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Gly→Ala Point Mutation and Conformation of Poly-Ala Stretch of PABPN1: A Molecular Dynamics Study
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作者 Mohd Shafique Mohan Lal Garg Fateh Singh Nandel 《Journal of Biophysical Chemistry》 2015年第2期54-63,共10页
Single nucleotide replacing mutations in genes cause a number of diseases, but sometimes these mutations mimic other genetic mutations such as trinucleotide repeats expansions. A mutation in codon GGG→GCG results in ... Single nucleotide replacing mutations in genes cause a number of diseases, but sometimes these mutations mimic other genetic mutations such as trinucleotide repeats expansions. A mutation in codon GGG→GCG results in Gly→Ala at the N-terminal of PABPN1 protein that mimics the trinucleotide repeat expansion disease called Oculopharyngeal muscular dystrophy (OPMD). Molecular dynamics simulations in water with peptide models having sequence Ac-A10-GA2GG-NHme (peptide A) and Ac-A10A3GG-NHme (peptide B) reveal an increase in the length of helical segment in peptide B. The α-helical length is found to be stable in peptide B with starting geometry of a right handed helix, while in the case peptide A, the helical length is short. The interactions of water molecules at terminals, side chain-backbone interactions and hydrogen bonds provide stability to resultant conformation. The adopted helix by the poly-Ala stretch may lead to masking some other active parts of the PABPN1 that may trigger the aggregation, decrease in degradation and/or impaired function of protein. Hence, further studies with N-terminal may be helpful to understand unclear disease mechanism. 展开更多
关键词 Single NUCLEOTIDE Polymorphism gly→ala Mutation Poly-ala OPMD PABPN1
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一种新的四肽(TFA-Gly-Pro-Thr-Ala-OH)合成工艺
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作者 吴修艮 丁德平 +1 位作者 聂丽云 高瑞银 《齐鲁药事》 2010年第1期47-48,共2页
目的确定一种新的四肽(TFA-Gly-Pro-Thr-Ala-OH)合成工艺。方法以Boc-Gly-OSu、Boc-Thr-OSu、丙氨酸和脯氨酸为原料,选择适当的反应条件,得Boc-Gly-Pro-Thr-Ala-OH,再通过反应生成更稳定的目标产物。结果收率较高,质量稳定。结论本合成... 目的确定一种新的四肽(TFA-Gly-Pro-Thr-Ala-OH)合成工艺。方法以Boc-Gly-OSu、Boc-Thr-OSu、丙氨酸和脯氨酸为原料,选择适当的反应条件,得Boc-Gly-Pro-Thr-Ala-OH,再通过反应生成更稳定的目标产物。结果收率较高,质量稳定。结论本合成的新的四肽在收率、有关物质等方面都符合要求。 展开更多
关键词 TFA—gly—Pro-Thr—ala—OH 抗肿瘤 化合物 合成
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胶原三肽的酶法制备工艺研究 被引量:3
3
作者 汪雪莲 刘鹏展 +1 位作者 崔春 刘国锋 《中国调味品》 CAS 北大核心 2023年第1期97-101,共5页
以罗非鱼鱼皮为实验原料,研究不同蛋白酶处理对其蛋白质回收率、水解度以及酶解液风味的影响;以罗非鱼鱼皮内切蛋白酶酶解产物为底物,经解淀粉芽孢杆菌蛋白酶二次酶解后测定酶解液的肽分子量分布、胶原三肽种类和特征胶原三肽GPH含量。... 以罗非鱼鱼皮为实验原料,研究不同蛋白酶处理对其蛋白质回收率、水解度以及酶解液风味的影响;以罗非鱼鱼皮内切蛋白酶酶解产物为底物,经解淀粉芽孢杆菌蛋白酶二次酶解后测定酶解液的肽分子量分布、胶原三肽种类和特征胶原三肽GPH含量。结果表明,罗非鱼鱼皮经碱性蛋白酶和木瓜蛋白酶于55℃下水解3.5 h,其蛋白回收率和水解度分别为87.59%和7.50%、88.59%和9.45%,酶解液有轻微苦味。在碱性蛋白酶和木瓜蛋白酶酶解产物中加入解淀粉芽孢杆菌蛋白酶于55℃二次水解胶原蛋白肽12 h后,其水解度分别为18.40%和14.64%,水解产物中分子量<500 Da的肽段分别占比54.28%和48.90%。UPLC-MS/MS分析显示碱性蛋白酶酶解后经解淀粉芽孢杆菌蛋白酶二次酶解,鉴定发现酶解液中主要的胶原三肽有GPH、GPA和HAG,其中分步酶解产物中GPH含量达到1.46%。 展开更多
关键词 胶原三肽 鱼皮胶原蛋白 gly-Pro-Hyp gly-Pro-ala
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HPLC法测定仔猪小肠刷状缘膜囊孵育体系中的二肽含量 被引量:5
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作者 代建国 李德发 +2 位作者 朴香淑 杨文军 武玉波 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期94-98,共5页
用高效液相色谱法测定了经仔猪小肠刷状缘膜囊水解后的甘 - L-脯、L-亮 -甘和 β-丙 -组共 3种二肽的剩余含量。分别以水 -三氟乙酸 (质量浓度分别为 0 .1 % ,0 .0 8%和 0 .1 % ,p H值分别为 2 .2 0 ,2 .30和 2 .2 0 )和乙腈 -三氟乙酸 ... 用高效液相色谱法测定了经仔猪小肠刷状缘膜囊水解后的甘 - L-脯、L-亮 -甘和 β-丙 -组共 3种二肽的剩余含量。分别以水 -三氟乙酸 (质量浓度分别为 0 .1 % ,0 .0 8%和 0 .1 % ,p H值分别为 2 .2 0 ,2 .30和 2 .2 0 )和乙腈 -三氟乙酸 (三氟乙酸质量浓度 0 .1 % )为流动相 ,经 Phenomennex ODS分析柱 (2 50 mm× 4.60 mm,5μm,C1 8)分离 ,在 2 0 0~ 40 0 nm处检测。结果表明 ,3种二肽在 0~ 30 0 μg.m L-1之间 ,其峰面积 (X)对质量浓度 (Y,μg.m L-1 )回归得方程分别为 Y=0 .0 0 0 1 X- 5.6945,(R2 =0 .9946) ;Y=0 .0 0 0 4 X- 1 .41 6 7,(R2 =0 .9999) ;Y=0 .1 842 X- 7.365 4,(R2 =0 .9948)。平均回收率依次为 1 0 0 .0 0 % ,1 0 0 .0 1 %和 99.92 % ,保留时间依次为 7.63,8.0 1和 4.1 7min,最大吸收波长依次为 2 0 1 ,2 0 0和 2 80 nm。该方法快速、简便和准确 ,结果稳定 ,重现性好 。 展开更多
关键词 HPLC法 仔猪 小肠 刷状缘膜囊 孵育体系 二肽 含量 高效液相色谱法 甘-L-脯二肽 L-亮-甘二肽 β-丙-组二肽
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脑出血和脑梗死患者血清谷氨酸、甘氨酸和丙氨酸浓度的改变及意义 被引量:1
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作者 朱其芳 梁浩 《蛇志》 1998年第3期10-12,共3页
目的探讨血清中谷氨酸、甘氨酸和丙氨酸含量变化与脑出血和脑梗死的关系,为今后临床深入研究提供参考资料。方法用氨基酸分析仪对23例急性脑出血和26例脑梗死病人谷氨酸、甘氨酸和丙氨酸进行测定,并与对照组进行比较。结果病人组... 目的探讨血清中谷氨酸、甘氨酸和丙氨酸含量变化与脑出血和脑梗死的关系,为今后临床深入研究提供参考资料。方法用氨基酸分析仪对23例急性脑出血和26例脑梗死病人谷氨酸、甘氨酸和丙氨酸进行测定,并与对照组进行比较。结果病人组的兴奋性氨基酸谷氨酸的含量明显高于对照组(P<0.01),病人组的抑制性氨基酸甘氨酸和丙氨酸的含量与对照组无显著差异(P>0.05)。结论提示兴奋性氨基酸谷氨酸可能作为损伤因素参与脑出血和脑梗死脑损伤的发生。 展开更多
关键词 脑出血 脑梗死 谷氨酸 甘氨酸 丙氨酸 血清
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CZE分析抑肽酶中去丙氨酸-抑肽酶和去丙氨酸-去甘氨酸-抑肽酶
6
作者 徐明明 吴利红 陈钢 《中国药品标准》 CAS 2009年第6期441-444,共4页
目的:建立毛细管区带电泳分析抑肽酶中的去丙氨酸-抑肽酶和去丙氨酸-去甘氨酸-抑肽酶的方法。方法:未涂层石英毛细管柱60 cm×75μm;运行缓冲液120 mmol.L-1的磷酸二氢钾溶液(pH2.5);运行电压为12 KV,柱温30℃;检测波长214 nm。结果... 目的:建立毛细管区带电泳分析抑肽酶中的去丙氨酸-抑肽酶和去丙氨酸-去甘氨酸-抑肽酶的方法。方法:未涂层石英毛细管柱60 cm×75μm;运行缓冲液120 mmol.L-1的磷酸二氢钾溶液(pH2.5);运行电压为12 KV,柱温30℃;检测波长214 nm。结果:抑肽酶、去丙氨酸-抑肽酶、去丙氨酸-去甘氨酸-抑肽酶迁移时间的RSD分别为1.13%,1.11%,1.11%,校正峰面积(A/t)的RSD分别为3.96%,3.94%,3.84%,A/t%的RSD分别为0.18%、0.96%,1.13%。结论:本法分析抑肽酶中的去丙氨酸-抑肽酶和去丙氨酸-去甘氨酸-抑肽酶高效快速、杂质分离度高、操作成本低,有助于控制其产品质量。 展开更多
关键词 毛细管区带电泳 抑肽酶 去丙氨酸-抑肽酶 去丙氨酸-去甘氨酸-抑肽酶
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Structural, thermal and enzymatic analysis of naturally occurring and D-amino acid substituted peptides
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作者 Velmurugan Punitha Raghava Rao Jonnalagadda Balachandran Unni Nair 《Advances in Bioscience and Biotechnology》 2012年第7期900-908,共9页
Designing of new peptide materials for biomedical and protein engineering applications are important. In the present work an attempt has been made to study the effect of D-Leu in collagen like tetra peptide on the str... Designing of new peptide materials for biomedical and protein engineering applications are important. In the present work an attempt has been made to study the effect of D-Leu in collagen like tetra peptide on the structure and stability of peptide against enzymes and results are compared with its chiral counterpart L-form. Effect of replacement of L-Leu in Leu-Gly-Pro-Ala tetra peptide with D-Leu on structure has been studied using circular dichroic spectroscopy (CD). Our findings suggest that, D-Leu substitution leads to conformational changes in Leu-Gly-Pro-Ala secondary structure from β-sheet to turns. L → D-Leu Configurational changes in Leu-Gly-Pro-Ala owes to enhanced thermal stability which has been substantiated through CD and differential scanning calorimetry. Change in chirality of the leucine inhibits collagenolytic activity, which enables to design selective inhibition of proteases with greater specificity. 展开更多
关键词 Collagen-Like Peptide Configurational Change Leu-gly-Pro-ala Collagen CHIRALITY AMINO Acid
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金振口服液氨基酸特征指纹图谱及29种氨基酸同时定量的质量控制方法研究 被引量:4
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作者 李海波 杨群 +6 位作者 区伟珍 王团结 曹亮 王振中 姚新生 于洋 肖伟 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第23期5972-5979,共8页
目的氨基酸自动分析仪建立金振口服液(JOL)氨基酸特征指纹图谱及29种氨基酸(磷酸丝氨酸、牛磺酸、天冬氨酸、苏氨酸、丝氨酸、天冬酰胺、谷氨酸、谷氨酰胺、肌氨酸、甘氨酸、丙氨酸、瓜氨酸、α-氨基丁酸、缬氨酸、胱氨酸、异亮氨酸、... 目的氨基酸自动分析仪建立金振口服液(JOL)氨基酸特征指纹图谱及29种氨基酸(磷酸丝氨酸、牛磺酸、天冬氨酸、苏氨酸、丝氨酸、天冬酰胺、谷氨酸、谷氨酰胺、肌氨酸、甘氨酸、丙氨酸、瓜氨酸、α-氨基丁酸、缬氨酸、胱氨酸、异亮氨酸、亮氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸、β-丙氨酸、β-氨基丁酸、γ-氨基丁酸、鸟氨酸、赖氨酸、组氨酸、3-甲基组氨酸、精氨酸、羟脯氨酸、脯氨酸)同时定量的分析方法。方法采用日立855-4507型离子交换色谱柱(60mm×4.6mm,3μm);检测波长分别为570、440 nm;流动洗脱泵体积流量0.35 mL/min;衍生泵体积流量0.30 mL/min;反应柱温135℃;以柠檬酸缓冲溶液为流动相进行梯度洗脱,建立JOL氨基酸特征指纹图谱,对29个主要特征峰进行化学成分指认,运用中药指纹图谱相似度软件对16批市售制剂进行相似度评价,同时对29种氨基酸进行含量测定。结果建立了JOL氨基酸特征指纹图谱结合29种氨基酸同时定量的方法;16批市售制剂的指纹图谱与对照指纹图谱的相似度值在0.989~1.000;29种定量成分线性关系良好(R2=1.000),且平均回收率为95.71%~101.87%;16批市售制剂29种氨基酸的质量浓度分别为磷酸丝氨酸15.4572~29.3624μg/mL、牛磺酸64.4234~114.2386μg/mL、天冬氨酸19.0564~32.5490μg/mL、苏氨酸6.704 8~7.841 8μg/mL、丝氨酸22.609 4~39.382 8μg/mL、天冬酰胺61.134 0~115.456 0μg/mL、谷氨酸32.254 6~63.127 2μg/mL、谷氨酰胺5.2238~8.9532μg/mL、肌氨酸4.0810~44.0076μg/mL、甘氨酸12.4030~23.5164μg/mL、丙氨酸33.876 8~44.257 4μg/mL、瓜氨酸3.514 2~9.881 0μg/mL、α-氨基丁酸1.126 4~2.287 8μg/mL、缬氨酸11.584 6~15.469 0μg/mL、胱氨酸1.660 2~4.041 8μg/mL、异亮氨酸4.087 8~5.469 2μg/mL、亮氨酸8.295 2~11.724 0μg/mL、酪氨酸7.492 6~10.761 2μg/mL、苯丙氨酸4.856 4~9.248 0μg/mL、β-丙氨酸2.309 4~6.782 6μg/mL、β-氨基丁酸0.175 0~14.790 6μg/mL、γ-氨基丁酸17.654 4~26.621 8μg/mL、鸟氨酸42.338 4~58.172 6μg/mL、赖氨酸12.994 9~28.498 0μg/mL、组氨酸1.802 6~4.0674μg/mL、3-甲基组氨酸2.6084~4.3840μg/mL、精氨酸107.1416~301.6498μg/mL、羟脯氨酸15.8116~37.8076μg/mL、脯氨酸143.714 6~243.956 6μg/mL。结论氨基酸自动分析仪法测定JOL中氨基酸具有重现性好、结果可靠的优点;且JOL中氨基酸类成分定性定量研究在一定程度上明确了君药山羊角对制剂组方的成分贡献,为构建JOL全方位质量评价体系提供了有益补充。 展开更多
关键词 金振口服液 氨基酸自动分析仪 氨基酸特征指纹图谱 磷酸丝氨酸 牛磺酸 天冬氨酸 苏氨酸 丝氨酸 天冬酰胺 谷氨酸 谷氨酰胺 肌氨酸 甘氨酸 丙氨酸 瓜氨酸 α-氨基丁酸 缬氨酸 胱氨酸 异亮氨酸 亮氨酸 酪氨酸 苯丙氨酸 Β-丙氨酸 Β-氨基丁酸 γ-氨基丁酸 鸟氨酸 赖氨酸 组氨酸 3-甲基组氨酸 精氨酸 羟脯氨酸 脯氨酸
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海洋真菌Nigrospora sphaerica中化学成分的研究 被引量:6
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作者 张起辉 田黎 +3 位作者 闫政清 刘思 张忠山 裴月湖 《中国药学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期26-29,共4页
目的研究海洋真菌Nigrospora sphaerica菌丝体中的化学成分,以期得到有活性的先导化合物。方法利采用硅胶柱色谱、凝胶柱色谱、高效液相色谱等方法进行分离纯化,通过理化性质和波谱数据鉴定化合物的结构。结果从真菌Nigrospo—Fasphae... 目的研究海洋真菌Nigrospora sphaerica菌丝体中的化学成分,以期得到有活性的先导化合物。方法利采用硅胶柱色谱、凝胶柱色谱、高效液相色谱等方法进行分离纯化,通过理化性质和波谱数据鉴定化合物的结构。结果从真菌Nigrospo—Fasphaerica的菌丝体提取物中分离并鉴定了11个化合物,分别为麦角甾-5,7,22E-三烯-3卢-醇(1),胆甾醇(2),吡咯并哌嗪.2,5-二酮[环(脯-甘)二肽](3),3-甲基-吡咯并哌嗪-2,5-二酮[环(脯-丙)二肽](4),3-苄基-吡咯并哌嗪-2,5-二酮[环(脯-苯丙)二肽](5),3-苄基-哌嗪-2,5-二酮[环(甘-苯丙)二肽](6),5-羟甲基糠醛(7),亮氨酸(8),3,6-二甲基-哌嗪-2,5-二酮[环(丙-丙)二肽](9),腺嘌呤(10),尿嘧啶核苷(11)。结论化合物1,3~7和11为首次从海洋真菌Nigrospora sphaerica中分离得到。 展开更多
关键词 海洋真菌 球状黑孢子菌 吡咯并哌嗪-2 5-二酮[环(脯-甘)二肤] 3-甲基-吡咯并哌嗪-2 5-二酮[环(脯-丙)二肽] 3-苄基-吡咯并哌嗪-2 5-二酮[环(脯-苯丙)二肽]
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酶联免疫吸附试验测定儿童体内抗青霉素类IgG抗体
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作者 张蕾 王永铭 +1 位作者 沈刚 陈斌艳 《中国药理学报》 CSCD 1996年第3期274-277,共4页
目的:建立一个测定青霉素类反应性IgG的酶联免疫吸附方法(ELISA)并用该方法观察儿童血清中的特异性抗体.方法:采用免疫印迹、ELISA、半抗原抑制试验.结果:青霉素类和牛血清白蛋白结合成复合物,该复合物能作为EL... 目的:建立一个测定青霉素类反应性IgG的酶联免疫吸附方法(ELISA)并用该方法观察儿童血清中的特异性抗体.方法:采用免疫印迹、ELISA、半抗原抑制试验.结果:青霉素类和牛血清白蛋白结合成复合物,该复合物能作为ELISA中的包被抗原(100mg·L-1).样品稀释倍数和吸光度间有良好的相关性,相关系数09918.运用ELISA在13例临床可疑青霉素过敏的患儿中检测出4例青霉素抗体,1例青霉素和氨苄西林抗体,3例青霉素、氨苄西林、哌拉西林抗体.结论:成功的建立了一个ELISA方法,针对青霉素的IgG应答在儿童具有异质性.IgG抗体不但能识别青霉素分子本身,还能识别降解产物以及来自复合物的新抗原决定族.青霉素、氨苄西林、哌拉西林间有免疫交叉反应. 展开更多
关键词 免疫球蛋白G 青霉素类 交叉反应 抗体 ELISA
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