贵州省2012年度禽流感病毒H5N1亚型HA-1基因分析

目的建立并完善贵州省禽流感病毒基因分析检测技术平台,了解贵州省禽流感病毒H5N1亚型HA1片断与WHO公布的流行株比对有否发生变异。方法收集禽流感H5N1亚型病毒毒株,提取病毒核酸RNA,通过RT-PCR扩增HA1片断,用电泳观察PCR产物目的条带大小,经过纯化、测序,用Biodeit、MEGA4相关软件进行序列比对,进行差异性分析,构建系统发育树。结果贵州省禽流感病毒H5N1亚型中鸭来源的禽流感病毒组成一个分支,组内差异性在0.00～5.00之间;鸡来源的禽流感病毒组成另外一个分支,组内高度同源,差异性为零。结论贵州省禽流感病毒在物种之间存在一定的种属特异性。并且与湖南省的禽流感病毒亲缘关系较近,这与两省之间地理交界有关。

贵州省2012年度甲型流感病毒组成情况分析

目的了解2012年度贵州省甲型流感病毒各个亚型的组成情况。方法收集流感样病例标本,提取病毒核酸RNA,通过实时荧光定量PCR(Real-Time PCR)方法筛选甲型流感病毒阳性的标本,再对其进行各个亚型的鉴别,了解甲型流感病毒各个亚型的组成情况。结果本年度共检测到甲型流感病毒73份,其中甲型H3亚型病毒71份;新型H1N1病毒2份;甲型H1亚型病毒未检出。结论贵州省2012年度甲型流感病毒的优势毒株为甲型H3亚型病毒,占总甲型流感病毒的97.27%;新型H1N1病毒占总甲型流感病毒的2.73%。甲型H1亚型病毒未检出。

贵州省新型甲型H1N1(2009)流感病毒HA-1基因分析

目的建立并完善贵州省新型甲型H1N1流感病毒基因分析检测技术平台,了解贵州省新型甲型H1N1(2009)流感病毒HA1片断与WHO公布的流行株有否发生变异。方法收集16株新型甲型H1N1流感病毒毒株,提取病毒核酸RNA,通过RT-PCR扩增HA1片断,用电泳观察PCR产物目的条带大小,经过纯化、测序,用Biodeit、MEGA4相关软件进行序列比对,同源性及差异性分析,构建系统发育树。结果贵州省(2009)代表株与中俄代表株A/Habarovak/01/2009(H1N1)和墨西哥第一株甲型H1N1流感A/Mexio City/001/2009(H1N1)同属一个谱系,亲缘关系较近,同源性在93.2%～95.8%之间。结论贵州省(2009)代表株与WHO公布的流行株在核苷酸水平上有一定程度的变异。

2022—2023年贵州省呼吸道病毒病原谱及流感A(H1N1)pdm亚型病毒基因特征分析

目的了解贵州省2022—2023年流感样病例呼吸道病毒病原谱的构成情况,进一步分析流感A(H1N1)pdm亚型病毒的基因特征及变化规律。方法收集贵州省2022—2023年流感样病例591份,采用多重荧光定量PCR方法对常见呼吸道病原体进行检测,检测项目包括流感病毒(IFV)、副流感病毒(HPIV)、冠状病毒(HCoV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、腺病毒(ADV)、偏肺病毒(HMPV)、鼻病毒(HRV)和博卡病毒(HBoV)8种病毒及其分型,检测结果采用SPSS 22.0统计软件进行数据分析;通过高通量测序技术进行流感A(H1N1)pdm亚型病毒全基因组序列测定,采用Nextclade、MEGA7等进行血凝素(HA)基因序列分析及糖基化位点、抗原决定簇、受体结合位点突变情况分析。结果共检测出呼吸道病毒阳性样本363份,总阳性率为61.42%,检出率前3位的分别是IFV-A(H1N1)pdm亚型病毒(阳性率15.06%,89份)、IFV-A(H3N2)亚型病毒(阳性率13.71%,81份)和新冠病毒(SARS-CoV-2)(阳性率13.37%,79份)。不同性别和不同年龄组呼吸道病原体检出率差异无统计学意义;不同季节呼吸道病原体检出率差异有统计学意义(P<0.001)。混合感染病例检出36份,检出率为6.09%,以鼻病毒的混合感染检出最多(17份,占比47.22%)。共获得16株贵州省流感A(H1N1)pdm09亚型病毒全基因组序列,均为6B.1A.5a.2a进化分支。Sb抗原决定簇发生A186T、Q189E氨基酸替换;受体结合位点发生190位螺旋(184-191):A186T、Q189E及220位环E224A突变;未发现糖基化位点改变。结论呼吸道病毒是流感样病例的重要病原体,以流感病毒最为常见,混合感染占比较高。IFV及HMPV检出率有明显季节性差异。2022—2023年贵州省IFV-A(H1N1)pdm09亚型病毒分子结构与功能尚未发生大的变化,与疫苗株匹配性良好,流感疫苗的抗体保护性较好。

2018-2022年贵州省流感样病例流行特征分析

目的为了解2018—2022年贵州省流感样病例(ILI)的流行特征,掌握流感病毒的变异变迁情况,为科学防控流感提供依据。方法采用描述流行病学方法,对2018—2022年贵州省ILI监测数据进行分析。结果2018—2022年贵州省ILI的就诊比例(ILI%)为7.94%,ILI%呈逐年上升趋势。流感流行时间呈冬春季和夏秋季双峰分布。ILI%较高的前3个市(州)分别为黔南州、贵阳市和黔东南州,ILI%最低的为安顺市。5岁以下儿童ILI的占比最高,60岁及以上人群ILI占比最少,不同年龄组ILI的构成差异具有统计学意义(P<0.001)。2018—2022年贵州省ILI流感病毒核酸阳性率为11.37%,五年间不同流感病毒优势毒株交替流行。以月为单位的流感病毒核酸阳性率与ILI%呈正相关关系(P=0.028)。2018—2022年贵州省共报告流感暴发疫情227起,主要发生在中小学校,暴发疫情检出流感病毒类型主要为甲型H3N2、BV和甲型H1N1。结论2018—2022年贵州省ILI%逐年上升,2020年之后流感病毒核酸阳性率先降低后升高,流行毒株发生了改变,发病人群仍主要是学校5岁及以下儿童。需加强学校5岁以下儿童流感的健康宣教和疫苗接种。