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应用微卫星多态分析青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalski(Kessler))六个野生群体的遗传多样性 被引量:15
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作者 蒋鹏 史建全 +2 位作者 张研 祁洪芳 孙效文 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期939-945,共7页
青海湖裸鲤是青海湖唯一的经济鱼类,由于湖区生态环境的恶化,使得该鱼种群数量越来越稀少。2004年中国环境发展国际合作委员会在《中国物种红色名录》中,将其列为濒危物种。研究利用生物素-磁珠富集法获得10个具有多态的微卫星分子标记... 青海湖裸鲤是青海湖唯一的经济鱼类,由于湖区生态环境的恶化,使得该鱼种群数量越来越稀少。2004年中国环境发展国际合作委员会在《中国物种红色名录》中,将其列为濒危物种。研究利用生物素-磁珠富集法获得10个具有多态的微卫星分子标记,检测6个野生裸鲤群体:布哈河群体、沙柳河群体、哈尔盖河群体、泉吉河群体、黑马河群体、淡水系群体的遗传多样性。结果表明:每个座位上的等位基因数为2~8个,大小在161~486bp之间。有效等位基因数在1.00~5.45个,平均多态信息含量分别为0.3642、0.4044、0.3830、0.4047、0.3869和0.3940,无偏观测杂合度的平均值在0.4145~0.5105之间,说明这几个群体属于中度多态,遗传多样性水平较高。根据群体间的遗传距离和遗传相似系数发现,布哈河群体与淡水系群体之间的遗传距离最大(DA=0.1607),哈尔盖河群体与泉吉河群体之间的遗传距离最小(DA=0.0125)。由UPGMA聚类图可知:哈尔盖河和泉吉河两个群体聚为一个分支,布哈河、沙流河、黑马河和淡水系4个群体聚为另一个分支。 展开更多
关键词 青海湖裸鲤 遗传多样性 微卫星
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基于离散SNP位点解析青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)对水温和盐度的适应性
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作者 罗慧 匡箴 +2 位作者 罗颖 祁洪芳 方弟安 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期25-33,共9页
青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)在长期的进化过程中逐渐适应了青海湖特殊的高原地理环境。为揭示青海湖裸鲤的适应性进化机制,采用基因分型测序(genotyping by sequencing, GBS)技术对6个群体72尾青海湖裸鲤开展离散单核苷酸多态... 青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)在长期的进化过程中逐渐适应了青海湖特殊的高原地理环境。为揭示青海湖裸鲤的适应性进化机制,采用基因分型测序(genotyping by sequencing, GBS)技术对6个群体72尾青海湖裸鲤开展离散单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点筛选,探讨其可能受到自然选择作用的相关SNP位点,并对离散SNP位点所在contigs进行序列比对及功能注释。研究共得到1 566个高度变异的适应性离散SNP位点。NR(non-redundant protein sequences)注释显示,相似比例序列所占比例最高的前两个物种分别是鱇浪白鱼(Anabarilius grahami)和鲤(Cyprinus carpio)。GO注释分析发现,注释到细胞过程、代谢过程和结合的contigs较多。KEGG注释分析显示,注释到代谢通路和神经活性配体-受体相互作用通路的contigs最多,其中,注释到代谢通路的基因包括ctu1、cps1、gba2、fasn和plcg1等,推测这些基因与青海湖裸鲤的本地适应性相关。研究结果证明青海湖裸鲤可能形成了与温度、盐度等环境因子相关的本地适应性机制,研究结果为进一步深入探讨青海湖裸鲤的本地适应性机制提供了技术方法和数据支撑。 展开更多
关键词 青海湖裸鲤 基因分型测序 离散SNP位点 功能注释 本地适应性
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青海湖裸鲤繁殖群体线粒体基因组D-loop区序列多态性 被引量:37
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作者 陈大庆 张春霖 +1 位作者 鲁成 张信 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期800-806,共7页
利用PCR技术扩增青海湖3个不同地区(黑马河,布哈河,沙柳河)的青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii(Kessler))线粒体D-loop基因片段,测定该基因片段1 005 bp序列。通过线粒体基因组D-loop区序列比较分析,对比3个不同地区的83尾青海湖裸... 利用PCR技术扩增青海湖3个不同地区(黑马河,布哈河,沙柳河)的青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii(Kessler))线粒体D-loop基因片段,测定该基因片段1 005 bp序列。通过线粒体基因组D-loop区序列比较分析,对比3个不同地区的83尾青海湖裸鲤的遗传结构进行研究,共检测出多态性位点65个,其中有1个插入位点(b3,nt-569),2个缺失位点(s6和b37,nt-169、nt-170),多态性位点数62。3个群体内的多态性位点分别为黑马河51个、布哈河38个、沙柳河39个,平均核苷酸位点差异数分别为9.377、7.782和7.510。结果表明,不同地区的遗传距离分别为黑马河群体与布哈河群体间的平均遗传距离最小(0.010 93),布哈河群体与沙柳河群体次之(0.014 23),黑马河群体与沙柳河群体的遗传平均距离最大(0.019 09)。3个群体间的遗传平均距离都在0.01以上,而且3个群体间总的遗传分化指数为0.019 26,基因流为12.73。UPGMA法构建的分子系统树中,沙柳河群体聚成一支,黑马河和布哈河群体混杂在一起,聚成一支。从序列差异的分析中得出,沙柳河群体与黑马河和布哈河群体的亲缘关系较远;黑马河和布哈河群体亲缘关系较近。以上数据还表明,青海湖裸鲤3个繁殖群体间具有较弱的遗传分化,洄游到同一河流里进行交配繁殖的群体内基因交流作用比较大。 展开更多
关键词 青海湖裸鲤 线粒体基因组D-loop区 遗传多样性
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青海湖裸鲤生活史类型的研究 被引量:12
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作者 刘军 《四川动物》 CSCD 北大核心 2005年第4期455-458,共4页
用模糊聚类法定量研究了青海湖裸鲤的生活史类型,以平衡产量模式进行了验证,并用世代生物量法探讨了其合理捕捞强度与捕捞年龄.结果表明:青海湖裸鲤属比较典型的k-选择类型鱼类;青海湖裸鲤平衡产量曲线与达氏鳇的平衡产量曲线非常相似;... 用模糊聚类法定量研究了青海湖裸鲤的生活史类型,以平衡产量模式进行了验证,并用世代生物量法探讨了其合理捕捞强度与捕捞年龄.结果表明:青海湖裸鲤属比较典型的k-选择类型鱼类;青海湖裸鲤平衡产量曲线与达氏鳇的平衡产量曲线非常相似;青海湖裸鲤的临界年龄为15.67龄,整个世代生物量在11~16龄达到最大;建议对青海湖裸鲤进行捕捞的最小捕捞年龄为12龄,捕捞强度不超过0.1. 展开更多
关键词 青海湖裸鲤 生活史类型 模糊聚类分析 平衡产量模式
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2种裸鲤线粒体DNA细胞色素b基因序列分析 被引量:4
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作者 李太平 《西南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2004年第1期81-83,共3页
对青海湖裸鲤和花斑裸鲤的线粒体DNA细胞色素b基因进行了PCR扩增、克隆及其序列测定,得到的序列长度均为1140bp,但T,C,A,G含量有所不同。在青海湖裸鲤细胞色素b基因中它们的含量分别为355(31.1%),296(26%),305(26.8%)和184(16.1%),GC含... 对青海湖裸鲤和花斑裸鲤的线粒体DNA细胞色素b基因进行了PCR扩增、克隆及其序列测定,得到的序列长度均为1140bp,但T,C,A,G含量有所不同。在青海湖裸鲤细胞色素b基因中它们的含量分别为355(31.1%),296(26%),305(26.8%)和184(16.1%),GC含量为42.1%,分子量为349693道尔顿(Dalton);在花斑裸鲤细胞色素b基因中,它们的含量分别为358(31.4%),294(25.8%),305(26.8%)和183(16.1%),GC含量为41.8%,分子量为349698道尔顿(Dalton)。 展开更多
关键词 青海湖裸鲤 花斑裸鲤 细胞色素B DNA序列
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青海湖裸鲤资源增殖放流概述 被引量:7
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作者 史建全 祁洪芳 《中国渔业经济》 北大核心 2009年第5期80-84,共5页
青海湖裸鲤(Gymnocypris przew alskii)是青海湖中唯一的水生经济动物,处于青海湖整个生态系统核心地位,1979年被国务院在《水产资源繁殖保护条例》中列为我国重要或名贵水生动物,1994年在《中国生物多样性保护行动计划》中,列入鱼类优... 青海湖裸鲤(Gymnocypris przew alskii)是青海湖中唯一的水生经济动物,处于青海湖整个生态系统核心地位,1979年被国务院在《水产资源繁殖保护条例》中列为我国重要或名贵水生动物,1994年在《中国生物多样性保护行动计划》中,列入鱼类优先保护物种二级名录,2004年被中国环境发展国际合作委员会生物多样性工作组在《中国物种红色名录》中,列为濒危物种。由于自然和人为的因素,自上世纪后半页以来,青海湖裸鲤资源急剧下降,严重影响青海湖"鱼鸟共生"生态平衡。本文概述青海湖裸鲤资源保护现状,提出青海湖裸鲤增殖放流存在的问题。 展开更多
关键词 青海湖 裸鲤 增殖放流
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青海湖裸鲤、鲤鱼的血红蛋白的电泳研究 被引量:3
7
作者 魏乐 《青海师范大学学报(自然科学版)》 2000年第2期39-43,共5页
本文用聚丙烯酰胺凝胶垂直平板电泳方法 ,对鲤科 (Cypiinidae) 2种鱼类 :青海湖裸鲤 (GymnocyprisPrzewalskii)、鲤鱼 (CypiinusCarpioLinnaeus)的血红蛋白进行了分析研究 ,讨论了两者血红蛋白的种间差异以及它们各自的遗传特异性 ,以... 本文用聚丙烯酰胺凝胶垂直平板电泳方法 ,对鲤科 (Cypiinidae) 2种鱼类 :青海湖裸鲤 (GymnocyprisPrzewalskii)、鲤鱼 (CypiinusCarpioLinnaeus)的血红蛋白进行了分析研究 ,讨论了两者血红蛋白的种间差异以及它们各自的遗传特异性 ,以期积累生化遗传学资料。以便进一步在生化水平上为鉴别物种的特异性和它们在进化上的亲缘关系提供佐证。结果显示 :两种鱼类各自的血红蛋白谱带稳定 ,但两者之间有较大差异。从扫描图谱分析 ,每种鱼类个体之间血红蛋白电泳结果既有微小的个体特异性 ,又表现较大的一致性。 展开更多
关键词 血红蛋白 聚丙烯酰胺凝胶电泳 青海湖裸鲤 鲤鱼
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裸鲤卵有毒成份在人工脂双层形成离子通道 被引量:2
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作者 施玉 王文萍 卓晓亮 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第3期357-361,共5页
误食裸鲤(Gymmocypris Prizewalskii Kessler,又名鳇鱼)卵而致呕吐和腹泻的病例早已有报告,其作用来源于可引起平滑肌收缩的有毒成份。本工作利用卵磷脂和胆固醇形成的脂双层,在电压箝位下首次观... 误食裸鲤(Gymmocypris Prizewalskii Kessler,又名鳇鱼)卵而致呕吐和腹泻的病例早已有报告,其作用来源于可引起平滑肌收缩的有毒成份。本工作利用卵磷脂和胆固醇形成的脂双层,在电压箝位下首次观察到经Sephadex G(50)初步分离的裸鲤卵的有毒组分改变脂双层的膜电导,形成跨膜离子通道。这个组分至少含有两种分别可在脂双层形成阴离子和阳离子通道的成份。 展开更多
关键词 裸鲤 鱼纲 鱼卵 毒性成份 脂双层 离子通道
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青海湖裸鲤油脂中脂肪酸初步分析 被引量:2
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作者 杨绪启 王雪萍 +1 位作者 王发春 安承熙 《青海大学学报(自然科学版)》 1998年第2期19-21,13,共4页
用乙醚—正乙烷混合溶剂提取青海湖裸鲤油脂;用氢氧化钾—甲醇酯交换法甲酯化,以毛细管气相色谱法测定脂肪酸组成,鉴定了15种主要脂肪酸,其中以棕榈酸、棕榈油酸、油酸、α-亚麻酸、二十碳五烯酸(EPA)和二十二碳六烯酸(DHA)为主.
关键词 青海湖裸鲤 脂肪酸 油脂 EPA DHA
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