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过量表达棉花GDSL脂肪酶提高甘蓝型油菜油脂含量的研究 被引量:4
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作者 郝晓云 蔡永智 +3 位作者 袁哈利 李榕 王斐 李鸿彬 《中国粮油学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第6期63-68,73,共7页
GDSL脂肪酶作为一种脂质水解酶具有广泛的底物特异性,在植物的油脂代谢、生长发育等众多生理过程中发挥着重要作用。利用RT—PCR技术从发育的陆地棉种子中克隆得到棉花的GDSL脂肪酶基因的cDNA,该基因开放读码框为1068bp,编码含有356... GDSL脂肪酶作为一种脂质水解酶具有广泛的底物特异性,在植物的油脂代谢、生长发育等众多生理过程中发挥着重要作用。利用RT—PCR技术从发育的陆地棉种子中克隆得到棉花的GDSL脂肪酶基因的cDNA,该基因开放读码框为1068bp,编码含有356个氨基酸的蛋白质。对棉花种子发育不同时期进行半定量PCR分析的结果表明,在种子发育15—20d时,GhGLIP基因的表达量较高。将该基因构建到真核表达载体pCAMBIA2300中,转入农杆菌GV3101后转化甘蓝型油菜野油19,通过筛选和鉴定获得转基因阳性油菜株系。转基因油菜的GDSL脂肪酶活力获得了显著提高,转基因油菜种子的油脂含量比野生型油菜提高了8.68%,提高比率为24.3%。 展开更多
关键词 棉花种子 gdsl脂肪酶 油脂含量 甘蓝型油菜
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木豆GDSL脂肪酶基因的克隆及表达分析 被引量:4
2
作者 乔光 文晓鹏 丁贵杰 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第8期1720-1725,共6页
【目的】为探明GDSL家族脂肪酶的抗逆机理,【方法】在前期研究基础上,利用RACE技术克隆木豆GDSL脂肪酶基因,并通过荧光定量PCR技术检测其表达特性。【结果】获得1条木豆GDSL脂肪酶基因,命名为Cc GDSL1,该基因含开放阅读框全长1107 bp,编... 【目的】为探明GDSL家族脂肪酶的抗逆机理,【方法】在前期研究基础上,利用RACE技术克隆木豆GDSL脂肪酶基因,并通过荧光定量PCR技术检测其表达特性。【结果】获得1条木豆GDSL脂肪酶基因,命名为Cc GDSL1,该基因含开放阅读框全长1107 bp,编码369个氨基酸;经同源性分析,Cc GDSL1编码的氨基酸序列与豆科植物中GDSL脂肪酶具有较高的相似性。该基因在叶、茎和根中均表达,且叶和茎中表达量显著高于根;干旱胁迫能提高Cc GDSL1的表达量,随干旱的持续表现出先降后升随后趋于稳定的表达模式。【结论】推测Cc GDSL1基因参与木豆应激干旱胁迫。 展开更多
关键词 木豆 gdsl脂肪酶 克隆 表达
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Enantio-selective preparation of (S)-1-phenylethanol by a novel marine GDSL lipase MT6 with reverse stereo-selectivity 被引量:4
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作者 邓盾 张云 +1 位作者 孙爱君 胡云峰 《Chinese Journal of Catalysis》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1966-1974,共9页
We previously functionally characterized a novel marine microbial GDSL lipase MT6 and identified that the stereo-selectivity of MT6 was opposite to that of other common lipases in trans-esterification reactions.Herein... We previously functionally characterized a novel marine microbial GDSL lipase MT6 and identified that the stereo-selectivity of MT6 was opposite to that of other common lipases in trans-esterification reactions.Herein,we have investigated the use of MT6 in stereo-selective biocatalysis through direct hydrolysis reactions.Notably,the stereo-selectivity of MT6 was also demonstrated to be opposite to that of other common lipases in hydrolysis reactions.Parameters,including temperature,organic co-solvents,pH,ionic strength,catalyst loading,substrate concentration,and reaction time,affecting the enzymatic resolution of racemic 1-phenylethyl acetate were further investigated,with the e.e.of the final(S)-l-Phenylethanol product and the conversion being 97%and 28.5%,respectively,after process optimization.The lengths of side chains of 1-phenylethyl esters greatly affected the stereo-selectivity and conversion during kinetic resolutions.MT6 is a novel marine microbial GDSL lipase exhibiting opposite stereo-selectivities than other common lipases in both trans-esterification reactions and hydrolysis reactions. 展开更多
关键词 gdsllipase BIOCATALYSIS Kinetic resolution Direct hydrolysis (S)-1-Phenylethanol Reverse stereo-selectivity
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沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因的鉴定及序列分析 被引量:1
4
作者 刘玉洁 郭丹妮 +3 位作者 张渝 覃信梅 李惠敏 秦新民 《江苏农业科学》 北大核心 2017年第11期45-48,共4页
利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序。通过差异分析得到GDSL酯酶/脂肪酶的基因序列,该基因全长1 306 bp(Gen Bank登录号:KU159279),开放阅读框(简称ORF)全长1 104 bp,共编码367个氨基酸,编码的蛋白质分子量为40.09... 利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序。通过差异分析得到GDSL酯酶/脂肪酶的基因序列,该基因全长1 306 bp(Gen Bank登录号:KU159279),开放阅读框(简称ORF)全长1 104 bp,共编码367个氨基酸,编码的蛋白质分子量为40.09 ku,理论等电点为6.44,含有1个与SGNH蛋白相同的保守结构域(conserved active sites,简称CAS);GDSL基因在沙田柚自交1 d花柱中的表达量(简称RPKM)为4.68,2 d为2.41,3 d则迅速下降到0.27;在异交1 d花柱中该基因的表达量为4.48,2 d迅速升高至7.43,3 d仍维持较高水平为4.37;系统进化树显示,沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因与甜橙(Citrus sinensis)亲缘关系很近,属于同一进化分支。 展开更多
关键词 沙田柚 gdsl酯酶/脂肪酶基因 序列分析 鉴定
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油菜GDSL脂肪酶基因BnLIP1的克隆及其原核表达 被引量:3
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作者 凌华 《中国农学通报》 CSCD 2007年第12期102-106,共5页
克隆油菜GDSL脂肪酶基因BnLIP1,实现该基因在原核系统中重组表达,为研究其功能奠定基础。采用TRIzol法提取总RNA,通过RT-PCR法扩增BnLIP1编码序列,构建原核表达载体pEL1并转化大肠杆菌,IPTG诱导表达后通过SDS-PAGE检测目的蛋白。根据Gen... 克隆油菜GDSL脂肪酶基因BnLIP1,实现该基因在原核系统中重组表达,为研究其功能奠定基础。采用TRIzol法提取总RNA,通过RT-PCR法扩增BnLIP1编码序列,构建原核表达载体pEL1并转化大肠杆菌,IPTG诱导表达后通过SDS-PAGE检测目的蛋白。根据GenBank报道的序列设计引物,从萌发的油菜种子黄化幼苗中成功克隆到BnLIP1的编码序列,长度为1170bp。将该编码序列构建到原核表达载体pET32a(+)并与标签序列融合,在E.coliBL21菌株中成功表达了与标签蛋白融合的BnLIP1蛋白,大小约为61kDa。首次实现了油菜GDSL脂肪酶基因在原核系统中的表达,为GDSL脂肪酶Bn-LIP1蛋白的分离纯化及活性研究奠定了基础。 展开更多
关键词 油菜 gdsl-motif 脂肪酶 重组表达 大肠杆菌
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GDSL脂肪酶增强棉花对大丽轮枝菌的抗性
6
作者 安晶 潘泽 李鸿彬 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2017年第4期420-424,共5页
大丽轮枝菌是影响棉花生长发育的一种通过土传真菌维管束的病菌,严重影响棉花纤维的产量和品质。为研究棉花GDSL脂肪酶(GDSL lipase,GLIP)在植物响应大丽轮枝菌中的重要功能,本研究利用大丽轮枝菌悬浮液对新陆早42号及其转GhGLIP基因的... 大丽轮枝菌是影响棉花生长发育的一种通过土传真菌维管束的病菌,严重影响棉花纤维的产量和品质。为研究棉花GDSL脂肪酶(GDSL lipase,GLIP)在植物响应大丽轮枝菌中的重要功能,本研究利用大丽轮枝菌悬浮液对新陆早42号及其转GhGLIP基因的棉花株系叶片进行处理,分析转GhGLIP棉花株系对大丽轮枝菌的生理生化响应。结果表明,棉花GDSL脂肪酶基因GhGLIP能够响应大丽轮枝菌的刺激,转GhGLIP基因棉花株系可显著抑制大丽轮枝菌导致的叶片细胞死亡。与未处理相比,经大丽轮枝菌处理后的野生型和转基因棉花株系植株的GDSL脂肪酶活力显著增加。同时,转基因棉花株系植株过氧化氢酶、过氧化物酶、超氧化物歧化酶、苯丙氨酸解氨酶和多酚氧化物酶的表达显著提升,说明GhGLIP基因诱导了棉花对大丽轮枝菌的抗性。本研究为棉花抵抗大丽轮枝菌的分子机制解析,及进一步利用基因工程技术培育抗病棉花材料提供了有效参考。 展开更多
关键词 gdsl脂肪酶 大丽轮枝菌 棉花抗病 抗氧化系统酶类
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一个棉花GDSL脂肪酶基因的克隆与功能分析 被引量:3
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作者 佟祥超 王丽曼 +3 位作者 胡文静 张雪颖 张天真 郭旺珍 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1164-1171,共8页
GDSL脂肪酶与GXSXG脂肪酶是2个重要的脂肪酶亚家族。其中,GDSL家族脂肪酶具有水解酶活性,能水解多种酯类物质。本试验根据新乡小吉无绒无絮(XinWX)和无绒有絮(XinFLM)近等基因系纤维起始期29K芯片竞争杂交结果,选择了一个在纤维起始期... GDSL脂肪酶与GXSXG脂肪酶是2个重要的脂肪酶亚家族。其中,GDSL家族脂肪酶具有水解酶活性,能水解多种酯类物质。本试验根据新乡小吉无绒无絮(XinWX)和无绒有絮(XinFLM)近等基因系纤维起始期29K芯片竞争杂交结果,选择了一个在纤维起始期具有极显著表达差异的EST序列(GenBank登录号为DR458916),以该序列信息为探针,利用电子克隆方法并进行cDNA及基因组全长基因PCR扩增、测序验证,克隆获得一个陆地棉GDSL脂肪酶基因(GhGDSL;GenBank登录号为KC186125)。该基因ORF长1065bp,编码354个氨基酸,含有5个外显子和4个内含子。该基因在二倍体棉种基因组中含一个拷贝,在四倍体棉种基因组中含2个拷贝。序列比对显示该基因在四倍体棉种的2个亚组中独立进化,且D亚组比A亚组变异大。染色体定位显示该基因2个拷贝分别位于A4(Chr.4)和D4(Chr.22)染色体上。定量RT-PCR结果表明,GhGDSL在开花后3~10d的纤维组织中表达量高,其中在海7124中表达高峰在8DPA,在TM-1中表达高峰从5DPA持续到10DPA。利用[(TM-1×Hai7124)×TM-1]的BC1S1群体开展GhGDSL功能与纤维、种子品质性状关联分析,发现该基因A亚组的拷贝与种子脂肪含量存在显著相关(P=0.048);D亚组的拷贝与种子蛋白含量存在极显著相关(P=0.008)。推测GhGDSL基因功能与种子中脂肪、蛋白代谢相关,同时也参与纤维伸长过程。 展开更多
关键词 gdsl脂肪酶 克隆 表达 基因定位 关联分析 棉花
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陆地棉GDSL脂肪酶增强拟南芥对黄萎病菌的抗性 被引量:6
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作者 袁哈利 郝晓云 +1 位作者 郑学伟 李鸿彬 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2015年第5期529-534,共6页
为了分析脂肪酶对于黄萎病菌的抗性功能,本研究采用RT-PCR技术从陆地棉中克隆得到1个GDSL脂肪酶(GDSL Lipase,GLIP)基因Gh GLIP,ORF全长1068 bp。采用滴花法将重组表达载体35S::Gh GLIP转入哥伦比亚型拟南芥,通过筛选、鉴定和纯合得到T... 为了分析脂肪酶对于黄萎病菌的抗性功能,本研究采用RT-PCR技术从陆地棉中克隆得到1个GDSL脂肪酶(GDSL Lipase,GLIP)基因Gh GLIP,ORF全长1068 bp。采用滴花法将重组表达载体35S::Gh GLIP转入哥伦比亚型拟南芥,通过筛选、鉴定和纯合得到T3代转基因拟南芥。利用黄萎病菌悬浮液分别对野生型和转基因拟南芥植株叶片进行局部处理后,发现转Gh GLIP基因拟南芥植株能够抑制黄萎病菌诱发的叶片细胞死亡及病菌在叶片感染处的生长繁殖。酶活性测定结果显示,转Gh GLIP基因拟南芥植株的抗氧化系统酶和病程相关酶的表达获得了显著的增强;RT-PCR分析结果表明,黄萎病菌处理1 d后,转Gh GLIP基因拟南芥叶片的病程相关基因和乙烯信号相关基因的表达获得了显著的增加。本研究结果表明,棉花Gh GLIP基因可能通过参与乙烯信号,以及促进抗氧化系统酶和病程相关基因的表达,进一步增强拟南芥对于黄萎病菌的抗性。本研究可为棉花Gh GLIP基因增强植物抗病性分子机制解析,以及进一步的基因工程利用提供一定参考。 展开更多
关键词 棉花gdsl脂肪酶 黄萎病 乙烯信号 抗氧化系统酶 病程相关基因
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副结核分枝杆菌胞外GDSL脂肪酶MAP_2739的酶学特性研究 被引量:2
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作者 王建国 陈凡若 +10 位作者 鹿萍 臧鑫鑫 党光辉 姜艳艳 崔宁 冯婷婷 张嘉俊 王慧 崔莹莹 崔子寅 刘思国 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期331-338,共8页
本实验室前期研究发现了未见报道的副结核分枝杆菌(MAP)GDSL脂肪酶家族蛋白MAP_2739。为进一步分析MAP_2739的酶学特性,本实验利用生物信息学网站和软件对MAP_2739保守结构域、二级结构、3D同源建模等分析,进一步确认其属于GDSL脂肪酶... 本实验室前期研究发现了未见报道的副结核分枝杆菌(MAP)GDSL脂肪酶家族蛋白MAP_2739。为进一步分析MAP_2739的酶学特性,本实验利用生物信息学网站和软件对MAP_2739保守结构域、二级结构、3D同源建模等分析,进一步确认其属于GDSL脂肪酶家族蛋白。以MAP参考株基因组DNA为模板,PCR扩增获得map_2739目的基因约891 bp,克隆于表达载体pET-22b中,构建重组质粒pET-22b-map_2739,转化大肠杆菌感受态细胞,经IPTG诱导表达、蛋白复性、Ni-TNA柱亲和层析纯化后,利用SDS-PAGE分析目的蛋白的表达及纯化效果,并通过western blot鉴定。结果显示,获得了以包涵体形式表达的经复性的纯化重组MAP_2739蛋白(rMAP_2739)。利用该蛋白制备兔多克隆抗体,通过ELISA方法检测,多抗血清效价为1∶51200。经差速离心法分离MAP参考株组分,利用该多克隆抗体为一抗,通过western blot检测,结果显示在细胞壁、细胞膜和细胞浆均出现35 ku的特异性条带,表明MAP_2739为胞外蛋白。以对硝基苯基酯(p-NPs)为底物进行酶活测定,结果显示MAP_2739蛋白为脂肪酶,可水解短链和长链脂肪酸,其最适酶反应pH值为9.0,且rMAP_2739蛋白经巴氏消毒法预处理后,仍具有脂肪酶活性。以重组质粒pET-22b-map_2739为模板,利用各定点突变引物,经PCR扩增各突变的map_2739基因,并测序后转化大肠杆菌感受态细胞,通过western blot鉴定蛋白表达及纯化情况,并进行了酶活测定分析,结果显示获得各定点突变纯化蛋白,确定S46和D204为MAP_2739的酶活性位点。综上所述,本研究首次证明MAP_2739是MAP胞外GDSL脂肪酶,该结果为进一步研究其在MAP致病中的作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 副结核分枝杆菌 gdsl脂肪酶 MAP_2739 酶学特性
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香蕉GDSL脂肪酶基因家族全基因组鉴定与表达分析 被引量:1
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作者 张城瑜 任纹慧 +7 位作者 耿小慧 李丹 吴昊 倪珊珊 王梦鸽 罗彬彬 徐涵 赖钟雄 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1415-1429,共15页
【目的】揭示香蕉GDSL脂肪酶基因家族(MaGDSL)序列特征及其在香蕉生长发育过程中的潜在功能。【方法】利用生物信息学方法对MaGDSL进行全基因组鉴定,分析其染色体、启动子顺式作用元件和转录因子结合位点(TFBS)的分布情况以及编码蛋白... 【目的】揭示香蕉GDSL脂肪酶基因家族(MaGDSL)序列特征及其在香蕉生长发育过程中的潜在功能。【方法】利用生物信息学方法对MaGDSL进行全基因组鉴定,分析其染色体、启动子顺式作用元件和转录因子结合位点(TFBS)的分布情况以及编码蛋白的理化性质、基因结构、保守基序和系统进化关系,并基于转录组数据库分析MaGDSLs在高温(45℃)/低温(4℃)处理的叶片、枯萎病菌FocTR4侵染的根系以及自然成熟/乙烯催熟的不同成熟阶段的果实中的表达模式,同时利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析部分MaGDSL成员在花粉中的表达情况。【结果】香蕉A基因组中有76个MaGDSL成员,分布于11个染色体上,可分为9个亚家族,各成员编码区长度为1 014~2 193 bp,其中有5个成员含有不同数量的转录本;多数MaGDSL成员包含5个外显子和4个内含子,编码蛋白具有信号肽且主要定位在内外膜上;启动子区存在多种植物激素和逆境胁迫相关响应元件以及22种TFBSs;MaGDSLs中有3个串联重复基因簇位于4、8号染色体,6个串联重复基因对分别位于1、6、7、8、9和10号染色体上,22对片段重复基因分布在除11号染色体外的所有染色体上。MaGDSLs在香蕉叶片和根部的表达水平差异较大,且个别成员受高、低温胁迫以及枯萎病菌调控,其中5个成员(MaGDSL4-5、8-1、8-12、9-4、9-5)受高、低温胁迫抑制表达,而MaGDSL2-1和MaGDSL6-8受高、低温胁迫诱导表达,MaGDSL4-1和MaGDSL11-1受低温和FocTR4调控,MaGDSL5~8仅响应低温胁迫,其中MaGDSL2-2和MaGLP10-5对各种处理均有响应,而MaGDSL1-1在根系和花粉中均有高表达。【结论】MaGDSLs可能在香蕉生长发育过程中发挥重要作用,同时部分成员特异响应生物和非生物胁迫。 展开更多
关键词 香蕉 gdsl脂肪酶 基因组 逆境胁迫 表达分析
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一个杨树GDSL基因组织表达的特性及其在拟南芥异源的表达 被引量:2
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作者 奈婕菲 程玉祥 《江苏农业科学》 北大核心 2014年第3期16-18,共3页
GDSL酯酶为脂肪水解酶家族的一个分支,参与植物生长发育和防御反应等多种功能。半定量RT-PCR分析结果显示,毛果杨GDSL酯酶基因Potri.002G253400在顶端茎组织中高丰度特异性表达;构建Potri.002G253400-GFP融合的植物表达载体,转化模式植... GDSL酯酶为脂肪水解酶家族的一个分支,参与植物生长发育和防御反应等多种功能。半定量RT-PCR分析结果显示,毛果杨GDSL酯酶基因Potri.002G253400在顶端茎组织中高丰度特异性表达;构建Potri.002G253400-GFP融合的植物表达载体,转化模式植物拟南芥并获得其过量表达的转基因株系7个;激光共聚焦显微镜检测结果显示,GFP荧光蛋白高丰度表达于转基因植株根的细胞壁区域,说明Potri.002G253400蛋白可能定位于细胞壁。 展开更多
关键词 毛果杨 拟南芥 gdsl酯酶 载体构建 转基因
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Genome-wide identification and expression analysis of GDSL esterase/lipase genes in tomato 被引量:1
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作者 SUN Yao-guang HE Yu-qing +3 位作者 WANG He-xuan JIANG Jing-bin YANG Huan-huan XU Xiang-yang 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2022年第2期389-406,共18页
The GDSL esterase/lipase family contains many functional genes that perform important biological functions in growth and development, morphogenesis, seed oil synthesis, and defense responses in plants. The expression ... The GDSL esterase/lipase family contains many functional genes that perform important biological functions in growth and development, morphogenesis, seed oil synthesis, and defense responses in plants. The expression of GDSL esterase/lipase genes can respond to biotic and abiotic stresses. Although GDSL esterase/lipase family genes have been identified and studied in other plants, they have not been identified and their functions remain unclear in tomato. This study is the first to identify 80 GDSL esterase/lipase family genes in tomato, which were named SlGELP1–80. These genes were mapped to their positions on the chromosomes and their physical and chemical properties, gene structure, phylogenetic relationships, collinear relationships, and cis-acting elements were analyzed. The spatiotemporal expression characteristics of the Sl GELP genes in tomato were diverse. In addition, RNA-seq analysis indicated that the expression patterns of the SlGELP genes in tomato differed before and after inoculation with Stemphylium lycopersici. qRT-PCR was used to analyze the expression of five Sl GELP genes after treatments with S. lycopersici, salicylic acid and jasmonic acid. Finally, this study was the first to identify and analyze GDSL esterase/lipase family genes in tomato via bioinformatics approaches, and these findings provide new insights for improving the study of plant disease resistance. 展开更多
关键词 gdsl esterase/lipase gene family identification plant disease resistance gray leaf spot Solanum lycopersicum
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黄瓜CsGDSL脂解酶基因的克隆与表达分析
13
作者 高璐瑶 曹嘉健 +2 位作者 王春华 武涛 杜亚琳 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2023年第4期47-53,共7页
GDSL脂解酶是影响角质层发育的重要基因,克隆黄瓜GDSL脂解酶基因,并分析其表达模式,旨在为黄瓜角质层发育及黄瓜果实光泽的研究奠定基础。根据黄瓜基因组数据库中的参考序列,对黄瓜GDSL脂解酶基因进行克隆,并进行生物信息学分析。利用qR... GDSL脂解酶是影响角质层发育的重要基因,克隆黄瓜GDSL脂解酶基因,并分析其表达模式,旨在为黄瓜角质层发育及黄瓜果实光泽的研究奠定基础。根据黄瓜基因组数据库中的参考序列,对黄瓜GDSL脂解酶基因进行克隆,并进行生物信息学分析。利用qRT-PCR技术明确该基因在黄瓜各组织部位中的表达情况。以6份光泽性不同的黄瓜为材料,对该基因序列进行克隆,以明确该基因在不同光泽性黄瓜中的作用。对黄瓜GDSL脂解酶基因启动子进行克隆并分析其作用元件。参照黄瓜基因组数据库设计扩增引物进行PCR扩增,获得CsGDSL基因,CDS长度1059 bp,编码352个氨基酸,二级结构以无规卷曲(45.45%)与α-螺旋(33.24%)为主;该基因在进化过程中较为保守,与甜瓜CmGDSL亲缘关系最为紧密;在黄瓜花后3 d的子房中表达量较开花0 d的子房高;在6个品种中CsGDSL基因CDS序列保守;CsGDSL基因与逆境胁迫、激素及光等具有响应。获得了CsGDSL脂解酶基因,明确了其在黄瓜不同组织部位中的表达情况,该基因在不同材料中较为保守,由此推测,黄瓜CsGDSL可能影响黄瓜果皮光泽。 展开更多
关键词 黄瓜 角质层 gdsl基因 脂解酶
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植物GDSL脂肪酶家族研究进展 被引量:4
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作者 郝晓云 蔡永智 +3 位作者 钱雯婕 袁哈利 李榕 李鸿彬 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1286-1290,共5页
GDSL脂肪酶是一种新的脂肪酶家族成员,由于对其研究起步较晚,尤其是对植物GDSL脂肪酶的研究较少,因此对它们的很多功能和特点的研究还不够深入。近年来的研究表明,GDSL脂肪酶催化位点非常灵活,在与底物结合后其构象会改变,因此,该类酶... GDSL脂肪酶是一种新的脂肪酶家族成员,由于对其研究起步较晚,尤其是对植物GDSL脂肪酶的研究较少,因此对它们的很多功能和特点的研究还不够深入。近年来的研究表明,GDSL脂肪酶催化位点非常灵活,在与底物结合后其构象会改变,因此,该类酶具有多种潜在的功能。目前,已经克隆和鉴定了部分植物GDSL脂肪酶基因,分析并鉴定了一些基因的功能。对植物中GDSL脂肪酶的功能方面研究较多的是其参与植物生长发育、油脂代谢和抗逆性反应等。文章介绍了植物中的GDSL脂肪酶在结构和生理功能等方面的研究进展。 展开更多
关键词 植物 gdsl-motif 脂肪酶 研究进展
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油棕GDSL酯酶/脂肪酶基因的全基因组鉴定及表达分析 被引量:1
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作者 周丽霞 杨蒙迪 李睿 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第14期4545-4559,共15页
全基因组范围内挖掘并鉴定油棕脂肪酶基因(GDSL)家族成员,并对其进行生物信息学及表达分析,为今后油棕GDSL的功能研究奠定基础。以拟南芥GDSL蛋白序列为标签,在油棕全基因组数据库中BLAST同源GDSL蛋白序列,并通过CDD和PFAM数据库完成GDS... 全基因组范围内挖掘并鉴定油棕脂肪酶基因(GDSL)家族成员,并对其进行生物信息学及表达分析,为今后油棕GDSL的功能研究奠定基础。以拟南芥GDSL蛋白序列为标签,在油棕全基因组数据库中BLAST同源GDSL蛋白序列,并通过CDD和PFAM数据库完成GDSL蛋白序列的分析,剔除无保守结构的序列,最后利用生物信息学对油棕GDSL家族成员进行可视化分析。共获得109个油棕GDSL基因,其中有90个基因分布在油棕的15条染色体上,1号染色体上含有的基因数最多,为14个;基因结构较为稳定,大多数基因具有5个外显子,少数基因的外显子数目变化较大;油棕GDSL基因家族motif保守性较高;通过预测蛋白的二级结构,发现EgGDSL蛋白均存在α-螺旋、β-转角、无规则卷曲及延伸链这4种结构,其中75个EgGDSL以无规则卷曲为主要结构,α-螺旋为次要结构,34个蛋白以α-螺旋为主要结构,无规则卷曲为次要结构;通过热图分析发现EgGDSL基因在油棕不同组织中(中果皮,果仁,根,叶,茎和花)均有一定的表达,且具有显著的组织和时空表达特异性。本研究首次提供了油棕GDSL基因家族的染色体定位、基因结构、保守motif、氨基酸理化性质、系统进化树及基因在不同组织中的表达信息,为今后深入研究其在油棕生长发育、脂质代谢等过程的作用机理提供理论依据。 展开更多
关键词 油棕 酯酶/脂肪酶(gdsl) 生物信息学分析
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龙眼GDSL酯酶/脂肪酶基因的全基因组鉴定及表达分析 被引量:4
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作者 刘梦雨 蒋梦琦 +5 位作者 陈燕 张舒婷 薛晓东 肖学宸 赖钟雄 林玉玲 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期597-612,共16页
基于第三代龙眼基因组数据库及其转录组数据库,通过生物信息学分析对龙眼GDSL酯酶/脂肪酶家族进行全基因组鉴定。结果显示龙眼GDSL(Dl GDSL)家族共有118个成员,分为15个亚家族,亚细胞定位显示主要分布于细胞外基质中。染色体位置及共线... 基于第三代龙眼基因组数据库及其转录组数据库,通过生物信息学分析对龙眼GDSL酯酶/脂肪酶家族进行全基因组鉴定。结果显示龙眼GDSL(Dl GDSL)家族共有118个成员,分为15个亚家族,亚细胞定位显示主要分布于细胞外基质中。染色体位置及共线性基因分析表明,118个Dl GDSL基因中有111个定位在15条龙眼染色体上,包括13对共线性基因。基因结构和蛋白质保守基序分析表明该家族的外显子在2~12之间,且motif2和motif3是Dl GDSL家族中尤为重要的保守基序。启动子顺式作用元件分析表明,启动子序列中包含众多光响应、激素应答、无氧诱导、胁迫响应和昼夜节律等响应元件,且大部分成员都含有茉莉酸甲酯(Me JA)、脱落酸(ABA)、生长素(IAA)和赤霉素(GA)等激素应答作用元件。FPKM值分析发现从胚性愈伤组织到球形胚阶段有26个差异表达的基因,提示Dl GDSL家族部分成员可能在龙眼体胚形态建成中发挥重要作用。q RT-PCR分析表明,在外源ABA和Me JA处理下龙眼胚性愈伤组织中,Dl GDSL家族部分成员可能与ABA、Me JA等激素信号转导相关。 展开更多
关键词 龙眼 gdsl 全基因组 鉴定 表达分析
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油用向日葵GDSL脂酶/脂肪酶基因的序列分析 被引量:1
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作者 于海峰 张旭婷 +5 位作者 马艳红 李美娜 陈阜 李素萍 郭树春 张艳芳 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期18-28,共11页
为挖掘油用向日葵中的GDSL脂肪酶基因,本研究以油用向日葵转录组测序得到的Unigenes为对象,筛选GDSL脂酶/脂肪酶基因并对其理化性质和序列结构等特点进行生物信息学分析。结果表明:油用向日葵中筛选到7个GDSL脂酶/脂肪酶基因,编码的蛋... 为挖掘油用向日葵中的GDSL脂肪酶基因,本研究以油用向日葵转录组测序得到的Unigenes为对象,筛选GDSL脂酶/脂肪酶基因并对其理化性质和序列结构等特点进行生物信息学分析。结果表明:油用向日葵中筛选到7个GDSL脂酶/脂肪酶基因,编码的蛋白质为稳定存在的亲水性蛋白,由255~396个氨基酸组成,分子量介于28.75~42.61ku,等电点分布在4.91~8.89;除unigene 60916外,编码的蛋白质都含有较多的跨膜区域和较高的磷酸化程度;α-螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构;进化树分析表明,这7个基因聚为三类,保守性较高,其中unigene 58624与AT4G01130.1在同一分支上高度保守,unigene 60916与AT1G74460.1相似度最高,含有多个α螺旋和β折叠,推测与种子的油脂代谢有关。 展开更多
关键词 油用向日葵 gdsl脂酶/脂肪酶基因 序列分析
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ZmMs30 Encoding a Novel GDSL Lipase Is Essential for Male Fertility and Valuable for Hybrid Breeding in Maize 被引量:18
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作者 Xueli An Zhenying Dong +17 位作者 Youhui Tian Ke Xie Suowei Wu Taotao Zhu Danfeng Zhang Van Zhou Canfang Niu Biao Ma Quancan Hou Jianxi Bao Simiao Zhang Ziwen Li Yanbo Wang Tingwei Yan Xiaojing Sun Yuwen Zhang Jinping Li Xiangyuan Wan 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2019年第3期343-359,共17页
Genic male sterility (GMS) is very useful for hybrid vigor utilization and hybrid seed production. Although a large number of GMS genes have been identified in plants, little is known about the roles of GDSL lipase me... Genic male sterility (GMS) is very useful for hybrid vigor utilization and hybrid seed production. Although a large number of GMS genes have been identified in plants, little is known about the roles of GDSL lipase members in anther and pollen development. Here, we report a maize GMS gene, ZmMs30, which encodes a novel type of GDSL lipase with diverged catalytic residues. Enzyme kinetics and activity assays show that ZmMs30 has lipase activity and prefers to substrates with a short carbon chain. ZmMs30 is specifically expressed in maize anthers during stages 7-9. Loss of ZmMs30 function resulted in defective anther cuticle, irregular foot layer of pollen exine, and complete male sterility. Cytological and lipidomics analyses demonstrate that ZmMs30 is crucial for the aliphatic metabolic pathway required for pollen exine formation and anther cuticle development. Furthermore, we found that male sterility caused by loss of ZmMs30 function was stable in various inbred lines with different genetic background, and that it didn't show any negative effect on maize heterosis and production, suggesting that ZmMs30 is valuable for crossbreeding and hybrid seed production. We then developed a new multi-control sterility system using ZmMs30 and its mutant line, and demonstrated it is feasible for generating desirable GMS lines and valu. able for hybrid maize seed production. Taken together, our study sheds new light on the mechanisms of anther and pollen development, and provides a valuable male-sterility system for hybrid breeding maize. 展开更多
关键词 ZmMs30f gdsl LIPASE multi-control STERILITY (MCS) system hybrid SEED production MAIZE
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蒙古冰草GDSL酯酶/脂肪酶基因的序列及表达分析
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作者 闫秀秀 范菠菠 +5 位作者 张学峰 于卓 房永雨 吴婧 赵彦 马艳红 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期41-56,共16页
为挖掘蒙古冰草(Agropyron mongolicum)中的GDSL酯酶/脂肪酶基因,以干旱胁迫下蒙古冰草转录组测序得到的Unigenes为对象,利用生物信息学方法对蒙古冰草GDSL脂肪酶基因进行理化性质、亚细胞定位、同源性以及系统发育进化分析,同时对不同... 为挖掘蒙古冰草(Agropyron mongolicum)中的GDSL酯酶/脂肪酶基因,以干旱胁迫下蒙古冰草转录组测序得到的Unigenes为对象,利用生物信息学方法对蒙古冰草GDSL脂肪酶基因进行理化性质、亚细胞定位、同源性以及系统发育进化分析,同时对不同干旱处理条件下的GDSL脂肪酶基因进行表达分析。结果表明:蒙古冰草中52个GDSL脂肪酶基因,蛋白质分子量在6.80~44.77 kU,66~420个氨基酸,pI 4.27~9.42;52个蒙古冰草GDSL脂肪酶基因亚细胞定位预测显示细胞外基质、叶绿体、细胞核、细胞质、细胞膜、细胞壁均有分布;将其与13个已知具有抗旱功能的GDSL脂肪酶基因进行同源性对比及进化树构建,蒙古冰草GDSL脂肪酶基因与水稻、大麦、拟南芥、木豆、大豆、蜡梅、辣椒的GDSL脂肪酶基因均有较高相似性。在干旱处理0.5、1.0、2.0、3.0、5.0、7.0 d及复水1.0 d,与对照(CK)相比,14个基因呈显著下调表达,38个基因呈现为上调表达。对6个蒙古冰草GDSL脂肪酶蛋白跨膜及信号肽和磷酸化预测结果显示,DN26944_c0_g1属于跨膜蛋白;DN26944_c0_g1、DN14677_c0_g2、DN29240_c0_g2这3个蛋白均含有信号肽,推测其为外分泌蛋白。通过磷酸化位点分析发现DN26944_c0_g1、DN14677_c0_g2、DN29240_c0_g2、DN17531_c0_g6、DN29240_c0_g3、DN20405_c0_g1蛋白磷酸化程度总体不高,其中DN26944_c0_g1最高有34处磷酸位点,DN14677_c0_g2最低有7处磷酸位点。模拟干旱处理下蒙古冰草DN26944_c0_g1、DN14677_c0_g2、DN29240_c0_g2、DN17531_c0_g6、DN29240_c0_g3、DN20405_c0_g1这6个基因的表达量均显著高于对照组(CK),说明这6个酯酶/脂肪酶基因在蒙古冰草干旱胁迫中起正调控作用。 展开更多
关键词 蒙古冰草 gdsl酯酶/脂肪酶基因 生物信息学分析 抗旱
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基于部分采样点辅助校正OFDM信号的准无损压缩算法
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作者 戴宪华 李妍 +1 位作者 余宝贤 苏冬日 《数据采集与处理》 CSCD 北大核心 2015年第3期504-510,共7页
传统的正交频分复用(Orthogonal frequency division multiplexing,OFDM)信号压缩算法由于低的压缩比和低的信号量化误差比(Signal to quantization-error ratio,SQR)造成较高的误码率,无法满足OFDM系统的需求。为了实现高的压缩比和低... 传统的正交频分复用(Orthogonal frequency division multiplexing,OFDM)信号压缩算法由于低的压缩比和低的信号量化误差比(Signal to quantization-error ratio,SQR)造成较高的误码率,无法满足OFDM系统的需求。为了实现高的压缩比和低的误码率,提出了一种联合削峰尾插(Clipping with tail plug,CTP)技术、几何级数压扩(Geometric series companding,GSC)技术及部分采样点校正(Partial sample calibration,PSC)技术的准无损压缩算法。计算机仿真结果表明,对于4096-正交幅度调制(Quadrature amplitude modulation,QAM)的OFDM信号,压缩比最高可达1.86∶1,误码率低于10-7,量化误差对应的平均SQR高达70dB,因而能够很好地满足光纤到分配点+千兆数字用户线路(Fiber to the distribution point+GCga digital subscriber line,FTTdp+GDSL)系统的需求。 展开更多
关键词 准无损压缩 几何级数压扩 部分采样点校正 削峰尾插 FTTdp+gdsl系统
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