期刊文献+
共找到2,493篇文章
< 1 2 125 >
每页显示 20 50 100
Optimization of Multiplex PCR Systems for Gene-chip Detection of Mutations in Exons in cTnI Gene Associated with FHCM
1
作者 Nongyue He Yuanying Zhang Jinan Zhang 《稀有金属材料与工程》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2006年第A03期270-273,共4页
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is one of the diseases damaging people health most badly and some mutations of exons in cardiac troponin I (cTnI) gene are closely associated with family hypertrophic cardiomyopathy (... Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is one of the diseases damaging people health most badly and some mutations of exons in cardiac troponin I (cTnI) gene are closely associated with family hypertrophic cardiomyopathy (FHCM).A microarray was fabricated to screen mutations in exons 3,5,7,and 8 in cTnI gene.Primers were designed for the PCR (polymerase chain reaction) to amplify the target DNA fragments from fresh blood samples.In order to simplify the PCR process,multiplex PCR technology was investigated in detail.The concentration of Mg^(2+) played an important role in multiplex PCR process,a properly low concentration of Mg^(2+) submitted a better speciality of PCR products.The speciality was also favored when the annealing temperature was reasonably enhanced and 64℃is the optimal annealing temperature for the multiplex PCR systems.When applying the fabricated gene-chip to detect the target fragments from PCR mixture,the signal intensity sequence is in accordance with that from theoretic estimate. 展开更多
关键词 hypertrophic cardiomyopathy(HCM) gene-chip multiplex PCR mutation HYBRIDIZATION
下载PDF
甲真菌病的真菌学检测方法研究进展
2
作者 曹冰莹 廖德君 +1 位作者 杨茜 杨政敏 《皮肤性病诊疗学杂志》 2024年第2期129-135,共7页
目前甲真菌病被认为是全球分布的主要公共卫生问题之一。甲真菌病的诊断依靠典型临床表现、真菌学检查(真菌镜检和真菌培养)以及甲病理检查。传统的真菌学检测方法在精准快速地鉴定真菌种类方面存在较大困难。免疫学诊断、基于PCR的分... 目前甲真菌病被认为是全球分布的主要公共卫生问题之一。甲真菌病的诊断依靠典型临床表现、真菌学检查(真菌镜检和真菌培养)以及甲病理检查。传统的真菌学检测方法在精准快速地鉴定真菌种类方面存在较大困难。免疫学诊断、基于PCR的分子鉴定、基因芯片技术、LAMP、MALDI-TOF MS及光谱学鉴定等新兴诊断技术具有快速、简便、精准的优点,能够克服传统诊断技术的局限性。本文阐述甲真菌病真菌学检测方法的研究进展,旨在发现和总结传统诊断方法与新兴诊断方法的优缺点,以便新兴检测方法的研究与发展。 展开更多
关键词 甲真菌病 真菌 检测方法 基因芯片
下载PDF
基于高世代姊妹系发掘玉米穗长性状QTL及候选基因
3
作者 孙瑞东 李艺萌 +6 位作者 黄然 刘颖 周筱航 丁明阳 刘新航 吕香玲 李凤海 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期270-278,共9页
玉米穗长通过影响穗粒数,进而影响产量,是育种改良的重要目标性状之一。发掘与穗长性状相关QTL和基因对穗长性状的遗传改良具有重要意义。本研究以一对穗长具有显著差异的高世代姊妹系为亲本,构建F2群体并自交得到F2:3,利用Maize6H-60K... 玉米穗长通过影响穗粒数,进而影响产量,是育种改良的重要目标性状之一。发掘与穗长性状相关QTL和基因对穗长性状的遗传改良具有重要意义。本研究以一对穗长具有显著差异的高世代姊妹系为亲本,构建F2群体并自交得到F2:3,利用Maize6H-60K基因芯片分别对亲本及F2群体进行基因型分析,并通过ICIM、GCIM和dQTGseq 3种方法对F2和F2:3群体的穗长进行QTL定位。结果表明,3种方法共定位到7个与穗长相关QTL位点和43个QTNs,解释了2.04%~10.24%的表型变异。交叉分析不同方法得出的定位结果,在6号染色体上发现一个调控穗长的稳定QTL qEL6.01。根据定位区间内基因注释的结果,并结合参考基因的表达谱数据,共筛选出5个在雌穗中表达的候选基因:Zm00001d035514、Zm00001d035526、Zm00001d035537、Zm00001d035553和Zm00001d035535。本研究结果为玉米穗长基因的克隆及育种改良奠定了基础。 展开更多
关键词 玉米 穗长性状 QTL 基因芯片 候选基因
下载PDF
视觉发育关键期单眼形觉剥夺弱视大鼠视皮层的差异表达基因及其功能分析
4
作者 李佳芹 毕爱玲 毕宏生 《山东医药》 CAS 2024年第7期6-11,共6页
目的筛选视觉发育关键期单眼形觉剥夺弱视大鼠视皮层的差异表达基因,并分析其功能。方法选取出生13 d尚未睁眼SD大鼠24只,按随机数字表法均分为空白对照组、模型组。模型组进行右侧眼睑缝合建立单眼形觉剥夺弱视模型。出生60 d,麻醉处... 目的筛选视觉发育关键期单眼形觉剥夺弱视大鼠视皮层的差异表达基因,并分析其功能。方法选取出生13 d尚未睁眼SD大鼠24只,按随机数字表法均分为空白对照组、模型组。模型组进行右侧眼睑缝合建立单眼形觉剥夺弱视模型。出生60 d,麻醉处死大鼠,取其脑组织。用基因芯片实验筛选差异表达基因,用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对差异表达基因进行富集分析。结果与空白对照组比较,模型组左侧视皮层差异表达基因共163个,右侧视皮层差异表达基因数共38个,共有差异表达基因16个。GO富集分析显示,左侧视皮层差异表达基因富集程度大于2的涉及22个条目,右侧视皮层差异表达基因富集程度大于2的涉及19个条目。KEGG富集分析显示,模型组差异表达基因主要功能集中于胚胎背腹轴线形成、光信号传导通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、核苷酸结合寡聚化结构域(NOD)样受体信号通路、神经营养蛋白信号通路、神经递质配体-受体相互作用信号通路等。其中MAPK1、鸟氨酸结合蛋白Gα2(GNAT2)基因异常表达可能与视功能异常改变有关,MAPK1基因主要功能集中在胚胎背腹轴线形成、MAPK信号通路、NOD样受体信号通路、神经营养蛋白信号通路、神经配体-受体相互作用信号通路,GNAT2基因主要功能为光信号传导通路。结论视觉发育关键期进行单眼形觉剥夺可造成大鼠大脑视皮层基因异常表达,并引起其调控的信号通路相关基因表达改变,造成视觉信号传导功能异常;MAPK1、GNAT2基因异常表达可能是弱视发病的生物学机制之一。 展开更多
关键词 弱视 形觉剥夺 视觉发育关键期 基因芯片技术 MAPK1基因 GNAT2基因
下载PDF
快速定性检测人呼吸道样本中冠状病毒基因芯片的制备方法及其效果评价
5
作者 郑皓宇 郑文学 +6 位作者 谷奕诺 安一鸣 张嘉琪 张雨涵 张姗姗 孟晓婷 王放 《国际老年医学杂志》 2024年第2期135-141,共7页
目的探讨冠状病毒基因芯片的研制方法,建立一种快速定性检测人咽拭子、痰液、肺泡灌洗液等呼吸道感染样本中的7种冠状病毒和2种流感病毒核酸的方法。方法根据互联网公布的10种呼吸道感染病毒的基因序列,设计了相应的引物和探针序列,经... 目的探讨冠状病毒基因芯片的研制方法,建立一种快速定性检测人咽拭子、痰液、肺泡灌洗液等呼吸道感染样本中的7种冠状病毒和2种流感病毒核酸的方法。方法根据互联网公布的10种呼吸道感染病毒的基因序列,设计了相应的引物和探针序列,经琼脂糖凝胶电泳筛选验证后,将探针点样于醛基修饰基片,完成了检测芯片制作。结果将聚合酶链式反应扩增产物用10倍梯度稀释法稀释后进行基因芯片检测,结果表明可形成杂交斑点的最低检测浓度为103copies/mL。结论研制的冠状病毒基因芯片具有良好的特异度和灵敏度,可同时对SARS-CoV-2及其他呼吸道病毒同时进行高通量快速检测。 展开更多
关键词 冠状病毒 流感病毒 基因芯片
下载PDF
基于GEO基因芯片联合网络药理学及分子对接技术探讨参苓脾喜汤治疗慢性胃炎、胃黏膜上皮内瘤变、胃早期癌作用机制
6
作者 张玉佩 唐伟 《中国中医药图书情报杂志》 2024年第2期57-62,共6页
目的 基于GEO基因芯片、网络药理学及分子对接技术探讨参苓脾喜汤防治慢性胃炎(CG)、胃黏膜上皮内瘤变(GIN)、胃早期癌(EGC)的作用机制。方法 从GEO数据库下载含CG、GIN、EGC基因芯片GSE130823,使用R4.1.1筛选共同差异表达基因。利用TC... 目的 基于GEO基因芯片、网络药理学及分子对接技术探讨参苓脾喜汤防治慢性胃炎(CG)、胃黏膜上皮内瘤变(GIN)、胃早期癌(EGC)的作用机制。方法 从GEO数据库下载含CG、GIN、EGC基因芯片GSE130823,使用R4.1.1筛选共同差异表达基因。利用TCMSP数据库筛选参苓脾喜汤活性成分及对应靶点,使用R4.1.1对共同表达基因与药物靶点取交集,通过Cytoscape3.9.1软件构建中药-活性成分-靶点网络,并通过STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络并进行拓扑分析,以筛选核心靶点,使用R4.1.1对交集基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。最后将排名靠前的药物活性成分与核心靶点蛋白进行分子对接验证。结果 共筛选出1 115个差异表达基因,参苓脾喜汤活性成分119种,靶点247个,主要活性成分包括槲皮素、豆甾醇、木犀草素等。预测得到参苓脾喜汤治疗CG、GIN、EGC潜在作用靶点22个,包括CHRM3、AR、ADRB2、DPP4等。GO功能和KEGG富集分析结果显示,参苓脾喜汤治疗CG、GIN、EGC主要涉及对cAMP、IL-17、TNF、离子跨膜转运蛋白活性的调节、钙信号通路等方面。分子对接结果显示,木犀草素与ALB、AR、DPP4有较强结合能力,槲皮素与ALB、DPP4有较强结合能力,豆甾醇与AR有较强结合能力。结论 参苓脾喜汤中多种活性成分可能通过cAMP、IL-17、TNF等信号通路,调控ALB、AR、DPP4、CYP3A4等靶点治疗CG、GIN、EGC。 展开更多
关键词 GEO基因芯片 慢性胃炎 胃黏膜上皮内瘤变 胃早期癌 参苓脾喜汤 网络药理学 分子对接
下载PDF
秸秆覆盖休耕对土壤C、N、P循环功能基因的影响
7
作者 王根林 段衍 +4 位作者 刘峥宇 王译阳 刘沣漫 孙磊 李玉梅 《农业资源与环境学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期325-332,共8页
为了探索一种适于坡耕地的基于种养结合的耕作方式,采用田间试验结合基因芯片研究方法,探究了秸秆覆盖休耕技术[包括隔年秸秆覆盖休耕+旋耕(RF)、2年旋耕+1年秸秆覆盖休耕(RRF)]与常规耕作(CRT,秸秆移除后旋耕)对土壤C、N、P循环的影响... 为了探索一种适于坡耕地的基于种养结合的耕作方式,采用田间试验结合基因芯片研究方法,探究了秸秆覆盖休耕技术[包括隔年秸秆覆盖休耕+旋耕(RF)、2年旋耕+1年秸秆覆盖休耕(RRF)]与常规耕作(CRT,秸秆移除后旋耕)对土壤C、N、P循环的影响。结果表明:外源C的投入激发了土壤微生物对有机物料的降解潜力,无论是RF处理,还是RRF处理,参与土壤C循环的降解功能基因(acsE、xylA和rbcL)丰度均有一定程度的增加,xylA基因平均相对丰度较CRT处理增加43.12%,而秸秆不还田的CRT处理中参与C同化基因(acsA)的丰度显著增加,平均增加33.03%;CRT处理参与N循环基因的丰度降低,而秸秆覆盖还田促进了土壤中N从NH4+-N向NO3--N的转化,gdh基因丰度增加;秸秆覆盖还田后土壤活性P的积累增强,碱性磷酸酶基因(phoD)丰度较CRT处理平均增加59.57%,phoD与速效P和phnk基因丰度呈显著正相关。研究表明,秸秆覆盖还田促进了土壤微生物C、N、P周转,进而促进外源有机C的转化和土壤有机C的积累,短期内秸秆当季覆盖休耕与上季覆盖休耕处理间差异不大。研究结果为东北黑土区坡耕地实施保护性耕作和防控土壤侵蚀提供了科学依据。 展开更多
关键词 秸秆还田 基因芯片 土壤元素循环 微生物功能 耕作
下载PDF
广西壮族自治区胸科医院不同年龄和性别肺泡灌洗液分枝杆菌菌种分布特征
8
作者 蓝吉慧 唐柳生 +3 位作者 雷振 董捷 覃善芳 黄丽玲 《中国当代医药》 CAS 2024年第16期122-125,共4页
目的通过微阵列基因芯片法检测肺泡灌洗液分枝杆菌,了解广西壮族自治区胸科医院肺部感染分枝杆菌患者不同年龄和性别的菌种分布特征。方法收集2018年1月至2022年12月广西壮族自治区胸科医院收治的肺部感染患者的肺泡灌洗液通过微阵列基... 目的通过微阵列基因芯片法检测肺泡灌洗液分枝杆菌,了解广西壮族自治区胸科医院肺部感染分枝杆菌患者不同年龄和性别的菌种分布特征。方法收集2018年1月至2022年12月广西壮族自治区胸科医院收治的肺部感染患者的肺泡灌洗液通过微阵列基因芯片法检测的结果,统计就诊患者的资料,分析其分枝杆菌的分布特征。结果949份灌洗液检测出分枝杆菌348例,检测率为36.7%(348/949),其中结核分枝杆菌复合群占83.6%(291/348),男性检出率为33.2%(203/611),女性检出率为26.0%(88/338),男女间检出率比较,差异有统计学意义(χ_(2)=5.29,P<0.05),非结核分枝杆菌(NTM)占16.4%(57/348),男性检出率为5.1%(31/611),女性检出率为7.7%(26/338),男女间检出率比较,差异无统计学意义(χ_(2)=2.64,P>0.05)。检测出的NTM中,胞内分枝杆菌占35.1%(20/57),龟/脓肿分枝杆菌占33.3%(19/57),鸟分枝杆菌占19.3%(11/57),戈登分枝杆菌占5.3%(3/57),蟾蜍分枝杆菌占5.3%(3/57),浅黄分枝杆菌占1.7%(1/57)。各年龄段的肺部感染患者中,结核分枝杆菌复合群的检出率比较,差异无统计学意义(χ_(2)=10.8,P>0.05),各年龄段的肺部感染患者中,NTM的检出率比较,差异有统计学意义(χ_(2)=18.7,P<0.01)。结论广西壮族自治区胸科院肺部感染分枝杆菌以结核分枝杆菌复合群为主,NTM主要的流行菌株为胞内分枝杆菌、龟/脓肿分枝杆菌和鸟分枝杆菌,结核分枝杆菌复合群的肺部感染患者不存在年龄差异,但存在性别差异,NTM的肺部感染患者不存在性别差异,但存在年龄差异,有老龄化趋势,NTM菌种具有多样化。 展开更多
关键词 微阵列基因芯片法 分枝杆菌 肺泡灌洗液 检出率
下载PDF
苗药组方熏蒸疗法对家兔早期膝骨性关节炎模型的差异基因分析及聚类分析
9
作者 张力文 王兴桂 +1 位作者 李春 庞平 《西部中医药》 2024年第2期20-26,共7页
目的:探讨苗药组方熏蒸疗法对家兔早期膝骨性关节炎(knee osteoarthriti,KOA)模型差异表达基因进行层次聚类分析的意义。方法:将新西兰兔40只随机分为4组,空白对照组、模型对照组、苗药熏蒸组、清水对照组,每组10只。采用木瓜蛋白酶在... 目的:探讨苗药组方熏蒸疗法对家兔早期膝骨性关节炎(knee osteoarthriti,KOA)模型差异表达基因进行层次聚类分析的意义。方法:将新西兰兔40只随机分为4组,空白对照组、模型对照组、苗药熏蒸组、清水对照组,每组10只。采用木瓜蛋白酶在兔膝关节腔内注射的方法复制早期KOA模型,造模成功后用苗药熏蒸疗法治疗20天,运用基因芯片检测技术对软骨组织的基因表达谱进行检测,最后将得到的原始数据通过RMA算法进行预处理,通过相关基因分析软件进行差异基因(difference gene,DEG)分析,并对其基因表达谱进行聚类分析。结果:DEG分析显示,模型对照组与空白对照组比较,差异显著基因有827个,上调435个,下调392个;苗药熏蒸组与模型对照组比较,差异显著基因有208个,上调112个,下调96个;清水熏蒸组与模型对照组比较,差异显著基因有152个,上调93个,下调59个。聚类分析显示,每个实验组的标本基本为一类,每个标本重复性好,每个实验组与对照组比较,它们的基因表达各有特点。结论:基因芯片检测可以发现苗药熏蒸疗法治疗早期KOA的差异表达基因,而聚类分析发现其相关基因的改变及其基因表达的特殊性。 展开更多
关键词 骨性关节炎 基因芯片技术 苗药熏蒸疗法 差异表达 信号通路
下载PDF
云南水稻种质资源的遗传多样性分析 被引量:1
10
作者 邓伟 吕莹 +14 位作者 董阳均 徐雨然 杨华涛 张锦文 张建华 奎丽梅 涂建 相罕章 管俊娇 董维 谷安宇 安华 杨丽萍 张笑 李小林 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期624-635,共12页
利用基因芯片GSR40K评估了135份来自云南不同海拔地区水稻种质资源的遗传多样性和群体结构。结果显示云南不同海拔地区水稻种质资源具有较丰富的遗传多样性,利用SNP标记进行籼粳特性分型,将种质资源分为籼稻类型、偏籼类型、中间类型、... 利用基因芯片GSR40K评估了135份来自云南不同海拔地区水稻种质资源的遗传多样性和群体结构。结果显示云南不同海拔地区水稻种质资源具有较丰富的遗传多样性,利用SNP标记进行籼粳特性分型,将种质资源分为籼稻类型、偏籼类型、中间类型、粳稻类型和偏粳类型;利用单倍型标记和功能标记鉴定了与育种相关的82个基因,结果表明135份材料都含有非落粒性相关的基因,接近70%的水稻品种含有稻瘟病抗性基因,含有抗虫基因及香味基因的品种数量较少;利用聚类和主成分分析将135份材料分成7个亚群,通过遗传分化指数GST值评估每一个标记位点在7个亚群之间的分化程度,结果表明7个亚群间存在高度的遗传分化,且135份水稻品种基因组区域上至少有0.09%的区域是完全不一样的,而有0.08%的区域是频繁交流和固定的,因此不同亚群间的基因交流频率极低。利用亚群间海拔高度的差异,分析群体间的差异基因组区域,推测可能是与海拔适应性相关。本研究结果为云南地方水稻资源的有效保护和高效利用提供科学依据。 展开更多
关键词 遗传多样性 群体结构 基因芯片 SNP标记 遗传分化
下载PDF
肺泡灌洗液改良抗酸染色和基因芯片法在肺结核中的诊断价值 被引量:2
11
作者 范励侦 熊江琴 +5 位作者 王雪梅 虞佳 周松林 李杰 宋军福 熊国亮 《中国当代医药》 CAS 2023年第1期63-66,共4页
目的探讨肺泡灌洗液(BALF)改良抗酸染色和基因芯片法诊断肺结核的价值。方法选取2017年1月至2020年12月江西省胸科医院收治的150例疑似肺结核患者作为研究对象,患者均行肺泡灌洗液改良抗酸染色和基因芯片法进行诊断,观察两者对肺结核的... 目的探讨肺泡灌洗液(BALF)改良抗酸染色和基因芯片法诊断肺结核的价值。方法选取2017年1月至2020年12月江西省胸科医院收治的150例疑似肺结核患者作为研究对象,患者均行肺泡灌洗液改良抗酸染色和基因芯片法进行诊断,观察两者对肺结核的诊断价值。结果150例疑似肺结核患者中,最终诊断肺结核105例,非肺结核45例,以临床最终诊断为金标准,肺泡灌洗液改良抗酸染色灵敏度、特异度、准确度、阳性预测值、阴性预测值分别为63.81%、95.56%、73.33%、97.10%、53.09%;肺泡灌洗液基因芯片法灵敏度、特异度、准确度、阳性预测值、阴性预测值分别为80.00%、97.78%、85.33%、98.82%、67.69%;肺泡灌洗液基因芯片法检测结核分枝杆菌的灵敏度和准确度高于改良抗酸染色,差异有统计学意义(P<0.05)。结论肺泡灌洗液基因芯片和改良抗酸染色法诊断肺结核具有良好价值,相比改良抗酸染色法基因芯片法可以更灵敏、准确地诊断肺结核,值得临床借鉴。 展开更多
关键词 肺泡灌洗液 改良抗酸染色 基因芯片 肺结核
下载PDF
基于网络药理学探究栀子川芎胶囊防治动脉粥样硬化的作用机制 被引量:1
12
作者 吴立旗 盛松 +1 位作者 周庆兵 徐凤芹 《中西医结合心脑血管病杂志》 2023年第14期2513-2522,共10页
目的:采用网络药理学、基因芯片分子对接方法探讨栀子川芎胶囊防治动脉粥样硬化(AS)的作用机制。方法:利用14个数据库和基因芯片等预测栀子川芎胶囊防治AS的靶点,构建成分-治疗靶点(C-T)网络、治疗靶点网络(T-D),并计算网络贡献指数、... 目的:采用网络药理学、基因芯片分子对接方法探讨栀子川芎胶囊防治动脉粥样硬化(AS)的作用机制。方法:利用14个数据库和基因芯片等预测栀子川芎胶囊防治AS的靶点,构建成分-治疗靶点(C-T)网络、治疗靶点网络(T-D),并计算网络贡献指数、度值、中介中心性、接近中心性和平均最短路径筛选C-T和T-D网络主要核心成分和靶点。对治疗靶点进行富集分析,最后对核心成分和核心靶点做分子对接验证。结果:预测得到治疗靶点162个,根据网络贡献指数、度值、中介中心性、接近中心性和平均最短路径筛选C-T和T-D网络得到叶酸和槲皮素2个核心成分、13个核心靶点。富集分析显示栀子川芎胶囊从炎症反应、氧化应激、脂质和营养物质代谢等多方面防治AS,并且治疗靶点富集于全身多个组织器官。分子对接验证结果表明核心成分与核心靶点间具有较强的结合力。结论:栀子川芎胶囊防治AS具有多成分、多靶点的特点,可以从多层次、多角度防治AS。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 栀子川芎胶囊 网络药理学 基因芯片 分子对接 靶点 富集分析
下载PDF
基于芯片数据估计不同方法对槐猪近交系数的影响
13
作者 韩云珍 阳文攀 +9 位作者 洪渊 龙毅 刘相杰 范小萍 李文静 邓政 刘鸣慧 郑素梅 阮国荣 丁能水 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期947-955,共9页
旨在选取适用的方法评估槐猪群体的近交情况。本试验采用“中芯一号”育种芯片分别计算Fhom1、Fhom2、Fvan1、Fvan2和Fyang来进行247头槐猪(300日龄)个体近交系数的估计,探究SNP数目对近交估计值的影响以及不同估计方法之间的相关性。... 旨在选取适用的方法评估槐猪群体的近交情况。本试验采用“中芯一号”育种芯片分别计算Fhom1、Fhom2、Fvan1、Fvan2和Fyang来进行247头槐猪(300日龄)个体近交系数的估计,探究SNP数目对近交估计值的影响以及不同估计方法之间的相关性。结果发现,随着SNP数目增加,近交系数Fhom1、Fhom2、Fvan1和Fyang的极差逐渐减少,当SNP数目达到10000时近交系数趋于稳定,与质控后的31545个SNPs计算的近交系数接近。Fhom1、Fhom2、Fvan1、Fvan2和Fyang的值分别为-0.2165~0.3440、-0.3548~0.3217、-0.3228~0.8921、-0.2436~0.7909、-0.1894~0.5433。Froh1和Froh2的值分别为0.0087~0.4069和0.0022~0.4024。通过比较不同基因组近交系数Person相关与Spearman秩相关可知,Fhom1与Fhom2、Froh1、Froh5间有较强的正相关;Fvan2与Fvan1、Fyang间有较强的正相关;Froh1与Froh5间有较强的正相关;而Fhom2与Fvan1、Fvan2呈负相关。由于Froh的取值范围在0~1之间,与系谱近交系数相同,符合近交系数评估习惯;同时,Froh同Fhom、Fvan、Fyang等基因组近交系数评估方式有着一定的正相关,适用度高。SNP密度影响近交系数的评估,其数目与密度充足时,采用Froh进行基因组近交系数评估较为适宜,这可为评估地方猪的近交水平、防止近交衰退、优化选种选配方案提供有利的技术手段。 展开更多
关键词 槐猪 基因芯片 近交系数 相关性
下载PDF
针刺调控脑缺血再灌注损伤大鼠海马区环状RNA_009775表达的研究
14
作者 向静 江姗姗 +6 位作者 唐红 汪红娟 李展富 王瑶 谢灿明 田浩梅 陈楚淘 《湖南中医药大学学报》 CAS 2023年第10期1838-1845,共8页
目的研究针刺对脑缺血再灌注损伤(cerebral ischemia reperfusion injury,CIRI)大鼠海马区环状RNA_009775表达的影响,探索针刺对CIRI可能的作用机制。方法将39只SD大鼠随机分为假手术组、模型组、针刺组,每组13只。除假手术组外,其余两... 目的研究针刺对脑缺血再灌注损伤(cerebral ischemia reperfusion injury,CIRI)大鼠海马区环状RNA_009775表达的影响,探索针刺对CIRI可能的作用机制。方法将39只SD大鼠随机分为假手术组、模型组、针刺组,每组13只。除假手术组外,其余两组均采用线栓法制备CIRI模型。造模后,针刺组大鼠捆绑固定行针刺干预,间隔12 h进行1次,共7次;假手术组与模型组大鼠仅捆绑不针刺。Garcia评分法、TTC染色法评估针刺疗效;基因芯片技术筛选针刺组/模型组、模型组/假手术组核心共同差异表达circRNA;qRT-PCR法对芯片筛选结果进行验证;TargetScan软件预测核心circRNA的下游mi RNA及mRNA,构建核心circRNA的调控网络,并对m RNA进行基因本体功能富集分析;Western blot法验证神经元核抗原抗体(neuron specific nuclear protein,NEUN)表达量。结果干预后,与假手术组相比,模型组大鼠Garcia评分、NEUN和circRNA_009775表达量显著降低(P<0.01),脑梗死面积比显著升高(P<0.01);与模型组相比,针刺组脑梗死面积比显著降低(P<0.01),Garcia评分、NEUN和circRNA_009775表达量显著升高(P<0.05或P<0.01)。芯片筛选核心共同差异表达circRNA,经qRT-PCR验证circRNA_009775表达趋势与芯片结果一致,结合靶关系预测,构建了含有1个circRNA、12个miRNA、31个mRNA的调控网络。基因本体功能富集分析显示mRNA主要涉及神经系统发育、神经元生成等生物过程。结论针刺具有改善CIRI大鼠神经功能缺损、降低脑梗死面积、部分减轻海马区神经元损伤的作用,其机制可能与调控circRNA_009775介导的潜在调控网络、促进神经系统发育、神经元生成等生物过程有关。 展开更多
关键词 脑缺血再灌注损伤 针刺 海马区 环状RNA 基因芯片 神经元 督脉
下载PDF
兽用中药生物学检测方法与评价技术
15
作者 龚旭昊 李慧杰 +1 位作者 董玲玲 顾进华 《中国兽药杂志》 2023年第12期14-22,共9页
兽用中药化学成分复杂、药效物质基础研究薄弱,质量控制与评价一直是其研究的难点。现行的以理化检测方法为主的质量控制手段难以满足现代中兽医药发展的需要,难以很好地反映中药的有效性、安全性。本文阐述了显微鉴别、DNA条形码分子... 兽用中药化学成分复杂、药效物质基础研究薄弱,质量控制与评价一直是其研究的难点。现行的以理化检测方法为主的质量控制手段难以满足现代中兽医药发展的需要,难以很好地反映中药的有效性、安全性。本文阐述了显微鉴别、DNA条形码分子鉴定、基因芯片等生物学检测方法与评价技术在兽用中药质量控制中的应用价值,建议加强生物学相关检测及评价技术的研究和应用,弥补传统质控方法的不足,促进兽用中药质量控制水平的全面提升。 展开更多
关键词 兽用中药 显微鉴别 DNA条形码 基因芯片 生物评价
下载PDF
内蒙古自治区包头市儿童急性呼吸道感染病原体分布及流行特征
16
作者 赵常亮 蒋海燕 +1 位作者 吴玥 刘利军 《发育医学电子杂志》 2023年第2期119-124,共6页
目的分析内蒙古自治区包头市儿童急性呼吸道感染(acute respiratory infection,ARI)病原体分布及流行特征。方法将2016年7月1日至2021年6月30日包头市7家三级医院儿科40180例0~12岁ARI患儿的鼻咽拭子标本纳入研究,并按性别、年龄、季节... 目的分析内蒙古自治区包头市儿童急性呼吸道感染(acute respiratory infection,ARI)病原体分布及流行特征。方法将2016年7月1日至2021年6月30日包头市7家三级医院儿科40180例0~12岁ARI患儿的鼻咽拭子标本纳入研究,并按性别、年龄、季节、年份进行分组研究。采用高通量荧光基因芯片技术进行26种34个亚型病原体基因检测。统计学方法采用χ^(2)检验。结果40180例标本中,共32887例检出病原体,检出率为81.85%;其中16289例(49.53%)为单一病原体感染,11679例(35.51%)为双重感染,4919例(14.96%)为三重及以上感染。累计检出58993株病原体株,其中细菌检出率为66.69%(26798/40180);病毒检出率为71.89%(28884/40180)。细菌中前3位为肺炎链球菌、流感嗜血杆菌和溶血性链球菌。病毒中前3位为呼吸道合胞病毒、副流感病毒和腺病毒。男性22727例(56.56%),女性17453例(43.44%);病毒与细菌检出率男性均高于女性,差异有统计学意义(χ^(2)值分别为32.180、5.645,P值均<0.05)。年龄<3岁者占69.35%(27865/40180),其病毒、细菌、白色念珠菌、肺炎支原体检出率均高于≥3岁儿童(χ^(2)值分别为1505.948、4613.823、48.792、4361.449,P值均<0.001)。春季送检10858份(27.02%),夏季送检7048份(17.54%),秋季送检9765份(24.30%),冬季送检12509份(31.13%),除了肺炎克雷伯菌,其他病原体在不同季节的分布比较,差异均有统计学意义(P值均<0.05)。一年四季均以肺炎链球菌感染为主;在病毒感染中,春秋两季以副流感病毒为主,夏季以腺病毒为主,冬季以呼吸道合胞病毒为主。不同年份的病原体检出率比较,差异均有统计学意义(P值均<0.001)。2016年至2021年肺炎链球菌是感染占比最高的病原体。结论内蒙古自治区包头市0~12岁ARI患儿的病原体以病毒为主,其次为细菌、肺炎支原体。男性患儿发病率高于女性患儿;年龄<3岁者高于≥3岁者;冬春季高于夏秋季,医务工作者应高度重视。 展开更多
关键词 儿童 急性呼吸道感染 病原体分布 高通量荧光基因芯片 流行特征 肺炎链球菌
下载PDF
生物芯片技术在生物医学研究中的应用进展 被引量:6
17
作者 徐霁雪 张博文 +4 位作者 魏鸾葶 梁辰昊 吴玉婷 赵艳 李成 《实用临床医药杂志》 CAS 2023年第1期126-130,共5页
生物芯片技术源于Southern印迹技术,是一项基于生物分子间特异性相互作用原理的高通量的微量分析技术。从单纯地将生物组分集成以降低成本、提高效率,到结合微刻技术及多种微流结构对实验步骤进行优化、集成,再到对组织、器官自然状态... 生物芯片技术源于Southern印迹技术,是一项基于生物分子间特异性相互作用原理的高通量的微量分析技术。从单纯地将生物组分集成以降低成本、提高效率,到结合微刻技术及多种微流结构对实验步骤进行优化、集成,再到对组织、器官自然状态的模拟,生物芯片技术发展迅猛,且在医学生物研究领域展现出巨大的应用前景。本文简述生物芯片技术的概念、发展与分类,并对近年来不同类型生物芯片在生物医学研究中的最新应用进展进行综述。 展开更多
关键词 生物芯片 生物医学 基因芯片 器官芯片 组织芯片 细胞芯片
下载PDF
补阳还五汤抗动脉粥样硬化氧化应激的生信分析及实验研究 被引量:4
18
作者 龙清吟 傅馨莹 +6 位作者 李菀榆 李俊熙 刘竞泽 李艳军 谭维 胡聪 张伟 《湖南中医药大学学报》 CAS 2023年第4期668-676,共9页
目的基于基因芯片数据库(GEO)、网络药理学,结合ox-LDL诱导的大鼠主动脉血管内皮细胞氧化损伤模型进行实验验证,探究补阳还五汤(Buyang Huanwu Decoction,BYHWD)干预动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)氧化应激的作用及相关机制。方法通... 目的基于基因芯片数据库(GEO)、网络药理学,结合ox-LDL诱导的大鼠主动脉血管内皮细胞氧化损伤模型进行实验验证,探究补阳还五汤(Buyang Huanwu Decoction,BYHWD)干预动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)氧化应激的作用及相关机制。方法通过TCMSP、Herb数据库收集BYHWD中7味中药有效成分及靶点;从GEO数据库下载GSE19286、GSE2372数据集,鉴定AS差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs);通过GeneCards数据库获取氧化应激靶点;取交集筛选出BYHWD、DEGs、氧化应激共同靶点,进行PPI、GO和KEGG通路富集分析;在GSE19286、GSE2372的表达矩阵中,采用独立样本t检验进行核心靶点验证。结合GEO数据库和网络药理学结果进行体外实验验证,检测药物对细胞活性氧表达及ALB、PLG、F2、GC、PLK1基因表达的影响。结果筛选出972个中药靶点、9438个氧化应激靶点、173个DEGs,其中103个DEGs在AS组织样本中高表达、70个DEGs在AS组织样本中低表达;综合中药作用靶点、AS DEGs和氧化应激靶点,得到24个“AS潜在靶点”,进行GO和KEGG富集分析,结果提示“AS潜在靶点”主要通过调控细胞周期信号通路,卵母细胞成熟信号通路和细胞减数分裂信号通路等信号通路发挥作用。根据Degree算法对“AS潜在靶点”进行拓扑分析,鉴定出前5位“AS核心靶点”,据统计分析提示BYHWD可能可以通过上调ALB、PLG、F2、GC的表达、下调PLK1的表达起到干预AS氧化应激的作用。体外实验结果显示,BYHWD能抑制ox-LDL引起的活性氧(reactive oxygen species,ROS)增高;qPCR结果显示,ox-LDL刺激后的大鼠主动脉内皮细胞ALB、PLG、F2、GC基因表达均下降,PLK1基因表达上升,BYHWD含药血清干预后可以上调ALB、PLG、F2、GC基因的表达(P<0.01;P<0.05),下调PLK1的表达(P<0.05)。结论BYHWD干预AS氧化应激具有多成分、多靶点、多途径的作用特点,其机制可能与减少ROS表达,上调ALB、PLG、F2、GC基因、下调PLK1基因表达相关。 展开更多
关键词 补阳还五汤 动脉粥样硬化 氧化应激 基因芯片 网络药理学 分子对接
下载PDF
电针干预对单眼形觉剥夺弱视大鼠视皮层基因表达的影响 被引量:1
19
作者 路致远 毕爱玲 +2 位作者 吴建峰 毕宏生 卢秀珍 《现代中西医结合杂志》 CAS 2023年第5期590-595,632,共7页
目的运用基因芯片技术对形觉剥夺及电针干预后的弱视大鼠视皮层中差异表达基因进行生物学分析与关键基因的筛选,为弱视发生及电针治疗提供基因水平理论依据。方法将SD大鼠随机分为正常组、弱视组和电针组,每组5只。弱视组和电针组大鼠... 目的运用基因芯片技术对形觉剥夺及电针干预后的弱视大鼠视皮层中差异表达基因进行生物学分析与关键基因的筛选,为弱视发生及电针治疗提供基因水平理论依据。方法将SD大鼠随机分为正常组、弱视组和电针组,每组5只。弱视组和电针组大鼠采用单眼缝合方法造成右眼剥夺性弱视,术后30~60 d对电针组大鼠进行电针干预,每周至少干预6 d。电针干预结束后,处死各组大鼠并取左侧视皮层,使用基因芯片技术检测视皮层中基因表达情况。筛选各组中Fold Change≥2.0且P<0.05的差异基因进行统计,应用基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析差异基因的功能及其参与的生物学通路。结果与正常组比较,弱视组有135个基因下调,28个基因上调;与弱视组比较,电针组有52个基因上调,25个基因下调。GO富集分析发现弱视组和电针组产生的差异基因主要功能集中于蛋白翻译、蛋白转运、离子跨膜转运、细胞内外小分子结合、组织器官发育等。KEGG富集分析发现弱视组和电针组产生的差异基因共同参与ERBB信号通路、光信号传导、TLR信号通路、神经胶质细胞瘤等。PPI网络显示丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)和热休克蛋白A1A(HSPA1A)基因位于网络核心,二者的异常表达可能与弱视发生及电针干预密切相关,在神经突触可塑性过程中起重要作用。结论形觉剥夺弱视大鼠的视皮层在视觉发育过程中存在大量基因的异常表达,电针刺激可以拮抗部分基因的差异表达;由MAPK1和HSPA1A基因调控的代谢通路改变可能是弱视发病及电针治疗弱视的重要分子生物学机制。 展开更多
关键词 单眼形觉剥夺 电针 基因芯片 丝裂原活化蛋白激酶1 热休克蛋白A1A
下载PDF
广西地区先天性耳聋患者及其家系成员常见耳聋基因突变特点分析 被引量:1
20
作者 林钻平 贠露 +6 位作者 甘函箫 徐慧兰 唐凤珠 唐杰 陈睿春 李凤提 林敢生 《中国临床新医学》 2023年第5期437-441,共5页
目的应用耳聋基因芯片对广西地区先天性耳聋患者及其直系家属进行筛查,分析广西地区耳聋的主要致聋基因及突变特点。方法招募2017年12月至2022年12月广西壮族自治区人民医院收治的非综合征型耳聋(NSHL)患者及其直系血缘亲属共336例作为... 目的应用耳聋基因芯片对广西地区先天性耳聋患者及其直系家属进行筛查,分析广西地区耳聋的主要致聋基因及突变特点。方法招募2017年12月至2022年12月广西壮族自治区人民医院收治的非综合征型耳聋(NSHL)患者及其直系血缘亲属共336例作为研究对象。采集外周血并提取DNA,应用耳聋基因芯片检测受试者耳聋相关的4个热点基因中的16个突变位点:GJB2(35delG、176-191del16、235delC、299-300delAT),GJB3(538C>T、547G>A),SLC26A4(IVS7-2A>G、2168A>G、1174A>T、1226G>A、1229C>T、IVS15+5G>A、1975G>C、2027T>A),线粒体12S rRNA(1494C>T、1555A>G),统计并分析其耳聋基因突变特点。结果158例耳聋患者中共检出常见耳聋基因突变24例(15.19%)。其中SLC26A4基因突变15例(9.49%),GJB2基因突变8例(5.06%),线粒体12S rRNA突变1例(0.63%)。178例听力正常的耳聋患者亲属共检出22例基因突变,检出率为12.36%。其中SLC26A4基因突变12例(6.74%),GJB2基因突变10例(5.62%)。结论SLC26A4和GJB2是广西地区人群遗传性耳聋的常见突变基因,其中SLC26A4 c.IVS7-2A>G位点突变率最高,其次为GJB2 c.235delC突变,应引起临床医师关注。 展开更多
关键词 先天性遗传性耳聋 耳聋基因 基因芯片
下载PDF
上一页 1 2 125 下一页 到第
使用帮助 返回顶部