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桤木Genomic-SSR与EST-SSR分子标记的差异分析
1
作者
王泽亮
杨勇智
+3 位作者
杜晋城
陈炙
黄振
郭洪英
《四川林业科技》
2023年第4期36-42,共7页
桤木(Alnus cremastogyne)为非豆科固氮树种,也是我国最重要的一个桤木属特有种,具有重要的生态功能。本文分析了桤木基因组SSR与EST-SSR两种来源标记的遗传差异,结果显示EST-SSR的平均等位基因数与平均有效等位基因数高于Genomic-SSR,...
桤木(Alnus cremastogyne)为非豆科固氮树种,也是我国最重要的一个桤木属特有种,具有重要的生态功能。本文分析了桤木基因组SSR与EST-SSR两种来源标记的遗传差异,结果显示EST-SSR的平均等位基因数与平均有效等位基因数高于Genomic-SSR,而对平均观察杂合度与平均期望杂合度来说,Genomic-SSR高于EST-SSR,聚类分析显示Genomic-SSR与EST-SSR在小的分群上有差异,说明Genomic-SSR与ESTSSR标记在解析遗传多样性与遗传关系方面有一定差异,综合两种标记可以获得更加客观的结果。
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关键词
桤木
简单序列重复
遗传多样性
多倍体
genodive
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题名
桤木Genomic-SSR与EST-SSR分子标记的差异分析
1
作者
王泽亮
杨勇智
杜晋城
陈炙
黄振
郭洪英
机构
四川省林业科学研究院
四川省草原科学研究院
出处
《四川林业科技》
2023年第4期36-42,共7页
基金
世界银行贷款长江流域上游森林生态系统恢复项目(2019-510000-02-01-400761)
四川省科技计划项目(2021YFYZ0032)。
文摘
桤木(Alnus cremastogyne)为非豆科固氮树种,也是我国最重要的一个桤木属特有种,具有重要的生态功能。本文分析了桤木基因组SSR与EST-SSR两种来源标记的遗传差异,结果显示EST-SSR的平均等位基因数与平均有效等位基因数高于Genomic-SSR,而对平均观察杂合度与平均期望杂合度来说,Genomic-SSR高于EST-SSR,聚类分析显示Genomic-SSR与EST-SSR在小的分群上有差异,说明Genomic-SSR与ESTSSR标记在解析遗传多样性与遗传关系方面有一定差异,综合两种标记可以获得更加客观的结果。
关键词
桤木
简单序列重复
遗传多样性
多倍体
genodive
Keywords
Alnus cremastogyne
SSR
Genetic diversity
Polyploid
genodive
分类号
S792.14 [农业科学—林木遗传育种]
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题名
作者
出处
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1
桤木Genomic-SSR与EST-SSR分子标记的差异分析
王泽亮
杨勇智
杜晋城
陈炙
黄振
郭洪英
《四川林业科技》
2023
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