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玉米地方品种Glb1基因克隆及其遗传多样性分析 被引量:1
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作者 陈发波 方平 +3 位作者 姚启伦 程远芳 聂术君 秦林林 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1347-1352,共6页
【目的】了解我国西南地区不同玉米地方品种的遗传多样性,为合理利用这些玉米种质资源提供参考。【方法】以西南地区12份玉米地方品种为材料,对Glb1基因片段进行克隆、测序及序列比对,分析其遗传多样性。【结果】12份玉米材料Glb1基因... 【目的】了解我国西南地区不同玉米地方品种的遗传多样性,为合理利用这些玉米种质资源提供参考。【方法】以西南地区12份玉米地方品种为材料,对Glb1基因片段进行克隆、测序及序列比对,分析其遗传多样性。【结果】12份玉米材料Glb1基因序列长度为1138-1149 bp,其序列一致性为96.21%。12份材料Glb1基因序列间存在较多的变异位点,大于等于3 bp的插入/缺失有8个,主要位于第81-84、122-128、161-164、368-371、428-442、668-680、966-976和1003-1011 bp。不同玉米地方品种材料间的遗传相似系数为96.50%-100.00%,平均为98.58%。根据聚类分析结果可将12份材料分为五大类,且来源于同一地区的玉米材料趋向于聚为一类。【结论】Glb1基因具有较高的保守性,所选材料间Glb1基因序列存在一定的遗传多样性,利用Glb1基因序列可作为鉴定不同玉米地方品种的一种理想分子标记。 展开更多
关键词 玉米地方品种 glb1基因 克隆 遗传差异 分子标记
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GM1神经节苷脂沉积病致病基因GLB1新变异c.101T>C(p.Ile34Thr)的识别和致病性分析 被引量:5
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作者 兰雪荣 邱建武 +2 位作者 李华 蔡香然 宋元宗 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期71-76,共6页
单唾液酸四己糖神经节苷脂(GM1)神经节苷脂沉积病是由半乳糖苷酶beta-1(GLB1)基因变异影响GLB活性所致的常染色体隐性遗传病,GLB功能缺陷造成GM1降解障碍而在溶酶体贮积。该文报道1例GM1神经节苷脂沉积病患儿的临床及遗传学特点。患儿,... 单唾液酸四己糖神经节苷脂(GM1)神经节苷脂沉积病是由半乳糖苷酶beta-1(GLB1)基因变异影响GLB活性所致的常染色体隐性遗传病,GLB功能缺陷造成GM1降解障碍而在溶酶体贮积。该文报道1例GM1神经节苷脂沉积病患儿的临床及遗传学特点。患儿,女,2岁5个月,因运动发育倒退1年余就诊。体格检查发现双眼球偏斜伴水平震颤,眼底镜检查无异常,四肢肌张力高,肘、膝、踝关节活动受限,膝腱反射亢进。血生化检查发现AST明显升高。24小时脑电图监测到频繁癫痫发作,弥漫性θ波活动增多,以右半球显著。头颅MRI显示双侧脑室周围白质变薄并见弥漫性T2WI高信号影,边界不清;白质纤维束三维重建(DTI)提示双侧大脑半球白质纤维束细小、稀疏,以右侧为著。遗传学分析发现患儿GLB1基因存在来自于其父母的c.446C>T(p.Ser149Phe)和c.101T>C(p.Ile34Thr)复合杂合突变,其中c.101T>C(p.Ile34Thr)未见文献报道。患儿最终确诊为GM1神经节苷脂沉积病。予抗癫痫和康复训练等对症支持治疗2个月,病情未见好转。 展开更多
关键词 GM1神经节苷脂沉积病 glb1基因 基因变异 儿童
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GLB1基因变异致GM1神经节苷脂贮积症Ⅱ型1例报告并文献复习
3
作者 李甜馨 陆相朋 +6 位作者 彭琰琰 卢婷婷 廉文君 冯斌 都修波 马丙祥 郑宏 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期813-817,共5页
目的分析GM1神经节苷脂贮积症Ⅱ型的临床及基因变异特征。方法回顾分析1例GM1神经节苷脂贮积症Ⅱ型患儿的临床资料,并复习相关文献。结果患儿,男,1岁2个月,因运动发育倒退3个月就诊。脊椎侧位X线可见鸟嘴突样改变。基因检测显示患儿GLB... 目的分析GM1神经节苷脂贮积症Ⅱ型的临床及基因变异特征。方法回顾分析1例GM1神经节苷脂贮积症Ⅱ型患儿的临床资料,并复习相关文献。结果患儿,男,1岁2个月,因运动发育倒退3个月就诊。脊椎侧位X线可见鸟嘴突样改变。基因检测显示患儿GLB1基因存在2处杂合变异,c.202C>T、c.832G>A;经基因功能预测具有致病性。患儿确诊为GM1神经节苷脂贮积症Ⅱ型。结论发现未见报道的GLB1基因变异位点和临床表型,扩大了GM1神经节苷脂贮积症Ⅱ型基因变异谱。 展开更多
关键词 GM1神经节苷脂贮积症Ⅱ型 glb1基因 儿童
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SH3GLB1基因功能与相关疾病研究进展
4
作者 杨堃 徐金操 高雪 《医学研究杂志》 2023年第12期190-193,共4页
SH3GLB1基因编码SH3GLB1蛋白(sh3 domain containing grb2 like,endophilin b1,SH3GLB1),该蛋白在人体多组织中表达,包括肝脏、肾脏、肠以及中枢神经系统等,主要定位于细胞质、高尔基体和线粒体。它与Bcl-2家族的促凋亡成员Bcl-2相关X蛋... SH3GLB1基因编码SH3GLB1蛋白(sh3 domain containing grb2 like,endophilin b1,SH3GLB1),该蛋白在人体多组织中表达,包括肝脏、肾脏、肠以及中枢神经系统等,主要定位于细胞质、高尔基体和线粒体。它与Bcl-2家族的促凋亡成员Bcl-2相关X蛋白(Bax)结合,参与调节凋亡信号通路。该蛋白也参与自噬、线粒体形态维持。研究显示SH3GLB1功能失调与肿瘤及神经系统疾病相关。本文就SH3GLB1基因生物学功能及相关疾病研究进展做一综述。 展开更多
关键词 SH3glb1 自噬 凋亡 线粒体功能 肿瘤 神经系统疾病
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一例GM1-神经节苷脂贮积症患儿的临床与GLB1基因变异分析
5
作者 程双喜 王清明 +3 位作者 陈霭信 周玲芳 洪晓纯 袁海明 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2022年第5期537-541,共5页
目的探讨一例GM1-神经节苷脂贮积症患儿的基因型与表型的关系。方法采用全外显子测序(whole-exome sequencing,WES)对患儿家系进行检测,并应用Sanger测序对可疑变异位点进行验证。取患儿外周血白细胞利用荧光法进行β半乳糖苷酶活性分... 目的探讨一例GM1-神经节苷脂贮积症患儿的基因型与表型的关系。方法采用全外显子测序(whole-exome sequencing,WES)对患儿家系进行检测,并应用Sanger测序对可疑变异位点进行验证。取患儿外周血白细胞利用荧光法进行β半乳糖苷酶活性分析。结果先证者为一名2岁3个月女性患儿,临床表现为精神运动发育倒退,语言缺失,智力障碍和行为异常。WES检测到GLB1基因发生复合杂合错义变异NM_000404.2:c.1343A>T(p.Asp448Val)和c.1064A>C,(p.Gln355Pro)(GRCh37/hg19),分别遗传于母亲和父亲。GLB1p.Asp448Val变异未检测出β半乳糖苷酶活性,因此该变异为临床致病性变异。而p.Gln355Pro变异尚无报道,该变异位点位于β半乳糖苷酶具有催化活性的TIM barrel结构域,在正常人群数据库频率为0,多种计算机软件预测有害。先证者外周血白细胞β半乳糖苷酶活性分析结果表明酶残余活性为0,证明p.Gln355Pro变异也会导致β半乳糖苷酶活性丧失,因此该变异被评估为临床致病性变异。结论本研究丰富了GLB1基因变异谱,为家庭遗传咨询提供了指导。 展开更多
关键词 glb1基因 精神运动发育倒退 智力障碍 GM1-神经节苷脂贮积症 β半乳糖苷酶 遗传咨询
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GM1神经节苷脂贮积症患儿的GLB1基因突变研究 被引量:2
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作者 高敏 金瑞峰 +3 位作者 张开慧 李志毅 盖中涛 刘毅 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2019年第2期128-131,共4页
目的 明确1例疑似因遗传代谢病引起的发育倒退的患儿的遗传学病因。 方法 对1例1岁3个月无明显诱因发育进行性倒退患儿进行临床和实验室检查,并抽取患儿及其父母的外周静脉血,应用新一代目标区域捕获测序技术对患儿进行遗传代谢病相关... 目的 明确1例疑似因遗传代谢病引起的发育倒退的患儿的遗传学病因。 方法 对1例1岁3个月无明显诱因发育进行性倒退患儿进行临床和实验室检查,并抽取患儿及其父母的外周静脉血,应用新一代目标区域捕获测序技术对患儿进行遗传代谢病相关基因的检测,对可疑突变位点进行患儿及其父母的Sanger测序验证。 结果 患儿头颅MRI提示髓鞘化迟缓,基因检测示GLB1基因存在c.2006-2007insT和c.475-476 insGGTCC突变,分别来源于其父母。 结论 GLB1基因的c.2006-2007insT和c.475-476 insGGTCC复合杂合突变可能是本例患儿的致病原因,该突变可能引起GM1神经节苷脂贮积症,进而导致患儿发育倒退的症状。 展开更多
关键词 GM1神经节苷脂贮积症 发育倒退 glb1基因
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Long noncoding RNA RP4 functions as a competing endogenous RNA through miR-7-5p sponge activity in colorectal cancer 被引量:17
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作者 Mu-Lin Liu Qiao Zhang +4 位作者 Xiao Yuan Long Jin Li-Li Wang Tao-Tao Fang Wen-Bin Wang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2018年第9期1004-1012,共9页
AIM To investigate the role of long noncoding RNA(lnc RNA) RP4 in colorectal cancer.METHODS Lentivirus-mediated lnc RNA RP4 overexpression and knockdown were performed in the colorectal cancer cell line SW480. Cell pr... AIM To investigate the role of long noncoding RNA(lnc RNA) RP4 in colorectal cancer.METHODS Lentivirus-mediated lnc RNA RP4 overexpression and knockdown were performed in the colorectal cancer cell line SW480. Cell proliferation, tumor growth, and early apoptosis were evaluated by a cell counting kit-8 assay, an in vivo xenograft tumor model, and annexin V/propidium iodide staining, respectively. Analysis of the lnc RNA RP4 mechanism involved assessment of the association of its expression with mi R-7-5 p and the SH3 GLB1 gene. Western blot analysis was also performed to assess the effect of lnc RNA RP4 on the autophagy-mediated cell death pathway and phosphatidylinositol-3-kinase(PI3 K)/Akt signaling.RESULTS Cell proliferation, tumor growth, and early apoptosis in SW480 cells were negatively regulated by lnc RNA RP4. Functional experiments indicated that lnc RNA RP4 directly upregulated SH3 GLB1 expression by acting as a competing endogenous RNA(ce RNA) for mi R-7-5 p. This interaction led to activation of the autophagy-mediated cell death pathway and de-repression of PI3 K and Akt phosphorylation in colorectal cancer cells in vivo.CONCLUSION Our results demonstrated that lnc RNA RP4 is a ce RNA that plays an important role in the pathogenesis of colorectal cancer, and could be a potential therapeutic target for colorectal cancer treatment. 展开更多
关键词 COLORECTAL cancer LONG noncoding RNA RP4 SH3glb1 miR-7-5p competing ENDOGENOUS RNA
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SEZ6L2基因单核苷酸多态性与199例食管癌患者术后生存期关联分析 被引量:1
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作者 马琳琳 赵学科 +12 位作者 宋昕 徐瑞华 魏梦霞 李留玉 尤朵 王苒 韩雪娜 孙琳 陈亚杰 乔佳欣 谢叶真 白合林 王立东 《食管疾病》 2022年第1期8-11,共4页
目的分析食管鳞状细胞癌患者基因单核苷酸多态性特点,解析基因单核苷酸多态性对食管鳞状细胞癌早期预警的重要性。方法对郑州大学第一附属医院省部共建食管癌防治国家重点实验室50万例食管癌患者临床信息数据库中的199例食管鳞癌患者的S... 目的分析食管鳞状细胞癌患者基因单核苷酸多态性特点,解析基因单核苷酸多态性对食管鳞状细胞癌早期预警的重要性。方法对郑州大学第一附属医院省部共建食管癌防治国家重点实验室50万例食管癌患者临床信息数据库中的199例食管鳞癌患者的SNP rs75331747等信息进行整理剖析,用单因素双重线性回归方法解释其是否是食管鳞状细胞癌患者生存的影响因素。结果199例食管鳞癌患者中,T/T基因型个体生存率显著高于G/G基因型个体,T/T基因型个体生存率高于G/T基因型个体,G/T基因型个体生存率高于G/G基因型个体(P<0.001),SEZ6L2基因rs75331747SNP位点多态性是食管鳞状细胞癌生存的影响因素。结论SEZ6L2基因rs75331747可能影响食管鳞状细胞癌患者的生存结局,可以作为潜在的预后标志物。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌 单核苷酸多态性 rs75331747 基因型 β-半乳糖苷酶1
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GM1神经节苷脂贮积症诊疗的研究进展
9
作者 刘晓女 《医药前沿》 2024年第36期63-66,共4页
GM1神经节苷脂贮积症是一种罕见但严重的遗传性疾病,对患者的生活质量和健康产生严重影响。GLB1基因变异导致β-半乳糖苷酶活性降低或完全丧失,引起代谢产物积聚于组织器官,尤其神经系统,从而导致发育落后或倒退,严重者死亡。该病可于... GM1神经节苷脂贮积症是一种罕见但严重的遗传性疾病,对患者的生活质量和健康产生严重影响。GLB1基因变异导致β-半乳糖苷酶活性降低或完全丧失,引起代谢产物积聚于组织器官,尤其神经系统,从而导致发育落后或倒退,严重者死亡。该病可于婴儿期起病,表现为神经系统进行性退化,包括肌张力异常、运动障碍、智力发育迟缓、视觉和听觉问题等。此外,患者还可能出现骨骼异常、肝脾肿大等全身症状。本文通过检索国内GM1神经节苷脂贮积症的报道文献,总结患儿临床表现、遗传改变等特点,进一步探究基因型与临床表型的关系,为疾病诊断提供一定帮助,为探究基因型与临床表型关系奠定基础。 展开更多
关键词 GM1神经节苷脂贮积症 β-半乳糖苷酶 遗传学 glb1基因
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GM1神经节苷脂贮积症患儿临床与遗传学特点及文献复习
10
作者 铁晓玲 车凤玉 +1 位作者 杨颖 陈小聪 《中华神经科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1136-1143,共8页
目的分析3例GM1神经节苷脂贮积症Ⅰ型患儿的临床、遗传学及生物信息学特征,并进行文献复习。方法对2020年1月至2022年12月于西安市儿童医院就诊的3例分别以“反复抽搐发作”“发育落后”“肢体松软”入院的患儿进行全外显子测序、β-半... 目的分析3例GM1神经节苷脂贮积症Ⅰ型患儿的临床、遗传学及生物信息学特征,并进行文献复习。方法对2020年1月至2022年12月于西安市儿童医院就诊的3例分别以“反复抽搐发作”“发育落后”“肢体松软”入院的患儿进行全外显子测序、β-半乳糖苷酶活性检测,利用MutaBind2、PyMOL模拟突变对蛋白理化性质、三维结构的影响。结果3例患儿均在婴儿期出现严重发育迟滞或倒退,继发癫痫,血碱性磷酸酶、谷氨酸氨基转移酶明显增高,β-半乳糖苷酶活性分别为1.59%、3.47%、1.96%,骨骼X线示腰椎前缘鸟嘴样改变,头颅磁共振成像示髓鞘形成不良。全外显子测序结果显示3例患儿均携带GLB1基因复合杂合变异,其中c.148T>C变异未见报道及收录,c.785G>T和c.1438A>G、c.304C>G变异仅收录1例。生信分析结果显示突变后蛋白的结合亲和力降低,分子间氢键破坏或与周围残基形成较强空间位阻,结合文献证据,推测突变可能影响蛋白的整体结构和稳定性,使酶活性下降。结论GM1神经节苷脂贮积症的诊断及分型需综合临床特征、外显子组测序及β-半乳糖苷酶活性检测,生信分析有助于预测突变对蛋白结构和功能的影响。 展开更多
关键词 神经节苷脂累积病 GM1型 儿童 β半乳糖苷酶类 突变 误义 glb1基因
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1个GM1神经节苷脂贮积症合并杜氏肌营养不良症家系的遗传学病因分析
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作者 黄超 丁杨 +8 位作者 向菁菁 刘英华 宋小艳 刘敏娟 毛君 唐慧 李红 孟庆霞 王挺 《中国优生与遗传杂志》 2024年第5期1001-1005,共5页
目的分析1个GM1神经节苷脂贮积症合并杜氏肌营养不良症家系的遗传学病因。方法运用高通量测序技术、一代测序技术、染色体微阵列分析技术、多重连接探针扩增技术等对该病例及其家系成员进行联合基因检测。结果基因检测结果提示,先证者G... 目的分析1个GM1神经节苷脂贮积症合并杜氏肌营养不良症家系的遗传学病因。方法运用高通量测序技术、一代测序技术、染色体微阵列分析技术、多重连接探针扩增技术等对该病例及其家系成员进行联合基因检测。结果基因检测结果提示,先证者GLB1基因存在c.446C>T(p.S149F)和c.1214C>T(p.T405I)复合杂合突变,两个突变分别来自于父亲(c.1214C>T)和母亲(c.446C>T),胎儿未见GLB1基因突变,但存在DMD基因第49号外显子缺失,来源于母亲。结论GLB1基因c.446C>T和c.1214C>T的复合杂合突变可能是本例患儿的致病原因,多种基因检测技术手段的联合应用可以提高基因变异的检出率,减少出生缺陷的发生,为产前诊断及遗传咨询提供新的方案思路。 展开更多
关键词 GM1神经节苷脂贮积症 glb1基因 杜氏肌营养不良症 基因检测 遗传咨询
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实时监测衰老报告小鼠模型的研究进展 被引量:1
12
作者 孙洁 王宇宁 +1 位作者 罗珊珊 刘宝华 《生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期836-846,共11页
衰老是老年慢性疾病的独立危险因素,理解衰老机制是实现这些疾病早期预防与有效干预的关键之一。系统衰老是动态演进的过程,其机制研究面临挑战。随着对细胞衰老与系统衰老相关生物标志物研究的进展以及小动物活体光学成像的发展,国内... 衰老是老年慢性疾病的独立危险因素,理解衰老机制是实现这些疾病早期预防与有效干预的关键之一。系统衰老是动态演进的过程,其机制研究面临挑战。随着对细胞衰老与系统衰老相关生物标志物研究的进展以及小动物活体光学成像的发展,国内外同行构建了越来越多的实时监测衰老报告小鼠模型,助力衰老机制与干预策略研究。本文基于几种经典的、广泛应用的衰老生物标志物(p16^(Ink4a)、p21^(Waf1/Cip1)、p53和Glb1),归纳了近些年来与其相关的实时监测衰老报告小鼠模型,综合分析了它们在系统衰老研究中的应用价值。 展开更多
关键词 衰老 实时监测报告小鼠 p16^(Ink4a) p21^(Waf1/Cip1) P53 glb1
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TGFβ信号调控阿霉素诱导的衰老肿瘤细胞表达SA-β-gal 被引量:1
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作者 许东旭 张力 +2 位作者 杨兆娟 夏苏华 刘永忠 《现代生物医学进展》 CAS 2013年第10期1801-1806,共6页
目的:细胞衰老是维持机体稳态的一种重要机制,表达SA-β-gal被认为是衰老细胞的一种特异性的标志,但有研究表明在衰老细胞中SA-β-gal染色阳性只是衰老细胞的溶酶体变大的结果,为了探究SA-β-gal的表达与细胞衰老之间的具体关系,我们验... 目的:细胞衰老是维持机体稳态的一种重要机制,表达SA-β-gal被认为是衰老细胞的一种特异性的标志,但有研究表明在衰老细胞中SA-β-gal染色阳性只是衰老细胞的溶酶体变大的结果,为了探究SA-β-gal的表达与细胞衰老之间的具体关系,我们验证了参与调节衰老细胞表达SA-β-gal的信号通路及SA-β-gal的表达情况是否会对细胞衰老的过程产生影响。方法:肿瘤细胞用低剂量的阿霉素处理24小时后,再分别给予不同的小分子抑制剂继续作用4天,观察SA-β-gal染色阳性的细胞数目及SA-β-gal表达与否对于衰老细胞在分泌细胞因子、生长阻滞等细胞生物学功能上的影响。结果:在阿霉素诱导细胞发生衰老的过程中,TGFβ抑制剂SB431542能够抑制衰老细胞表达SA-β-gal,而SA-β-gal表达的缺失并不影响细胞衰老的其他特征性改变。结论:低剂量的阿霉素作用肿瘤细胞后,细胞会进入衰老的状态。在细胞衰老的过程中,TGFβ受体I的抑制剂SB431542可以抑制衰老细胞表达SA-β-gal,但是SA-β-gal的缺失表达并不影响细胞衰老的过程及衰老细胞的其他特性,如:不可逆的生长阻滞、分泌有活性的细胞因子等。结果表明:SA-β-gal并不能作为衰老细胞的特异性标志。 展开更多
关键词 衰老相关-β-半乳糖苷酶 转化生长因子β 半乳糖苷酶beta1
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