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大豆ELF3的生物信息学分析及GmELF3Ld功能初探
1
作者
李佳雯
张帅锋
+3 位作者
吴庚雪
吴红霞
杨龙
岳岩磊
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期1-11,共11页
ELF3是生物节律钟重要的组成部分,在植物的生长发育中发挥重要作用。大豆是光周期敏感的短日作物,含有5个ELF3同源基因,其中GmELF3a/J是引起大豆绿色革命的明星基因,主要调控大豆童期的发育。为分析其他4个GmELF3同源基因的功能,本研究...
ELF3是生物节律钟重要的组成部分,在植物的生长发育中发挥重要作用。大豆是光周期敏感的短日作物,含有5个ELF3同源基因,其中GmELF3a/J是引起大豆绿色革命的明星基因,主要调控大豆童期的发育。为分析其他4个GmELF3同源基因的功能,本研究利用MEGA-X、Multalin SOPMA和ExPASy-Prot Param等工具对它们的进化关系、蛋白功能、特性、亚细胞定位及基因表达情况进行生物信息学分析,同时通过转化拟南芥初步研究GmELF3Ld的功能。结果表明:大豆中5个ELF3基因可以分为两类,其中GmELF3a/J、GmELF3b和GmELF3c为A类,GmELF3Ld和GmELF3Le为B类。GmELF3Le的α螺旋含量及不稳定性指数均为最高。另外,这5个蛋白均为亲水性非跨膜蛋白,含有多个丝氨酸和酪氨酸磷酸化位点,为蛋白活性调控提供条件。B类基因表达量远高于A类且表现出明显的营养器官与生殖器官分化,即GmELF3b和GmELF3c基因在花和种子中高表达,GmELF3Ld和GmELF3Le则在叶片中高表达。转基因拟南芥研究结果表明,GmELF3Ld抑制拟南芥开花关键基因FT和CO的表达,延迟拟南芥的花期。本研究结果表明两类GmELF3同源蛋白具有不同的生物学功能,GmELF3Ld延迟拟南芥的花期。
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关键词
大豆
ELF3
生物信息学
gmelf3ld
拟南芥
转基因
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职称材料
题名
大豆ELF3的生物信息学分析及GmELF3Ld功能初探
1
作者
李佳雯
张帅锋
吴庚雪
吴红霞
杨龙
岳岩磊
机构
河南农业大学生命科学学院
河南农业大学资源与环境学院
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第1期1-11,共11页
基金
国家自然科学基金(32001573)
河南农业大学青年英才项目(30500613)。
文摘
ELF3是生物节律钟重要的组成部分,在植物的生长发育中发挥重要作用。大豆是光周期敏感的短日作物,含有5个ELF3同源基因,其中GmELF3a/J是引起大豆绿色革命的明星基因,主要调控大豆童期的发育。为分析其他4个GmELF3同源基因的功能,本研究利用MEGA-X、Multalin SOPMA和ExPASy-Prot Param等工具对它们的进化关系、蛋白功能、特性、亚细胞定位及基因表达情况进行生物信息学分析,同时通过转化拟南芥初步研究GmELF3Ld的功能。结果表明:大豆中5个ELF3基因可以分为两类,其中GmELF3a/J、GmELF3b和GmELF3c为A类,GmELF3Ld和GmELF3Le为B类。GmELF3Le的α螺旋含量及不稳定性指数均为最高。另外,这5个蛋白均为亲水性非跨膜蛋白,含有多个丝氨酸和酪氨酸磷酸化位点,为蛋白活性调控提供条件。B类基因表达量远高于A类且表现出明显的营养器官与生殖器官分化,即GmELF3b和GmELF3c基因在花和种子中高表达,GmELF3Ld和GmELF3Le则在叶片中高表达。转基因拟南芥研究结果表明,GmELF3Ld抑制拟南芥开花关键基因FT和CO的表达,延迟拟南芥的花期。本研究结果表明两类GmELF3同源蛋白具有不同的生物学功能,GmELF3Ld延迟拟南芥的花期。
关键词
大豆
ELF3
生物信息学
gmelf3ld
拟南芥
转基因
Keywords
soybean
ELF3
bioinformatics
gmelf3ld
Arabidopsis
transgenesis
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆ELF3的生物信息学分析及GmELF3Ld功能初探
李佳雯
张帅锋
吴庚雪
吴红霞
杨龙
岳岩磊
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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