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8份广西产绞股蓝种质的RAPD引物筛选及其遗传多样性分析
被引量:
5
1
作者
周娟
罗育
+3 位作者
吴耀生
李科志
蒋军富
徐鹏
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期273-278,共6页
本研究的目的在于筛选合适的RAPD随机引物,应用RAPD技术对药用植物绞股蓝进行遗传多样性分析,并构建DNA指纹图谱。研究结果表明,我们利用生物信息学方法挑选出的20条引物中有19条引物的扩增条带清晰且多态性好;在清晰稳定出现的354条带...
本研究的目的在于筛选合适的RAPD随机引物,应用RAPD技术对药用植物绞股蓝进行遗传多样性分析,并构建DNA指纹图谱。研究结果表明,我们利用生物信息学方法挑选出的20条引物中有19条引物的扩增条带清晰且多态性好;在清晰稳定出现的354条带中,294条具有多态性;其中有3条引物的扩增条带可清楚区分绞股蓝与混淆品种乌蔹莓,可建立其DNA指纹图谱。按UPGMA法进行聚类分析,计算其遗传相似系数,结果显示,8份绞股蓝供试材料聚为两类,聚类结果与其地理区域远近和生长环境一致。本研究中筛选出的19条引物适用于绞股蓝遗传多样性分析,且获得的DNA指纹图谱可用于鉴别绞股蓝。
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关键词
绞股蓝
rapd
遗传多样性
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职称材料
绞股蓝种质资源遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析
被引量:
10
2
作者
李华
史美荣
肖娅萍
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期1666-1672,共7页
目的研究绞股蓝Gynostemma pentaphyllun种质资源的遗传多样性及亲缘关系。方法采用ISSR分子标记技术对来自全国12个省市不同生态环境的48份绞股蓝种质材料进行遗传多样性及亲缘关系分析。结果 100条ISSR引物中共筛选出15条扩增条带清...
目的研究绞股蓝Gynostemma pentaphyllun种质资源的遗传多样性及亲缘关系。方法采用ISSR分子标记技术对来自全国12个省市不同生态环境的48份绞股蓝种质材料进行遗传多样性及亲缘关系分析。结果 100条ISSR引物中共筛选出15条扩增条带清晰、稳定性好且多态性明显的引物,48份材料DNA扩增共获得214个位点,其中多态位点206个,多态性比率(PPL)96.26%,平均每条引物扩增位点为14.27个;平均观察等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Shannon多样性信息指数(I)和Nei’s基因多样性指数(H)分别为1.962 6、1.335 8、0.221 1和0.359 8;种质材料间的遗传相似系数变幅为0.57~0.96,平均为0.72。利用UPGMA聚类分析,以遗传相似系数0.71为界,48份材料聚为4大类。结论绞股蓝种质材料间的遗传多样性较高,种质间的亲缘关系与其地理分布和生态环境并不完全一致。
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关键词
绞股蓝
种质资源
遗传多样性
亲缘关系
ISSR标记
原文传递
题名
8份广西产绞股蓝种质的RAPD引物筛选及其遗传多样性分析
被引量:
5
1
作者
周娟
罗育
吴耀生
李科志
蒋军富
徐鹏
机构
广西医科大学生物化学与分子生物学教研室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期273-278,共6页
基金
广西科学基金(0731065)
广西区教育厅硕士研究生科研创新项目(2009)共同资助
文摘
本研究的目的在于筛选合适的RAPD随机引物,应用RAPD技术对药用植物绞股蓝进行遗传多样性分析,并构建DNA指纹图谱。研究结果表明,我们利用生物信息学方法挑选出的20条引物中有19条引物的扩增条带清晰且多态性好;在清晰稳定出现的354条带中,294条具有多态性;其中有3条引物的扩增条带可清楚区分绞股蓝与混淆品种乌蔹莓,可建立其DNA指纹图谱。按UPGMA法进行聚类分析,计算其遗传相似系数,结果显示,8份绞股蓝供试材料聚为两类,聚类结果与其地理区域远近和生长环境一致。本研究中筛选出的19条引物适用于绞股蓝遗传多样性分析,且获得的DNA指纹图谱可用于鉴别绞股蓝。
关键词
绞股蓝
rapd
遗传多样性
Keywords
gynostemma pentaphyllurn (thunb) makino
,
rapd
,
genetic diversity
分类号
S567.237 [农业科学—中草药栽培]
Q943 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
绞股蓝种质资源遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析
被引量:
10
2
作者
李华
史美荣
肖娅萍
机构
陕西师范大学生命科学学院药用资源与天然药物化学教育部重点实验室西北濒危药材资源开发国家工程实验室
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第11期1666-1672,共7页
基金
国家"十二五"科技支撑计划(660588)
文摘
目的研究绞股蓝Gynostemma pentaphyllun种质资源的遗传多样性及亲缘关系。方法采用ISSR分子标记技术对来自全国12个省市不同生态环境的48份绞股蓝种质材料进行遗传多样性及亲缘关系分析。结果 100条ISSR引物中共筛选出15条扩增条带清晰、稳定性好且多态性明显的引物,48份材料DNA扩增共获得214个位点,其中多态位点206个,多态性比率(PPL)96.26%,平均每条引物扩增位点为14.27个;平均观察等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Shannon多样性信息指数(I)和Nei’s基因多样性指数(H)分别为1.962 6、1.335 8、0.221 1和0.359 8;种质材料间的遗传相似系数变幅为0.57~0.96,平均为0.72。利用UPGMA聚类分析,以遗传相似系数0.71为界,48份材料聚为4大类。结论绞股蓝种质材料间的遗传多样性较高,种质间的亲缘关系与其地理分布和生态环境并不完全一致。
关键词
绞股蓝
种质资源
遗传多样性
亲缘关系
ISSR标记
Keywords
gynostemma
pentaphyllun
(thunb
.)
makino
germplasm reseources
genetic diversity
phylo
genetic
relationship
ISSRmarkers
分类号
R282.12 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
8份广西产绞股蓝种质的RAPD引物筛选及其遗传多样性分析
周娟
罗育
吴耀生
李科志
蒋军富
徐鹏
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010
5
下载PDF
职称材料
2
绞股蓝种质资源遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析
李华
史美荣
肖娅萍
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2015
10
原文传递
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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