基因挖掘软件GenCLip寻找强直性脊柱炎相关基因的研究

目的:以强直性脊柱炎(AS)为例,分析探讨基因挖掘软件GenCLip用于寻找与疾病相关的基因的可行性。方法:根据全基因组cDNA芯片结果,在常规统计方法初筛得出的25个差异基因(AS与健康志愿者比较)的基础上,采用GenCLip寻找与AS相关的基因。结果:在用2个关键词Fibrosis、Inflammation创建网络时发现了2个新的与AS相关的基因RGS1和CCL3L3,它们和AS的炎症、纤维化网络相关,通过实时荧光定量法证实RGS1是一个未分化脊柱关节病(SpA)重要的生物标记,而CCL3L3在AS中的作用则有待进一步研究。结论:用GenCLip软件分析芯片结果寻找疾病相关基因可能是一个可行方法,建议推广应用以进一步验证其可靠性。