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受盐胁迫诱导表达的旱地棉GarMSL基因结构与表达特征
被引量:
3
1
作者
郭琪
刘章伟
+4 位作者
范昕琦
徐鹏
张香桂
倪万潮
沈新莲
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期1-6,共6页
棉属野生旱地棉种具有很好的耐盐性,是开展棉花耐盐性机制研究以及改良陆地棉耐盐性的重要资源。基于cDNAAFLP技术分离获得了旱地棉盐胁迫下的差异表达片段序列信息,利用电子克隆方法并在基因组和转录水平上进行全长基因验证,克隆获得1...
棉属野生旱地棉种具有很好的耐盐性,是开展棉花耐盐性机制研究以及改良陆地棉耐盐性的重要资源。基于cDNAAFLP技术分离获得了旱地棉盐胁迫下的差异表达片段序列信息,利用电子克隆方法并在基因组和转录水平上进行全长基因验证,克隆获得1个编码旱地棉类机械敏感离子通道蛋白的基因,命名为GarMSL(GenBank登录号:KC167359)。该基因ORF长为2 124 bp,编码707个氨基酸,含13个外显子和12个内含子。生物信息学分析显示,该蛋白包含ABC转运体功能域、阳离子外排功能域及机械敏感离子通道功能域等多种蛋白功能域。拷贝数分析推测,该基因在二倍体棉种基因组中含1个拷贝,在四倍体棉种基因组中含2个拷贝。qRT-PCR分析显示,该基因在旱地棉不同盐处理时期的叶片和根中均上调表达,在诱导24 h后表达水平达到高峰。
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关键词
garmsl基因
结构特征
盐胁迫
诱导表达
旱地棉
下载PDF
职称材料
题名
受盐胁迫诱导表达的旱地棉GarMSL基因结构与表达特征
被引量:
3
1
作者
郭琪
刘章伟
范昕琦
徐鹏
张香桂
倪万潮
沈新莲
机构
江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花与油菜重点实验室
南京农业大学农学院
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期1-6,共6页
基金
转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08005-004-002)
江苏省农业科技自主创新基金(CX(12)3068)
文摘
棉属野生旱地棉种具有很好的耐盐性,是开展棉花耐盐性机制研究以及改良陆地棉耐盐性的重要资源。基于cDNAAFLP技术分离获得了旱地棉盐胁迫下的差异表达片段序列信息,利用电子克隆方法并在基因组和转录水平上进行全长基因验证,克隆获得1个编码旱地棉类机械敏感离子通道蛋白的基因,命名为GarMSL(GenBank登录号:KC167359)。该基因ORF长为2 124 bp,编码707个氨基酸,含13个外显子和12个内含子。生物信息学分析显示,该蛋白包含ABC转运体功能域、阳离子外排功能域及机械敏感离子通道功能域等多种蛋白功能域。拷贝数分析推测,该基因在二倍体棉种基因组中含1个拷贝,在四倍体棉种基因组中含2个拷贝。qRT-PCR分析显示,该基因在旱地棉不同盐处理时期的叶片和根中均上调表达,在诱导24 h后表达水平达到高峰。
关键词
garmsl基因
结构特征
盐胁迫
诱导表达
旱地棉
Keywords
garmsl
gene
structural characterization
salt stress
induced expression
Gossypium aridum
分类号
S562 [农业科学—作物学]
Q781 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
受盐胁迫诱导表达的旱地棉GarMSL基因结构与表达特征
郭琪
刘章伟
范昕琦
徐鹏
张香桂
倪万潮
沈新莲
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
3
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