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罕见β-珠蛋白基因Codon 24(GGT>GGA)突变导致β-地中海贫血1例及文献分析
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作者 梁文雪 陈成 +2 位作者 李琦 陈萍 张学 《广西医科大学学报》 CAS 2024年第4期585-589,共5页
目的:分析罕见β-珠蛋白基因突变类型、血液学及临床特征。方法:收集疑为β-地中海贫血的病例120例。对病例进行全血细胞分类及计数、血红蛋白(Hb)电泳分析检测。用跨越断裂点PCR方法、荧光PCR熔解曲线方法、DNA测序等分析α-和β-珠蛋... 目的:分析罕见β-珠蛋白基因突变类型、血液学及临床特征。方法:收集疑为β-地中海贫血的病例120例。对病例进行全血细胞分类及计数、血红蛋白(Hb)电泳分析检测。用跨越断裂点PCR方法、荧光PCR熔解曲线方法、DNA测序等分析α-和β-珠蛋白基因突变类型。结果:120例β-地中海贫血病例中,检出1例为罕见β-珠蛋白基因突变,基因分析为Codon 24(GGT>GGA,HBB:c.75T>A)杂合子。该病例为男性,39岁,血常规检测显示:Hb 127.3 g/L,血红细胞(RBC)5.81×10^(12)/L,红细胞平均体积(MCV)70.29 fL,红细胞平均血红蛋白量(MCH)21.94 pg,红细胞平均血红蛋白浓度(MCHC)312.10 g/L。Hb分析显示Hb A_(2)4.5%,Hb F 0.4%。a-地中海贫血基因分析未发现常见的基因突变类型。结论:首次在国内发现罕见β-珠蛋白基因Codon 24(GGT>GGA,HBB:c.75T>A)突变导致β-地中海贫血。该病例在临床上易漏诊,应引起重视。 展开更多
关键词 Β-地中海贫血 Codon 24(GGT>gga) 基因突变 临床表型
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基于第一性原理GGA+U方法研究Si掺杂β-Ga_(2)O_(3)电子结构和光电性质
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作者 张英楠 张敏 +1 位作者 张派 胡文博 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2024年第1期296-305,共10页
采用基于密度泛函理论的GGA+U方法,计算了本征和Si掺杂β-Ga_(2)O_(3)的形成能、能带结构、态密度、差分电荷密度和光电性质.结果表明,Si取代四面体Ga(1)更容易实验合成,得到的β-Ga_(2)O_(3)带隙和Ga-3d态峰值与实验结果吻合较好,且贫... 采用基于密度泛函理论的GGA+U方法,计算了本征和Si掺杂β-Ga_(2)O_(3)的形成能、能带结构、态密度、差分电荷密度和光电性质.结果表明,Si取代四面体Ga(1)更容易实验合成,得到的β-Ga_(2)O_(3)带隙和Ga-3d态峰值与实验结果吻合较好,且贫氧条件下更倾向于获得有效掺杂.Si掺杂后,总能带向低能端移动,费米能级进入导带,呈现n型导电性;Si-3s轨道电子占据导带底,电子公有化程度加强,电导率明显改善.随着Si掺杂浓度的增加,介电函数ε_(2)(ω)的结果表明,激发导电电子的能力先增强后减弱,与电导率的量化分析结果一致.光学带隙增大,吸收带边上升速度减慢;吸收光谱结果显示Si掺杂β-Ga_(2)O_(3)具有较强的深紫外光电探测能力.计算结果将为下一步Si掺杂β-Ga_(2)O_(3)实验研究和器件设计的创新及优化提供理论参考. 展开更多
关键词 gga+U方法 Si掺杂β-Ga_(2)O_(3) 电子结构 光电性质
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GGA2在囊泡转运和相关疾病中作用的研究进展
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作者 陶逸豪 拜尔娜·木太力甫 +3 位作者 祁正芳 刘昶吾 田园 韩洋洋 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期543-550,共8页
囊泡转运(vesicle transport)是大分子及颗粒性物质在细胞器间的跨膜转运方式,参与细胞多项重要的生命活动,如激素分泌、神经递质的释放及信息传递、天然免疫等,反式高尔基体网络(trans-Golgi network,TGN)-内体(endosome)运输作为其中... 囊泡转运(vesicle transport)是大分子及颗粒性物质在细胞器间的跨膜转运方式,参与细胞多项重要的生命活动,如激素分泌、神经递质的释放及信息传递、天然免疫等,反式高尔基体网络(trans-Golgi network,TGN)-内体(endosome)运输作为其中一条途径,参与跨膜蛋白回收和重复利用[1]。TGN-内体运输缺陷引起的蛋白平衡紊乱和细胞功能紊乱,与恶性肿瘤、神经退行性疾病及糖尿病等多种疾病联系密切[2],如胶质瘤细胞中转接蛋白(adaptor pro-tein,AP)复合物1σ3的减少可抑制肿瘤增殖、侵袭和迁移[3];高尔基体相关、含γ-衔接蛋白耳(gamma-adaptin ear,GAE)的ADP核糖基化因子(ADP-ribo-sylation factor,ARF)结合蛋白3(Golgi-associated GAE-containing ARF-binding protein 3,GGA3)功能丧失引起β-分泌酶1(β-secretase 1)轴突积聚导致阿尔茨海默病早期病变[4]。 展开更多
关键词 gga2蛋白 囊泡转运 癌症 阿尔茨海默病 糖尿病
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gga-miR-30d-5p表达分析及其对鸡脂肪沉积的调控作用
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作者 黄华云 李瑞瑞 +4 位作者 张子晓 王钱保 黄正洋 李春苗 赵振华 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期3359-3368,共10页
【目的】分析gga-miR-30d-5p在鸡腹脂和肌内脂肪沉积中的作用,为进一步阐明鸡腹脂和肌内脂肪沉积的分子机制提供理论依据。【方法】实时荧光定量PCR检测gga-miR-30d-5p在S3系鸡和隐性白羽鸡不同发育时期不同组织中的表达,转染gga-miR-30... 【目的】分析gga-miR-30d-5p在鸡腹脂和肌内脂肪沉积中的作用,为进一步阐明鸡腹脂和肌内脂肪沉积的分子机制提供理论依据。【方法】实时荧光定量PCR检测gga-miR-30d-5p在S3系鸡和隐性白羽鸡不同发育时期不同组织中的表达,转染gga-miR-30d-5p mimics和inhibitor,观察脂肪细胞脂肪沉积的变化。【结果】gga-miR-30d-5p在心脏、肝脏、脾脏、皮脂、腹脂、胸肌、肾脏、卵巢和腿肌组织中均有表达。在腹脂组织中,gga-miR-30d-5p在0周龄时的表达存在显著的品种差异(P<0.05,下同),且在0周龄时的表达均显著高于其他周龄;肝脏组织中,gga-miR-30d-5p在0、14和16周龄的表达存在显著的品种差异,gga-miR-30d-5p在S3系鸡中的表达随着发育时期的增长逐渐升高,16周龄的表达显著高于其他周龄;在隐性白羽鸡,16周龄的表达最高且显著高于8周龄;腿肌组织中,gga-miR-30d-5p在2周龄时的表达存在显著的品种差异性。在脂肪细胞中,gga-miR-30d-5p在诱导分化4 d后的表达均显著高于增殖期;转染gga-miR-30d-5pmimics,脂肪细胞脂滴沉积极显著升高(P<0.01,下同);转染gga-miR-30d-5pinhibitor脂肪细胞脂滴沉积能力极显著下降。靶基因GO功能注释和KEGG信号通路富集分析结果显示,SOCS3和PGP可能是gga-miR-30d-5p调控脂肪沉积的预测靶基因。【结论】gga-miR-30d-5p在鸡的肝脏、腹脂和腿肌组织中表达存在显著的品种差异,转染gga-miR-30d-5p mimics/inhibitor脂肪细胞脂滴沉积极显著升高或降低。gga-miR-30d-5p具有促进鸡腹脂和肌内脂肪沉积的作用。 展开更多
关键词 gga-miR-30d-5p 腹脂脂肪 肌内脂肪 脂肪沉积
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GGA+U方法研究C-Al掺杂GaN的电子结构和光学性质 被引量:1
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作者 王晓东 潘多桥 +9 位作者 刘丽芝 刘纪博 马磊 刘晨曦 庞国旺 史蕾倩 张丽丽 雷博程 赵旭才 黄以能 《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2023年第1期137-143,共7页
本文用密度泛函理论的第一性原理,研究了C单掺、Al单掺、C-Al共掺GaN体系的电子结构及光学性质.通过分析发现,与本征GaN相比,掺杂后体系都发生了晶格畸变,其中C-Al共掺GaN体系,较容易形成且禁带宽度明显减小,形成了P型半导体,显著降低... 本文用密度泛函理论的第一性原理,研究了C单掺、Al单掺、C-Al共掺GaN体系的电子结构及光学性质.通过分析发现,与本征GaN相比,掺杂后体系都发生了晶格畸变,其中C-Al共掺GaN体系,较容易形成且禁带宽度明显减小,形成了P型半导体,显著降低了电子跃迁所需要的能量;另外,该共掺体系的静介电常数最大,极化能力最强,介电虚部的主峰向低能区域偏移,并且吸收光谱在可见光范围内产生了红移现象,这都体现了C-Al共掺可以拓展GaN体系对可见光的响应范围.因此,C-Al共掺将有望提高GaN体系的光催化性能. 展开更多
关键词 GAN gga+U 电子结构 光学性质
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gga-miR-155对MDCC-MSB1细胞转录组的影响
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作者 余祖华 贾艳艳 +7 位作者 何雷 廖成水 李静 魏颖 陈建 陈松彪 尚珂 丁轲 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期663-672,共10页
旨在探讨gga-miR-155对马立克病病毒转化的肿瘤细胞系MDCC-MSB1细胞转录组水平变化的影响。本研究以MDCC-MSB1细胞为研究对象,首先将gga-miR-155模拟物及其阴性对照转染MDCC-MSB1细胞,在转染后48 h提取总RNA,用安捷伦2100核酸检测仪分... 旨在探讨gga-miR-155对马立克病病毒转化的肿瘤细胞系MDCC-MSB1细胞转录组水平变化的影响。本研究以MDCC-MSB1细胞为研究对象,首先将gga-miR-155模拟物及其阴性对照转染MDCC-MSB1细胞,在转染后48 h提取总RNA,用安捷伦2100核酸检测仪分析各组细胞总RNA的完整性,采用RT-qPCR分析gga-miR-155在MDCC-MSB1细胞中的过表达情况;然后利用高通量测序技术,分析gga-miR-155过表达后MDCC-MSB1细胞转录水平的变化,筛选差异表达基因,结合生物信息学分析预测差异表达基因中gga-miR-155靶mRNA。结果显示:制备了gga-miR-155在MDCC-MSB1细胞过表达样本并构建了高通量测序文库;与对照组相比,gga-miR-155过表达组的差异表达基因有87个,其中,上调表达的基因有47个,下调表达的基因有40个;GO与KEGG分析显示,这些差异表达基因显著富集于代谢和蛋白结合过程/信号通路;通过Targetscan和miRada软件预测下调表达基因中鸡BACH1为gga-miR-155的靶mRNA(P<0.05)。综上,过表达gga-miR-155可调控MDCC-MSB1细胞的转录组水平,差异表达基因中BACH1基因可能在gga-miR-155的作用下参与了MDCC-MSB1细胞的代谢过程。 展开更多
关键词 gga-miR-155 马立克病 MDCC-MSB1细胞 转录组
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鸡gga-miR-199a慢病毒表达系统的构建
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作者 董小琳 任远明 +2 位作者 薛剑楠 王方 魏泽辉 《家畜生态学报》 北大核心 2023年第2期14-18,共5页
为建立一种稳定持续表达鸡gga-miR-199a的系统,将从鸡DF-1细胞扩增到的gga-miR-199a前体序列克隆入pLL3.7慢病毒载体质粒中用以包装慢病毒。同时构建了更换pLL3.7质粒中鼠源U6启动子更换为鸡源及人源U6启动子的pLL3.7慢病毒载体质粒;将... 为建立一种稳定持续表达鸡gga-miR-199a的系统,将从鸡DF-1细胞扩增到的gga-miR-199a前体序列克隆入pLL3.7慢病毒载体质粒中用以包装慢病毒。同时构建了更换pLL3.7质粒中鼠源U6启动子更换为鸡源及人源U6启动子的pLL3.7慢病毒载体质粒;将其与慢病毒包装辅助质粒共转至HEK293T细胞中,收集浓缩病毒颗粒并侵染细胞并获得过表达gga-miR-199a的单细胞克隆。提取单细胞克隆总RNA进行gga-miR-199a-5P的定量检测。结果表明,经慢病毒侵染后的细胞中鸡gga-miR-199a表达量显著提高,且人源U6启动子的转录效率最高,该研究成功建立了一种稳定持续表达鸡gga-miR-199a的慢病毒系统,说明该系统有利于在鸡活体或原代细胞中开展miRNA功能的研究。 展开更多
关键词 gga-miR-199a 慢病毒 过表达
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CircCPA4调节miR-377-3p/GGA3轴对肺癌细胞增殖、凋亡和上皮间质转化的影响
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作者 金曼 王彤辉 +1 位作者 任小飞 李淼 《河北医药》 CAS 2023年第18期2731-2735,2740,共6页
目的 探讨CircCPA4调节miR-377-3p/GGA3轴对肺癌细胞增殖、凋亡和上皮间质转化(EMT)的影响。方法 qRT-PCR、Western blot分别检测肺癌组织、相邻正常组织、人肺癌A549细胞、人正常肺上皮细胞BEAS-2B中CircCPA4、miR-377-3p、GGA3表达;将... 目的 探讨CircCPA4调节miR-377-3p/GGA3轴对肺癌细胞增殖、凋亡和上皮间质转化(EMT)的影响。方法 qRT-PCR、Western blot分别检测肺癌组织、相邻正常组织、人肺癌A549细胞、人正常肺上皮细胞BEAS-2B中CircCPA4、miR-377-3p、GGA3表达;将A549细胞分为NC组(未做任何处理)、si-NC组(转染si-NC)、si-CircCPA4组(转染si-CircCPA4)、si-CircCPA4+inhibitor NC组(转染si-CircCPA4+inhibitor NC)、si-CircCPA4+miR-377-3p inhibitor组(转染si-CircCPA4+miR-377-3p inhibitor)。双荧光素酶报告基因实验检测CircCPA4、miR-377-3p、GGA3的关系;qRT-PCR检测A549细胞中CircCPA4、miR-377-3p表达;CCK-8法检测A549细胞增殖情况;流式细胞术检测A549细胞凋亡;Transwell检测A549细胞侵袭、迁移数量;Western blot检测A549细胞GGA3、E-cadherin、Vimentin、N-cadherin的蛋白水平。结果 在肺癌组织和肺癌A549细胞中CircCPA4、GGA3水平显著上调(P<0.05),miR-377-3p表达量显著下调(P<0.05)。与NC组、si-NC组比较,si-CircCPA4组A549细胞OD_(450)值、迁移、侵袭细胞数量、CircCPA4表达量、GGA3、N-cadherin、Vimentin蛋白水平显著下降(P<0.05),A549细胞凋亡率、miR-377-3p表达量、E-cadherin蛋白水平显著升高(P<0.05);而miR-377-3p表达下调消除了沉默CircCPA4对A549细胞恶性生物学行为的抑制作用;CircCPA4靶向调节miR-377-3p/GGA3轴。结论 沉默CircCPA4可能通过上调miR-377-3p来抑制GGA3表达,抑制A549细胞增殖、EMT,促进细胞凋亡。 展开更多
关键词 CircCPA4 miR-377-3p 肺癌 增殖 凋亡 上皮间质转化 gga3
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N-Al共掺杂锐钛矿型TiO_2电子结构的GGA+U方法计算 被引量:3
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作者 郑永杰 胡义 +1 位作者 荆涛 田景芝 《材料科学与工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期791-794 926,926,共5页
本文基于密度泛函理论(DFT)的GGA+U方法,应用Materials Studio 5.0软件包中的CASTEP程序模拟计算了Al掺杂锐钛矿型TiO2和N-Al共掺杂锐钛矿型TiO2的电子结构。计算结果表明:Al掺杂和N-Al共掺杂均能够降低TiO2的带隙值。Al掺杂是由于Al的3... 本文基于密度泛函理论(DFT)的GGA+U方法,应用Materials Studio 5.0软件包中的CASTEP程序模拟计算了Al掺杂锐钛矿型TiO2和N-Al共掺杂锐钛矿型TiO2的电子结构。计算结果表明:Al掺杂和N-Al共掺杂均能够降低TiO2的带隙值。Al掺杂是由于Al的3s和3p态使导带底端下移而导致TiO2的带隙变窄;而N-Al共掺杂由于在体系中引入了N2p态,使导带底端向能量更低的方向移动,比Al单独掺杂时具有更低的带隙值。该研究结果很好地解释了Al掺杂以及N-Al共掺杂诱使TiO2的导带底端下移,禁带宽度减小,导致光谱响应范围红移的内在原因。 展开更多
关键词 锐钛矿型TiO2 N-Al共掺杂 gga+U
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CGT52TGT和GGA57GAA甘露聚糖结合凝集素突变体的构建 被引量:7
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作者 张丽芸 陈政良 王宏伟 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期391-393,共3页
目的 构建CCT52TGT和GGA57GAA 2种甘露聚糖结合凝集素(MBL)基因突变体。方法 设计2对引物52F/52R和57F/57R(R中引入了点突变),以含汉族人野生型MBL cDNA的重组质粒pGEM-mbl为模板,采用TaKaRa MutanBEST突变试剂盒进行定点突变,以PCR和... 目的 构建CCT52TGT和GGA57GAA 2种甘露聚糖结合凝集素(MBL)基因突变体。方法 设计2对引物52F/52R和57F/57R(R中引入了点突变),以含汉族人野生型MBL cDNA的重组质粒pGEM-mbl为模板,采用TaKaRa MutanBEST突变试剂盒进行定点突变,以PCR和测序分析进行鉴定。结果 分别用52F/52R和57F/57R为引物对进行PCR,均得到1个约3800 bp的DNA片段,自身连接后获得重组质粒。以SP6/T7P为引物对进行PCR,获得约900 bp的扩增产物。序列分析表明,2种克隆分别除其第52、57位密码变为TGT、GAA外,其余与野生型MBL cDNA完全相同。结论 构建成功CGT52TGT和GGA57GAA MBL基因突变体,为深入探索MBL基因突变引起调理吞噬缺损的机理和MBL分子的结构-功能关系提供了分子模型。 展开更多
关键词 甘露聚糖结合凝集素 CGT52TGT突变体 gga57GAA突变体 定点突变
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用GGA泛函方法研究苯分子在石墨(001)表面的吸附 被引量:1
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作者 王文宁 叶向宇 +3 位作者 李振华 范康年 徐伟 华中一 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第24期2374-2378,共5页
采用GGA近似的PW 91泛函 ,在周期性边界条件下 ,使用平面波基组和超软赝势 ,研究了一系列的苯分子在石墨表面的吸附构型 .我们发现苯分子之间的相互作用对苯在石墨表面的吸附能有较大影响 ,平行和垂直吸附构型分别在 3× 4和 2×... 采用GGA近似的PW 91泛函 ,在周期性边界条件下 ,使用平面波基组和超软赝势 ,研究了一系列的苯分子在石墨表面的吸附构型 .我们发现苯分子之间的相互作用对苯在石墨表面的吸附能有较大影响 ,平行和垂直吸附构型分别在 3× 4和 2× 4超元胞中得到最大的吸附能 .由于垂直吸附的苯分子之间相互作用较强 ,因此在较大的覆盖度下 ,苯分子将倾向于垂直吸附在石墨的表面 . 展开更多
关键词 泛函 吸附能 分子 基组 近似 赝势 构型 gga 方法研究 相互作用
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鸡p53抑制传染性法氏囊病病毒复制及gga-miR-2127对其调控的分子机制 被引量:3
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作者 欧阳伟 王永山 +7 位作者 孟凯 潘群兴 王晓丽 夏兴霞 诸玉梅 毕振威 董晨红 张海彬 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期759-766,共8页
传染性法氏囊病(IBD)是由传染性法氏囊病病毒(IBDV)引起的一种高度危害养鸡业的传染病。肿瘤抑制蛋白p53能够抑制多种病毒的复制,但对IBDV复制的影响仍然不清楚。本研究以IBDV为模式病毒,采用体外感染模式,在IBDV感染的DF-1细胞中,p53... 传染性法氏囊病(IBD)是由传染性法氏囊病病毒(IBDV)引起的一种高度危害养鸡业的传染病。肿瘤抑制蛋白p53能够抑制多种病毒的复制,但对IBDV复制的影响仍然不清楚。本研究以IBDV为模式病毒,采用体外感染模式,在IBDV感染的DF-1细胞中,p53的表达水平和活性均显著升高。p53过表达可以抑制IBDV的复制,并激活鸡体抗病毒天然免疫基因(IPS-1、IRF3、PKR、OAS、Mx)的表达水平上调;抑制p53的表达则得到相反的结果;表明p53可以激活鸡体的抗病毒天然免疫反应发挥抗IBDV感染作用。利用生物信息学方法和双荧光素酶报告系统分析发现,gga-miR-2127可以作用于p53 mRNA的3'UTR;荧光定量RT-PCR和免疫印迹分析表明gga-miR-2127可以使p53的蛋白水平表达降低,但mRNA水平没有变化;gga-miR-2127过表达可以使鸡体的抗病毒天然免疫基因表达降低,IBDV复制水平升高。本研究表明:gga-miR-2127可以作用于p53 mRNA的3'UTR调控p53的表达从而影响其下游抗病毒天然免疫基因的表达来发挥抗IBDV感染的作用。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 P53 miRNA gga-miR-2127 天然免疫
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gga-miR-142-5p负调控chMDA5抗传染性法氏囊病病毒感染的分子机制 被引量:4
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作者 欧阳伟 潘群兴 +5 位作者 钱晶 王晶宇 王晓丽 夏兴霞 诸玉梅 王永山 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2018年第6期24-33,共10页
传染性法氏囊病(infectious bursal disease,IBD)是由传染性法氏囊病病毒(Infectious bursal disease virus,IBDV)引起的一种高度危害养鸡业的传染病。chMDA5在识别病原相关分子模式(pathogen associated molecular pattern,PAMPs)及激... 传染性法氏囊病(infectious bursal disease,IBD)是由传染性法氏囊病病毒(Infectious bursal disease virus,IBDV)引起的一种高度危害养鸡业的传染病。chMDA5在识别病原相关分子模式(pathogen associated molecular pattern,PAMPs)及激活宿主的天然免疫应答中具有重要的作用,但chMDA5识别IBDV的分子机制仍然不清楚。本研究用IBDV感染DT40细胞,在IBDV感染的DT40细胞中,chMDA5的表达水平显著升高。chMDA5过表达可以抑制IBDV的复制,并激活IFN-β promoter和Mx promoter活性,chMDA5抑制表达则得到相反的结果;chMDA5激活IFN-β promoter活性主要是通过IRF7通路。用生物信息学方法和双荧光素酶报告系统分析发现gga-miR-142-5p可作用于chMDA5的3'UTR;qRT-PCR和免疫印迹分析表明gga-miR-142-5p可以使chMDA5的蛋白水平表达降低,但mRNA水平没有变化;gga-miR-142-5p可依赖IRF7通路使IFN-β promoter和Mx promoter活性降低,IBDV复制水平升高。本研究表明,gga-miR-142-5p可以作用于chMDA5的3'UTR负调控chMDA5的表达从而影响其下游IFN-β promoter和Mx promoter活性来发挥抗IBDV感染的作用。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 gga-miR-142-5p chMDA5 天然免疫
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gga-miR-155对MDCC-MSB1细胞生物学行为的影响 被引量:2
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作者 余祖华 丁轲 +11 位作者 郁川 贾艳艳 何雷 廖成水 李静 张春杰 李银聚 吴庭才 程相朝 张梦珂 邱静静 罗俊 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期2496-2504,共9页
为了解gga-miR-155对MDCC-MSB1细胞生物学行为的影响,将人工合成的gga-miR-155模拟物、gga-miR-155抑制物以及阴性对照瞬时转染MDCC-MSB1细胞。然后采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测MDCC-MSB1细胞中gga-miR-155的表达水平,CCK-8法检测... 为了解gga-miR-155对MDCC-MSB1细胞生物学行为的影响,将人工合成的gga-miR-155模拟物、gga-miR-155抑制物以及阴性对照瞬时转染MDCC-MSB1细胞。然后采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测MDCC-MSB1细胞中gga-miR-155的表达水平,CCK-8法检测转染后细胞增殖能力的变化,流式细胞术检测MDCC-MSB1细胞的细胞周期与凋亡的变化,Transwell检测MDCC-MSB1细胞的迁移、侵袭能力的变化。结果显示,gga-miR-155模拟物可显著上调MDCC-MSB1细胞gga-miR-155表达水平,促进MDCC-MSB1细胞增殖,细胞G1期细胞减少,S和G2期细胞增加,同时凋亡减少,迁移、侵袭能力增加;gga-miR-155抑制物可显著下调MDCCMSB1细胞gga-miR-155表达水平,抑制MDCC-MSB1细胞增殖,细胞G1期细胞增加、S和G2期细胞减少,同时凋亡增加,迁移、侵袭能力下降。结果表明,gga-miR-155可促进MDCC-MSB1细胞增殖、迁移和侵袭,抑制其凋亡。 展开更多
关键词 gga-miR-155 MDCC-MSB1细胞 细胞增殖 细胞凋亡 迁移 侵袭
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基于GGA优化的PNN方法在气水储层识别中的应用 被引量:1
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作者 张光辉 周文 +2 位作者 张银德 金文辉 包艳 《断块油气田》 CAS 北大核心 2011年第2期228-231,共4页
能够较准确地进行气水层识别一直以来都是油气勘探开发非常关注的一个问题。在认真分析Z气田山2段储层地质特征的基础上。提出了基于格雷码遗传算法优化的概率神经网络方法(GGA—PNN),探索了该方法在气水层识别中的应用。首先综合常... 能够较准确地进行气水层识别一直以来都是油气勘探开发非常关注的一个问题。在认真分析Z气田山2段储层地质特征的基础上。提出了基于格雷码遗传算法优化的概率神经网络方法(GGA—PNN),探索了该方法在气水层识别中的应用。首先综合常规测井资料和试气资料构建59个气水层样本(其中学习样本36个,预测样本23个),并进行数据归一化处理,然后采用格雷码遗传算法采训练PNN平滑参数和隐中心矢量建立起气水层目的层段识别模型。利用该模型对36个建模训练样本进行回判.正确率达100%。然后对23个预测样本进行识别,结果正确的有22个,预测精度达95.65%,其中一个误判样本是把干层判识为气层。由此表明,利用GGA—PNN方法对山2段未知流体属性的正确识别是可行的。 展开更多
关键词 地质特征 流体属性 gga—PNN 气水识别
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gga-miR-21过表达细胞株对传染性法氏囊病病毒复制的影响 被引量:2
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作者 欧阳伟 朱向东 +4 位作者 王永山 王永强 潘群兴 毕振威 王笑梅 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期847-853,共7页
为研究microRNA(gga-miR-21)对传染性法氏囊病病毒(IBDV)复制的影响,本研究利用PCR方法从鸡的肝细胞基因组中扩增细胞pri-gga-miR-21,克隆于慢病毒表达质粒pL-EGFP中构建重组质粒pL-miR-21。将pL-miR-21与3个包装质粒pLP1、pLP2和pLP/V... 为研究microRNA(gga-miR-21)对传染性法氏囊病病毒(IBDV)复制的影响,本研究利用PCR方法从鸡的肝细胞基因组中扩增细胞pri-gga-miR-21,克隆于慢病毒表达质粒pL-EGFP中构建重组质粒pL-miR-21。将pL-miR-21与3个包装质粒pLP1、pLP2和pLP/VSVG共转染293FT细胞,制备含gga-miR-21基因的重组慢病毒VL+miR-21。将VL+miR-21感染DF-1细胞,经杀稻瘟菌素筛选获得过表达gga-miR-21的细胞株DF-miR-21,采用定量RT-PCR(qRT-PCR)检测表明,gga-miR-21的表达量比正常DF-1细胞提高60%。将IBDV接种于DF-miR-21细胞,在96 h后,其病毒滴度(104.75TCID50/0.1 mL)显著低于正常DF-1细胞的病毒滴度(108.75TCID50/0.1 mL)。采用生物信息学方法和双荧光素酶报告系统分析验证,在IBDV基因组VP1基因中存在gga-miR-21的结合靶点。将IBDV感染DF-miR-21细胞,采用western blot分析,VP1蛋白的表达量比正常DF-1细胞显著降低;用qRT-PCR分析,VP1 mRNA水平与正常DF-1细胞没有明显差异。本实验结果表明:细胞gga-miR-21可以抑制IBDV的复制,其分子作用机理是在VP1基因翻译水平上实现的。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 miRNA gga-miR-21 慢病毒表达系统 病毒复制
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gga-miRNA-155对MDCC-MSB1细胞增殖的影响
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作者 余祖华 丁轲 +8 位作者 郁川 贾艳艳 何雷 廖成水 李静 张梦珂 邱静静 张春杰 程相朝 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2019年第2期1-6,共6页
【目的】构建gga-miRNA-155前体基因(pre-gga-miRNA-155)真核表达载体,验证gga-miRNA-155在MDCC-MSB1细胞中的表达效果,探究其对MDCC-MSB1细胞增殖的影响。【方法】采用PCR方法从鸡肝脏基因组DNA中扩增gga-miRNA-155前体基因片段pre-gga... 【目的】构建gga-miRNA-155前体基因(pre-gga-miRNA-155)真核表达载体,验证gga-miRNA-155在MDCC-MSB1细胞中的表达效果,探究其对MDCC-MSB1细胞增殖的影响。【方法】采用PCR方法从鸡肝脏基因组DNA中扩增gga-miRNA-155前体基因片段pre-gga-miRNA-155,并将其克隆入pMD-18T载体,构建克隆载体pMD-18T-pre-gga-miRNA-155。用EcoRⅠ和XhoⅠ双酶切pcDNA6.2-GW/EmGFP-miRNA真核表达载体和pMD-18T-pre-gga-miRNA-155,将pre-gga-miRNA-155酶切回收片段与pcDNA6.2-GW/EmGFP-miRNA的酶切回收片段进行连接,构建重组真核表达载体pcDNA6.2-pre-gga-miRNA-155,对其进行PCR、EcoRⅠ和XhoⅠ双酶切及DNA测序鉴定。将重组载体转染到MDCC-MSB1细胞中,应用实时荧光定量PCR (Real-time PCR)检测gga-mi-RNA-155的表达水平,利用MTT法检测细胞增殖能力的变化。【结果】PCR扩增获得了长度约154bp的鸡pre-gga-mi-RNA-155基因。成功构建了pre-gga-miRNA-155的真核表达载体pcDNA6.2-pre-gga-miRNA-155,瞬时转染MD-CC-MSB1细胞后gga-miRNA-155表达水平显著增加,且MDCC-MSB1细胞的体外增殖能力增强。【结论】成功构建了pre-gga-miRNA-155的真核表达载体,其可在MDCC-MSB1细胞中过表达gga-miRNA-155,且可促进MDCC-MSB1细胞的体外增殖。 展开更多
关键词 gga-miRNA-155 表达载体 MDCC-MSB1细胞 细胞增殖
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Optimal Bandgap of Double Perovskite La-Substituted Bi2FeCrO6 for Solar Cells:an ab initio GGA+U Study
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作者 B.Merabet H.Alamri +4 位作者 M.Djermouni A.Zaoui S.Kacimi A.Boukortt M.Bejar 《Chinese Physics Letters》 SCIE CAS CSCD 2017年第1期81-85,共5页
The ab initio generalized gradient approximation (GGA)+U study of multiferroic (La Bi )<sub>2</sub>FeCrO<sub>6</sub> in pnma structure and ferri-magnetic order, including Hubbard corrections ( ... The ab initio generalized gradient approximation (GGA)+U study of multiferroic (La Bi )<sub>2</sub>FeCrO<sub>6</sub> in pnma structure and ferri-magnetic order, including Hubbard corrections ( eV) for transition metal/rare earth d-electrons with 20 atoms cell, shows optimum local magnetic moments of (Cr , Fe equal to (?2.56, 4.14) μB and an ideal spin-down band gap of 1.54 eV. Tuned-band gap La-substituted double oxide perovskites BFCO should exhibit enhanced visible-light absorption and carrier mobility, thus could be convenient light absorbers and then efficient alternatives to wide-gap chalcopyrite absorber-based solar cells failing to achieve highest power conversion efficiencies, and even compete with their metal-organic halide perovskites counterparts. 展开更多
关键词 Cr La Optimal Bandgap of Double Perovskite La-Substituted Bi2FeCrO6 for Solar Cells:an ab initio gga+U Study Fe Bi gga
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Elastic and Optoelectronic Properties of KCdF3:ab initio Calculations through LDA/GGA/TB-mBJ within FP-LAPW Method
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作者 K. Ephraim Babu N. Murali +2 位作者 K. Vijaya Babu B. Kishore Babu V. Veeraiah 《Chinese Physics Letters》 SCIE CAS CSCD 2015年第1期108-112,共5页
Ab initio calculations are performed on the electronic, structural, elastic and optical properties of the cubic per- ovskite KCdF3. Tile Kohn Sham equations are solved by applying the full potential linearized augment... Ab initio calculations are performed on the electronic, structural, elastic and optical properties of the cubic per- ovskite KCdF3. Tile Kohn Sham equations are solved by applying the full potential linearized augmented plane wave (FP-LAPW) method. The exchange correlation effects are included through the local density approximation (LDA ), generalized gradient approximation (GGA) and modified Becke-Johnson (mBJ) exchange potential The calculated lattice constant is in good agreement with the experimental result. The elastic properties such as elastic constants, anisotropy factor, shear modulus, Young's modulus and Poisson's ratio are calculated. KCdF3 is ductile and elastically anisotropic. The calculations of the electronic band structure, density of states (DOS) and charge density show that this compound has an indirect energy band gap (M-F) with a mixed ionic and covalent bonding. The contribution of the different bands is analyzed from the total and partial density of states curves. Optical response of the dielectric functions, optical reflectivity, absorption coefficient, real part of optical conductivity, refractive index, extinction coefficient and electron energy loss, are presented for the energy range of O-40eV. The compound KCdF3 can be used for high-frequency optical and optoelectronic devices. 展开更多
关键词 gga Cd Elastic and Optoelectronic Properties of KCdF3:ab initio Calculations through LDA/gga/TB-mBJ within FP-LAPW Method LDA FP
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GGA+U方法研究不同浓度镧(La)与氮(N)掺杂纤锌矿ZnO的光学性质 被引量:1
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作者 刘桂安 王少霞 +4 位作者 赵旭才 雷博程 夏桐 黄以能 张丽丽 《原子与分子物理学报》 CAS 北大核心 2019年第6期1037-1044,共8页
本文运用基于密度泛函理论的GGA+U方法,计算了纯ZnO体系,La、N单掺ZnO体系及Zn1-xLaxO0.875N0.125(x=0.125,0.25,0.375)三个共掺体系的电子结构和光学性质.计算结果表明,共掺体系中随着La浓度的增加,掺杂后体系的禁带宽度变小,电子跃迁... 本文运用基于密度泛函理论的GGA+U方法,计算了纯ZnO体系,La、N单掺ZnO体系及Zn1-xLaxO0.875N0.125(x=0.125,0.25,0.375)三个共掺体系的电子结构和光学性质.计算结果表明,共掺体系中随着La浓度的增加,掺杂后体系的禁带宽度变小,电子跃迁所需能量减小,晶格畸变程度增大,有利于阻碍光生空穴和电子对的复合,吸收光谱吸收带边红移程度越来明显,覆盖了整个可见光区域.这些特征非常有利地说明共掺体系随La浓度的增加,其光催化功能和电学性能也在提升. 展开更多
关键词 gga+U方法 电子结构 光学性质 纤锌矿ZnO
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