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无义介导的mRNA降解机制在肿瘤发生和治疗中的功能研究进展
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作者 汪宇慧 王京鹏 +2 位作者 陈贝 王亚茹 李唐亮 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期930-936,共7页
无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是广泛存在于真核生物细胞的转录后调控机制,可以识别并降解含有提前终止密码子(premature termination codons,PTC)的异常转录本,防止截短蛋白积累,同时NMD可以降解一些正常可以... 无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是广泛存在于真核生物细胞的转录后调控机制,可以识别并降解含有提前终止密码子(premature termination codons,PTC)的异常转录本,防止截短蛋白积累,同时NMD可以降解一些正常可以翻译为功能蛋白的mRNA分子,精准调控基因表达。NMD的生物学功能集中在细胞命运调控、细胞应激反应与动物胚胎发育等过程。本综述对无义介导的mRNA降解通路激活和抑制在肿瘤发生、发展和治疗中的功能及分子机制进行简要探讨。现有研究指出,NMD因子突变可导致人类多种肿瘤的发生。有意义的是,抑制NMD因子的表达,可以通过激活DNA损伤反应和抑制促癌因子的表达,起到杀灭癌症细胞的功效。本综述可为人类癌症发生的生物学机制和治疗策略提供新的思路。 展开更多
关键词 无义介导的mRNA降解 肿瘤 DNA损伤反应 炎症
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一种基于词法特征和数据挖掘的无意义变量名检测方法
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作者 姜艳杰 东春浩 刘辉 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2024年第6期23-33,共11页
标识符是代码的重要组成部分,也是人们理解代码语义的关键元素之一。变量名是最常见的标识符之一,其质量对于代码的可读性和可理解性有着重要的意义。然而,因为各种原因程序员经常使用一些毫无意义的变量名,如“a”和“var”等。这些无... 标识符是代码的重要组成部分,也是人们理解代码语义的关键元素之一。变量名是最常见的标识符之一,其质量对于代码的可读性和可理解性有着重要的意义。然而,因为各种原因程序员经常使用一些毫无意义的变量名,如“a”和“var”等。这些无意义的变量名严重降低了代码的可理解性,需要进行检测并重构(重命名)。为此,提出了一种基于词法特征和数据挖掘的自动化方法,以检测代码中无意义的变量名。首先,对开源代码中的无意义变量名进行了实证分析,发现无意义变量名通常比较短且不包含任何有意义的单词,因此可以利用词法特征筛选出名称较短且不包含有意义单词的可疑变量名。如果可疑变量名包含缩写词,则使用缩写词扩展算法进行扩展,以获得完整的变量名。然后,基于数据挖掘算法判断可疑变量名是否为约定俗成的常用变量名。有些常用的变量名,如“i”和“e”,虽然字面上没有明确的语义,但是通过约定俗成的表示规范,程序员可以理解该变量的语义,因此不算是无意义的变量名,也不需要进行重构。如果可疑变量名称不是约定俗成的常用变量名,则断定该变量名为无意义的变量名,并提醒程序员进行重命名。在开源数据集上进行实验,结果表明,该方法具有较高的准确率,其平均查准率为85%,平均查全率为91.5%。 展开更多
关键词 软件重构 代码质量 数据挖掘 无意义变量名 词法特征
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从修辞语体视角看“废话文学”的文学效应
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作者 莎茹拉 《辽东学院学报(社会科学版)》 2024年第1期71-78,共8页
为探究当前“废话文学”对语言文字安全的影响,在梳理和分析“废话文学”概念的基础上,认为“废话文学”具有文学和网络语言的双重属性。继而从修辞语体的视角入手,深入探析“废话文学”的概念、语域分布、表达效果和其带来的文学效应... 为探究当前“废话文学”对语言文字安全的影响,在梳理和分析“废话文学”概念的基础上,认为“废话文学”具有文学和网络语言的双重属性。继而从修辞语体的视角入手,深入探析“废话文学”的概念、语域分布、表达效果和其带来的文学效应。由此,归纳总结出“废话文学”风趣幽默的风格特征,而这也正是使得“废话文学”广为流行并被滥用而不自知的原因。 展开更多
关键词 “废话文学” 网络语言 修辞语体
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中国恩施土家族苗族自治州高度近视患者SCO2基因新突变
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作者 李印 张丹丹 +1 位作者 吴青松 李拓 《国际眼科杂志》 2024年第1期5-9,共5页
目的:探讨SCO2(OMIM 604272)基因在恩施土家族苗族自治州高度近视患者中的致病性变异。方法:共招募384例高度近视患者,其中至少一眼球镜度数≤-6.00 D,且眼轴长度≥26.00 mm。应用苯酚-氯仿法从5 mL外周静脉血中提取DNA。通过Sanger测... 目的:探讨SCO2(OMIM 604272)基因在恩施土家族苗族自治州高度近视患者中的致病性变异。方法:共招募384例高度近视患者,其中至少一眼球镜度数≤-6.00 D,且眼轴长度≥26.00 mm。应用苯酚-氯仿法从5 mL外周静脉血中提取DNA。通过Sanger测序以鉴定SCO2第2外显子的致病性变异。运用计算机预测软件对检测到的变异进行评估。来自同一地区的288名健康人群作为正常对照。结果:共检测出7个突变位点,分别为4个同义突变(c.201C>T/p.=,c.576C>T/p=,c.633A>C/p.=,c.780T>C/p.=.),2个错义突变(c.187A>G/p.Ile63Val,c.59G>C/p.Arg20Pro)和1个无义突变(c.544C>T/p.Gln182*)。通过PolyPhen2、SIFT和Provean软件预测,两个错义突变没有致病性。新的无义突变(c.544C>T/p.Gln182*)在1000G中未被发现,在288个正常对照中也未被发现。Variant Taster预测该无义突变位点是保守的。结论:新发现的无义突变可能是我们研究的高度近视患者的致病原因。SCO2与高度近视相关,而这批高度近视人群中SCO2基因突变的发生率低至1/384;该无义突变可能是中国恩施土家族苗族自治州高度近视的一种罕见变异。 展开更多
关键词 高度近视 SCO2 Sanger测序 突变 无义突变
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NMD途径功能缺陷对水稻表型及转录组的影响
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作者 吴岳阳 周小燕 +1 位作者 吴玉峰 黄驹 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期540-551,共12页
无义介导的m RNA降解途径(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是细胞内一种关键的RNA质量控制途径,能够有效的降解细胞内错误的m RNA,以保持细胞内部环境的稳定与健康。本研究通过CRISPR/Cas9及amiRNA技术获得水稻NMD途径相关基因UPF1、... 无义介导的m RNA降解途径(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是细胞内一种关键的RNA质量控制途径,能够有效的降解细胞内错误的m RNA,以保持细胞内部环境的稳定与健康。本研究通过CRISPR/Cas9及amiRNA技术获得水稻NMD途径相关基因UPF1、UPF1-like、UPF2、UPF3的敲除或敲低型突变体,结合转录组测序和表型观察,探究NMD途径缺陷对水稻基因表达及可变剪接(alternative splicing,AS)的影响。研究结果表明,NMD途径为水稻正常生长所必需,部分缺陷也会造成株高、花粉活力等表型不同程度的变化。对基因表达的分析显示,NMD途径缺陷影响的基因大多表达上调,且ko-upf1-like和kd-upf1对基因表达的影响大于kd-upf2和kd-upf3。具体而言,NMD途径缺陷在水稻中引发了防御反应相关基因表达量的上升及次生代谢相关基因表达量的下降,且在60天龄早衰突变体中影响的基因更为广泛。转录组分析显示,不同的NMD途径相关基因缺陷均改变了数百个可变剪接,这些存在差异可变剪接的基因多与可变剪接调控通路相关,约有一半在不同突变体中共享,且大量富集了NMD靶标的特征。NMD途径能够通过影响可变剪接形式,改变转录本丰度等多种形式,调控防御反应和衰老等通路基因的表达,在水稻维持正常生理功能的过程中有着重要作用。 展开更多
关键词 无义介导的mRNA降解 水稻 可变剪接 差异表达基因
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A novel nonsense mutation of GPR143 gene in a Korean kindred with X-linked congenital nystagmus 被引量:2
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作者 Ungsoo Samuel Kim Eunhae Cho Hyon J.Kim 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2016年第9期1367-1370,共4页
Dear Editor,I am Dr.Ungsoo Samuel Kim.from Kim's Eye Hospital,Konyang University,Seoul,Korea.I write to present a novel mutation of GPR143 in Korean patients with X-linked congenital nystagmus by using exome sequenci... Dear Editor,I am Dr.Ungsoo Samuel Kim.from Kim's Eye Hospital,Konyang University,Seoul,Korea.I write to present a novel mutation of GPR143 in Korean patients with X-linked congenital nystagmus by using exome sequencing.Congenital nystagmus is an inherited ocular disorder that can occur as an X-linked condition. 展开更多
关键词 GPR A novel nonsense mutation of GPR143 gene in a Korean kindred with X-linked congenital nystagmus GENE
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Interaction of nonsense suppressor tRNAs and codon nonsense mutations or termination codons
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作者 Zixian Lu 《Advances in Biological Chemistry》 2012年第3期301-314,共14页
Codon nonsense mutations include amber, ochre, or opal mutations according to termination codon consisting of three types (TAG, TAA and TGA). Codon nonsense mutations are also divided into natural and artificial mutat... Codon nonsense mutations include amber, ochre, or opal mutations according to termination codon consisting of three types (TAG, TAA and TGA). Codon nonsense mutations are also divided into natural and artificial mutations. We discussed the interaction of codon nonsense mutations and suppressor tRNAs in vitro and in vivo. Nonsense suppressions do not only happen in prokaryotes but also in eukaryotes. Meanwhile, the misreading of termination codon and in-corporation of nonnatural amino acids into proteins are also introduced. 展开更多
关键词 nonsense Suppression CODON nonsense MUTATION SUPPRESSOR TRNAS
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Targeted next-generation sequencing identifies a novel nonsense mutation in ANK1 for hereditary spherocytosis:A case report
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作者 Pan Fu Yang-Yang Jiao +4 位作者 Kai Chen Jing-Bo Shao Xue-Lian Liao Jing-Wei Yang Sha-Yi Jiang 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2022年第15期4923-4928,共6页
BACKGROUND Hereditary spherocytosis(HS)is characterized by anemia,jaundice,splenomegaly,and cholelithiasis,and is caused by abnormal genes encoding red blood cell membrane components.The most common mutations found in... BACKGROUND Hereditary spherocytosis(HS)is characterized by anemia,jaundice,splenomegaly,and cholelithiasis,and is caused by abnormal genes encoding red blood cell membrane components.The most common mutations found in HS are in the ANK1 gene.CASE SUMMARY A 4-mo-old girl was admitted to our hospital with pallor that had lasted for more than 2 mo.She presented with jaundice,anemia and splenomegaly.A heterozygous mutation of ANK1(exon23:c.G2467T:p.E823X)was identified,and the mutation was determined to be autosomal dominant.This mutation is linked to the relatively serious anemia she had after birth;this anemia improved with age.CONCLUSION The utilization of next-generation sequencing may assist with the accurate diagnosis of HS,especially in atypical cases. 展开更多
关键词 Hereditary spherocytosis ANK1 mutation Next-generation sequencing Case report nonsense mutation
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Sense and Nonsense
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《英语学习》 2010年第7期8-9,共2页
“Send cash,not ash!” ——经济崩溃.火山喷发.冰岛大乱欧洲!2008年金融危机期间冰岛主要银行倒闭.致使英国与荷兰三十余万人积蓄血本无归,冰岛公投拒赔他国储户损失。2010年44以来冰岛南部火山持续喷发,火山灰严重影响欧洲... “Send cash,not ash!” ——经济崩溃.火山喷发.冰岛大乱欧洲!2008年金融危机期间冰岛主要银行倒闭.致使英国与荷兰三十余万人积蓄血本无归,冰岛公投拒赔他国储户损失。2010年44以来冰岛南部火山持续喷发,火山灰严重影响欧洲航运与旅游业.欧盟委员会估计其造成的损失高达15亿至25亿欧元。 展开更多
关键词 《Sense and nonsense 英语学习 学习方法 阅读
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Sense and Nonsense
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《英语学习》 2010年第10期4-5,共2页
"Every saint has a past, every sinner has a future, so we'll keep working." ——“每个圣人都有过去,每个罪人都有未来。”不久前.美国微软公司创始人比尔·盖茨和“股神”沃伦·巴菲特联手呼吁美国富豪捐出至少一... "Every saint has a past, every sinner has a future, so we'll keep working." ——“每个圣人都有过去,每个罪人都有未来。”不久前.美国微软公司创始人比尔·盖茨和“股神”沃伦·巴菲特联手呼吁美国富豪捐出至少一半个人财富用于慈善。此前.二人已分别捐出绝大多数个人财富.巴菲特捐出99%的个人财富.盖茨则承诺把大多数财富交由自己的慈善基金会处理。如今,40名资产超过10亿美元的美国富豪承诺将捐出至少一半财富,用于慈善事业.响应盖茨和巴菲特先前联手发起的号召。 展开更多
关键词 《Sense and nonsense 英语学习 学习方法 阅读
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National Nonsense and V. S. Naipaul's Ethical Distance
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作者 Hongbing Zhang 《Sino-US English Teaching》 2011年第10期672-679,共8页
关键词 英语学习 英语教学 英语美文 英语阅读
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Sense and Nonsense
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作者 程思然(选编) 《英语学习》 2011年第5期4-5,共2页
"I'm outraged. It's hard for me tobelieve they would treat the family the way they have, which has been abysmally."——爱因斯坦1955年去世时,将其7.5万页的手稿版权和其他资产捐给了以色列耶路撒冷希伯来大学。该大学... "I'm outraged. It's hard for me tobelieve they would treat the family the way they have, which has been abysmally."——爱因斯坦1955年去世时,将其7.5万页的手稿版权和其他资产捐给了以色列耶路撒冷希伯来大学。该大学同时拥有他的肖像权.每年,用爱因斯坦肖像制作的视频、摇头玩偶以及万圣节面具等产品,都能产生数百万美元的效益。 展开更多
关键词 《Sense and nonsense 英语学习 学习方法 阅读
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Sense and Nonsense
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作者 程思然(选编) 《英语学习》 2011年第3期4-5,共2页
“只有蒸汽,没有引擎。” ——《纽约时报》专栏作家Thomas L.Friedman如此评价美国沸沸扬扬的“茶党”运动(Tea Party movement)。
关键词 《Sense and nonsense 英语学习 学习方法 阅读
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Sense and Nonsense
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《英语学习》 2010年第11期4-5,共2页
"We ask for their understanding. We are correcting deficiencies that we have noted in the implementation of our operating procedures, and none of us wanted this outcome." ——8月23日发生在马尼拉的劫持人质事件,警... "We ask for their understanding. We are correcting deficiencies that we have noted in the implementation of our operating procedures, and none of us wanted this outcome." ——8月23日发生在马尼拉的劫持人质事件,警方与劫匪对峙十多个小时,但仍造成8名香港游客死亡。事件引起香港公众对菲律宾当局和警方的强烈愤怒。菲律宾警方承认参与营救行动的警察团队训练不够,团队领导无能.营救行动计划不周。同时.菲律宾总统阿基诺三世就自己在24日的新闻发布会上面露笑容道歉.称他当时在“表达愤怒,没有其他任何意思”,并希望得到港人的谅解。 展开更多
关键词 《Sense and nonsense 英语学习 学习方法 阅读
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长岛型掌跖角化病的研究进展
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作者 韩宏敏 韩建文 《皮肤科学通报》 2023年第5期624-630,共7页
长岛型掌跖角化病(Nagashima-type palmoplantar keratoderma,NPPK),是东亚人群中常见的弥漫性非表皮松解性掌跖角化病,遗传方式为常染色体隐性遗传。目前已知NPPK由丝氨酸蛋白酶抑制剂B7(serine proteinase inhibitor B7,SERPINB7)基... 长岛型掌跖角化病(Nagashima-type palmoplantar keratoderma,NPPK),是东亚人群中常见的弥漫性非表皮松解性掌跖角化病,遗传方式为常染色体隐性遗传。目前已知NPPK由丝氨酸蛋白酶抑制剂B7(serine proteinase inhibitor B7,SERPINB7)基因的功能缺失所引起,但具体发病机制尚未明确。临床表现以掌跖部位边界清楚的红斑及轻至中度的角化过度为主要特征。目前针对NPPK的标准化疗法尚未制定。最近有研究表明庆大霉素可诱导无义突变进行通读,因此可作为NPPK的潜在性治疗选择,但庆大霉素对该病的具体机制及标准治疗方法仍需深入研究。 展开更多
关键词 长岛型掌跖角化病 SERPINB7 无义突变 庆大霉素
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Effect of high-molecular-weight glutenin subunit Dy10 on wheat dough properties and end-use quality
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作者 WANG Yan GUO Zhen-ru +16 位作者 CHEN Qing LI Yang ZHAO Kan WAN Yong-fang Malcolm JHAWKESFORD JIANG Yun-feng KONG Li PU Zhi-en DENG Mei JIANG Qian-tao LAN Xiu-jin WANG Ji-rui CHEN Guo-yue MA Jian ZHENG You-liang WEI Yu-ming QI Peng-fei 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2023年第6期1609-1617,共9页
High-molecular-weight glutenin subunits(HMW-GSs) are the most critical grain storage proteins that determine the unique processing qualities of wheat. Although it is a part of the superior HMW-GS pair(Dx5+Dy10), the c... High-molecular-weight glutenin subunits(HMW-GSs) are the most critical grain storage proteins that determine the unique processing qualities of wheat. Although it is a part of the superior HMW-GS pair(Dx5+Dy10), the contribution of the Dy10 subunit to wheat processing quality remains unclear. In this study, we elucidated the effect of Dy10 on wheat processing quality by generating and analyzing a deletion mutant(with the Dy10-null allele), and by elucidating the changes to wheat flour following the incorporation of purified Dy10. The Dy10-null allele was transcribed normally,but the Dy10 subunit was lacking. These findings implied that the Dy10-null allele reduced the glutenin:gliadin ratio and negatively affected dough strength(i.e., Zeleny sedimentation value, gluten index, and dough development and stability times) and the bread-making quality;however, it positively affected the biscuit-making quality. The incorporation of various amounts of purified Dy10 into wheat flour had a detrimental effect on biscuit-making quality. The results of this study demonstrate that the Dy10 subunit is essential for maintaining wheat dough strength. Furthermore, the Dy10-null allele may be exploited by soft wheat breeding programs. 展开更多
关键词 HMW-GS nonsense mutation Dy10-null allele end-use quality
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晶状体蛋白截短导致先天性白内障的两个家系致病基因分析
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作者 杨振菲 佘重阳 李乾 《中国计划生育学杂志》 2023年第8期1884-1887,共4页
目的:通过使用全基因组外显子测序确定两个先天性白内障家系的致病基因变异。方法:对2019-2020年在首都医科大学附属北京同仁医院就诊的2个先天性白内障家系部分成员进行详细的临床眼科检查及全身查体。采集先证者及亲属外周血并提取基... 目的:通过使用全基因组外显子测序确定两个先天性白内障家系的致病基因变异。方法:对2019-2020年在首都医科大学附属北京同仁医院就诊的2个先天性白内障家系部分成员进行详细的临床眼科检查及全身查体。采集先证者及亲属外周血并提取基因组DNA,应用全外显子测序筛查可疑致病基因,并对家系全部成员进行Sanger测序验证候选致病变异位点。结果:经过外显子测序及生物信息学分析,家系1中在CRYBB1基因中存在无义变异c.656G>A,造成βB1晶状体蛋白质第219位色氨酸变异为终止密码子(p.W219X),最终产生晶状体蛋白截短。家系2中的发现在CRYGD基因中存在无义变异c.337C>T,造成γD晶状体蛋白质第113位谷氨酰胺变异为终止密码子(p.Q113X),导致晶状体蛋白截短。结论:位于CRYBB1基因的无义变异c.656G>A是导致家系1出现先天性白内障的病因;位于CRYGD基因的无义变异c.337C>T是导致家系2出现先天性白内障的病因。 展开更多
关键词 先天性白内障 晶状体蛋白CRYBB1 晶状体蛋白CRYGD 错义变异 蛋白截短
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一个Ⅰ型神经纤维瘤家系的基因突变分析 被引量:3
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作者 黄颖浩 杨琴波 +3 位作者 邓云华 余念文 王擎 刘木根 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期309-312,共4页
鉴定了一个中国家庭中的常染色体显性遗传病-Ⅰ型神经纤维瘤,通过连锁分析和NF1基因测序,发现该家系中NF1疾病的致病基因与NF1基因连锁,并在NF1基因上发现了一个无义突变G1336X,该突变导致神经纤维蛋白从C末端截断1483个氨基酸残基。G13... 鉴定了一个中国家庭中的常染色体显性遗传病-Ⅰ型神经纤维瘤,通过连锁分析和NF1基因测序,发现该家系中NF1疾病的致病基因与NF1基因连锁,并在NF1基因上发现了一个无义突变G1336X,该突变导致神经纤维蛋白从C末端截断1483个氨基酸残基。G1336X突变在该家系中与疾病共分离,但家系中的正常成员未能检出,表明NF1基因的G1336X的突变是引起该家族患NF1疾病的原因。该突变是第一次在中国NF1疾病人群中报道。 展开更多
关键词 神经纤维瘤 连锁分析 测序 无义突变
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异形词是词位的无值变体 被引量:14
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作者 长召其 张志毅 《语言文字应用》 CSSCI 北大核心 2003年第3期41-46,共6页
词位有语音变体、词形变体、构词变体、语法变体、语义变体、语用变体。异形词是其中的无值变体。异形词有中心成员、次中心成员、边缘成员。
关键词 异形词 词位 无值变体 成员
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1例Wiskott-Aldrich综合征临床特征和致病基因突变分析 被引量:4
20
作者 刘维亮 李芳 +2 位作者 何志旭 蒋红雨 艾戎 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期846-848,861,共4页
目的:分析1例Wiskott-Aldrich综合征患者的临床特征及分子遗传特征。方法:分析患者的临床特征,收集患者及其父母外周血,提取基因组DNA,针对WASP基因所有编码外显子及外显子和内含子交界处进行PCR扩增测序。结果:我们报道的患者具有典型... 目的:分析1例Wiskott-Aldrich综合征患者的临床特征及分子遗传特征。方法:分析患者的临床特征,收集患者及其父母外周血,提取基因组DNA,针对WASP基因所有编码外显子及外显子和内含子交界处进行PCR扩增测序。结果:我们报道的患者具有典型的WAS表型,临床得分为5分;患儿Coomb's试验,自身抗体中ANA及类风湿因子均阳性,伴有自身免疫性疾病。患儿为WASP基因第7外显子中第665位核苷酸C突变为T(c.665C>T),导致211位密码子发生无义突变,该位置提前出现终止密码(p.R211X);其母亲为此突变基因携带者。结论:这例男性中国Wiskott-Aldrich综合征患儿由于WASP基因突变致病,此基因型患儿(p.R211X)拥有典型的WAS表型且伴有自身免疫性疾病的临床型为国内首次报道。 展开更多
关键词 WISKOTT-ALDRICH综合征 WASP基因 无义突变 自身免疫性疾病
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