GSTM5在前列腺癌中的表达及其对前列腺癌进展的潜在机制

目的基于生物信息学方法探究正常前列腺和前列腺癌(PCa)组织中的差异表达基因,筛选出可能作为PCa潜在生物标志物的基因,为后期临床医学提供科学依据。方法从GEO数据库下载GSE55945、GSE46602和GSE69223三个基因芯片数据集,通过联川生物云平台筛选差异表达基因(DEGs),使用STRING构建DEGs的蛋白质-蛋白质互作网络(PPI),导入Cytoscape后利用CytoHubba插件筛选MCC评分前30位的基因作为关键基因(Hub基因),利用DAVID对关键基因进行GO和KEGG富集分析,采用GraphPad Prism软件绘制ROC曲线,利用GEPIA数据库对关键基因进行验证,并进一步进行生存分析,利用UALCAN验证关键基因的表达与PCa Gleason分级是否有相关性。结果GSE55945、GSE46602和GSE69223三个数据集分别得到428、727和1285个差异表达基因。韦恩(Venn)图显示三个数据集中包含的DEGs有105个。105个DEGs对应的PPI网络中筛选MCC评分排名前30位的基因作为Hub基因,其所涉及的生物过程主要包括蛋白激酶B信号的正向调节、细胞分化、转录的正调控、转化生长因子β受体信号通路负调控、细胞迁移的正向调节等,所涉及的通路为粘着斑、雌激素信号通路等。ROC曲线结果显示CAV1、KDR、CAV2、TGFBR1、SLC7A11、GSTM2、GSTM3、GSTM5、MYO6共9个基因同时在3个数据集中的诊断能力有统计学意义。9个Hub基因通过GEPIA网站验证显示,其中CAV1、KDR、CAV2、TGFBR1、GSTM2、GSTM3、GSTM5在PCa中呈低表达,而SLC7A11、MYO6在PCa中呈高表达,生存分析提示GSTM5高表达时PCa患者OS延长。UALCAN结果显示,GSTM5基因的表达与Gleason分级有明显相关性,并且随着Gleason评分的增加,GSTM5基因的表达不断降低。结论9个Hub基因中,CAV1、KDR、CAV2、TGFBR1、GSTM2、GSTM3、GSTM5在PCa中呈低表达,而SLC7A11、MYO6在PCa中呈高表达,其中GSTM5基因与PCa生存率有关,并随着Gleason评分增加,GSTM5基因的表达降低,提示GSTM5可能作为PCa潜在的生物标志物。

骨髓增生异常综合征GSTM5基因启动子区甲基化的状态及意义

目的探讨谷胱甘肽转移酶mu5(GSTM5)启动子区甲基化状态在骨髓增生异常综合征(MDS)发生发展中的作用,为MDS的早期诊断提供新的潜在分子标记物。方法收集2018年10月至2021年6月在解放军总医院血液科初诊的40例MDS[MDS伴单系发育异常(MDS-SLD)5例,MDS伴多系发育异常(MDS-MLD)7例,MDS伴环形铁粒幼红细胞(MDS-RS)6例,MDS伴原始细胞增多Ⅰ型(RAEB1)13例,MDS伴原始细胞增多Ⅱ型(RAEB2)9例]患者、8例MDS转化为急性髓系白血病(sAML)患者和6例对照(4例缺铁性贫血、2例营养性巨幼细胞性贫血)患者的骨髓血标本。采用Agena MassARRAY核酸质谱技术对3组标本进行GSTM5基因启动子区甲基化的定量检测。采用Wilcoxon非参数检验比较不同组GSTM5基因甲基化水平。采用受试者工作特征(ROC)曲线评价试验的特异度、敏感度和准确度。结果聚类分析结果显示,MDS组GSTM5甲基化率高于对照组[0.50(0.27,0.79)比0.29(0.10,0.45),P<0.05];sAML组GSTM5甲基化率明显高于MDS组[0.67(0.36,0.86)比0.50(0.27,0.79),P<0.05]。分析各CpG位点甲基化率的差异,在CpG_1、CpG_4,5、CpG_6,7,8、CpG_11、CpG_13,14、CpG_15、CpG_16、CpG_22和CpG_24位点,MDS组与对照组比较,差异有统计学意义(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,在CpG_6,7,8单位曲线下面积最大,AUC=0.861(95%CI 0.717~1.000,P<0.05),敏感度和特异度分别为85%和83%。分析GSTM5甲基化与MDS疾病发展的关系,在骨髓原始细胞较高组和高危亚组(RAEB)中GSTM5基因甲基化水平较高。结论GSTM5基因启动子区甲基化在MDS中较常见,并且在MDS发生发展过程中可能起重要作用,可作为诊断MDS的潜在肿瘤标志物。