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大豆GmPM31基因生物信息学、组织表达及高温高湿响应分析
被引量:
3
1
作者
刘骕骦
邱颖胜
+4 位作者
刘燕敏
李阳
魏家萍
沈英姿
吴酬飞
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期612-619,共8页
sHSPs家族基因GmPM31具有典型的ACD结构域,为了预测和研究GmPM31的功能,本研究以田间劣变抗性春大豆湘豆3号为材料,分离GmPM31及其启动子序列,对该基因的结构及启动子上的顺式作用元件进行生物信息学分析,采用qRT-PCR方法对GmPM31的组...
sHSPs家族基因GmPM31具有典型的ACD结构域,为了预测和研究GmPM31的功能,本研究以田间劣变抗性春大豆湘豆3号为材料,分离GmPM31及其启动子序列,对该基因的结构及启动子上的顺式作用元件进行生物信息学分析,采用qRT-PCR方法对GmPM31的组织表达模式及高温高湿处理下的表达量变化进行分析。结果表明:GmPM31基因的ORF全长为459 bp,编码153个氨基酸,包含1个ACD保守域结构。蛋白质系统进化树分析结果显示,GmPM31与CI(Class I)亚家族的sHSPs同源性较高,表明GmPM31属于Class I sHSPs家族成员。GmPM31基因启动子中有多个逆境胁迫响应元件,包括激素应答相关元件ABRE、ERE和AAGAA-motif等,干旱和冷胁迫相关的MYB和MYC转录因子作用元件,高盐胁迫相关元件Box III,厌氧胁迫相关元件ARE等。qRT-PCR结果显示,GmPM31在成熟种子中大量表达,其次在幼荚和叶片中表达,在根、茎和花中表达量极低。种子发育过程中,GmPM31表达量呈现先上升后下降的趋势,在开花后第45天表达量达到最大。高温高湿胁迫处理96和168 h时种子中GmPM31的表达量显著高于对照组,说明高温高湿胁迫诱导种子中GmPM31上调表达。研究结果表明GmPM31参与了春大豆种子的发育以及高温高湿胁迫响应过程。
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关键词
春大豆
gmpm31
生物信息学分析
顺式作用元件
表达
种子
高温高湿
下载PDF
职称材料
大豆GmPM31基因的功能分析及拟南芥转化
2
作者
刘骕骦
李昕雨
+5 位作者
王泽博
刘燕敏
刘春冬
沈英姿
李阳
吴酬飞
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期526-535,共10页
大豆GmPM31基因编码蛋白属于植物小分子热激蛋白sHSP-CI(Class I)亚家族的成员,为研究其在大豆抗逆过程中的生物学功能,对GmPM31蛋白进行亚细胞定位分析;采用酵母双杂交和双分子荧光互补方法验证Gm2-MMP与GmPM31蛋白在体内的互作关系;构...
大豆GmPM31基因编码蛋白属于植物小分子热激蛋白sHSP-CI(Class I)亚家族的成员,为研究其在大豆抗逆过程中的生物学功能,对GmPM31蛋白进行亚细胞定位分析;采用酵母双杂交和双分子荧光互补方法验证Gm2-MMP与GmPM31蛋白在体内的互作关系;构建GmPM31启动子5’端不同缺失片段的植物表达载体,通过烟草叶片瞬时表达系统分析其驱动GUS基因的表达水平;利用农杆菌侵染法将GmPM31基因转化拟南芥。结果表明:大豆基质金属蛋白酶Gm2-MMP与小分子热激蛋白GmPM31存在体内互作关系。经40℃高温高湿胁迫处理,与对照组相比,P2062与P1800启动子驱动表达的GUS活性显著增加,说明-1800~-1535 bp区段对GmPM31基因响应高温高湿胁迫信号起关键作用。繁种过表达GmPM31转基因拟南芥植株,筛选得到5株T_(2)代拟南芥阳性植株。
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关键词
大豆
gmpm31
基因
蛋白互作
启动子分析
过表达
下载PDF
职称材料
题名
大豆GmPM31基因生物信息学、组织表达及高温高湿响应分析
被引量:
3
1
作者
刘骕骦
邱颖胜
刘燕敏
李阳
魏家萍
沈英姿
吴酬飞
机构
湖州学院理工学院
湖州师范学院生命科学学院
甘肃农业大学农学院/农作物生物学国家重点实验室
南京农业大学农学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期612-619,共8页
基金
浙江省自然科学基金(LQ20C130003)
浙江省教育厅一般科研项目(YZ0Z145972)。
文摘
sHSPs家族基因GmPM31具有典型的ACD结构域,为了预测和研究GmPM31的功能,本研究以田间劣变抗性春大豆湘豆3号为材料,分离GmPM31及其启动子序列,对该基因的结构及启动子上的顺式作用元件进行生物信息学分析,采用qRT-PCR方法对GmPM31的组织表达模式及高温高湿处理下的表达量变化进行分析。结果表明:GmPM31基因的ORF全长为459 bp,编码153个氨基酸,包含1个ACD保守域结构。蛋白质系统进化树分析结果显示,GmPM31与CI(Class I)亚家族的sHSPs同源性较高,表明GmPM31属于Class I sHSPs家族成员。GmPM31基因启动子中有多个逆境胁迫响应元件,包括激素应答相关元件ABRE、ERE和AAGAA-motif等,干旱和冷胁迫相关的MYB和MYC转录因子作用元件,高盐胁迫相关元件Box III,厌氧胁迫相关元件ARE等。qRT-PCR结果显示,GmPM31在成熟种子中大量表达,其次在幼荚和叶片中表达,在根、茎和花中表达量极低。种子发育过程中,GmPM31表达量呈现先上升后下降的趋势,在开花后第45天表达量达到最大。高温高湿胁迫处理96和168 h时种子中GmPM31的表达量显著高于对照组,说明高温高湿胁迫诱导种子中GmPM31上调表达。研究结果表明GmPM31参与了春大豆种子的发育以及高温高湿胁迫响应过程。
关键词
春大豆
gmpm31
生物信息学分析
顺式作用元件
表达
种子
高温高湿
Keywords
Spring soybean
gmpm31
Bioinformatics analysis
Cis-element
Expression
Seed
High temperature and high humidity stress
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
大豆GmPM31基因的功能分析及拟南芥转化
2
作者
刘骕骦
李昕雨
王泽博
刘燕敏
刘春冬
沈英姿
李阳
吴酬飞
机构
湖州学院理工学院
南京农业大学农学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室
湖州师范学院生命科学学院
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期526-535,共10页
基金
浙江省自然科学基金(LQ20C130003)
浙江省教育厅一般科研项目(Y202248468)
+2 种基金
国家级大学生创新训练计划项目(202113287102,202213287008)
湖州学院大学生创新创业训练计划项目(2022CXCY19)
浙江省大学生科技创新活动计划暨新苗人才计划项目(2022R485A003)。
文摘
大豆GmPM31基因编码蛋白属于植物小分子热激蛋白sHSP-CI(Class I)亚家族的成员,为研究其在大豆抗逆过程中的生物学功能,对GmPM31蛋白进行亚细胞定位分析;采用酵母双杂交和双分子荧光互补方法验证Gm2-MMP与GmPM31蛋白在体内的互作关系;构建GmPM31启动子5’端不同缺失片段的植物表达载体,通过烟草叶片瞬时表达系统分析其驱动GUS基因的表达水平;利用农杆菌侵染法将GmPM31基因转化拟南芥。结果表明:大豆基质金属蛋白酶Gm2-MMP与小分子热激蛋白GmPM31存在体内互作关系。经40℃高温高湿胁迫处理,与对照组相比,P2062与P1800启动子驱动表达的GUS活性显著增加,说明-1800~-1535 bp区段对GmPM31基因响应高温高湿胁迫信号起关键作用。繁种过表达GmPM31转基因拟南芥植株,筛选得到5株T_(2)代拟南芥阳性植株。
关键词
大豆
gmpm31
基因
蛋白互作
启动子分析
过表达
Keywords
soybean
gmpm31
gene
protein interaction
promoter analysis
overexpression
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆GmPM31基因生物信息学、组织表达及高温高湿响应分析
刘骕骦
邱颖胜
刘燕敏
李阳
魏家萍
沈英姿
吴酬飞
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
下载PDF
职称材料
2
大豆GmPM31基因的功能分析及拟南芥转化
刘骕骦
李昕雨
王泽博
刘燕敏
刘春冬
沈英姿
李阳
吴酬飞
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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职称材料
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