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加性-显性-母体效应及GE互作效应遗传模型的模拟比较(英文)
被引量:
5
1
作者
阿布德拉芒
朱军
《生物数学学报》
CSCD
2002年第2期208-214,共7页
运用蒙特卡罗方法比较了8个亲本正反交的加性-显性-母体效应的全模型及缩减模型.当σM2和σME2存在时,检测各项遗传方差分量的功效高达97%以上.如果存在σM2和σME2而缩减模型未包括这两项效应时,除显性效应以外的各项方差分量都被高估...
运用蒙特卡罗方法比较了8个亲本正反交的加性-显性-母体效应的全模型及缩减模型.当σM2和σME2存在时,检测各项遗传方差分量的功效高达97%以上.如果存在σM2和σME2而缩减模型未包括这两项效应时,除显性效应以外的各项方差分量都被高估.对于加性-显性模型,如果忽略了基因型与环境互作,σε2和σA2将被高估.当母体效应和基因型与环境互作被忽略时,将显著地增加遗传效应预测值的方差.
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关键词
加性
显性
母体效应
ge互作
效应
遗传模型
模拟比较
遗传主差分量
遗传效应
预测
混合模型方法
蒙特卡罗模拟
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职称材料
利用CSSL和BIL群体分析稻米垩白率QTL及互作效应
被引量:
9
2
作者
周立军
刘喜
+5 位作者
江玲
郑蕾娜
陈亮明
刘世家
翟虎渠
万建民
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期1129-1135,共7页
【目的】分析稻米垩白率加性效应、上位性效应及其环境互作效应,探讨稻米垩白率的遗传特点和不同群体检测QTL的效率。【方法】利用由粳稻品种越光和籼稻品种Kasalath杂交衍生的BIL群体和以越光为背景、Kasalath为供体的CSSL群体,对2005...
【目的】分析稻米垩白率加性效应、上位性效应及其环境互作效应,探讨稻米垩白率的遗传特点和不同群体检测QTL的效率。【方法】利用由粳稻品种越光和籼稻品种Kasalath杂交衍生的BIL群体和以越光为背景、Kasalath为供体的CSSL群体,对2005年和2006年南京的稻米垩白率QTL及其互作效应进行了分析。【结果】CSSL群体检测到5个垩白率QTL和2对具有上位性效应的QTL;BIL群体检测到3个QTL和4对具有上位性效应的QTL。其中,qPGWC-6a在2个群体中重复出现,1对具有上位性效应的QTL在CSSL群体中2年均被检测到,在BIL群体中,所有QTL与环境存在显著互作(P<0.01)。在第3和4染色体上检测到2个新的垩白率QTL。【结论】上位性效应和加性效应在垩白率遗传中同样重要。垩白率QTL和具有上位性效应的QTL与环境的互作普遍存在,但效应小于相应的加性效应和上位性效应。利用不同群体分析垩白率QTL,有利于全面揭示稻米垩白率的遗传互作网络。
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关键词
稻米
垩白率
QTL
上位性
ge互作
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职称材料
题名
加性-显性-母体效应及GE互作效应遗传模型的模拟比较(英文)
被引量:
5
1
作者
阿布德拉芒
朱军
机构
浙江大学生物信息学研究所
出处
《生物数学学报》
CSCD
2002年第2期208-214,共7页
文摘
运用蒙特卡罗方法比较了8个亲本正反交的加性-显性-母体效应的全模型及缩减模型.当σM2和σME2存在时,检测各项遗传方差分量的功效高达97%以上.如果存在σM2和σME2而缩减模型未包括这两项效应时,除显性效应以外的各项方差分量都被高估.对于加性-显性模型,如果忽略了基因型与环境互作,σε2和σA2将被高估.当母体效应和基因型与环境互作被忽略时,将显著地增加遗传效应预测值的方差.
关键词
加性
显性
母体效应
ge互作
效应
遗传模型
模拟比较
遗传主差分量
遗传效应
预测
混合模型方法
蒙特卡罗模拟
Keywords
ge
netic variance component
Predicted
ge
netic effects
Mixed model approach
Monte Carlo simulation
分类号
Q348 [生物学—遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
利用CSSL和BIL群体分析稻米垩白率QTL及互作效应
被引量:
9
2
作者
周立军
刘喜
江玲
郑蕾娜
陈亮明
刘世家
翟虎渠
万建民
机构
南京农业大学农学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室/江苏省植物基因工程技术研究中心
中国农业科学院
中国农业科学院作物科学研究所
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第4期1129-1135,共7页
基金
国家自然科学基金项目(30500315)
国家高技术研究发展计划项目(2006AA100101,2006AA10Z1B1)
+3 种基金
国家科技支撑计划项目(2006BAD01A01)
江苏省高技术招标项目(BG2006301)
江苏省农业种质资源基因库项目(sx(2007)g02)
高等学校学科创新引智计划(B08025)
文摘
【目的】分析稻米垩白率加性效应、上位性效应及其环境互作效应,探讨稻米垩白率的遗传特点和不同群体检测QTL的效率。【方法】利用由粳稻品种越光和籼稻品种Kasalath杂交衍生的BIL群体和以越光为背景、Kasalath为供体的CSSL群体,对2005年和2006年南京的稻米垩白率QTL及其互作效应进行了分析。【结果】CSSL群体检测到5个垩白率QTL和2对具有上位性效应的QTL;BIL群体检测到3个QTL和4对具有上位性效应的QTL。其中,qPGWC-6a在2个群体中重复出现,1对具有上位性效应的QTL在CSSL群体中2年均被检测到,在BIL群体中,所有QTL与环境存在显著互作(P<0.01)。在第3和4染色体上检测到2个新的垩白率QTL。【结论】上位性效应和加性效应在垩白率遗传中同样重要。垩白率QTL和具有上位性效应的QTL与环境的互作普遍存在,但效应小于相应的加性效应和上位性效应。利用不同群体分析垩白率QTL,有利于全面揭示稻米垩白率的遗传互作网络。
关键词
稻米
垩白率
QTL
上位性
ge互作
Keywords
rice
percenta
ge
of grains with chalkiness (PGWC)
QTL
epistasis
ge
notype × environment (
ge
)
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
加性-显性-母体效应及GE互作效应遗传模型的模拟比较(英文)
阿布德拉芒
朱军
《生物数学学报》
CSCD
2002
5
下载PDF
职称材料
2
利用CSSL和BIL群体分析稻米垩白率QTL及互作效应
周立军
刘喜
江玲
郑蕾娜
陈亮明
刘世家
翟虎渠
万建民
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2009
9
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
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