德州驴GDF10基因多态鉴定及其与生长性状的关联分析

[目的]研究将生长/分化因子-10(GDF10)作为候选基因,探讨其多态与不同性别的德州驴生长性状之间的关系。[方法]通过对440头德州驴进行多态检测,鉴定得到3个SNPs位点,并对SNP位点进行分型。利用SPSS 18.0软件分析3个SNPs位点的不同基因型与德州驴9个生长性状的关联分析。[结果]结果显示,3个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05);群体遗传参数分析发现,GDF10基因的SNP位点的纯合度较高,多态信息含量均处于中度多态(0.25G位点AA基因型个体的尻高显著高于GA基因型个体(P<0.05);g.2041898A>G位点AA基因型个体的体高和尻长显著高于GA基因型个体(P<0.05);g.2043035 C>T位点上CC基因型个体的尻长显著高于CT基因型个体(P<0.05)。在公驴中,g.2043035 C>T位点CC基因型个体的体高显著低于CT基因型(P<0.05)。[结论]综上所述,GDF10基因多态性与德州驴的部分生长性状相关,有潜力作为德州驴的生长发育性状分子标记。

南德温杂交肉牛生长分化因子10基因多态性与体尺性状的关联分析

以98头南德温杂交肉牛血样为材料,随机抽样构建混合DNA池,利用高分辨率熔解曲线分析技术和直接测序法检测生长分化因子10(growth differentiation factor 10,GDF10)基因的序列变异,研究分析GDF10基因的多态性。采用SHEsis和PHASE软件对GDF10基因多态位点进行配对连锁不平衡和单倍型分析,采用SPSS 17.0进行基因多态位点和单倍型组合与体尺性状关联性分析。结果显示,南德温杂交肉牛GDF10基因检测到3个多态位点1113(G/A)、9569(G/A)和9628(G/A);关联分析表明,南德温杂交肉牛GDF10基因不同突变位点的基因型与体斜长、体高、胸围和管围差异显著(P<0.05);单倍型分析后在群体中发现8种单倍型组合,其中AAA、GGA与南德温杂交肉牛的体高、体斜长、胸围和管围显著相关(P<0.05)。由此推断,南德温杂交肉牛GDF10基因3个多态位点和2个单倍型组合与体斜长、体高、胸围和管围显著相关,可以作为肉牛生产性状的候选分子标记,为肉牛遗传资源开发与利用提供科学依据。