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Preparation of norovirus GII loop mediated isothermal amplification freeze-drying microsphere reagents and its application in an on-site integrated rapid detection platform
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作者 Yanqi Wu Yuhong Guan +3 位作者 Peilin Huang Hui Chen Liping Bai Zhihong Jiang 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2024年第9期262-265,共4页
Norovirus is an infectious disease that can cause non-bacterial gastroenteritis,which has a low infectious dose,rapid onset,and strong transmission ability;therefore,rapid and sensitive detection is essential to reduc... Norovirus is an infectious disease that can cause non-bacterial gastroenteritis,which has a low infectious dose,rapid onset,and strong transmission ability;therefore,rapid and sensitive detection is essential to reduce the transmission of gastroenteritis.In the study,a norovirus GII loop-mediated isothermal amplification assay was developed and prepared into freeze-drying microspheres,and a closed-cassette-based,integrated,reagent-ambient storage,on-site instant detection platform for norovirus GII was constructed using a commercial,fully automated nucleic acid analyzer with integrated magnetic bearing based nuclear acid extraction and nucleic acid detection,with a sensitivity of 10 copies/μL,with no cross-reactivity with other 5 viruses.For 28 simulated samples,the integrated assay platform was consistent with the experimental results of reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction(RT-qPCR)assays after conventional laboratory nucleic acid extraction.The entire process can be finished in about 1 h,which is ideal for immediate rapid detection. 展开更多
关键词 Freeze-dried microspheres Point-of-care testing Loop-mediated isothermal amplification norovirus gii Integrated testing
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GII.12型诺如病毒与受体HBGAs结合模式分析 被引量:2
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作者 靳淼 陈克娜 +6 位作者 宋敬东 李慧莹 章青 孔翔羽 刘娜 高基民 段招军 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期164-169,共6页
为阐明GII.12型诺如病毒与组织血型抗原(Histo-blood group antigens,HBGAs)受体结合模式,本研究首先合成GII.12型诺如病毒毒株Pune株(GenBank登录号:EU921353)P区基因序列,并在原核系统中表达P蛋白,利用快速液相色谱分析鉴定P粒子的形... 为阐明GII.12型诺如病毒与组织血型抗原(Histo-blood group antigens,HBGAs)受体结合模式,本研究首先合成GII.12型诺如病毒毒株Pune株(GenBank登录号:EU921353)P区基因序列,并在原核系统中表达P蛋白,利用快速液相色谱分析鉴定P粒子的形成,将P粒子免疫小鼠,应用HBGAs表型明确的唾液样本分析P粒子的HBGAs结合模式。通过唾液结合分析,GII.12型诺如病毒Pune株与B型、AB型唾液结合较高,与A型、O型分泌型及O型非分泌型唾液结合较低,表明GII.12型诺如病毒与B抗原亲和性更高,这与先前GII.12型诺如病毒晶体结构的研究一致。这些研究提示,B型、AB型个体相对于其他血型个体,可能对GII.12型诺如病毒更具易感性。GII.12型诺如病毒与B抗原有更高的亲和性,为GII.12型诺如病毒的预防和控制提供了科学基础。 展开更多
关键词 诺如病毒 急性胃肠炎 gii.12基因型 P粒子 组织血型抗原
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两起GII.2型诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情的病原学分析 被引量:1
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作者 闫革彬 彭华 +4 位作者 舒高林 李东迅 王维钧 徐代庆 严寒秋 《国际病毒学杂志》 2017年第6期384-388,共5页
目的 调查2016年10月昌平区某两所幼儿园两起急性胃肠炎暴发疫情的病原体,为疫情防控提供依据.方法 采集两所幼儿园各一起急性胃肠炎暴发疫情的病例和密切接触者粪便标本,采用实时荧光RT-PCR检测方法检测病毒核酸,抽取部分阳性标本采用... 目的 调查2016年10月昌平区某两所幼儿园两起急性胃肠炎暴发疫情的病原体,为疫情防控提供依据.方法 采集两所幼儿园各一起急性胃肠炎暴发疫情的病例和密切接触者粪便标本,采用实时荧光RT-PCR检测方法检测病毒核酸,抽取部分阳性标本采用一步法RT-PCR扩增诺如病毒衣壳蛋白区部分基因,将PCR产物双向测序,采用Bio Edit和MEGA 6.06软件进行序列比对和进化分析.结果 70份粪便标本中37份为诺如病毒GII组核酸阳性,检出率为52.86%;未检出GI组.13份阳性标本的测序结果经序列比对均为诺如病毒GII.2基因型.两所幼儿园疫情代表毒株同源性为99.6%,与2016年北京和江苏毒株(GenBank序列号KY421122和KY421121)同源性最高.进化分析显示,两所幼儿园疫情代表毒株与诺如病毒GII.2基因型位于一个大的进化簇上,同中国的3株GII.2基因型毒株(GenBank序列号KY457736、KY421122、KY421121)亲缘关系最近.结论 北京昌平区两所幼儿园出现的病毒性腹泻疫情的毒株为GII.2型,应加强日常监测与防控. 展开更多
关键词 诺如病毒 暴发 gii.2型 进化树
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