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小拟南芥激素相关基因及GH3.6的克隆与表达 被引量:6
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作者 黄薇 孙琦 +3 位作者 刘芳 金玉环 罗先梅 黄先忠 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2019年第3期323-331,共9页
植物激素是植物体内产生的一些微量的、能调节自身生理过程的有机化合物,生长素是一种重要的植物激素,在植物生长发育的过程中起着重要作用。为了探索激素相关基因在短命植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)逆境适应过程中的作用,本研究... 植物激素是植物体内产生的一些微量的、能调节自身生理过程的有机化合物,生长素是一种重要的植物激素,在植物生长发育的过程中起着重要作用。为了探索激素相关基因在短命植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)逆境适应过程中的作用,本研究基于小拟南芥响应高盐胁迫叶片转录组数据库,首先筛选出2156个激素相关基因,包括生长素、脱落酸、乙烯、水杨酸、茉莉酸、油菜素内酯、细胞分裂素及赤霉素相关的基因,其中生长素和脱落酸相关基因所占比例最多并且多为上调表达。进一步通过分层聚类(H-Cluster),K均值聚类(K-means Cluster)和密度聚类(SOM Cluster)分析持续上调的基因,发现一个编码吲哚乙酸酰胺合成酶的基因GRETCHEN HAGEN 3.6(GH3.6)在高盐胁迫过程中明显上调表达。采用RT-PCR克隆小拟南芥Ap GH3.6基因,其开放阅读框长为1839 bp,编码612个氨基酸。系统进化分析表明,Ap GH3.6与山"菜(Eutrema salsugineum)GH3.6进化关系最近,属于同一进化分支。转录组数据分析表明在250 m M Na Cl下,Ap GH3.6持续上调表达;实时荧光定量PCR分析表明Ap GH3.6在小拟南芥各个组织中均有表达,但在花中表达量最高;高盐胁迫表达分析表明,随着胁迫时间增加,Ap GH3.6表达量不断升高。为了进一步研究该基因的功能,构建了植物过量表达载体35S∶Ap GH3.6并转化农杆菌GV3101。本研究为深入分析激素相关基因在小拟南芥响应盐胁迫中的功能机制奠定了基础。 展开更多
关键词 小拟南芥 gretchen hagen3(gh3) 生长素 基因表达
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CsGH3基因在长清茶新梢中的季节表达响应
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作者 马青平 韩笑 +5 位作者 宋来超 郭尚敬 孙海伟 张虹 丁兆堂 王玉 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2024年第23期7695-7701,共7页
GH3(Gretchen Hagen 3)基因属于植物生长素早期响应基因,通过调控生长素的稳态,在植物的生长发育过程中发挥重要作用。本研究在茶树中扩增出一个CsGH3基因,序列长度为1794 bp,蛋白质分子量为149.38 kD,等电点pI为4.69。序列比对发现CsGH... GH3(Gretchen Hagen 3)基因属于植物生长素早期响应基因,通过调控生长素的稳态,在植物的生长发育过程中发挥重要作用。本研究在茶树中扩增出一个CsGH3基因,序列长度为1794 bp,蛋白质分子量为149.38 kD,等电点pI为4.69。序列比对发现CsGH3与芝麻等植物同源序列相似度达86%以上,说明CsGH3属于GH3家族蛋白。基于茶树等27个物种的GH3蛋白序列建立系统进化树,结果显示,茶树CsGH3编码的蛋白序列与红猕猴桃的GH3蛋白序列处于同一个分支,说明茶树与红猕猴桃的亲缘关系最近,与芝麻和阿拉伯咖啡的亲缘关系次之,与酸枣等其他物种的亲缘关系较远。本研究以济南市长清区立泰山和南湖玉露两个不同地块的长清茶为试验材料,利用实时荧光定量PCR技术研究CsGH3在不同季节的表达动态。结果表明,夏季的CsGH3基因的相对表达量显著高于春秋两季,春季与秋季的CsGH3基因表达量没有显著性差异。研究结果为进一步揭示茶树CsGH3基因的生物学功能提供依据。 展开更多
关键词 茶树 gh3基因 生长素 不同季节
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Anchorene,a carotenoid-derived growth regulator,modulates auxin homeostasis by suppressing GH3-mediated auxin conjugation
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作者 Danping Ke Yinpeng Xie +13 位作者 Haipeng Li Liqun Hu Yi He Chao Guo Yahui Zhai Jinggong Guo Kun Li Zongyan Chu Junli Zhang Xuebin Zhang Salim Al-Babili Kai Jiang Yuchen Miao Kun-Peng Jia 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2024年第11期2490-2504,共15页
Anchorene,identified as an endogenous bioactive carotenoid-derived dialdehyde and diapocarotenoid,affects root development by modulating auxin homeostasis.However,the precise interaction between anchorene and auxin,as... Anchorene,identified as an endogenous bioactive carotenoid-derived dialdehyde and diapocarotenoid,affects root development by modulating auxin homeostasis.However,the precise interaction between anchorene and auxin,as well as the mechanisms by which anchorene modulates auxin levels,remain largely elusive.In this study,we conducted a comparative analysis of anchorene's bioactivities alongside auxin and observed that anchorene induces multifaceted auxin-like effects.Through genetic and pharmacological examinations,we revealed that anchorene's auxin-like activities depend on the indole-3-pyruvate-dependent auxin biosynthesis pathway,as well as the auxin inactivation pathway mediated by Group II Gretchen Hagen 3(GH3)proteins that mainly facilitate the conjugation of indole-3-acetic acid(IAA)to amino acids,leading to the formation of inactivated storage forms.Our measurements indicated that anchorene treatment elevates IAA levels while reducing the quantities of inactivated IAA–amino acid conjugates and ox IAA.RNA sequencing further revealed that anchorene triggers the expression of numerous auxin-responsive genes in a manner reliant on Group II GH3s.Additionally,our in vitro enzymatic assays and biolayer interferometry(BLI)assay demonstrated anchorene's robust suppression of GH3.17-mediated IAA conjugation with glutamate.Collectively,our findings highlight the significant role of carotenoid-derived metabolite anchorene in modulating auxin homeostasis,primarily through the repression of GH3-mediated IAA conjugation and inactivation pathways,offering novel insights into the regulatory mechanisms of plant bioactive apocarotenoids. 展开更多
关键词 Anchorene auxin conjugation carotenoid-derived bioactive apocarotenoid gretchen hagen 3 root development
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甜樱桃GH3基因家族全基因组鉴定与表达分析 被引量:8
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作者 侯黔东 沈天娇 +5 位作者 余欢欢 仇志浪 文壮 张惠敏 吴亚维 文晓鹏 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期2360-2374,共15页
以甜樱桃(Prunus avium L.)为材料,对IAA酰胺合成酶(Gretchen Hagen 3,GH3)基因家族全基因组进行鉴定及生物信息分析;同时,分析其在不同组织中的表达及对外源GA3、ABA、MeJA、IAA的响应。结果表明,甜樱桃基因组中共存在8个GH3基因,根据... 以甜樱桃(Prunus avium L.)为材料,对IAA酰胺合成酶(Gretchen Hagen 3,GH3)基因家族全基因组进行鉴定及生物信息分析;同时,分析其在不同组织中的表达及对外源GA3、ABA、MeJA、IAA的响应。结果表明,甜樱桃基因组中共存在8个GH3基因,根据在染色体的位置依次命名为Pav GH3.1~PavGH3.8,编码区长度为1 683~1 851 bp,预测大多数基因定位在叶绿体中;PavGH3外显子数3或4,且有较多保守基序;除5号和7号染色体外,其他染色体均有分布;启动子存在ABA、MeJA等6种激素响应元件;PavGH3在进化上分为2组,且PavGH3.5和PavGH3.6与拟南芥GH3一些成员存在共线性。表达分析显示,PavGH3.2、PavGH3.6和PavGH3.7为3个主要表达基因。PavGH3.4和PavGH3.5在第2次生理落果中较第1次上调表达,与正常果实相比,第1次生理落果中PavGH3.5和PavGH3.7下调表达,PavGH3.4和PavGH3.6上调表达。PavGH3.2、PavGH3.3、PavGH3.6和PavGH3.7为主要响应激素的基因。推测PavGH3基因家族广泛参与甜樱桃的生长发育,且可能与落果关系密切。 展开更多
关键词 甜樱桃 IAA酰胺合成酶 基因家族 生长素响应 表达分析
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