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不等微卫星座位数目对Nei氏标准遗传距离估测精度的影响 被引量:16
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作者 张爱玲 马月辉 +1 位作者 陈秀梅 陈宏 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期431-433,共3页
以实际测定的19个微卫星座位的基因频率为基础,分析了中国4个山羊品种在3、6、9、12、15个微卫星座位情况下的遗传距离精度,结果表明:随着微卫星数目的增多,遗传距离精度也随着升高。t检验结果表明:15个座位下测得的遗传距离精度与在3、... 以实际测定的19个微卫星座位的基因频率为基础,分析了中国4个山羊品种在3、6、9、12、15个微卫星座位情况下的遗传距离精度,结果表明:随着微卫星数目的增多,遗传距离精度也随着升高。t检验结果表明:15个座位下测得的遗传距离精度与在3、6、9、12座位时的估测精度呈显著差异。分析群体间遗传关系时应选用较多的座位。 展开更多
关键词 遗传距离 估测精度 座位数 微卫星座位 标准 不等 基因频率 山羊品种 检验结果 遗传关系
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Nei氏标准遗传距离的估测精度 被引量:27
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作者 张继全 邵春荣 +1 位作者 王毓英 陈幼春 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第1期27-32,共6页
以实际基因频率为基础,用计算机模拟和实例分析等方法研究了Nei氏标准遗传距离估测精度的影响因素。指出:(1)稀有等位基因和在品种间低变异度的基因对聚类分析贡献极小,实验设计中可不予考虑;(2)相似品种间具有较低的遗传... 以实际基因频率为基础,用计算机模拟和实例分析等方法研究了Nei氏标准遗传距离估测精度的影响因素。指出:(1)稀有等位基因和在品种间低变异度的基因对聚类分析贡献极小,实验设计中可不予考虑;(2)相似品种间具有较低的遗传距离期望值,此时遗传距离的估测精度较低,实验设计中应多考虑位点数和个体数;(3)位点数较少时遗传距离估测精度较低,可靠性不高,使用很少位点进行聚类分析的工作以后不应再度进行;(4)随个体数增加,遗传距离估测精度增高。 展开更多
关键词 遗传距离 基因频率 精度 模拟 畜禽
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中国大陆钉螺种群遗传学研究——Ⅲ.遗传变异与地理分布的关系 被引量:6
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作者 周晓农 洪青标 +4 位作者 孙乐平 徐秋 吴中兴 黄海文 Thomas K.Kristensen 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 1995年第4期202-205,共4页
本研究目的是通过检测中国大陆钉螺不同种群的等位基因频率,研究种群遗传变异与相应地理分布之关系,以确定流行区现场钉螺的种群结构。结果显示,7个多态基因位点的等位基因频率地理分布呈现3种类型:均衡、分散和非连续变向分布。3个主... 本研究目的是通过检测中国大陆钉螺不同种群的等位基因频率,研究种群遗传变异与相应地理分布之关系,以确定流行区现场钉螺的种群结构。结果显示,7个多态基因位点的等位基因频率地理分布呈现3种类型:均衡、分散和非连续变向分布。3个主要多态基因位点(Est—4、Got和Mdh—2)均显示了非连续变向。样本种群间遗传距离与地理距离的回归分析表明,Logistic S曲线回归为最佳拟合曲线。结合其它数据,认为分裂亚群模型是中国大陆钉螺种群的基因结构模型。 展开更多
关键词 钉螺 地理分布 等位基因频率 遗传距离 LOGISTIC S形曲线回归
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四川南江两种水青冈种群遗传多样性初步研究 被引量:15
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作者 李俊清 吴刚 刘雪萍 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期42-49,共8页
利用凝胶电泳法研究米心水青冈(Fagusengleriana)和巴山水青冈(F.pashanica)2个种4个种群的遗传多样性。所测定的酶系统包括:过氧化物酶(PX1和PX2),磷酸葡萄糖脱氢酶(PGD),酸性磷酸化... 利用凝胶电泳法研究米心水青冈(Fagusengleriana)和巴山水青冈(F.pashanica)2个种4个种群的遗传多样性。所测定的酶系统包括:过氧化物酶(PX1和PX2),磷酸葡萄糖脱氢酶(PGD),酸性磷酸化酶(ACP),超氧物歧化酶(SOD),谷氨酸草酰乙酸转氨酶(GOT1和GOT2),异柠檬酸脱氢酶(IDH),磷酸果糖异构酶(PGI),甲基萘醌还原酶(MNR),葡萄糖磷酸变位酶(PGM1和PGM2)和苹果酸脱氢酶(MDH2)10种酶系统。测定和分析了水青冈等位基因频率、遗传多样性、固定指数、Hardy-Weinberg平衡和遗传距离指标。 展开更多
关键词 基因频率 遗传多样性 遗传距离 水青冈
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欧亚大陆水青冈种群遗传多样性对比分析 被引量:7
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作者 李景文 李俊清 《北京林业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第5期1-9,共9页
该文应用凝胶电泳法测定中国水青冈3个种,即米心水青冈、巴山水青冈和亮叶水青冈的种群遗传多样性;分析了各物种种间、种内的遗传变异和亲缘关系.同时与欧洲水青冈进行了对比,探讨不同环境下水青冈的地理变异及其变异的机制.所测定的酶... 该文应用凝胶电泳法测定中国水青冈3个种,即米心水青冈、巴山水青冈和亮叶水青冈的种群遗传多样性;分析了各物种种间、种内的遗传变异和亲缘关系.同时与欧洲水青冈进行了对比,探讨不同环境下水青冈的地理变异及其变异的机制.所测定的酶系统包括:过氧化物酶(PX1和PX2)、磷酸葡萄糖脱氢酶(PGD)、酸性磷酸化酶(ACP和ACP2)、超氧化物歧化酶(SOD)、谷氨酸草酰乙酸转氨酶(GOT1、GOT2和GOT3)、异柠檬酸脱氢酶(IDH)、磷酸果糖异构酶(PGI)、甲基萘醌还原酶(MNR)、葡萄糖磷酸变位酶(PGM1和PGM2)和苹果酸脱氢酶(MDH1和MDH2)10种酶系统.研究结果表明,各物种特有等位基因是分析遗传多样性的关键,不同季节气候和不同地理条件下,水青冈种内基因频率和等位基因表达也不同.亮叶水青冈和米心水青冈都含有较多的特有等位基因,是相对独立和分布范围广泛的树种;亮叶水青冈与巴山水青冈的亲缘关系最近,而米心水青冈与亮叶水青冈和巴山水青冈的亲缘关系都远.但这几种与欧洲水青冈相比,又相对具有更近的亲缘关系. 展开更多
关键词 水青冈 同工酶 基因频率 遗传多样性 遗传距离
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五个昆明小鼠封闭群遗传生化位点比较研究 被引量:5
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作者 岳秉飞 刘双环 +4 位作者 刘殿峰 胡卫平 章根木 王珑 邢瑞昌 《实验动物科学》 2003年第z1期58-62,共5页
目的 为了进行昆明小鼠标准化研究 ,探讨了不同种群遗传生化位点的差异。方法 随机选取北京生物制品研究所、长春生物制品研究所、华北药厂、中国医学科学院实验动物研究所和中国药品生物制品检定所昆明小鼠各 4 0只 (雌雄各半 ) ,测... 目的 为了进行昆明小鼠标准化研究 ,探讨了不同种群遗传生化位点的差异。方法 随机选取北京生物制品研究所、长春生物制品研究所、华北药厂、中国医学科学院实验动物研究所和中国药品生物制品检定所昆明小鼠各 4 0只 (雌雄各半 ) ,测定Es3等十三个生化位点的基因型分布。结果 各群在AKP1、Es1和Trf位点均为一个表现型 ,即b型 ;北京生物制品研究所、长春生物制品研究所和华北药厂的Ce2为单一的a型 ;Es3位点除北京生物制品研究所和长春生物制品研究所外 ,均无a型、ac和ab型 ;中国医学科学院实验动物研究所种群还在Hbb(s)和Idh1(a)位点只有一种表现型。各封闭群的基因频率在多数位点上处于平衡状态 ,遗传距离计算的结果表明 ,基因分布与种群的来源有密切关系。结论 不同昆明小鼠种群之间存在差异 。 展开更多
关键词 昆明小鼠 生化位点 基因频率 遗传距离
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汶上芦花鸡保种群体一对等位基因遗传漂变的计算机模拟 被引量:2
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作者 李国辉 韩威 +4 位作者 张会永 王洪志 殷建玫 尤哲夫 苏一军 《天津农业科学》 CAS 2016年第9期63-66,共4页
小群保种是我国家禽遗传资源保护的一种重要方式。在假定汶上芦花鸡保种群体不发生基因突变的情况下,群体内实行家系等量随机留种,采用计算机模拟方法研究一对等位基因(PRL基因)在群体内的实际频率和假设不同基因频率、不同群体规模保... 小群保种是我国家禽遗传资源保护的一种重要方式。在假定汶上芦花鸡保种群体不发生基因突变的情况下,群体内实行家系等量随机留种,采用计算机模拟方法研究一对等位基因(PRL基因)在群体内的实际频率和假设不同基因频率、不同群体规模保种群体内一对等位基因座位的遗传漂变。模拟试验共进行了800个世代。结果表明:汶上芦花鸡保种群体(群体实际有效含量为102)20世代后等位基因的丢失或固定率达5.34%。在假设群体中,群体规模越大,基因由于随机遗传漂变而发生丢失或固定的概率也越低。群体规模太小以及基因的初始频率过低或过高,均会增加基因丢失或固定的风险。 展开更多
关键词 汶上芦花鸡 等位基因 基因频率 遗传漂变 计算机模拟
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中国六群体MSY2小卫星位点的遗传学研究(英文)
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作者 张咏莉 薛雅丽 +3 位作者 陈峰 张贵寅 李璞 傅松滨 《广东药学院学报》 CAS 2005年第3期304-306,314,共4页
目的研究中国回族、四川省汉族、福建省汉族、锡伯族、蒙古族、赫哲族群体MSY2小卫星位点的遗传多态性。方法采用聚合酶链式反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳检测方法,对上述六群体334份男性血样本的遗传多态性进行分析。结果MSY2位点有三拷... 目的研究中国回族、四川省汉族、福建省汉族、锡伯族、蒙古族、赫哲族群体MSY2小卫星位点的遗传多态性。方法采用聚合酶链式反应(PCR)和琼脂糖凝胶电泳检测方法,对上述六群体334份男性血样本的遗传多态性进行分析。结果MSY2位点有三拷贝和四拷贝两种等位基因型。其中各群体中的大多数成员呈现四拷贝等位基因型,而三拷贝等位基因型频率较低且在各个群体中频率分布是呈现多样。结论根据MSY2位点等位基因频率的分布可评估出六个群体之间的遗传距离,对研究六群体之间的遗传关系和遗传结构具有重要意义。 展开更多
关键词 MSY2 等位基因频率 遗传距离 聚类关系
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