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我国部分新型布尼亚病毒分离株全基因组序列分析
被引量:
2
1
作者
刘秀兰
姚学君
+2 位作者
张雪峰
管书慧
姜仁杰
《江苏预防医学》
CAS
2018年第6期623-625,648,共4页
目的 分析我国新型布尼亚病毒分离株全基因组序列,了解遗传进化特点。 方法 利用DNA STAR和MEGA 6.0软件,对GenBank数据库收录的我国75株分离株全基因组序列进行分析,构建系统进化树,并对毒株核苷酸和氨基酸突变位点进行统计。 结...
目的 分析我国新型布尼亚病毒分离株全基因组序列,了解遗传进化特点。 方法 利用DNA STAR和MEGA 6.0软件,对GenBank数据库收录的我国75株分离株全基因组序列进行分析,构建系统进化树,并对毒株核苷酸和氨基酸突变位点进行统计。 结果 75株新型布尼亚病毒分离株流行优势株为基因型C;分离株核苷酸碱基突变总数合计5 938 bp,主要为碱基转换(占79.86%);氨基酸间突变总数合计3 304 aa。 结论 我国新型布尼亚病毒全基因组序列系统进化树具有相似的拓补结构。
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关键词
新型布尼亚病毒
全基因组
序列分析
GENBANK数据库
下载PDF
职称材料
题名
我国部分新型布尼亚病毒分离株全基因组序列分析
被引量:
2
1
作者
刘秀兰
姚学君
张雪峰
管书慧
姜仁杰
机构
盐城市疾病预防控制中心
江苏省疾病预防控制中心
出处
《江苏预防医学》
CAS
2018年第6期623-625,648,共4页
基金
江苏省重大传染病防控科技示范项目(BE2015714)
江苏省流行病学重点学科(ZDXK A2016008)
文摘
目的 分析我国新型布尼亚病毒分离株全基因组序列,了解遗传进化特点。 方法 利用DNA STAR和MEGA 6.0软件,对GenBank数据库收录的我国75株分离株全基因组序列进行分析,构建系统进化树,并对毒株核苷酸和氨基酸突变位点进行统计。 结果 75株新型布尼亚病毒分离株流行优势株为基因型C;分离株核苷酸碱基突变总数合计5 938 bp,主要为碱基转换(占79.86%);氨基酸间突变总数合计3 304 aa。 结论 我国新型布尼亚病毒全基因组序列系统进化树具有相似的拓补结构。
关键词
新型布尼亚病毒
全基因组
序列分析
GENBANK数据库
Keywords
Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus
Complete genome sequence
Sequence analysis
genband data base
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
我国部分新型布尼亚病毒分离株全基因组序列分析
刘秀兰
姚学君
张雪峰
管书慧
姜仁杰
《江苏预防医学》
CAS
2018
2
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职称材料
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参考文献
引证文献
统计分析
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