一种基于GO分子功能信息的序列编码辅助预测亚细胞定位方法

亚细胞定位与蛋白质的功能紧密相关.本研究提出了一种新的编码方式,试图根据那些与亚细胞定位相关的蛋白质分子功能信息,结合氨基酸二肽组成以提高亚细胞定位预测的性能.结果显示,在使用支持向量机和RH数据集的测试中,该方法的预测精度有了显著的提高,同时对于蛋白质序列N端的不准确性也具有一定的鲁棒性.

基于改进的GO-PseAA方法的凋亡蛋白亚细胞定位

亚细胞定位与蛋白质的功能紧密相关,细胞凋亡蛋白在生物体的发育和平衡状态中起着重要的作用,因此预测凋亡蛋白的亚细胞定位是十分有意义的。本文采用一种融合GO分子功能信息和伪氨基酸组分信息的杂合算法即GO-PseAA方法,来预测凋亡蛋白亚细胞定位。采用与Chen等相同的数据集和Jackknife检验,预测成功率达到了91.4%,结果表明本文采用的改进的GO-PseAA方法是预测凋亡蛋白亚细胞位置的一种很有效的方法。

基于GO-PseAA的凋亡蛋白亚细胞定位

亚细胞定位与蛋白质的功能紧密相关,细胞凋亡蛋白在生物体的发育和平衡状态中起着重要的作用,因此细胞凋亡蛋白的亚细胞定位是十分有意义的。