基于生物信息学鉴定CCNB2为肾嫌色细胞癌进展的关键基因

本研究旨在通过生物信息学方法筛选与肾嫌色细胞癌(Chromophobe renal cell carcinoma, chrcc)相关的生物标志物,作为预测chrcc预后的关键基因。GSE15641数据集从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中获取,共鉴定出1153个差异表达基因(DEGs)。随后,检测差异表达基因进行基因本体(GO)注释和京都基因基因组百科全书(KEGG)途径富集分析。此外,利用Cytoscape软件构建蛋白–蛋白相互作用(PPI)网络并可视化鉴定关键基因,包括KRAS、EGFR、EHHADH和CCNB2,根据Kaplan-Meier (K-M)生存分析,CCNB2是唯一重要的核心基因。根据我们的研究结果,CCNB2在The Cancer Genome Atlas(TCGA)-chrcc患者中的表达明显高于正常样本,并且CCNB2在癌症组织中的高表达与不良的临床病理因素有关。CCNB2高表达组与低表达组相比,总生存期(OS)和无进展间期(PFI)明显较差。同时,免疫浸润分析显示CCNB2表达与chrcc患者Th2细胞富集水平呈正相关,CCNB2表达与细胞毒性细胞和DC细胞呈负相关。最后,根据包括CCNB2基因在内的基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)富集结果,肝癌(HCC)亚类与乳腺癌(BC)的分类存在显著差异。在目前的工作中,CCNB2可以被认为是chrcc的预测性分子标记物和潜在的治疗靶点。