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The glutamate metabotropic receptor 5(GRM5)gene is associated with beef cattle home range and movement tortuosity 被引量:1
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作者 Cristian A.Moreno Garcia Huitong Zhou +5 位作者 David Altimira Robyn Dynes Pablo Gregorini Sadeepa Jayathunga Thomas M.R.Maxwell Jonathan Hickford 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2023年第1期72-87,共16页
Background:The grazing behaviour of herbivores and their grazing personalities might in part be determined genetically,but there are few studies in beef cattle illustrating this.In this study,we investigated for first... Background:The grazing behaviour of herbivores and their grazing personalities might in part be determined genetically,but there are few studies in beef cattle illustrating this.In this study,we investigated for first time the genetic variation within a candidate‘grazing gene',the glutamate metabotropic receptor 5 gene(GRM5),and tested associations between variation in that gene and variation in grazing personality behaviours(GP-behaviours)displayed by free-ranging cows during winter grazing in the steep and rugged rangelands of New Zealand.Mature beef cows(n=303,from 3 to 10 years of age)were tracked with global positioning system(GPS)and,with 5-minutes(min)relocation frequency,various GP-behaviours were calculated.These included horizontal and vertical distances travelled,mean elevation,elevation range,elevation gain,slope,home range and movement tortuosity,variously calculated using daily relocation trajectories with repeated measurements(i.e.,7 to 24 days(d))and satellite-derived digital elevation models(DEM).The different GP-behaviours were fitted into mixed models to ascertain their associations with variant sequences and genotypes of GRM5.Results:We discovered three GRM5 variants(A,B and C)and identified the six possible genotypes in the cattle studied.The mixed models revealed that A was significantly associated with elevation range,home range and movement tortuosity.Similarly,GRM5 genotypes were associated(P<0.05)to home range and movement tortuosity,while trends suggesting association(P<0.1)were also revealed for elevation range and horizontal distance travelled.Most GP-behaviour models were improved by correcting for cow age-class as a fixed factor.The analysis of GP-behaviours averaged per cow age-class suggests that grazing personality is fully established as beef cows reached 4 years of age.Home range and movement tortuosity were not only associated with GRM5 variation,but also negatively correlated with each other(r=-0.27,P<0.001).Conclusions:There seems to be a genetically determined trade-off between home range and movement tortuosity that may be useful in beef cattle breeding programmes aiming to improve the grazing distribution and utilisation of steep and rugged rangelands. 展开更多
关键词 Animal personality breeding programmes Genetic associations Grazing distribution Grazing patterns Steep and rugged terrain
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山东省水产种业高质量发展战略研究
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作者 陈松林 卢昇 +7 位作者 荣小军 刘志鸿 栾生 张红凤 廖梅杰 孙秀俊 隋娟 王逸翔 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1-14,共14页
山东是我国渔业大省,肩负着打造“蓝色粮仓”,构筑“海上田园”的重要使命。山东省水产种业的高质量发展,对于贯彻落实“大食物观”,保障我国水产品的持续、多样供给具有重要意义。本文基于文献分析、实地调研等方式,系统地梳理了山东... 山东是我国渔业大省,肩负着打造“蓝色粮仓”,构筑“海上田园”的重要使命。山东省水产种业的高质量发展,对于贯彻落实“大食物观”,保障我国水产品的持续、多样供给具有重要意义。本文基于文献分析、实地调研等方式,系统地梳理了山东省水产种业发展现状,指出了山东省水产种业在顶层设计规划、优异种质资源收集与保存、高效育种技术创新与应用、突破性新品种培育以及种业龙头企业打造等方面存在的不足,有针对性地提出了山东省养殖鱼类、贝类、虾蟹、参藻种业以及种业经济发展的远景目标、重点任务和行动建议,以期为山东省水产种业高质量发展提供参考。 展开更多
关键词 水产养殖 水产种业 遗传育种 种质资源 育种技术
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动物遗传评估软件研究进展
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作者 张元旭 李竟 +8 位作者 王泽昭 陈燕 徐凌洋 张路培 高雪 高会江 李俊雅 朱波 郭鹏 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1827-1841,共15页
遗传评估软件在动物领域的应用极大地提高了育种工作效率。随着基因组测序技术不断完善和人工智能技术的兴起,动物遗传评估软件也得到了快速的发展。本文首先介绍了常规育种和基因组育种在动物育种领域的应用,然后重点回顾了GBLUP方法... 遗传评估软件在动物领域的应用极大地提高了育种工作效率。随着基因组测序技术不断完善和人工智能技术的兴起,动物遗传评估软件也得到了快速的发展。本文首先介绍了常规育种和基因组育种在动物育种领域的应用,然后重点回顾了GBLUP方法、贝叶斯方法和机器学习以及深度学习方法的全基因组遗传评估软件的特点和发展历史,最后展望了计算机软件在动物遗传评估育种中的未来发展趋势,旨为动物育种领域的研究人员提供相关遗传评估软件的参考。 展开更多
关键词 动物遗传评估软件 研究进展 常规育种 全基因组育种 贝叶斯方法 GBLUP 机器学习
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水产动物遗传学课程教学改革探索
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作者 冉照收 孔菲 +2 位作者 曹嘉懿 张琳 解家松 《高教学刊》 2024年第14期140-143,共4页
我国是水产养殖大国,向水产养殖强国迈进的关键在于人才培养。水产动物遗传学是水产养殖专业的核心课程之一,不断提升其课程教学质量和效果是培养优秀水产人才的基础。该文在总结水产动物遗传学课程“前沿性强、逻辑性强、实操性强”的... 我国是水产养殖大国,向水产养殖强国迈进的关键在于人才培养。水产动物遗传学是水产养殖专业的核心课程之一,不断提升其课程教学质量和效果是培养优秀水产人才的基础。该文在总结水产动物遗传学课程“前沿性强、逻辑性强、实操性强”的鲜明特点基础上,围绕课程教学中的三大主题,即“教材-教师-学生”,对当下水产动物遗传学教学中存在的问题进行剖析并探索改革途径,以期助推水产养殖专业人才的培养。 展开更多
关键词 水产动物遗传学 教学改革 人才培养 前沿性 逻辑性
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基于Web of Science的江西农业大学重点学科论文统计分析 被引量:2
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作者 吴先福 李冬梅 +1 位作者 郭蕴丽 肖花 《农业图书情报学刊》 2014年第9期63-66,共4页
以Web of Science为统计源,对2001年以来江西农业大学动物遗传育种与繁殖学学科团队师生发表的论文进行统计分析,通过对论文数量、论文合作机构、文献类型、来源出版物、论文引用、h指数等多项指标的统计分析,探讨了江西农业大学动物遗... 以Web of Science为统计源,对2001年以来江西农业大学动物遗传育种与繁殖学学科团队师生发表的论文进行统计分析,通过对论文数量、论文合作机构、文献类型、来源出版物、论文引用、h指数等多项指标的统计分析,探讨了江西农业大学动物遗传育种与繁殖学学科科技论文产出随时间的变化趋势、学科团队的发展状况、科研合作、学科地位以及影响力。 展开更多
关键词 动物遗传育种与繁殖学 学科数据 统计分析 学科服务
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我国禁食水生野生动物法律法规研究--以人工繁育大鲵(Andrias davidianus)为例 被引量:3
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作者 吴佳琦 裴兆斌 李恒顺 《沈阳农业大学学报(社会科学版)》 2020年第3期377-384,共8页
近年来SARS病毒、H7N9流感、埃博拉和新型冠状病毒等传染病共同特征都与野生动物有关。保护野生动物、禁止非法买卖和滥食野生动物再次被提及,并推到重大疫情防控和公共卫生应急管理制度的高度,如何有利于提高国家生物安全治理能力,引... 近年来SARS病毒、H7N9流感、埃博拉和新型冠状病毒等传染病共同特征都与野生动物有关。保护野生动物、禁止非法买卖和滥食野生动物再次被提及,并推到重大疫情防控和公共卫生应急管理制度的高度,如何有利于提高国家生物安全治理能力,引起整个社会的巨大关注。以人工繁育大鲵(Andrias davidianus)等水生野生保护动物为例,目前保护野生动物方面的法律法规不能行动滞后,相关部门需要加快制定全面野生动物保护的法律法规。全国人大常委会已经将全部陆生野生动物纳入禁止食用范围,扩大对其食用和经营行为的法律调整范围。虽然近期出台很多关于禁食野生动物的相关规定,但对人工繁育大鲵(A.davidianus)等水生野生保护动物是不是可以被食用还不确定,此时全面完善食用人工养殖水生野生动物的管理制度,成为法律法规制定的重要内容。 展开更多
关键词 人工繁育大鲵 水生野生保护动物 人工繁育 禁止食用 野生动物 禁食清单
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动物遗传育种创新型技能训练设计与实践 被引量:1
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作者 徐琪 陈阳 +4 位作者 张钰 张扬 常国斌 李碧春 陈国宏 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期127-130,共4页
随着国家《种业振兴行动方案》的实施,高等农业院校在动物遗传育种课程中增设创新型技能训练已成为当下趋势。在阐明动物遗传育种创新型技能训练必要性的基础上,提出应用“创新素质塑造,项目任务驱动”模式,将理论教学内容运用到实践中... 随着国家《种业振兴行动方案》的实施,高等农业院校在动物遗传育种课程中增设创新型技能训练已成为当下趋势。在阐明动物遗传育种创新型技能训练必要性的基础上,提出应用“创新素质塑造,项目任务驱动”模式,将理论教学内容运用到实践中,从活体不可测定性状选育方法、育种方案制定、保种方案制定、鸡显性/隐性白羽分子检测、体细胞和配子冷冻保存、转基因克隆动物生产等模块开展专门训练,以提高学生的创新欲望,创造性思维和创新实践能力,满足我国畜禽种业振兴的人才培养的需求。 展开更多
关键词 动物遗传育种课程 综合技能训练 课程设计 创新素质 任务驱动
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BMP4在牦牛和犏牛睾丸组织及支持细胞中的差异表达分析
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作者 王明秀 张鹏 +4 位作者 陈雪梅 敬科民 刘欣睿 钟金城 蔡欣 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2023年第4期8-15,44,共9页
【目的】从牦牛和犏牛睾丸组织中分离培养支持细胞,检测骨形态发生蛋白4基因(BMP4)及其受体基因在牦牛、犏牛睾丸组织及支持细胞中的表达情况,为深入研究BMP4对犏牛精子发生过程的作用提供理论基础。【方法】采集12月龄牦牛和犏牛睾丸组... 【目的】从牦牛和犏牛睾丸组织中分离培养支持细胞,检测骨形态发生蛋白4基因(BMP4)及其受体基因在牦牛、犏牛睾丸组织及支持细胞中的表达情况,为深入研究BMP4对犏牛精子发生过程的作用提供理论基础。【方法】采集12月龄牦牛和犏牛睾丸组织,使用Trizol法提取各睾丸组织总RNA,利用RT-PCR技术检测BMP4及其受体基因(骨形态发生蛋白受体1B型(ALK6)、骨形态发生蛋白受体2型(BMPR2)、激活素A受体2A型(ACVR2A)、激活素A受体2B型(ACVR2B))的mRNA表达水平。通过两步酶法消化睾丸组织制备细胞悬液,经差速贴壁、饥饿处理和胰酶消化分离纯化牦牛和犏牛睾丸支持细胞。采用HE染色、油红O染色、碱性磷酸酶(ALP)染色、免疫荧光染色鉴定支持细胞,用Trizol法提取细胞总RNA,RT-PCR检测支持细胞、生精细胞、间质细胞、类肌细胞标志基因和BMP4及其受体基因的mRNA表达水平。采用实时荧光定量PCR检测BMP4及其受体基因在牦牛和犏牛睾丸支持细胞中的差异表达情况。【结果】HE染色结果显示,第3代(F3)支持细胞呈长条形或梭形。油红O染色结果显示,体外培养的细胞胞质中有明显脂滴积累,且在细胞核内可观察到支持细胞特有的双极小体结构。ALP染色结果显示,细胞不着色。免疫荧光染色结果显示,支持细胞标志蛋白GATA结合蛋白4(GATA4)呈阳性表达。RT-PCR检测结果显示,支持细胞标志基因BMP4、SRY-box转录因子9基因(SOX9)、波形蛋白基因(Vimentin)、Wilm肿瘤抑制基因(WT1)、FAS细胞表面死亡受体基因(FAS)和胶质细胞源性神经营养因子基因(GDNF)存在明显表达,而生精细胞标志基因出局区解旋酶4(DDX4)和类肌细胞标志基因半胱氨酸的血管生成诱导剂61(CYR61)无明显表达,间质细胞标志基因细胞色素P450家族11亚家族A成员1(CYP11A1)则有少量表达。BMP4在牦牛和犏牛睾丸支持细胞中都有表达,且在牦牛支持细胞中的表达量显著高于犏牛支持细胞,而其受体基因ALK6、BMPR2、ACVR2A和ACVR2B在牦牛支持细胞中的表达量显著或极显著低于犏牛支持细胞。【结论】从牦牛和犏牛睾丸组织中分离获得支持细胞,BMP4在牦牛支持细胞中表达量较高,暗示BMP4对犏牛精子发生具有潜在调控作用。 展开更多
关键词 牦牛 犏牛 骨形态发生蛋白4基因 支持细胞 动物遗传育种
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三维基因组学在畜禽遗传育种中的应用
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作者 陈傲 孙东晓 韩博 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期9-15,共7页
基因组DNA在细胞核中以三维结构高度折叠并浓缩成染色质的方式储存于核内,具有特定的高级空间结构和构象,在此基础上相继发现了染色体疆域、染色体区室、拓扑关联结构域、染色质环等结构。染色质的三维结构对生物体基因的表达调控具有... 基因组DNA在细胞核中以三维结构高度折叠并浓缩成染色质的方式储存于核内,具有特定的高级空间结构和构象,在此基础上相继发现了染色体疆域、染色体区室、拓扑关联结构域、染色质环等结构。染色质的三维结构对生物体基因的表达调控具有巨大影响,随着染色质构象捕获技术不断发展和衍生,研究基因组三维空间结构与功能的三维基因组学也逐渐成为近几年生物学研究领域内的一大热点。本文从染色质的三维结构、染色质捕获技术以及三维基因组学在畜禽遗传育种中的应用3个方面进行综述,旨在将三维基因组学内容更好的运用于畜禽遗传育种工作中,为后续相关研究提供参考。 展开更多
关键词 三维基因组学 Hi-C技术 畜禽遗传育种
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“水产动物育种学”在线课程建设和教学改革探索
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作者 王伟 董忠典 刘志刚 《教育教学论坛》 2023年第46期109-112,共4页
“水产动物育种学”是高校水产养殖专业的核心课程之一,课程内容涵盖水产动物遗传育种的基本原理与技术方法、育种相关研究与科研成果以及育种行业最新趋势。近年来,信息技术、云平台和传统教学方法不断融合,在线课程建设和线上线下混... “水产动物育种学”是高校水产养殖专业的核心课程之一,课程内容涵盖水产动物遗传育种的基本原理与技术方法、育种相关研究与科研成果以及育种行业最新趋势。近年来,信息技术、云平台和传统教学方法不断融合,在线课程建设和线上线下混合教学模式受到了广泛关注。基于超星学习通平台进行了“水产动物育种学”在线开放课程的建设和教学改革探索,同时对课程建设与教学改革探索中的经验和几点问题进行探讨,以期为相关课程的教学改革提供参考。 展开更多
关键词 水产动物育种学 在线课程 教学改革
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单细胞转录组测序技术畜牧业标准化现状分析 被引量:1
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作者 李夏伟 张琦 +1 位作者 朱晓春 王斌 《China Standardization》 2023年第1期60-64,共5页
Single-cell RNA sequencing technology(scRNA-seq)is an emerging,high-throughput,high-resolution big data production and analysis technology,which has helped some pioneering research and discoveries in the field of anim... Single-cell RNA sequencing technology(scRNA-seq)is an emerging,high-throughput,high-resolution big data production and analysis technology,which has helped some pioneering research and discoveries in the field of animal husbandry in recent years.This technology provides an essential basis for the early selection of livestock and poultry and the selection of excellent characters,showing that it has great application potential and broad prospects in animal husbandry research and production.Although scRNA-seq technology has established a wide range of commercial production services at home and abroad,the standardization status of this technology in animal husbandry needs further exploration,as it can provide clues and foundations for the application of scRNA-seq technology in animal husbandry. 展开更多
关键词 single-cell RNA sequencing technology animal husbandry STandARDIZATION genetic breeding
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水产群体基因组重测序数据分析软件包的开发
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作者 徐清腾 吴昊天 +1 位作者 江丽华 陆颖 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期17-29,共13页
为了帮助水生动物学研究者解决群体遗传学基础分析的困难,本实验在调研现有的水生动物重测序数据分析研究和成果的基础上,基于水生动物群体遗传学的常用方法和通用分析软件,构建可于本地运行的、能够完成大部分基因组重测序数据基础计... 为了帮助水生动物学研究者解决群体遗传学基础分析的困难,本实验在调研现有的水生动物重测序数据分析研究和成果的基础上,基于水生动物群体遗传学的常用方法和通用分析软件,构建可于本地运行的、能够完成大部分基因组重测序数据基础计算的软件包。软件包首先将质控过滤后的重测序数据与参考基因组序列进行比对,利用比对结果检测基因组的遗传变异,对群体进行系统发育分析、群体结构分析、主成分分析、遗传多样性重要量化指标的计算和选择性消除分析等,并通过R或Python语言工具包对分析结果进行可视化。根据该软件包对来自3个群体、共约30尾大黄鱼个体的简化基因组测序数据进行分析测试的结果,完成了软件包携带的测序数据比对、单核苷酸多态性(SNP)鉴定、系统进化树构建、群体结构预测、连锁不平衡检测和多样性指标等计算功能,并且较好地图形可视化了分析结果。该群体基因组重测序分析的简易软件包可用于野生和自然群体的群体遗传学分析的大部分基础统计、计算和绘图,适合包括水生生物学在内的相关领域的生物学研究者进行群体基因组学研究。本研究为水生动物重测序数据分析提供便利,节约科研时间,减少人力物力成本。相关源码和使用说明文档已公开上传至GitHub:https://github.com/xqteng/Re-seq_analysis。 展开更多
关键词 水生动物重测序 单核苷酸多态性 群体遗传学 软件 基因组
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动物基因工程技术在动物遗传育种上的应用现状与发展前景
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作者 宋语涵 《工业微生物》 CAS 2023年第6期78-80,共3页
动物基因工程技术利用先进的生物技术手段对动物基因进行编辑和改造,以达到改良动物品种、提高生产性能、增强适应力等目的。随着科学技术的不断进步,动物基因工程技术在动物遗传育种领域的应用现状和发展前景备受关注。因此,文章对动... 动物基因工程技术利用先进的生物技术手段对动物基因进行编辑和改造,以达到改良动物品种、提高生产性能、增强适应力等目的。随着科学技术的不断进步,动物基因工程技术在动物遗传育种领域的应用现状和发展前景备受关注。因此,文章对动物基因工程技术在动物遗传育种领域的应用现状与发展前景进行研究,以期能为未来的动物遗传育种研究和实践提供一些指导。 展开更多
关键词 动物基因工程技术 动物遗传育种 应用现状 发展前景
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EST-SSR分子标记在水生动物遗传研究中的应用 被引量:11
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作者 张琼 刘小林 +4 位作者 李喜莲 薛姝雯 辛静静 黄皓 相建海 《水产科学》 CAS 北大核心 2010年第5期302-306,共5页
关键词 EST—SSR 水生动物 遗传育种 分子标记
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水产动物育种分析与管理系统的开发和应用 被引量:11
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作者 栾生 孔杰 +4 位作者 王清印 张晓明 张兆明 胡红浪 孙喜模 《海洋水产研究》 CSCD 北大核心 2008年第3期92-100,共9页
针对国内水产动物多性状选择育种研究处于起步阶段的现状,以BLUP遗传评定为核心的水产动物多性状复合育种技术体系为依托,结合国内水产动物育种项目研究,开发了一套适合大多数水产动物育种分析与项目管理的软件系统。该系统是在WindowsX... 针对国内水产动物多性状选择育种研究处于起步阶段的现状,以BLUP遗传评定为核心的水产动物多性状复合育种技术体系为依托,结合国内水产动物育种项目研究,开发了一套适合大多数水产动物育种分析与项目管理的软件系统。该系统是在WindowsXP环境下利用MicrosoftSQLServer2000数据库和基于ObjectPascal语言的DelphiIDE工具开发完成的。主要包括6个功能模块:系统管理、基本信息、种质管理、性能管理、育种分析和销售管理等,覆盖整个育种项目周期,并对流程实行标准化,能够自动化完成种质和性能测定数据的管理、遗传参数估计、育种值计算和配种方案制定等主要工作。软件已经在中国对虾、大菱鲆和罗氏沼虾等育种项目中得到应用,其推广和应用能够有效提升行业的整体育种技术水平,推动我国水产动物育种工作的发展。 展开更多
关键词 水产动物育种 BLUP 软件 育种
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应用重复力模型估计虹鳟生长性状的遗传力和育种值 被引量:20
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作者 王炳谦 刘宗岳 +3 位作者 高会江 白秀娟 谷伟 范兆廷 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期182-187,共6页
采用单性状重复观测值动物模型(重复力模型)对中国水产科学研究院黑龙江水产研究所渤海冷水性鱼类试验站5个品系后代的4 026尾虹鳟(Oncorhynchus mykiss)的生长性状(体重、体长和肥满度)进行了遗传参数和育种值的估计,并对各个性状的表... 采用单性状重复观测值动物模型(重复力模型)对中国水产科学研究院黑龙江水产研究所渤海冷水性鱼类试验站5个品系后代的4 026尾虹鳟(Oncorhynchus mykiss)的生长性状(体重、体长和肥满度)进行了遗传参数和育种值的估计,并对各个性状的表型和遗传趋势进行预测。在此模型中考虑了年份-季节固定效应、父本固定效应和母本固定效应,个体的随机效应和个体永久环境效应。结果表明:该5个品系虹鳟及后代体重的遗传力为0.35,体长为0.10、肥满度为0.34。从不同评定方法的秩相关来看,用综合育种值方法与单个性状方法之间存在极显著的相关,其相关度分别为0.998,0.877,0.850,-0.071,-0.064和-0.13。用综合育种值对虹鳟个体的选择价值的评定和名次排列,以及与单个性状的评定名次有着一定程度上的差别。体重、体长和肥满度性状,其表型趋势与遗传趋势基本一致的品系,均可通过表型值进行选择。 展开更多
关键词 虹鳟 生长性状 遗传参数 育种值 重复力模型
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水产遗传育种与水产种业发展战略研究 被引量:51
17
作者 桂建芳 包振民 张晓娟 《中国工程科学》 北大核心 2016年第3期8-14,共7页
20多年来,随着水生生物学和生物技术的发展,我国在水产遗传育种与种业方面取得了诸多进展,但也面临着机遇和挑战。本文围绕种质资源保存与利用、遗传机制解析与功能基因挖掘、优良性状新品种选育、水产种业建设等,开展国内外遗传育种现... 20多年来,随着水生生物学和生物技术的发展,我国在水产遗传育种与种业方面取得了诸多进展,但也面临着机遇和挑战。本文围绕种质资源保存与利用、遗传机制解析与功能基因挖掘、优良性状新品种选育、水产种业建设等,开展国内外遗传育种现状对比分析研究,分析了当前存在的一些问题,提出未来特别是"十三五"期间水产遗传育种科技发展目标和重点任务。 展开更多
关键词 水产养殖 水产遗传育种 水产种业
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单核苷酸多态性及其在水产动物遗传育种中的应用 被引量:25
18
作者 刘福平 白俊杰 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期704-712,共9页
单核苷酸多态性(SNPs)是广泛存在于基因组中的一类由单个碱基转换或颠换引起的DNA序列多态性。它是继限制性片段长度多态性(RFLP)、微卫星标记(SSR)之后的新一代分子标记,已广泛应用于构建遗传连锁图谱、QTL定位、关联分析及研究群体遗... 单核苷酸多态性(SNPs)是广泛存在于基因组中的一类由单个碱基转换或颠换引起的DNA序列多态性。它是继限制性片段长度多态性(RFLP)、微卫星标记(SSR)之后的新一代分子标记,已广泛应用于构建遗传连锁图谱、QTL定位、关联分析及研究群体遗传结构与亲缘关系等方面。本文主要介绍了SNPs的概念、特点及检测SNPs的主要方法,综述了SNPs在水产动物遗传育种中的研究进展,以期将SNPs更广泛地应用于水产动物群体遗传、分子标记辅助育种和生物进化等研究领域。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 分子标记 水产动物 遗传育种
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一种基于高密度遗传标记的亲子鉴定方法及其应用 被引量:12
19
作者 张哲 罗元宇 +6 位作者 李晴晴 贺金龙 高宁 张豪 丁向东 张勤 李加琪 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期835-841,共7页
系谱是人类遗传及动植物育种研究与实践的重要信息来源之一。系谱记录错误是育种生产中普遍存在的一种记录错误,影响基因定位、遗传值及表型值预测等相关研究结果的可靠性。现有的方法软件可以利用遗传标记信息对疑似亲子进行亲子鉴定,... 系谱是人类遗传及动植物育种研究与实践的重要信息来源之一。系谱记录错误是育种生产中普遍存在的一种记录错误,影响基因定位、遗传值及表型值预测等相关研究结果的可靠性。现有的方法软件可以利用遗传标记信息对疑似亲子进行亲子鉴定,但这些软件方法操作复杂,限制标记数量,如Cervus。针对当前高密度SNP标记在人类及动植物研究中广泛应用的现状,文章提出了一种基于全基因组高密度SNP数据的亲子鉴定新方法,命名为EasyPC。对EasyPC及Cervus的运行效率进行了对比,并用中国荷斯坦牛(n=2180)和杜洛克猪(n=191)的全基因组SNP芯片数据对EasyPC进行了验证。结果表明:EasyPC运行效率高于Cervus,牛和猪群体系谱错误率分别为20%和6%,与相关研究报道相符。通过使用全基因组SNP标记对群体孟德尔错误率的经验分布进行分析,该方法不仅可以简单、快速、准确地判别系谱的正确性,而且还可以对错误系谱进行校正。EasyPC为解决全基因组研究中基因型及系谱数据前处理过程中的系谱校正问题提供了一种新的途径。 展开更多
关键词 亲子鉴定 系谱校正 遗传标记 孟德尔错误 动物育种
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水产动物育种值估计方法及其应用的研究进展 被引量:31
20
作者 栾生 孔杰 王清印 《海洋水产研究》 CSCD 北大核心 2008年第3期101-107,共7页
育种值是选种和配种计划制定的基础,育种值估计是水产动物选择育种的重要内容之一,育种值估计的准确性直接影响着育种项目的遗传进展和选择效果。本文综述了3种育种值估计方法,选择指数、最佳线性无偏预测BLUP法和标记辅助BLUP方法的原... 育种值是选种和配种计划制定的基础,育种值估计是水产动物选择育种的重要内容之一,育种值估计的准确性直接影响着育种项目的遗传进展和选择效果。本文综述了3种育种值估计方法,选择指数、最佳线性无偏预测BLUP法和标记辅助BLUP方法的原理、优缺点及其在水产动物育种中的应用进展。众多研究表明,基于系谱结构和表型信息的BLUP方法将成为水产动物育种中一种快速有效的育种值估计方法。 展开更多
关键词 水产动物 育种值估计 选择指数 BLUP MBLUP
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