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玉米Gln1-3 gDNA序列分离、基因结构、保守功能域与等位变异分析
被引量:
3
1
作者
吴永升
李新海
+4 位作者
张征
李明顺
郝转芳
张世煌
谢传晓
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第7期1114-1120,共7页
谷氨酰胺合成酶家族是高等植物体内氨态氮同化酶,是植物体内氮利用与循环的核心构件。玉米Gln1-3基因编码叶肉细胞中的细胞质同工酶,与全株氮向籽粒蛋白质同化与氮利用效率及产量紧密相关。本研究以玉米自交系辽白371为材料,采用PCR与...
谷氨酰胺合成酶家族是高等植物体内氨态氮同化酶,是植物体内氮利用与循环的核心构件。玉米Gln1-3基因编码叶肉细胞中的细胞质同工酶,与全株氮向籽粒蛋白质同化与氮利用效率及产量紧密相关。本研究以玉米自交系辽白371为材料,采用PCR与接头步移(walking)方法分离得到Gln1-3基因区域基因组DNA(gDNA)全长4571bp,起始密码子至终止密码子序列长3062bp。将该基因在GenBank注册,登录号为EU338535,并进行了详细注释。该基因由10个外显子、9个内含子组成,剪接方式主要为5′供位保守的GU与3′受位AG模式。编码的GS1蛋白由356个氨基酸组成,分子量39.2kD,等电点(pI)为5.202。保守功能域分析表明,氨基末端外显子2到外显子6为氨离子结合结构域,羧基末端外显子8与外显子9构成ATP酶结构域,在胞内行使催化功能。对50个玉米自交系Gln1-3基因重要分析区域进行了等位变异分析,鉴定出364个等位变异,其中313个为SNP变异,占86%。
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关键词
玉米
gln1-3基因
功能域
单核苷酸多态性
氮利用效率
关联性分析
下载PDF
职称材料
题名
玉米Gln1-3 gDNA序列分离、基因结构、保守功能域与等位变异分析
被引量:
3
1
作者
吴永升
李新海
张征
李明顺
郝转芳
张世煌
谢传晓
机构
中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第7期1114-1120,共7页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA10Z191)
引进国际先进农业科学技术计划(948计划)重大项目(2006-G3)
文摘
谷氨酰胺合成酶家族是高等植物体内氨态氮同化酶,是植物体内氮利用与循环的核心构件。玉米Gln1-3基因编码叶肉细胞中的细胞质同工酶,与全株氮向籽粒蛋白质同化与氮利用效率及产量紧密相关。本研究以玉米自交系辽白371为材料,采用PCR与接头步移(walking)方法分离得到Gln1-3基因区域基因组DNA(gDNA)全长4571bp,起始密码子至终止密码子序列长3062bp。将该基因在GenBank注册,登录号为EU338535,并进行了详细注释。该基因由10个外显子、9个内含子组成,剪接方式主要为5′供位保守的GU与3′受位AG模式。编码的GS1蛋白由356个氨基酸组成,分子量39.2kD,等电点(pI)为5.202。保守功能域分析表明,氨基末端外显子2到外显子6为氨离子结合结构域,羧基末端外显子8与外显子9构成ATP酶结构域,在胞内行使催化功能。对50个玉米自交系Gln1-3基因重要分析区域进行了等位变异分析,鉴定出364个等位变异,其中313个为SNP变异,占86%。
关键词
玉米
gln1-3基因
功能域
单核苷酸多态性
氮利用效率
关联性分析
Keywords
Maize
gln
1
-
3
Functional domain
SNP
Nitrogen use efficiency
Association analysis
分类号
S513 [农业科学—作物学]
Q754 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米Gln1-3 gDNA序列分离、基因结构、保守功能域与等位变异分析
吴永升
李新海
张征
李明顺
郝转芳
张世煌
谢传晓
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
3
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