了圈养东北虎FHV-1流行病学数据,为圈养大型猫科动物的FHV-1监测提供了参考,有利于提高东北虎种群的保护成效。 展开更多
关键词 东北虎 FHV-1 GD基因 巢式PCR
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猪伪狂犬病病毒gD基因的生物信息学分析 被引量:5
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作者 徐志文 郭万柱 +2 位作者 许雁峰 朱玲 张博 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期1382-1389,1394,共9页
自测12条PRV不同毒株的gD全序列连同GeneBank中登录的9条gD基N全序列共21条基因序列,使用生物软件对它们的基因序列的同源性、突变区域的定位、遗传进化关系、酶切位点的差异、密码子偏爱性,氨基酸序列的同源性、蛋白质亲水性、抗原... 自测12条PRV不同毒株的gD全序列连同GeneBank中登录的9条gD基N全序列共21条基因序列,使用生物软件对它们的基因序列的同源性、突变区域的定位、遗传进化关系、酶切位点的差异、密码子偏爱性,氨基酸序列的同源性、蛋白质亲水性、抗原表位分析、三级结构预测等生物信息学的内容进行预测和分析。结果表明:PRV-gD基因的开放阅读框的核苷酸长度在1197-1215nt之间,氨基酸长度在399-405个之间,核酸同源性在97.3%-100%之间,氨基酸的同源性在89.8%-98.8%之间,在核酸820-837位有个高变重复区,不同毒株基因均对GC极为偏爱。在遗传进化关系上将我国PRV流行分为四川、华北、东南3个区域。毒株间基因内酶切位点、蛋白质亲水性、抗原表位和蛋白质高级结构预测等内容的分析结果十分相似,说明PRV-gD基因具有很高的保守性。 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 GD基因 PCR 序列分析 生物信息学
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