苹果是我国种植面积最广的温带水果之一,由苹果黑腐皮壳菌(Valsa mali)引起的苹果树腐烂病(Valsa canker of apple)是危害我国苹果树最为严重的病害之一。明确病原菌生长发育、响应环境胁迫及致病作用,解析病原菌的适应性及致病分子机制...苹果是我国种植面积最广的温带水果之一,由苹果黑腐皮壳菌(Valsa mali)引起的苹果树腐烂病(Valsa canker of apple)是危害我国苹果树最为严重的病害之一。明确病原菌生长发育、响应环境胁迫及致病作用,解析病原菌的适应性及致病分子机制,有利于提出病害新的防控措施。本研究应用Double-joint PCR以及gap-repair方法获得基因VM1G_08720的缺失突变体和回补菌株。利用十字交叉法和伤口接种等方法,研究了基因VM1G_08720对病菌生长发育和致病性的影响。通过在PDA培养基中分别添加400μg/mL的荧光增白剂、200μg/mL的刚果红、0.01%的SDS三种细胞壁干扰剂和0.5M的NaCl、0.5M山梨醇两种渗透胁迫因子,研究了该基因对病菌细胞壁完整性的维持及渗透胁迫的影响。通过设置不同pH的培养基,研究了基因VM1G_08720在不同pH下对病菌生长发育的影响。研究结果显示,与野生型sdau11-175相比,基因VM1G_08720缺失突变体在菌落颜色、菌丝致密度、生长速率无显著差异,分生孢子器产生数量减少;在含有200μg/mL刚果红、0.01%SDS的培养基上,抑制率显著降低,在含有0.5 M NaCl的培养基上的抑制率显著增加,而在含有400μg/mL荧光增白剂和0.5 M山梨醇的培养基上,无显著差异;在pH为4-10时,生长速率显著降低,而在pH为11-12时,无显著性差异;在苹果果实和苹果枝条上的病斑大小无显著性差异,回补菌株均恢复到野生型水平。表明基因VM1G_08720在病菌分生孢子器的产生、酸碱度的响应、维持细胞壁完整性以及渗透胁迫方面发挥重要作用。展开更多
目的研究G_(2)/S期应答相关蛋白1(G_(2) and S phase-expressed protein 1,GTSE1)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达、免疫学作用和预后分析,及其潜在作用机制。方法使用公共数据库癌症基因组图谱(The Cancer Genome At...目的研究G_(2)/S期应答相关蛋白1(G_(2) and S phase-expressed protein 1,GTSE1)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达、免疫学作用和预后分析,及其潜在作用机制。方法使用公共数据库癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)提供的数据,用Kaplan-Meier、肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库和基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库进行GTSE1基因表达、免疫学作用及预后分析,通过免疫组化实验验证GTSE1在临床样本中的表达,应用R软件对GTSE1相关差异基因进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。结果GTSE1在人类癌组织中显著高表达,且与肝细胞癌预后不良显著相关(P<0.05);GTSE1基因表达与HCC中浸润性免疫细胞的丰度显著相关(P<0.001)。GTSE1相关的差异表达基因主要富集于核分裂、细胞器裂变、离子通道活性等基因模块;其参与的信号通路主要包括神经活性配体-受体的相互作用、细胞周期等。结论GTSE1在HCC中的表达显著上调并与患者预后不良显著相关,且在免疫细胞浸润中发挥重要作用,可作为HCC的预后标志物和免疫治疗靶点。展开更多
目的:探究外周血单个核细胞G_(2)/S期应答相关蛋白1(G_(2)and S phase-expressed-1,GTSE1)水平与上皮性卵巢癌(epithelial ovarian cancer,EOC)预后的关系。方法:GEPIA和Kaplan-Meier Plotter分析GTSE1在卵巢癌组织中的表达及其与预后...目的:探究外周血单个核细胞G_(2)/S期应答相关蛋白1(G_(2)and S phase-expressed-1,GTSE1)水平与上皮性卵巢癌(epithelial ovarian cancer,EOC)预后的关系。方法:GEPIA和Kaplan-Meier Plotter分析GTSE1在卵巢癌组织中的表达及其与预后的关系。选择2017年04月至2020年10月本院126例EOC患者(EOC组)和40例同期无EOC的健康体检者(对照组)作为研究对象。Ficoll密度梯度离心法分离外周血中单个核细胞,蛋白质免疫印迹法检测GTSE1水平。Spearman相关分析EOC组织和外周血单个核细胞中GTSE1水平的关系。随访了解EOC预后,用COX回归分析EOC预后的风险因素。结果:GEPIA和Kaplan-Meier Plotter分析结果显示,卵巢癌组织中GTSE1水平高于正常卵巢组织(P<0.05),GTSE1低水平卵巢癌患者的中位无进展生存时间高于GTSE1高水平卵巢癌患者(P<0.05)。随访期间复发98例(77.8%),其中铂类敏感型65例,铂类耐药型33例;死亡41例(32.5%)。EOC组的外周血单个核细胞中GTSE1 mRNA和GTSE1蛋白水平均高于对照组(P<0.001)。EOC患者癌组织和外周血单个核细胞中GTSE1水平呈正相关关系(r_(s)=0.225,P=0.011)。国际妇产科联盟(International Federation of Gynecology and Obstetrics,FIGO)Ⅰ-Ⅱ期患者的GTSE1水平低于Ⅲ-Ⅳ期的患者(P<0.001);未复发患者的GTSE1水平低于铂类敏感型和铂类耐药型的患者(P<0.05);生存患者的GTSE1水平低于死亡患者(P<0.001)。GTSE1高水平患者的无复发生存时间和总生存时间均低于GTSE1低水平患者(P<0.001)。COX回归分析结果显示,FIGO分期高(HR=2.110,95%CI:1.465~3.038,P<0.001;HR=2.261,95%CI:1.212~4.216,P=0.011)、初次手术残存灶>1 cm(HR=1.724,95%CI:1.130~2.631,P=0.012;HR=2.465,95%CI:1.246~4.874,P=0.010)和GTSE1>1.29(HR=2.071,95%CI:1.304~3.291,P=0.002;HR=5.634,95%CI:2.410~13.169,P<0.001)是EOC预后(复发和生存)的独立危险因素,应用贝伐单抗(HR=0.293,95%CI:0.116~0.738,P=0.010;HR=0.141,95%CI:0.056~0.357,P<0.001)是EOC预后的独立保护因素。结论:EOC患者外周血单个核细胞中GTSE1水平高提示预后不良风险高。展开更多
文摘苹果是我国种植面积最广的温带水果之一,由苹果黑腐皮壳菌(Valsa mali)引起的苹果树腐烂病(Valsa canker of apple)是危害我国苹果树最为严重的病害之一。明确病原菌生长发育、响应环境胁迫及致病作用,解析病原菌的适应性及致病分子机制,有利于提出病害新的防控措施。本研究应用Double-joint PCR以及gap-repair方法获得基因VM1G_08720的缺失突变体和回补菌株。利用十字交叉法和伤口接种等方法,研究了基因VM1G_08720对病菌生长发育和致病性的影响。通过在PDA培养基中分别添加400μg/mL的荧光增白剂、200μg/mL的刚果红、0.01%的SDS三种细胞壁干扰剂和0.5M的NaCl、0.5M山梨醇两种渗透胁迫因子,研究了该基因对病菌细胞壁完整性的维持及渗透胁迫的影响。通过设置不同pH的培养基,研究了基因VM1G_08720在不同pH下对病菌生长发育的影响。研究结果显示,与野生型sdau11-175相比,基因VM1G_08720缺失突变体在菌落颜色、菌丝致密度、生长速率无显著差异,分生孢子器产生数量减少;在含有200μg/mL刚果红、0.01%SDS的培养基上,抑制率显著降低,在含有0.5 M NaCl的培养基上的抑制率显著增加,而在含有400μg/mL荧光增白剂和0.5 M山梨醇的培养基上,无显著差异;在pH为4-10时,生长速率显著降低,而在pH为11-12时,无显著性差异;在苹果果实和苹果枝条上的病斑大小无显著性差异,回补菌株均恢复到野生型水平。表明基因VM1G_08720在病菌分生孢子器的产生、酸碱度的响应、维持细胞壁完整性以及渗透胁迫方面发挥重要作用。
文摘目的研究G_(2)/S期应答相关蛋白1(G_(2) and S phase-expressed protein 1,GTSE1)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达、免疫学作用和预后分析,及其潜在作用机制。方法使用公共数据库癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)提供的数据,用Kaplan-Meier、肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库和基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库进行GTSE1基因表达、免疫学作用及预后分析,通过免疫组化实验验证GTSE1在临床样本中的表达,应用R软件对GTSE1相关差异基因进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。结果GTSE1在人类癌组织中显著高表达,且与肝细胞癌预后不良显著相关(P<0.05);GTSE1基因表达与HCC中浸润性免疫细胞的丰度显著相关(P<0.001)。GTSE1相关的差异表达基因主要富集于核分裂、细胞器裂变、离子通道活性等基因模块;其参与的信号通路主要包括神经活性配体-受体的相互作用、细胞周期等。结论GTSE1在HCC中的表达显著上调并与患者预后不良显著相关,且在免疫细胞浸润中发挥重要作用,可作为HCC的预后标志物和免疫治疗靶点。
文摘目的:探究外周血单个核细胞G_(2)/S期应答相关蛋白1(G_(2)and S phase-expressed-1,GTSE1)水平与上皮性卵巢癌(epithelial ovarian cancer,EOC)预后的关系。方法:GEPIA和Kaplan-Meier Plotter分析GTSE1在卵巢癌组织中的表达及其与预后的关系。选择2017年04月至2020年10月本院126例EOC患者(EOC组)和40例同期无EOC的健康体检者(对照组)作为研究对象。Ficoll密度梯度离心法分离外周血中单个核细胞,蛋白质免疫印迹法检测GTSE1水平。Spearman相关分析EOC组织和外周血单个核细胞中GTSE1水平的关系。随访了解EOC预后,用COX回归分析EOC预后的风险因素。结果:GEPIA和Kaplan-Meier Plotter分析结果显示,卵巢癌组织中GTSE1水平高于正常卵巢组织(P<0.05),GTSE1低水平卵巢癌患者的中位无进展生存时间高于GTSE1高水平卵巢癌患者(P<0.05)。随访期间复发98例(77.8%),其中铂类敏感型65例,铂类耐药型33例;死亡41例(32.5%)。EOC组的外周血单个核细胞中GTSE1 mRNA和GTSE1蛋白水平均高于对照组(P<0.001)。EOC患者癌组织和外周血单个核细胞中GTSE1水平呈正相关关系(r_(s)=0.225,P=0.011)。国际妇产科联盟(International Federation of Gynecology and Obstetrics,FIGO)Ⅰ-Ⅱ期患者的GTSE1水平低于Ⅲ-Ⅳ期的患者(P<0.001);未复发患者的GTSE1水平低于铂类敏感型和铂类耐药型的患者(P<0.05);生存患者的GTSE1水平低于死亡患者(P<0.001)。GTSE1高水平患者的无复发生存时间和总生存时间均低于GTSE1低水平患者(P<0.001)。COX回归分析结果显示,FIGO分期高(HR=2.110,95%CI:1.465~3.038,P<0.001;HR=2.261,95%CI:1.212~4.216,P=0.011)、初次手术残存灶>1 cm(HR=1.724,95%CI:1.130~2.631,P=0.012;HR=2.465,95%CI:1.246~4.874,P=0.010)和GTSE1>1.29(HR=2.071,95%CI:1.304~3.291,P=0.002;HR=5.634,95%CI:2.410~13.169,P<0.001)是EOC预后(复发和生存)的独立危险因素,应用贝伐单抗(HR=0.293,95%CI:0.116~0.738,P=0.010;HR=0.141,95%CI:0.056~0.357,P<0.001)是EOC预后的独立保护因素。结论:EOC患者外周血单个核细胞中GTSE1水平高提示预后不良风险高。