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陕西省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒基因特征分析
1
作者
秦龙
张俊君
+2 位作者
陈斌
王士峰
余鹏博
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期1434-1439,共6页
目的分析陕西省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒(EA H1N1 SIV)的基因特征。方法采集患者咽拭子标本,接种MDCK细胞进行病毒分离获得毒株,采用全基因组深度测序方法获得分离株的8个基因节段序列,通过GenBank数据库中Blast程序...
目的分析陕西省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒(EA H1N1 SIV)的基因特征。方法采集患者咽拭子标本,接种MDCK细胞进行病毒分离获得毒株,采用全基因组深度测序方法获得分离株的8个基因节段序列,通过GenBank数据库中Blast程序进行核苷酸同源性分析,构建系统进化树,分析病毒基因特征。结果病例咽拭子标本经实验室确诊为EA H1N1 SIV,后分离毒株命名为A/Shaanxi-Weicheng/1351/2022(H1N1v)。同源性分析显示,该分离株的PB2、NP、HA、NA和M基因均与A/swine/Beijing/0301/2018(H1N1)核苷酸同源性最高,分别为98.29%、98.73%、97.41%、97.52%和99.08%。进化树显示,该分离株属于G4基因型EA H1N1 SIV,其中PB2、PB1、PA、NP和M基因来自pdm/09 H1N1,HA和NA基因来自EA H1N1,NS基因来自三源重配H1N1。其HA蛋白裂解位点为IPSIQSR↓G,为低致病性流感病毒的分子特征。NA蛋白未出现与神经氨酸酶抑制剂相关的氨基酸突变。PB2蛋白701N、PA蛋白P224S突变、NP蛋白Q357K突变、M蛋白P41A突变和NS蛋白92D均说明其对哺乳动物的适应性增强。结论该患者为陕西省首例人感染G4基因型EA H1N1 SIV病例,该病毒为低致病性,但其对哺乳动物的适应性增强,需要加强对此类SIVs的监测。
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关键词
猪源甲型
h1n1
流感病毒
欧亚类禽
h1n1
猪流感病毒
基因特征
进化树
监测
原文传递
云南省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒病原学特征分析
被引量:
11
2
作者
李梓
赵晓南
+9 位作者
黄维娟
杨磊
成艳辉
谭敏菊
李希妍
刘佳
陈志肖
隗合江
伏晓庆
王大燕
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期290-297,共8页
2020年云南发现了首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1(EA H1N1)猪流感病毒,针对分离到的A/YunnanMengzi/1462/2020(H1N1v)病毒分析其血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)氨基酸变异位点、生物学耐药、受体亲和力及抗原性变异特征,并对2020-2021年...
2020年云南发现了首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1(EA H1N1)猪流感病毒,针对分离到的A/YunnanMengzi/1462/2020(H1N1v)病毒分析其血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)氨基酸变异位点、生物学耐药、受体亲和力及抗原性变异特征,并对2020-2021年度季节性流感疫苗对该病毒的交叉保护效果进行评价。结果显示,EA H1N1猪流感病毒A/Yunnan-Mengzi/1462/2020(H1N1v)与世界卫生组织推荐的疫苗株A/Hunan/42443/2015(H1N1v)HA和NA氨基酸位点同源性分别为97.9%和97.4%;A/Yunnan-Mengzi/1462/2020(H1N1v)病毒对神经氨酸酶抑制剂敏感,以结合人流感病毒唾液酸受体α2,6为主,与疫苗株抗原性存在8倍以上差异。接种季节性流感疫苗的儿童、成人和老年组人群针对季节性流感疫苗株A/Guangdong-Maonan/SWL1536/2019(H1N1pdm)抗体滴度≥40者占比分别为80.0%、76.7%和63.3%;而对A/Yunnan-Mengzi/1462/2020(H1N1v)抗体滴度仅为13.3%、26.7%和6.7%。本研究提示接种季节性流感疫苗后产生的抗体对G4基因型EA H1N1病毒不能提供有效保护,该病毒与目前EA H1N1病毒疫苗株在氨基酸位点和抗原性上存在显著差异,并且保持了结合人流感病毒唾液酸受体的特性,研究结果提示需要构建新的疫苗株。
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关键词
欧亚类禽
h1n1
猪流感病毒(EA
h1n1
)
氨基酸位点
耐药性
受体
抗体
原文传递
题名
陕西省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒基因特征分析
1
作者
秦龙
张俊君
陈斌
王士峰
余鹏博
机构
咸阳市疾病预防控制中心微生物实验室
陕西省疾病预防控制中心病毒病预防控制所
出处
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期1434-1439,共6页
文摘
目的分析陕西省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒(EA H1N1 SIV)的基因特征。方法采集患者咽拭子标本,接种MDCK细胞进行病毒分离获得毒株,采用全基因组深度测序方法获得分离株的8个基因节段序列,通过GenBank数据库中Blast程序进行核苷酸同源性分析,构建系统进化树,分析病毒基因特征。结果病例咽拭子标本经实验室确诊为EA H1N1 SIV,后分离毒株命名为A/Shaanxi-Weicheng/1351/2022(H1N1v)。同源性分析显示,该分离株的PB2、NP、HA、NA和M基因均与A/swine/Beijing/0301/2018(H1N1)核苷酸同源性最高,分别为98.29%、98.73%、97.41%、97.52%和99.08%。进化树显示,该分离株属于G4基因型EA H1N1 SIV,其中PB2、PB1、PA、NP和M基因来自pdm/09 H1N1,HA和NA基因来自EA H1N1,NS基因来自三源重配H1N1。其HA蛋白裂解位点为IPSIQSR↓G,为低致病性流感病毒的分子特征。NA蛋白未出现与神经氨酸酶抑制剂相关的氨基酸突变。PB2蛋白701N、PA蛋白P224S突变、NP蛋白Q357K突变、M蛋白P41A突变和NS蛋白92D均说明其对哺乳动物的适应性增强。结论该患者为陕西省首例人感染G4基因型EA H1N1 SIV病例,该病毒为低致病性,但其对哺乳动物的适应性增强,需要加强对此类SIVs的监测。
关键词
猪源甲型
h1n1
流感病毒
欧亚类禽
h1n1
猪流感病毒
基因特征
进化树
监测
Keywords
Swine origin
influenza
A
h1n1
virus
Eurasian
avian
-like
h1n1
swine
influenza
virus
es
Genetic characteristic
Phylogenetic tree
Surveillance
分类号
R511.7 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
云南省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒病原学特征分析
被引量:
11
2
作者
李梓
赵晓南
黄维娟
杨磊
成艳辉
谭敏菊
李希妍
刘佳
陈志肖
隗合江
伏晓庆
王大燕
机构
中国疾病预防控制中心
云南省疾病预防控制中心
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第2期290-297,共8页
基金
国家科技重大专项(项目号:2020ZX10001-016-004-001),题目:人感染禽流感病毒潜在耐药突变及对致病性影响。
文摘
2020年云南发现了首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1(EA H1N1)猪流感病毒,针对分离到的A/YunnanMengzi/1462/2020(H1N1v)病毒分析其血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)氨基酸变异位点、生物学耐药、受体亲和力及抗原性变异特征,并对2020-2021年度季节性流感疫苗对该病毒的交叉保护效果进行评价。结果显示,EA H1N1猪流感病毒A/Yunnan-Mengzi/1462/2020(H1N1v)与世界卫生组织推荐的疫苗株A/Hunan/42443/2015(H1N1v)HA和NA氨基酸位点同源性分别为97.9%和97.4%;A/Yunnan-Mengzi/1462/2020(H1N1v)病毒对神经氨酸酶抑制剂敏感,以结合人流感病毒唾液酸受体α2,6为主,与疫苗株抗原性存在8倍以上差异。接种季节性流感疫苗的儿童、成人和老年组人群针对季节性流感疫苗株A/Guangdong-Maonan/SWL1536/2019(H1N1pdm)抗体滴度≥40者占比分别为80.0%、76.7%和63.3%;而对A/Yunnan-Mengzi/1462/2020(H1N1v)抗体滴度仅为13.3%、26.7%和6.7%。本研究提示接种季节性流感疫苗后产生的抗体对G4基因型EA H1N1病毒不能提供有效保护,该病毒与目前EA H1N1病毒疫苗株在氨基酸位点和抗原性上存在显著差异,并且保持了结合人流感病毒唾液酸受体的特性,研究结果提示需要构建新的疫苗株。
关键词
欧亚类禽
h1n1
猪流感病毒(EA
h1n1
)
氨基酸位点
耐药性
受体
抗体
Keywords
Eurasian
avian
-like
h1n1
swine
influenza
virus
es
HA and NA
Amino-acid sites
Drug resistance
Receptor
Antibody
分类号
R373.1 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
陕西省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒基因特征分析
秦龙
张俊君
陈斌
王士峰
余鹏博
《中华预防医学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
2
云南省首例人感染G4基因型欧亚类禽H1N1猪流感病毒病原学特征分析
李梓
赵晓南
黄维娟
杨磊
成艳辉
谭敏菊
李希妍
刘佳
陈志肖
隗合江
伏晓庆
王大燕
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
11
原文传递
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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