The Channel Behavior of Gramicidin D in the Self-assembled Monolayer

It was found for the first time that gramicidin D (GD) molecules can be incorporated into the ODM monolayer which is self-assembled on the surface of the gold electrode and form monovalent cation channels.

短杆菌肽A-DMPC通道内离子输运的分子动力学模拟

用最近提出的构建膜体系初始构象的有效方法 ,构建了在DMPC脂膜环境下短杆菌肽A通道模型 (GA -DMPC)。通过对Na +、Ca2 +、Cl-三种不同离子在GA -DMPC通道内不同位置的分子动力学模拟 ,研究离子在通道内输运过程中与通道及通道内水分子的相互作用 ,从分子动力学的角度阐明离子在通道内的输运机制。主要计算结果表明 :(1)离子在通道内的输运使GA的构象发生变化 ,GA的柔性是离子在通道内通透的重要因素 ;(2)Cl- 离子可扩大通道半径 ,Na+ 离子和Ca2 +离子则减小通道半径。Cl-离子不能在GA通道内通透 ;(3)离子的出现使通道内水分子的偶极方向发生变化。上述结果均与实验相符。

短杆菌肽通道内离子K^＋,Na^＋,Li^＋与水的相关性

基于右手螺旋短杆菌肽Ａ离子通道模型，利用分子动力学计算机模拟方法研究了通道内离子Ｋ＋，Ｎａ＋，Ｌｉ＋与水分子的相关性．

短杆菌肽在十八烷基硫醇自组装单层膜上的通道行为

短杆菌肽是短杆芽孢菌在芽孢形成过程中合成的一组憎水十五肽, 它能在脂双层膜上形成一价阳离子通道, 允许一些一价阳离子通过. 短杆菌肽离子通道研究在天然双层膜以及人工双层膜, 如类脂双层膜(BLM)、脂质体上开展的较多, 而基于支撑膜的研究则极少[1～4]. 本文在金电极上制备硫醇自组装单层膜, 研究了短杆菌肽的离子通道行为, 并提出了可能的机理.