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胀果甘草中NAC转录因子基因鉴定及盐胁迫下差异表达分析
被引量:
2
1
作者
刘珊
梁玉玲
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第22期7385-7394,共10页
NAC转录因子广泛作用于植物生长发育的各个阶段,具有应对逆境胁迫的作用。本研究利用生物信息学方法从胀果甘草愈伤组织转录组中鉴定出86个胀果甘草NAC转录因子基因和14个NAC差异表达基因,将14个差异表达基因分别命名为GiNAC01~GiNAC14...
NAC转录因子广泛作用于植物生长发育的各个阶段,具有应对逆境胁迫的作用。本研究利用生物信息学方法从胀果甘草愈伤组织转录组中鉴定出86个胀果甘草NAC转录因子基因和14个NAC差异表达基因,将14个差异表达基因分别命名为GiNAC01~GiNAC14。系统进化树聚类分析结果表明,胀果甘草愈伤组织转录组中的NAC家族基因被分为13个小组,14种NAC差异表达基因主要聚集在第5小组和第13小组。胀果甘草NAC差异表达基因与拟南芥NAC家族基因推定蛋白质构建的进化树被分为11个组,其中差异表达基因主要聚集在第1小组和第4小组。序列分析结果表明胀果甘草NAC差异表达基因推定氨基酸组成中富含丝氨酸和酸性氨基酸、脂肪族氨基酸占比较大;蛋白质二级结构主要组成元件是无规则卷曲,亚细胞定位多数定位于细胞核;蛋白质大多无跨膜螺旋和二硫桥结构,无信号肽结构,多为亲水性蛋白质。本研究丰富和完善了胀果甘草NAC基因的探索,为进一步研究胀果甘草NAC基因响应逆境胁迫的分子机制及功能奠定了基础。
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关键词
胀果甘草(
glycyrrhiza
inflate
)
盐胁迫
NAC基因
生物信息学
表达模式
原文传递
题名
胀果甘草中NAC转录因子基因鉴定及盐胁迫下差异表达分析
被引量:
2
1
作者
刘珊
梁玉玲
机构
河北大学生命科学学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第22期7385-7394,共10页
基金
河北省生物学一流学科建设项目、河北大学自然科学研究计划项目(No.799207217054)
部省合建优势特色学科——生物学(050001-521000103001)共同资助。
文摘
NAC转录因子广泛作用于植物生长发育的各个阶段,具有应对逆境胁迫的作用。本研究利用生物信息学方法从胀果甘草愈伤组织转录组中鉴定出86个胀果甘草NAC转录因子基因和14个NAC差异表达基因,将14个差异表达基因分别命名为GiNAC01~GiNAC14。系统进化树聚类分析结果表明,胀果甘草愈伤组织转录组中的NAC家族基因被分为13个小组,14种NAC差异表达基因主要聚集在第5小组和第13小组。胀果甘草NAC差异表达基因与拟南芥NAC家族基因推定蛋白质构建的进化树被分为11个组,其中差异表达基因主要聚集在第1小组和第4小组。序列分析结果表明胀果甘草NAC差异表达基因推定氨基酸组成中富含丝氨酸和酸性氨基酸、脂肪族氨基酸占比较大;蛋白质二级结构主要组成元件是无规则卷曲,亚细胞定位多数定位于细胞核;蛋白质大多无跨膜螺旋和二硫桥结构,无信号肽结构,多为亲水性蛋白质。本研究丰富和完善了胀果甘草NAC基因的探索,为进一步研究胀果甘草NAC基因响应逆境胁迫的分子机制及功能奠定了基础。
关键词
胀果甘草(
glycyrrhiza
inflate
)
盐胁迫
NAC基因
生物信息学
表达模式
Keywords
glycyrrhiza
inflata
Salt stress
NAC gene
Bioinformatics
Expression pattern
分类号
S567.71 [农业科学—中草药栽培]
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胀果甘草中NAC转录因子基因鉴定及盐胁迫下差异表达分析
刘珊
梁玉玲
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020
2
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