玉米RNA结合蛋白GRMZM2G052926基因的生物信息学分析

为了研究玉米RNA结合蛋白在玉米生长发育中的调节机制,以一个玉米RNA结合蛋白GRMZM2G052926基因为材料,采用生物信息学的方法,对其理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、功能域、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明:基因包含一个1 335bp开放阅读框,是一种具有亲水能力的不稳定酸性蛋白,相对分子质量38.301 1kDa,包含两个RRM超亲家族(RRM superfamily),无信号肽序列,无跨膜结构域,亚细胞定位在细胞质上,二级结构由无规则卷曲、α螺旋、延伸链和β折叠构成;系统进化树分析表明,GRMZM2G052926蛋白与水稻Os05g0437300蛋白亲缘关系最近,同源性达到87%。

玉米穗行数相关基因GRMZM2G398848的生物信息学分析

研究采用生物信息学的方法,对一个玉米穗行数相关基因GRMZM2G398848的理化性质、跨膜结构域、功能域、二级结构、三级结构等方面进行了预测和分析。结果表明:该基因编码蛋白由9 195个原子构成,其相对分子质量为65.681 1kDa,是一个不稳定亲水性蛋白,包含1个F-box超亲家族和2个AMN1超亲家族,无跨膜结构域,无信号肽,由α螺旋、无规则卷曲、延伸链和β折叠构成。

玉米GRMZM2G 455909基因的克隆及其抗病功能初步分析

本课题组前期研究获得玉米GRMZM2G 455909基因,该研究拟对GRMZM2G 455909基因开展生物信息学分析,明确其分子特征;构建过表达载体pCAMBIA1301a-GRMZM2G 455909,通过农杆菌介导法获得转GRMZM2G 455909基因拟南芥植株,分析转GRMZM2G 455909基因拟南芥植株抗病能力及其抗病信号通路。研究表明,GRMZM2G 455909基因所编码的蛋白序列属于NBS-LRR类蛋白家族;Pst DC3000处理转GRMZM2G 455909基因拟南芥植株,发现转基因植株体内菌体数量明显下降,其抗病性显著增强,推测Pst DC3000可能诱导转GRMZM2G 45590基因拟南芥体内形成水杨酸抗病信号通路。研究结果可为作物遗传育种抗病性的改良提供新的路径。