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基于Golden Gate高效构建psiCHECK双荧光素酶报告基因的方法及应用
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作者 杜雅婷 于文君 +2 位作者 李燕 付元磊 孙考祥 《山东第一医科大学(山东省医学科学院)学报》 CAS 2023年第3期180-185,共6页
目的 基于Golden Gate技术构建psiCHECK-CcdB重组双荧光素酶报告载体,并探讨其能否用于RNA干扰(RNA interference, RNAi)药物筛选。方法 通过聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增CcdB致死基因、氯霉素基因与Golden Gate组... 目的 基于Golden Gate技术构建psiCHECK-CcdB重组双荧光素酶报告载体,并探讨其能否用于RNA干扰(RNA interference, RNAi)药物筛选。方法 通过聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增CcdB致死基因、氯霉素基因与Golden Gate组装所需的BsmBI酶切位点,将其克隆至psiCHECK-2载体,构建出重组载体psiCHECK-CcdB。利用2种大肠杆菌DB3.1与DH5α对该载体的致死效率进行检测,选用1 387 bp大小的外源片段克隆至psiCHECK-CcdB载体,检测其连接效率,并验证重组载体能否发挥双荧光素酶报告系统功能,监测目的基因的表达变化。结果 菌落PCR以及测序鉴定psiCHECK-CcdB重组质粒构建成功,该质粒可有效致死无法耐受CcdB毒素的大肠杆菌DH5α菌株,在DB3.1菌株中正常生长。采用Golden Gate的方法可将外源片段简单快速克隆至psiCHECKCcdB载体中,连接效率显著提高且低背景克隆。通过测定双荧光素酶表达强度,证实了小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)靶向性结合目的基因可显著下调荧光素酶的表达,成功发挥双荧光素酶报告基因功能。结论 本研究成功构建了psiCHECK-CcdB重组双荧光素酶报告载体,应用Golden Gate组装技术,简化了实验操作流程,降低了实验成本,具备较高的阳性克隆率与多片段一次性组装的潜力,在RNAi药物筛选领域应用前景广阔。 展开更多
关键词 golden gate CcdB基因 双荧光素酶报告基因 分子克隆 RNAi药物筛选
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毕赤酵母多基因组装系统的构建及其在2-苯乙醇合成中的应用
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作者 陈晓瑞 战春君 +1 位作者 白仲虎 杨艳坤 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期20-25,I0001-I0003,共9页
巴斯德毕赤酵母是一种优良的外源蛋白生产平台,近年来也被用于发酵生产高附加值化学品。为了使产品生产适应发酵工业的需要,常需要对毕赤酵母进行代谢改造,同时表达多个基因。该文设计并建立了一种毕赤酵母多基因组装系统,利用golden g... 巴斯德毕赤酵母是一种优良的外源蛋白生产平台,近年来也被用于发酵生产高附加值化学品。为了使产品生产适应发酵工业的需要,常需要对毕赤酵母进行代谢改造,同时表达多个基因。该文设计并建立了一种毕赤酵母多基因组装系统,利用golden gate克隆实现多元件整合,并通过Cre-lox系统去除抗性标签。该系统可实现同时游离或整合表达多个基因,插入位点、启动子、终止子均可灵活调整。利用这一系统对毕赤酵母进行改造,用于发酵合成高价值化学品2-苯乙醇。通过游离表达比较不同来源的关键基因,并整合表达2-酮-3-脱氧-D-阿拉伯庚酮-7-磷酸合酶ARO3、ARO4^(K229L)和ARO5,分支酸变位酶ARO7^(G141S)和预苯酸脱水酶PHA2基因,最终重组菌株PE-3合成了408.4 mg/L 2-苯乙醇,是出发菌株的10倍以上。该研究建立多基因组装的系统可用于毕赤酵母代谢工程,构建适用于发酵生产蛋白或其他代谢产物的重组菌株。 展开更多
关键词 毕赤酵母 golden gate克隆 代谢改造 2-苯乙醇 多基因组装系统
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基于三联体和金门克隆的快速TALE模块组装技术
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作者 周继曾 杨洋 +3 位作者 鹿璇 李双鹏 邹庆剑 张焜 《生物化工》 CAS 2023年第5期50-55,85,共7页
目的:通过降低转录激活因子样效应物(Transcription Activator-Like Effector,TALE)重复,建立新型简单快速的组装方法。方法:利用密码子的简并性,建立含64种组合的三联体非重复序列库。设计一系列PCR引物,其5’端带有Ⅱ型限制性内切酶... 目的:通过降低转录激活因子样效应物(Transcription Activator-Like Effector,TALE)重复,建立新型简单快速的组装方法。方法:利用密码子的简并性,建立含64种组合的三联体非重复序列库。设计一系列PCR引物,其5’端带有Ⅱ型限制性内切酶识别序列。通过PCR扩增TALE三联体,Esp3I酶切获得DNA突出末端按顺序互补配对。所有三联体片段与TALE骨架载体混合后,用金门(Golden Gate)克隆技术进行有序组装,构建获得具有特定DNA靶向能力的TALE表达载体。结果:利用三联体,可通过一步反应实现简单快速TALE的构建,正确组装的效率高。将TALE与脱氨酶融合,再与CRISPR/Cas9系统组合成Ta C9-BE系统,在293T细胞中5个位点实现了高效的单碱基编辑。结论:结合TALE三联体库和金门克隆技术建立了一种新的TALE构建技术——Tri-GG,这种方法具有易操作、成本低、时间短的优势,为TALE在基因编辑的应用提供了一个新的技术途径。 展开更多
关键词 TALE 三联体 简并密码子 金门克隆 单碱基编辑技术
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植物hpRNA干扰载体构建的研究进展 被引量:9
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作者 言普 沈文涛 +1 位作者 黎小瑛 周鹏 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期7-12,共6页
RNAi技术在基因功能鉴定和功能基因表达调控中发挥着重要作用。hpRNA干扰载体被广泛用于植物的RNAi研究。对植物hpRNA干扰载体的构建方法进行综述,并分析其优缺点,为植物hpRNA干扰载体构建方法的选择提供参考。
关键词 RNAI HPRNA 干扰载体 载体构建 golden gate克隆
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EV71病毒反向遗传学系统的建立及拯救病毒的鉴定
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作者 庄稀尧 卢楠 +7 位作者 唐弘 李智颖 陈俊伊 熊雨涵 徐蕾 王瑜伟 康月茜 杨春 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1479-1484,共6页
目的:建立高效的EV71病毒反向遗传学系统,快速获得拯救病毒并鉴定其活性。方法:首先构建含有人RNA聚合酶Ⅰ启动子(PpolⅠ)、ccdB自杀基因和鼠终止子(mTer)的接收质粒pHM-ccdB,并在ccdB两侧引入AarⅠ酶切位点;为了回避EV71病毒基因组中... 目的:建立高效的EV71病毒反向遗传学系统,快速获得拯救病毒并鉴定其活性。方法:首先构建含有人RNA聚合酶Ⅰ启动子(PpolⅠ)、ccdB自杀基因和鼠终止子(mTer)的接收质粒pHM-ccdB,并在ccdB两侧引入AarⅠ酶切位点;为了回避EV71病毒基因组中自身的AarⅠ酶切位点,分两段PCR扩增基因组,在引物中引入必需的AarⅠ酶切位点,通过Golden Gate Clone技术连接到目的载体中获得病毒拯救质粒pHT-EV71,转染至RD细胞后,获得拯救的EV71病毒,并以RT-PCR、病毒滴度、Western blot以及电镜检测等方法鉴定拯救子代病毒。结果:通过引入ccdB致死基因和Golden Gate Clone成功构建了EV71病毒的拯救质粒(pHT-EV71),并将其转染至RD细胞后,观察到明显的致细胞病变效应(cytopathic effect,CPE),将得到的拯救子代病毒,经EV71 VP1的特异性引物进行RT-PCR扩增,观察到长约1900 bp的特异性条带;Western blot结果显示,该病毒可与EV71 VP1特异抗体结合;透射电子显微镜(transmission electron microscopy,TEM)检测可见20~30 nm球形病毒颗粒;在RD细胞中将子代病毒连续增殖8代后,检测其毒力高于母本株(6.35 lgTCID50/mL)。结论:通过引入ccdB和Golden Gate Clone技术,建立了快速、高效构建EV71病毒的拯救质粒的方法,效率达到100%,为正链RNA病毒反向遗传学系统的构建提供了一种新的策略,为进一步研究EV71病毒的致病机制及疫苗制备等提供了技术平台。 展开更多
关键词 肠道病毒71 golden gate clone 病毒拯救 病毒滴度
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“Golden Gate”克隆法构建靶向载体 被引量:4
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作者 梁龙 杨华 +2 位作者 杨永林 刘守仁 皮文辉 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期111-116,共6页
在同一反应体系内,利用IIS型限制性核酸内切酶和DNA连接酶进行"Golden Gate"克隆方法,将多个目的基因片段按照设定的顺序连接,实现多基因片段一步"无缝"连接。为编辑小鼠β酪蛋白基因位点,利用"Golden Gate&qu... 在同一反应体系内,利用IIS型限制性核酸内切酶和DNA连接酶进行"Golden Gate"克隆方法,将多个目的基因片段按照设定的顺序连接,实现多基因片段一步"无缝"连接。为编辑小鼠β酪蛋白基因位点,利用"Golden Gate"克隆法,构建了小鼠β酪蛋白基因位点同源重组靶向载体。 展开更多
关键词 DNA重组 &ldquo golden gate&rdquo 克隆法 小鼠&beta 酪蛋白基因
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炭疽芽胞杆菌A16D2株BA2380基因缺失突变株的构建 被引量:1
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作者 贾书骅 陈楠 +6 位作者 王东澍 王甜甜 冯尔玲 朱力 王恒樑 彭清忠 刘先凯 《微生物与感染》 2017年第3期164-171,共8页
本课题组早期研究结果表明,炭疽芽胞杆菌BA2380蛋白可能与炭疽芽胞杆菌毒力有关,因而有必要对其功能进行深入研究。选取炭疽芽胞杆菌A16D2株为出发菌株,以其BA2380基因为目的缺失基因,参照A16D2株基因组序列及质粒pSET4s序列,利用软件... 本课题组早期研究结果表明,炭疽芽胞杆菌BA2380蛋白可能与炭疽芽胞杆菌毒力有关,因而有必要对其功能进行深入研究。选取炭疽芽胞杆菌A16D2株为出发菌株,以其BA2380基因为目的缺失基因,参照A16D2株基因组序列及质粒pSET4s序列,利用软件设计上下游同源臂及抗性基因引物,用本实验室改造的"Golden Gate"克隆方法将3个片段同时连入温敏型穿梭载体pKMBK中(本实验室构建的受体质粒),从而构建基因打靶质粒。将该基因打靶质粒导入炭疽芽胞杆菌A16D2感受态细胞中,利用同源重组原理,筛选获得炭疽芽胞杆菌A16D2 BA2380基因缺失突变株,并对其进行验证。结果验证了本课题组构建的"Golden Gate"克隆体系进行多片段克隆的高效性,也为后续探索其基因功能奠定了基础。 展开更多
关键词 炭疽芽胞杆菌 golden gate克隆 基因替换 同源重组
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一种适用于片段替换/插入突变扫描的克隆方法
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作者 甘春杨 刘亚 +4 位作者 罗英英 张文露 黄爱龙 蔡雪飞 胡接力 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期55-63,共9页
功能序列的改造是基因工程的一项基础技术。序列改造往往涉及较大片段的插入或替换,为了获得更优化的改造序列,这种片段插入或替换经常需要以扫描方式进行。传统的酶切连接方式在这种情况下可能难以实现或者费时费力。建立了一种golden ... 功能序列的改造是基因工程的一项基础技术。序列改造往往涉及较大片段的插入或替换,为了获得更优化的改造序列,这种片段插入或替换经常需要以扫描方式进行。传统的酶切连接方式在这种情况下可能难以实现或者费时费力。建立了一种golden gate方法结合混合克隆和快速鉴定的策略(简称Gmix),利用该策略,成功地将外源基因(Gaussia荧光素酶基因)以4种模式,扫描式插入或替换HBV复制质粒的指定区域。该方法成功率高,操作简便快速且成本较低,适合于其他DNA序列的类似改造工作。 展开更多
关键词 克隆 基因工程 golden gate 片段扫描 方法
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Rapid and Efficient Assembly of Transcription Activator-Like Effector Genes by USER Cloning 被引量:1
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作者 Song Wang Wei Li +1 位作者 Shuo Wang Baoyang Hu 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2014年第6期339-347,共9页
Transcription activator-like effectors (TALEs) that were related to bacteria immune system have lately been employed in a promising approach of precise gene targeting. Because of the repetitive characteristics of TA... Transcription activator-like effectors (TALEs) that were related to bacteria immune system have lately been employed in a promising approach of precise gene targeting. Because of the repetitive characteristics of TALEs, existing TALE assembly methods are either very complicated, time-consuming, or too tricky to be handled in common labs. Here, we reported a rapid, efficient and easy method for TALE assembly. This method takes advantage of uracil-specific excision reagent (USER), an enzyme that can cleave DNA constructs and create long, unique single-strand DNA overhangs. Upon USER treatment, the overhangs on each individual TALE repeat unit can be rejoined hierarchically to form pentamers in a ligation-independent manner. Eventually, three pentamers are assembled into a full TALE construct by Golden Gate cloning. TALE nucleases (TALENs) generated with this method exhibit high genome-editing activity in human cells such as HEK293FT cells. Using this method, we have successfully synthesized three TALEN pairs targeting endogenous Tetl locus, and proved that all can specifically target Tetl gene, though in various degree. Comparing to other methods of TALEN assembly, this one is much less labor intensive and fairly faster, and positive clones can be obtained at high efficiency within only two days. We thus contribute to an easier approach for effective TALENs synthesis, which may highly facilitate the wide application of TALEN technology in genome editing, especially for human cells that require precise targeting. 展开更多
关键词 TAL effector TALENs USER Tetl golden gate cloning
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