应用ABEEM方法计算含金属离子Ga^(3+)蛋白的电荷分布

首次开发ABEEM方法应用于含金属离子Ga^(3+)蛋白体系的研究.ABEEM方法将分子电荷分解到了原子区域、σ键区域、π键区域和孤对电子区域.对金属离子Ga^(3+)与蛋白之间的相互作用采用成键模型,Ga^(3+)与配体原子之间有键电荷分布.通过蛋白晶体数据库的搜索,总结出Ga^(3+)离子和蛋白相互作用的模型分子,确定了相关的新的电荷参数.应用ABEEM方法对模型分子的电荷分布、电荷转移和Ga^(3+)离子的电荷进行了计算和分析.结果表明,ABEEM方法计算的电荷可以和从头算的HF/STO-3G方法的结果相比拟,可以快速给出所有的模型分子的电荷分布.并且通过金属离子Ga^(3+)蛋白大分子体系的电荷计算验证了ABEEM方法以及电荷参数的正确性和可转移性.高价态的Ga^(3+)离子和蛋白的相互作用的理论研究,为其动力学模拟研究奠定了基础.