ADP核糖基化因子的GTP酶激活蛋白1、肌动蛋白束蛋白1在胃癌组织中的表达及与患者预后的关系

目的探讨ADP核糖基化因子的GTP酶激活蛋白1(ASAP1)、肌动蛋白束蛋白1(FSCN1)在胃癌中的表达、预后相关性。方法运用UALCAN、Kaplan-Meier数据库分析ASAP1、FSCN1在胃癌组织与正常胃黏膜组织中的表达与患者预后的关系,并采用qRT-PCR、免疫组化验证ASAP1、FSCN1在胃癌与癌旁的表达差异。结果与正常胃黏膜组织相比,ASAP1、FSCN1在胃癌组织中表达升高(P<0.01),且ASAP1、FSCN1高表达组患者的总生存率下降(P<0.05)。qRT-PCR显示胃癌中ASAP1、FSCN1 mRNA的表达水平高于癌旁正常黏膜组织(P<0.05)。免疫组化结果显示,胃癌ASAP1、FSCN1阳性表达率高于癌旁正常胃黏膜组织,差异均有统计学意义(P<0.05)。ASAP1 mRNA和FSCN1 mRNA的表达成正相关(r=0.558,P=0.000)。ASAP1、FSCN1的表达与胃癌浸润深度、淋巴结转移及远处转移相关(P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析发现,ASAP1、FSCN1阴性表达总体生存率高于阳性表达(P<0.05)。结论ASAP1、FSCN1在胃癌组织中均高表达,2者可能协同促进胃癌的发生和发展,且在胃癌的浸润、转移中发挥了重要作用。

基于生信分析探索STARD8表达对肺癌A549细胞生物学功能的影响

目的探讨STARD8对肺癌A549细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡生物学功能的影响。方法从美国国家生物技术信息中心(NCBI),获取两份公开的基因芯片数据集(GSE18842和GSE68571),运用limma R包识别差异表达基因(DEGs)。采用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归法结合SVM-RFE算法对候选基因进行筛选,构建受试者工作特征(ROC)曲线,应用CIBERSORT工具进行免疫浸润分析。通过RT-qPCR和Western blot分析STARD8在对照组及肺癌组的mRNA及蛋白水平,通过细胞平板克隆、Transwell、细胞划痕及流式细胞实验分析STARD8对A549细胞的增殖、侵袭、迁移及凋亡能力的影响。结果共筛选出285个上调基因和377个下调基因,取交集得到1个诊断标志物基因STARD8,免疫分析显示CD4 T细胞、NK细胞出现免疫抑制。肺癌组中STARD8的mRNA及蛋白表达均下调(P均<0.05)。STARD8过表达时肺癌A549细胞的增殖、侵袭及迁移能力降低,凋亡能力增加(P均<0.05)。结论STARD8可抑制肺癌A549细胞增殖、侵袭及迁移,促进细胞凋亡。

环状RNA ADP核糖基化因子GTP酶激活蛋白调控类风湿关节炎滑膜成纤维细胞增殖及迁移机制

目的探讨环状RNA(circRNA)ADP核糖基化因子GTP酶激活蛋白(ASAP1)调控类风湿关节炎(RA)滑膜成纤维细胞(SFs)增殖及迁移机制。方法提取RA及关节外伤患者SFs行后续实验。分别用Lipofectamine 3000将si-NC、si-circASAP1、miR-NC、miR-144-3p mimics、pcDNA-NC、pcDNA-circASAP1、抗miR-NC与si-circASAP1、抗miR-144-3p与si-circASAP1分别转染RA-SFs(记为si-NC组、si-circASAP1组、miR-NC组、miR-144-3p组、pcDNA-NC组、pcDNA-circASAP1组、抗miR-NC+si-circASAP1组、抗miR-144-3p+si-circASAP1组)。未转染RA-SFs记为对照组(NC组)。细胞计数试剂盒-8(CCK-8)检测细胞增殖;实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测circASAP1和微小核糖核酸144-3p(miR-144-3p)表达;蛋白质印迹法检测基质金属蛋白酶2(MMP-2)及基质金属蛋白酶9(MMP-9)蛋白表达;Transwell检测细胞迁移;双荧光素酶报告基因实验检测circASAP1靶向调控miR-144-3p表达。两组间比较采用t检验;多组间比较用单因素方差分析(两组间比较用SNK-q检验)。结果RA患者滑膜组织及SFs中circASAP1表达高于关节外伤患者滑膜组织及SFs(滑膜组织2.46±0.28比1.00±0.12,SFs中3.16±0.15比1.00±0.11),miR-144-3p低于关节外伤患者滑膜组织及SFs(滑膜组织0.43±0.11比1.00±0.15,SFs中0.38±0.03比1.00±0.08),差异有统计学意义(t=40.949、26.182,P<0.05)。si-circASAP1组RA-SFs的circASAP1、MMP-2、MMP-9表达、细胞活力和细胞迁移数均低于NC组和si-NC组(0.47±0.03比1.00±0.07、1.02±0.10,0.41±0.03比0.83±0.07、0.81±0.06,0.35±0.03比0.77±0.06、0.75±0.06,0.57±0.05比1.12±0.07、1.11±0.09,97.00±7.23比194.00±13.25、203.00±11.54),差异有统计学意义(F=166.272、161.234、187.111、194.126、258.352,P<0.05)。miR-144-3p组RA-SFs的miR-144-3p表达高于miR-NC组(2.09±0.15比1.00±0.09),MMP-2、MMP-9表达、细胞活力和细胞迁移数均低于miR-NC组(0.37±0.02比0.83±0.07、0.31±0.02比0.74±0.06、0.62±0.05比1.21±0.07、115.00±7.36比197.00±12.51),差异有统计学意义(t=18.693、18.956、20.397、20.541、16.949,P<0.05)。抗miR-144-3p+si-circASAP1组RA-SFs中miR-144-3p表达量低于抗miR-NC+si-circASAP1组(0.49±0.05比1.00±0.07),MMP-2、MMP-9蛋白表达、细胞活力及细胞迁移数高于抗miR-NC+si-circASAP1组(0.89±0.06比0.40±0.03、0.72±0.07比0.34±0.02、1.02±0.08比0.57±0.04、188.00±10.67比95.00±6.13),差异有统计学意义(t=17.786、21.913、15.659、15.194、22.673,P<0.05)。结论RA患者circASAP1表达增高而miR-144-3p表达降低,抑制circASAP1通过上调miR-144-3p可降低SFs增殖和迁移能力。