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基于GEO数据库联合网络药理学研究川芎-赤芍药对治疗动脉粥样硬化的药理过程及分子机制
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作者 陈启庭 林洪 +4 位作者 陈利捷 卓超林 岳双冰 金宇 张淼 《中国医院用药评价与分析》 2024年第6期655-661,共7页
目的:探讨活血化瘀中药药对川芎-赤芍拮抗动脉粥样硬化的潜在分子机制及药理过程。方法:使用R语言Limma包分析GEO数据库GSE43292数据集,对有表达差异的动脉粥样硬化基因进行筛选和提取。川芎-赤芍药对所含的化学活性组分及靶点通过中药... 目的:探讨活血化瘀中药药对川芎-赤芍拮抗动脉粥样硬化的潜在分子机制及药理过程。方法:使用R语言Limma包分析GEO数据库GSE43292数据集,对有表达差异的动脉粥样硬化基因进行筛选和提取。川芎-赤芍药对所含的化学活性组分及靶点通过中药系统药理学数据库与分析平台检索。合并差异基因和药物作用靶点以获得共同的靶点。利用在线分析工具STRING和Cytoscape构建药物和靶点的调控网络以及靶点间的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。然后利用R语言注释靶点基因的基因本体(GO)功能,分析京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路,再进行基因集富集分析(GSEA)以验证KEGG的通路和富集的情况,确定靶点基因的调控功能和参与基因调控功能的信号转导通道。结果:共筛选出动脉粥样硬化差异基因1244个,川芎-赤芍药对含36个生物活性成分,其中靶点为环加氧酶1、肾上腺素受体、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ、激酶插入域受体、孕激素受体、基质金属蛋白酶9、CXC趋化因子配体8、蛋白激酶Cβ、白细胞介素6、CD14、二肽基肽酶-4、PIK3CG、肾上腺素受体α1B、微管相关蛋白2、尿激酶纤溶酶原激活剂和单胺氧化酶B。靶点在GO中主要富集在合成DNA过程的调控、DNA生物合成的过程、含胶原的细胞外基质、细胞外基质、蛋白酶结合、细胞迁移、血管形成过程、膜筏结构、转录的调节等与动脉粥样硬化炎症、脂肪代谢及血管生成相关的生物学注释。脂质与动脉粥样硬化通路和核因子κB信号通路与动脉粥样硬化关系最为密切,并且在KEGG信号通路和GSEA均显示出富集。结论:川芎-赤芍药对通过潜在的13个活性成分作用于可能的16个靶点调控相关信号转导通路,通过抗炎、调脂和保护血管等方式产生抗动脉粥样硬化的作用。 展开更多
关键词 川芎-赤芍药对 动脉粥样硬化 geo数据库联合网络药理学 信号通路
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网络药理学联合GEO数据挖掘与分子对接探究桔梗-鱼腥草治疗非小细胞肺癌的作用机制 被引量:2
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作者 李永顺 谢嘉嘉 +3 位作者 周继红 张立 陈树超 欧阳子琛 《新中医》 CAS 2023年第15期138-145,共8页
目的:通过网络药理学联合GEO数据挖掘以及分子对接技术探究桔梗-鱼腥草药对治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库搜集桔梗-鱼腥草活性成分及其作用靶点,在Gencards、OMIM和GEO数据... 目的:通过网络药理学联合GEO数据挖掘以及分子对接技术探究桔梗-鱼腥草药对治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库搜集桔梗-鱼腥草活性成分及其作用靶点,在Gencards、OMIM和GEO数据库获取疾病相关靶点,将二者靶点取交集获取桔梗-鱼腥草与NSCLC的共同靶点,并使用Cytoscape3.9.0软件进行药物-活性成分-靶点互作网络构建获取核心成分。通过String网站对药物-疾病共同靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用分析得到核心靶点。使用Metascape平台对共同靶点进行GO及KEGG富集分析。最后运用AutoDock和PyMol软件对核心成分和核心靶点进行分子对接和可视化处理。结果:共获得药物活性成分7个,药物-疾病共同靶点139个。其中核心活性成分3个:槲皮素、木犀草素、山奈酚;核心靶点5个:TP53、AKT1、JUN、TNF、EGFR。GO分析得到2281个相关条目。KEGG分析得到326条信号通路。分子对接显示槲皮素、木犀草素、山奈酚与TP53、AKT1、JUN、TNF、EGFR之间均具有较强亲和力。结论:桔梗-鱼腥草药对可能通过TP53、AKT1、JUN、TNF、EGFR等靶点和癌症通路、PI3K-AKT信号通路等途径发挥抗NSCLC的作用。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 桔梗-鱼腥草 网络药理学 geo数据挖掘 分子对接
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慢性间歇低氧和复氧对大鼠胰岛素抵抗及骨骼肌miR-27a-3p/PPARγ/IRS1/PI3K/AKT表达的影响
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作者 周雪利 李华 +5 位作者 陈青宇 靳美娜 李海波 白炜 贾楚璇 魏翠英 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1729-1737,共9页
目的探讨慢性间歇低氧(CIH)和复氧对大鼠胰岛素抵抗(IR)及骨骼肌miR-27a-3p/PPARγ/IRS1/PI3K/AKT表达的影响。方法从基因表达数据库(GEO)中下载CIH条件下miRNA数据集,运用DESeq2筛选差异表达最显著的miRNA作为研究对象,使用miRNA walk... 目的探讨慢性间歇低氧(CIH)和复氧对大鼠胰岛素抵抗(IR)及骨骼肌miR-27a-3p/PPARγ/IRS1/PI3K/AKT表达的影响。方法从基因表达数据库(GEO)中下载CIH条件下miRNA数据集,运用DESeq2筛选差异表达最显著的miRNA作为研究对象,使用miRNA walk网站对差异miRNA的靶基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并Cytoscape软件构建miRNA-mRNA-pathway调控网络。将48只雄性SD大鼠随机分为对照(CON)组和CIH组,24只/组,CON组常氧环境饲养12周,CIH组先予CIH环境饲养8周,再恢复常氧饲养4周。两组均在基线、8周、12周时留取血样和骨骼肌组织,检测空腹血糖(FBG)、空腹胰岛素(FINS)水平,HE染色观察骨骼肌病理改变并计算肌纤维横截面积,实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)和Western blotting法检测骨骼肌miR-27a-3p、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、葡萄糖转运蛋白4(GLUT4)、胰岛素受体1(IRS1)、p-IRS1、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)、磷酸激酶B(AKT)、p-AKT表达,比较组间差异。结果生信分析发现,GEO数据库未筛选出CIH状态下肌肉组织相关的miRNA数据集,仅得到肾脏组织差异表达miRNA的GSE202480数据集,从CON组和CIH组样本中筛选出165个差异表达的miRNA,选最显著miR-27a-3p作为研究对象。GO和KEGG分析显示,差异miRNA的靶基因主要参与肌肉调节和胰岛素信号传导。miRNA-mRNA-pathway调控网络显示miR-27a-3p是PPAR信号通路和PI3K/AKT信号通路的关键调控因子。动物实验发现,基线时,两组各项观察指标均无统计学意义(P>0.05);8周时,与CON组相比,CIH组FBG、FINS、HOMA-IR、PPARγ显著升高(P<0.05或P<0.01),肌纤维排列疏松,肌纤维横截面积、miR-27a-3p、p-IRS1/IRS1、PI3K、p-AKT/AKT显著降低(P<0.05或P<0.01),GLUT4表达呈升高趋势但无统计学意义(P>0.05);12周时,两组各项观察指标均无统计学意义(P>0.05)。结论CIH可导致大鼠IR增加和骨骼肌病理改变,而复氧可以逆转;CIH可致骨骼肌miR-27a-3p表达下调,PPARγ表达上调,IRS1/PI3K/AKT胰岛素信号转导受到抑制,而复氧干预可以逆转;miR-27a-3p可能通过调控PPARγ/IRS1/PI3K/AKT信号通路参与了CIH所致的IR。 展开更多
关键词 慢性间歇低氧-复氧 胰岛素抵抗 geo miR-27a-3p IRS1/PI3K/AKT通路
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Environmental archaeology on Longshan Culture (4500-4000 aBP) at Yuhuicun Site in Bengbu, Anhui Province 被引量:3
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作者 ZHANG Guangsheng ZHU Cheng +7 位作者 WANG Jihuai ZHU Guangyao MA Chunmei ZHENG Chaogui ZHAO Lanhui LI Zhongxuan LI Lan JIN Aichun 《Journal of Geographical Sciences》 SCIE CSCD 2010年第3期455-468,共14页
Based on the samples collected from the west wall of the ABYT2004 at Yuhuicun Site in Bengbu, Anhui Province, the multi-environmental substitute indexes such as the grain-size, Rb/Sr, zircon crystal morphology and mag... Based on the samples collected from the west wall of the ABYT2004 at Yuhuicun Site in Bengbu, Anhui Province, the multi-environmental substitute indexes such as the grain-size, Rb/Sr, zircon crystal morphology and magnetic susceptibility were analyzed. The age of archaeological strata was determined by AMS^14C dating. According to the results, combined with the information of the ancient human activities and the cultural heritage data obtained from the Longshan cultural archaeological strata, it can be concluded that (1) Before 4500 aBP, the climate was humid and water level was high in the Huaihe River and its tributaries, the drainage basin and its surrounding areas were even flooded, so the site area was submerged and there were no human activities around the site. (2) About 4500 aBP, the climate began to become drier and water level of the Huaihe River and its tributaries began to decline, thus floodplain gradually appeared, Yuhuicun Site and Longshan Culture began to appear. (3) Around 4100 aBP, the climate was humid and rainfall was abundant, which resulted in frequent flood disasters in the whole Huaihe River Basin. (4) After 4100 aBP, the climate gradually transited to be cold and dry, agricultural production was constrained to reduce the food source, Yuhuicun Site was almost abandoned. (5) The environmental information in sedimentary strata and historical records based on ancient books agree with each other. In addition, Yuhuicun Site was related to Dayu Zhishui (Yu the Great in taming the floods) in ancient books. 展开更多
关键词 Yuhuicun Site Longshan culture 4500-4000 aBP environmental change Huaihe River Basin
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Culture Self- Consciousness in Transmission of Chinese Philosophy from the Perspective of English Globalization -- Taking the Belt and Road Initiative for Example
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作者 Wang Yan Shi Wenjun 《学术界》 CSSCI 北大核心 2018年第3期273-282,共10页
The Belt and Road Initiative contains the aspiration of Chinese nation to pursue ideological freedom and desire of strengthening international exchanges and cooperation. This paper takes the Belt and Road Initiative f... The Belt and Road Initiative contains the aspiration of Chinese nation to pursue ideological freedom and desire of strengthening international exchanges and cooperation. This paper takes the Belt and Road Initiative for example,emphasizing the interpretation of the inheritance and development of Chinese culture so as to study the importance of Culture Self-Consciousness in Chinese Philosophy,in the context of English globalization. That is to say,this paper stresses the spirits and the stand of nation 's demonstration on pursuing peace,cooperation and sustainable development in the civilization continuity from traditional China to the contemporary China,with practical philosophic view. 展开更多
关键词 English globalization Chinese PHILOSOPHY culture SELF - CONSCIOUSNESS thebelt and ROAD INITIATIVE
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潮湿弥漫与南方影像--一个地缘文化视域下的观察
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作者 詹少尉 《中北大学学报(社会科学版)》 2024年第5期75-82,共8页
中国一般以秦岭-淮河一线作为南北方的分界。从地图上看,中国的南方区域大致上与中国的亚热带季风气候区重叠,于是,潮湿成为南方区域地缘意义上的最大公约数。银幕上的南方影像,可谓潮湿弥漫。影像建构上,潮湿与液体、废墟产生勾连;叙... 中国一般以秦岭-淮河一线作为南北方的分界。从地图上看,中国的南方区域大致上与中国的亚热带季风气候区重叠,于是,潮湿成为南方区域地缘意义上的最大公约数。银幕上的南方影像,可谓潮湿弥漫。影像建构上,潮湿与液体、废墟产生勾连;叙事形态上,文艺片侧重以“醒着做梦”的方式表现人物的幻想与梦魇,而强调犯罪类型的影片则通过时空嵌合的穿插叙事彰显迷雾色彩,恰与南方的潮湿神秘相得益彰;文化意义上,南方影像的潮湿美学以克制、平静的姿态表达解构和疏离的倾向,并以去现实化的诗性表达将个体的沉沉暮气与时代的怀旧症候相互关联,透露出特定社会阶段的郁结氛围。 展开更多
关键词 南方影像 潮湿 地缘文化 影像建构 怀旧症侯
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“Liberty,Love!” Hungarian Culture in Focus Hungarian Season in China 2007-2008
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《China & The World Cultural Exchange》 2007年第10期24-24,共1页
关键词 Hungarian culture in Focus Hungarian Season in China 2007-2008 Liberty Love
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GeO_2-SiO_2纳米复合材料的合成及其光学特性研究 被引量:7
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作者 周延怀 冯玉英 陆海彦 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2000年第1期23-24,共2页
运用溶胶 凝胶法合成了GeO2 SiO2 纳米复合材料 ,探索了为 pH在 2的条件下通过水解Si(OC2 H5) 4和GeCl4合成GeO2 SiO2 干胶的过程。在 10 0~ 12 0 0℃下对干胶进行热处理。采用UV光谱法测定了材料的光学性质 ,观察到随热处理温度的... 运用溶胶 凝胶法合成了GeO2 SiO2 纳米复合材料 ,探索了为 pH在 2的条件下通过水解Si(OC2 H5) 4和GeCl4合成GeO2 SiO2 干胶的过程。在 10 0~ 12 0 0℃下对干胶进行热处理。采用UV光谱法测定了材料的光学性质 ,观察到随热处理温度的升高 ,样品光谱的吸收边向长波方向移动。由于温度的影响 ,晶粒长大 ,带隙能量减小 ,纳米微晶的量子尺寸效应显示出来。经X射线衍射分析 ,观察到了随热处理温度的增高 ,材料结构从无序到有序的转变过程 ,直到 110 0℃时 ,有明显的微晶生成 ,其尺寸为 5~ 10nm。 展开更多
关键词 溶胶-凝胶 纳米半导体材料 geo2-SiO2
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基于GEO数据库的黄芪-当归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的分子机制研究 被引量:3
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作者 董又滋 赵泉霖 王毓国 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1190-1200,共11页
目的探究经典中药配伍组合黄芪-当归药对(芪归药对)对糖尿病合并心血管并发症的治疗作用及分子机制。方法运用BATMAN数据库对芪归药对进行分析,检索GEO数据库中关于糖尿病合并心血管并发症的相关基因芯片数据,借助GEO2R分析差异基因,构... 目的探究经典中药配伍组合黄芪-当归药对(芪归药对)对糖尿病合并心血管并发症的治疗作用及分子机制。方法运用BATMAN数据库对芪归药对进行分析,检索GEO数据库中关于糖尿病合并心血管并发症的相关基因芯片数据,借助GEO2R分析差异基因,构建靶点互作关系网络,拓扑得到芪归药对治疗糖尿病心血管并发症的关键基因;运用DAVID数据库对关键基因进行基因本体功能和KEGG通路富集分析。将20只SD大鼠随机分为健康对照组、糖尿病合并心血管并发症模型组、阳性对照二甲双胍治疗组和芪归药对治疗组,每组5只;除健康对照组外,其余各组均给予高脂高糖饲料并建立糖尿病合并心血管并发症模型;观察各组大鼠心肌细胞中PI3K、Akt3蛋白的表达情况。结果(1)在BATMAN数据库中分析得到芪归药对的相关靶点基因1332个,在GEO数据库中检索得到3个糖尿病合并心血管病变的芯片数据文件(GSE26887、GSE43950、GSE46262),利用GEO2R分析筛选出2759个差异基因;经映射得到芪归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的关键基因247个。(2)通过STRING数据库构建关键靶点的差异蛋白相互作用(PPI)网络图,运用Cytoscape 3.7.2构建“芪归药对—活性成分—靶点”网络。采用DAVID数据库进行功能富集分析提示,芪归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的生物学进程主要集中在RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正负调控、氧化还原过程、信号转导、凋亡过程、炎症反应、细胞增殖的正调控等,信号通路涉及新陈代谢通路、癌症通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、5'-单磷酸(cAMP)信号通路、环磷酸鸟苷酸-蛋白激酶(cGMP-PKG)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶与丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K-Akt)信号通路、非酒精性脂肪肝通路、胰岛素抵抗通路等。(3)采用SD大鼠的动物模型实验结果显示,与健康对照组比较,未接受治疗的糖尿病合并心血管并发症模型组心肌细胞中PI3K、Akt3蛋白表达量均明显降低(P<0.01);芪归药对治疗组和二甲双胍治疗组心肌细胞中PI3K表达量均高于模型组(P<0.01),但低于健康对照组(P<0.01);芪归药对治疗组Akt3蛋白表达量低于健康对照组(P<0.05),二甲双胍治疗组Akt3蛋白表达量高于模型组(P<0.05)。结论芪归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的特点是“多成分、多靶点、多途径”,多个关键基因和信号通路发挥了重要作用,进一步研究有望拓宽糖尿病中医药诊疗的思路。 展开更多
关键词 糖尿病合并心血管并发症 黄芪-当归 geo数据库 生物信息学
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基于GEO数据库和网络药理学探讨柴胡-葛根治疗原发性青光眼的机制 被引量:1
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作者 杨稀瑞 王继雪 +2 位作者 袁星星 董霏雪 赵辉 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2022年第8期603-607,共5页
目的基于GEO数据库和网络药理学探讨柴胡-葛根治疗原发性青光眼的机制,为原发性青光眼的治疗提供新方向。方法通过TCMSP数据库筛选柴胡、葛根的有效活性成分;通过检索GeneCards、OMIM等数据库及二次挖掘GEO数据库中的芯片数据筛选原发... 目的基于GEO数据库和网络药理学探讨柴胡-葛根治疗原发性青光眼的机制,为原发性青光眼的治疗提供新方向。方法通过TCMSP数据库筛选柴胡、葛根的有效活性成分;通过检索GeneCards、OMIM等数据库及二次挖掘GEO数据库中的芯片数据筛选原发性青光眼的作用靶点;利用David平台对靶基因进行GO功能及KEGG富集分析。体外实验以小鼠视网膜神经节细胞(RGC)为研究对象,以过氧化氢诱导RGC构建氧化应激损伤模型,设置空白组、模型组、空白+中药组、模型+中药组,倒置相差显微镜下观察各组RGC形态变化,RT-PCR检测各组RGC中PI3K和AKT mRNA表达情况。结果网络药理学研究结果证实,与原发性青光眼相关的差异蛋白靶点共63个,包括IL-6、VEGFA等。GO功能及KEGG富集分析结果显示,柴胡-葛根治疗原发性青光眼的生物学过程与蛋白结合、催化、有机环状化合物结合及有机物代谢过程等有关,主要通过调节PI3K-AKT、TNF、MAPK、VEGF、JAK-STAT等信号通路发挥作用。体外实验结果显示,模型+中药组RGC从缓慢贴壁到完全贴壁,并可见少量聚集性生长及串珠样排列,细胞体缓慢增大。RT-PCR检测结果显示,与空白组相比,空白+中药组RGC中PI3K和AKT mRNA表达均下降(均为P<0.05);与模型组相比,模型+中药组RGC中PI3K和AKT mRNA表达均下降(均为P<0.05)。结论柴胡-葛根能够通过抑制PI3K-AKT信号通路抑制细胞凋亡,起到改善原发性青光眼的作用。 展开更多
关键词 geo数据库 网络药理学 柴胡-葛根 原发性青光眼 视网膜神经节细胞
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溶胶-凝胶法制备Sn掺杂GeO_2粉体
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作者 聂荣志 敬承斌 《青岛科技大学学报(自然科学版)》 CAS 2011年第4期345-350,共6页
采用溶胶-凝胶法以锗酸根离子水溶液作为前驱体制备了Sn掺杂GeO2粉体样品。用X射线衍射和红外光谱分析了试样的微观结构;用X射线能谱仪测试了试样的组成;用场发射扫描电子显微镜观察了试样的微观形貌;用紫外-可见光光谱分析了试样的禁... 采用溶胶-凝胶法以锗酸根离子水溶液作为前驱体制备了Sn掺杂GeO2粉体样品。用X射线衍射和红外光谱分析了试样的微观结构;用X射线能谱仪测试了试样的组成;用场发射扫描电子显微镜观察了试样的微观形貌;用紫外-可见光光谱分析了试样的禁带宽度。结果表明,Sn掺杂GeO2粉体试样为单一六方GeO2晶相,粒子具有包覆形貌。Sn的掺杂引起了GeO2晶格常数有规律的变化和红外吸收光谱的红移。利用漫散射紫外-可见光光谱计算出GeO2和Sn掺杂GeO2试样的禁带宽度分别为5.04eV和4.51eV。荧光光谱显示Sn掺杂GeO2试样具有新的发光性质,发光波长为325nm。 展开更多
关键词 溶胶-凝胶 Sn掺杂geo2 红外光谱 禁带宽度 光致发光
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基于多级适应性休假和θ-进入规则的Geo/G/1排队系统的队长分布(英文)
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作者 魏瑛源 唐应辉 余玅妙 《应用数学》 CSCD 北大核心 2020年第1期186-201,共16页
本文考虑带有多级适应性休假的Geo/G/1离散时间排队系统,其中在服务员休假期间到达的顾客以概率(0<θ≤1)进入系统.运用更新过程理论和全概率分解技术,从任意初始状态出发,获得时刻n^+处队长瞬态分布的z-变换的递推表达式,并在瞬时... 本文考虑带有多级适应性休假的Geo/G/1离散时间排队系统,其中在服务员休假期间到达的顾客以概率(0<θ≤1)进入系统.运用更新过程理论和全概率分解技术,从任意初始状态出发,获得时刻n^+处队长瞬态分布的z-变换的递推表达式,并在瞬时性质分析的基础上,分别得到时刻n^+;n;n^-处队长稳态分布的递推公式,所得结果进一步表明稳态队长不再具有随机分解结构.最后通过数值实例,讨论队长稳态分布对系统参数的敏感性,并阐述了队长稳态分布的递推公式在系统容量优化设计中的重要应用价值. 展开更多
关键词 离散时间geo/G/1排队 多级适应性休假 θ-进入规则 队长分布 全概率分解技术 系统容量的优化设计
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Optimization of Culture Components for Laccase Activity from Pleurotus Ostreatus P40 Using Response Surface Methodology 被引量:1
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作者 任大军 王玲 +4 位作者 谢凯 鲍欣 张淑琴 张惠灵 吴高明 《Journal of Donghua University(English Edition)》 EI CAS 2013年第4期305-310,共6页
High enzymatic activity is required for laccase applications.Central composite design (CCD)-based response surface methodology (RSM) can effectively increase the enzymatic activity of Pleurotus ostreatus P40 in li... High enzymatic activity is required for laccase applications.Central composite design (CCD)-based response surface methodology (RSM) can effectively increase the enzymatic activity of Pleurotus ostreatus P40 in liquid substrate fermentation.Initial screening of the nutritional components was performed using a Plackett-Burman design.The variables,namely,bran,bagasse,Tween 80,and yeast extract,were found to have statistically significant effects on laccase activity.These variables were further optimized using CCD-based RSM.Optimal concentrations for the maximum laccase activity were 8.144 2 g/L bran,50 g/L bagasse,0.424 1 mL/L Tween 80,and 2.832 5 g/L yeast extract.Under optimized conditions,the maximum measured laccase activity reached 96 480 U/L,which was close to the predicted value (104 830 U/L) by RSM.Therefore,RSM can be used to optimize culture components for laccase activity from Pieurotus ostreatus P40. 展开更多
关键词 laccase activity Plackett-Burman design response surface methodology(RSM) optimization of culture components bagasseCLC number:Q93.335Document code:AArticle ID:1672-5220(2013)04-0305-06
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生物信息学分析miR-16-5p在乳腺癌中的作用及临床验证
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作者 黄亮 高东 +1 位作者 周丹丹 陈方红 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2023年第6期488-494,共7页
目的 生物信息学分析miR-16-5p在乳腺癌(BC)中的作用并进行临床验证。方法 BC的队列数据集来自高通量基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA),并通过生物信息学工具进行分析。在临床验证中,前瞻性纳入2018年1月至2022年2月接受手术... 目的 生物信息学分析miR-16-5p在乳腺癌(BC)中的作用并进行临床验证。方法 BC的队列数据集来自高通量基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA),并通过生物信息学工具进行分析。在临床验证中,前瞻性纳入2018年1月至2022年2月接受手术的BC患者(BC组),获取BC组织和对应的癌旁正常组织。另纳入同期150例体检健康女性作为对照组,获取其血清样本,采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测组织及血清miR-16-5p表达。所有BC患者至少随访3年。结果 共鉴定出195个差异表达基因(DEG),根据logFC≥1.5或logFC≤-1.5阈值,miR-16-5p表达显著下调,其受试者工作特征(ROC)曲线和Kaplan-Meier曲线分析显示,miR-16-5p区分BC组织及正常乳腺组织的曲线下面积(AUC)为0.73(95%CI:0.68~0.79),且miR-16-5p低表达的患者预后较差(P=0.013),因此miR-16-5p可作为候选miRNA。在临床验证集中,BC组织miR-16-5p相对表达量明显低于癌旁正常组织[0.46(0.29,0.66)vs. 0.82(0.56,1.08),P<0.001]。且BC患者血清miR-16-5p相对表达量也显著低于对照组[0.34(0.15,0.50)vs. 0.99(0.70,1.20),P<0.001]。ROC曲线显示,当血清miR-16-5p相对表达量≤0.520时可良好地诊断BC患者,AUC值为0.897(95%CI:0.863~0.932)。BC患者血清样本和BC组织样本中miR-16-5p相对表达量呈正相关(rs=0.373,P<0.001)。血清miR-16-5p表达与T分期、N分期、TNM分期有关(P<0.05)。血清miR-16-5p低表达组是影响BC患者患者3年内发生局部复发/远处转移及死亡的独立预测生物标志物(P<0.05)。结论 血清miR-16-5p表达对BC有诊断效能,低血清miR-16-5p表达预示着BC患者更差的疾病进展情况和3年内预后不良。 展开更多
关键词 乳腺癌 geo 癌症基因组图谱 miR-16-5p 临床验证
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基于miRNA-mRNA网络探讨黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的作用机制 被引量:1
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作者 李敏 陈浩雄 +1 位作者 黄佳纯 朱根福 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2023年第20期4895-4903,共9页
目的运用生物信息学和网络药理学方法挖掘黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的微小RNA(miRNA)-mRNA转录网络,探讨其作用机制。方法通过GEO数据库挖掘2型糖尿病miRNA和mRNA芯片集,并通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘黄芪-山药药... 目的运用生物信息学和网络药理学方法挖掘黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的微小RNA(miRNA)-mRNA转录网络,探讨其作用机制。方法通过GEO数据库挖掘2型糖尿病miRNA和mRNA芯片集,并通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘黄芪-山药药对活性成分及预测靶点,使用R语言及Perl软件筛选黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的关键miRNAs及mRNAs,借助Cytoscape3.8.2软件与STRING数据库构建活性成分-靶点网络、miRNA-mRNA转录网络及蛋白互作(PPI)网络,并进行基因本体(GO)功能及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并借助cytoNCA完成PPI网络的拓扑分析。结果2型糖尿病中存在64个差异miRNA和6143个差异mRNA构成的605组miRNA-mRNA互作关系;黄芪-山药药对存在56个有效成分和538个药物靶点,如PGR、PTGS1、AR、SCN5A、NCOA2等。2型糖尿病-miRNA-mRNA-有效成分-中药调控网络图得到miR-1307-3p-PTPN1、miR-1307-3p-SCN5A、miR-1307-3p-BCL2、miR-1307-3p-CHEK2、miR-1307-3p-E2F2、miR-1307-3p-IL10RB、miR-1307-3p-IRF1、miR-1307-3p-MAPK1、miR-491-5p-PTGS 1共9条miRNA-mRNA相互关系。PTPN1、SCN5A、BCL2、CHEK2、E2F2、IL10RB、IRF1、MAPK1、PTGS1共9个靶点作为miRNA调控黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的重要桥梁。GO结果富集在对类固醇激素的反应、对金属离子的反应、对药物的反应、内在凋亡信号通路、RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录起始等,KEGG结果富集在脂质和动脉粥样硬化、IL-17信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、p53信号通路等。结论2型糖尿病中存在多个miRNA-mRNA调控网络,黄芪-山药药对以多组分、多功能、多途径的形式,介导IL-17、TNF、p53、HIF-1等信号通路,miRNA-mRNA网络在黄芪-山药药对治疗2型糖尿病中发挥重要作用。 展开更多
关键词 2型糖尿病 miRNA-mRNA 黄芪-山药药对 生物信息学 geo数据库
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The Influence of Culture and Biographical Variables on the Brand Image of Google and Baidu: An Exploratory Study in Guangzhou,China
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作者 Rayne Cyla Handley Nicholas James Raw +1 位作者 Mattheus Louw Lynette Louw 《中国市场》 2014年第9期8-20,共13页
The study found significant correlations between the culture dimensions of Confucian work dynamism,humanheartedness and moral discipline and the brand image dimensions of online search engines.It was also found that s... The study found significant correlations between the culture dimensions of Confucian work dynamism,humanheartedness and moral discipline and the brand image dimensions of online search engines.It was also found that several significant relationships exist between the biographical variables of age and education and the brand image dimensions,and that culture and biographical variables have a linear relationship with brand image.The findings highlight that culture and biographical information can influence Chinese consumer perceptions of an international or local brand.Organizations thus need to align their brands with the culture and biographical profile of their target markets. 展开更多
关键词 Cross - culturAL management BRAND image China
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On Folk Culture Translation in Tales of Hulan River from the Perspective of Deconstructionism 被引量:1
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作者 邓玉华 但雅琼 《海外英语》 2018年第20期175-177,共3页
Since the beginning of 21 th century, promoting culture export and spreading Chinese culture have become the top priorityof China. As the main carrier of culture, excellent literary works become the best choice for Ch... Since the beginning of 21 th century, promoting culture export and spreading Chinese culture have become the top priorityof China. As the main carrier of culture, excellent literary works become the best choice for Chinese culture"going out". The trans-lation of folk culture in Tale of Hulan River translated by Howard Goldblatt is analyzed from the perspective of deconstructionismwith an aim to give other translators some inspiration and enlightenment on translation of Chinese culture. 展开更多
关键词 Howard Goldblatt Tales of Hulan River Folk culture I106 A 1009-5039(201
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Mn2+/N2-共掺杂Zn2GeO4晶体电子结构和光学性质的研究
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作者 蔡宏宇 吴海涛 +1 位作者 吴成国 何苏红 《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2020年第5期749-755,共7页
采用基于密度泛函理论的平面波超软赝势方法对本征Zn2GeO4,Mn2+掺杂Zn2GeO4,Mn2+/N2-共掺杂Zn2GeO4超晶胞进行了几何结构优化,计算了掺杂前后体系的晶格常数、能带结构、态密度和光学性质.结果表明,Mn离子掺入后,Mn离子3d轨道与O离子2p... 采用基于密度泛函理论的平面波超软赝势方法对本征Zn2GeO4,Mn2+掺杂Zn2GeO4,Mn2+/N2-共掺杂Zn2GeO4超晶胞进行了几何结构优化,计算了掺杂前后体系的晶格常数、能带结构、态密度和光学性质.结果表明,Mn离子掺入后,Mn离子3d轨道与O离子2p轨道之间有强烈的轨道杂化效应,掺杂系统不稳定,而Mn/N离子共掺后,Mn离子和N离子之间的吸引作用克服了Mn离子之间的排斥作用,能够明显地提高掺杂浓度和体系的稳定性.光学性质计算结果表明,Mn离子与N离子共掺杂能改善Zn2GeO4电子在低能区的光学跃迁特性,增强电子在可见光区的光学跃迁;吸收谱计算结果显示,Mn离子与N离子掺入后体系对低频电磁波吸收增加. 展开更多
关键词 Mn2+/N2-共掺杂Zn2geo4 第一性原理 电子结构 光学性质
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Discussion on Construction of Henan Cultural Products about Geotourism
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作者 Mei WU Tianyi ZHANG 《Asian Agricultural Research》 2013年第3期106-108,112,共4页
With the construction and development of Geoparks,geo-tourism culture is brought into being. Based on the significance of geotourism cultural product system,this article summarizes the natural heritage properties and ... With the construction and development of Geoparks,geo-tourism culture is brought into being. Based on the significance of geotourism cultural product system,this article summarizes the natural heritage properties and scientific cultural value of Henan geological heritage resources and landscape resources,points out the various risks in construction of geo-tourism culture,such as the uncertainty of geo-tourism resources and their distribution areas,the uncertainty of the Geoparks building policies from governments,etc. ,and finally proposes some constructive suggestions and measures to avoid these risks. 展开更多
关键词 geoPARK geo-tourism RESOURCES TOURISM culture Risk
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3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+的溶胶-凝胶法合成及其研究
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作者 莫素青 陈晔 蒋志维 《轻工科技》 2019年第6期25-26,50,共3页
溶胶-凝胶法合成3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+(2%)荧光粉的激发和发射的峰值强度受三氟乙酸含量的影响较大,随着三氟乙酸含量的增加,峰值强度呈现先增后降趋势;当加入三氟乙酸的量为14mmol时3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+(... 溶胶-凝胶法合成3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+(2%)荧光粉的激发和发射的峰值强度受三氟乙酸含量的影响较大,随着三氟乙酸含量的增加,峰值强度呈现先增后降趋势;当加入三氟乙酸的量为14mmol时3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+(2%)荧光性能最好。3.5MgO·0.5MgF2·GeO2:Mn4+(2%)发射主峰位于660nm,最大激发峰在280nm,能够被紫外光、紫光和蓝光发射的LED芯片所激发,发射红色荧光。 展开更多
关键词 溶胶-凝胶法 三氟乙酸 红色荧光粉 氟氧化物基质 3.5MgO·0.5MgF2·geo2:Mn4+(2%)
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