基于分子对接研究甜菊醇、异甜菊醇对赤霉素受体GID1的作用机制

开发安全的类赤霉素分子,用分子对接的方法分析甜菊醇、异甜菊醇与赤霉素受体GID1作用分子机制,阐明其结合自由能和相互作用关系,为进一步开发利用提供理论依据。通过检索文献确定赤霉素受体为GID1蛋白,以GA_(3)为对照物,利用AutoDock vina软件进行分子对接。结果表明,GA_(3)、甜菊醇、异甜菊醇与GID1蛋白的结合自由能分别为-11.10 kcal/mol,-10.81 kcal/mol,-11.26 kcal/mol,说明甜菊醇和异甜菊醇两种小分子都能与赤霉素受体GID1蛋白形成稳定结合,且异甜菊醇的作用效果强于赤霉素GA_(3)。