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题名大豆GmUGD基因家族生物信息学分析
被引量:5
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作者
朱延明
朱毅
端木慧子
肖佳雷
于洋
刘艾林
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机构
东北农业大学农业生物功能基因重点实验室
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出处
《东北农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第9期23-29,共7页
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基金
国家自然科学基金项目(31171578)
转基因生物新品种培育重大专项(2011ZX08004-002)
黑龙江省高校科技创新团队建设计划(2011TD055)
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文摘
尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UGD)是多糖合成中的一个关键酶,广泛参与植物生长发育与非生物胁迫响应过程。采用生物信息学方法,在全基因组水平预测出10个大豆Gm UGD基因;序列分析结果显示,Gm UGD基因均具有UDP-葡萄糖/GDP-甘露糖脱氢酶家族的3个典型结构域;基因复制分析表明,80%Gm UGD基因存在复制事件;系统发生分析结果显示,Gm UGD基因分为三类,分类结果与基因复制分析结果基本吻合;基于Uni Gene数据库与GEO数据库的表达模式分析显示,根中Gm UGD基因的ESTs最多,上胚轴中最少;另外,Gm UGD基因能够响应盐碱胁迫诱导,在大豆根和叶中表达模式不同。结果可为进一步研究大豆Gm UGD基因功能提供理论依据。
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关键词
gmugd基因
大豆
生物信息学
序列分析
表达分析
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Keywords
gmugd genes
soybean
bioinformatics
sequence analysis
expression analysis
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分类号
Q945.78
[生物学—植物学]
S565.1
[农业科学—作物学]
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