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深圳市2005-2007年H3N2亚型流行性感冒病毒流行病学和分子变异特征 被引量:3
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作者 张顺祥 谷利妞 +6 位作者 何建凡 程小雯 胡东生 吕星 吴春利 逯建华 房师松 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期861-866,共6页
目的探讨深圳市2005-2007年季节性流行性感冒(简称流感)流行病学特征和甲3亚型流感病毒可能的分子变异。方法对深圳市2005-2007年流感监测网络(由9所医院、6个区和市疾病预防控制中心共16个主要机构组成)的运行质量进行控制,按周... 目的探讨深圳市2005-2007年季节性流行性感冒(简称流感)流行病学特征和甲3亚型流感病毒可能的分子变异。方法对深圳市2005-2007年流感监测网络(由9所医院、6个区和市疾病预防控制中心共16个主要机构组成)的运行质量进行控制,按周统计分析主要监测医院流感样病例占就诊者的百分比(ILI百分比),并采集流感样病例鼻咽拭子进行流感病毒分离鉴定,对分离到的毒株提取病毒RNA,用反转录聚合酶链式反应(RT—PER)扩增血凝素基因重链区(HA1区)基因片段,产物纯化后测序并进行核苷酸相似性、基因进化树和氨基酸变异分析。结果深圳市2005-2007年流感活动水平在各年间有所波动,呈现夏季高峰,2006和2007年5-7月为流行高峰期。2005-2007年流感病毒的分离率分别为4.78%(114/2385)、5.77%(212/3674)和12.12%(343/2831),分离毒株数多少与ILI百分比的季节波动相关,按周分离率与ILI百分比的变化趋势基本一致。2005和2006年甲3亚型所占比例分别为25.46%(28/114)和2.83%(6/212),而2007年成为优势毒株,占62.68%(215/343)。甲3亚型病毒HA1区序列进化树分析发现,虽然进化树的主干基本按照毒株分离的时间先后发展,与不同年度WHO推荐的疫苗株先后一致,但2005-2007年的主要流感毒株共分为5个分支,2005-2006年毒株在第Ⅰ~Ⅲ分支,2007年4—6月和5—12月形成2个分支,与同期WHO推荐的疫苗株不在一个进化分支,深圳甲3亚型流感病毒的变化较早,出现疫苗株滞后现象。所有毒株未见HA1区序列缺失和插入,受体结合位点和二硫键位点氨基酸也显保守,一些位点出现了不同属性氨基酸的置换,并导致个别潜在的糖基化位点的丢失或增加,但尚不能判定为新变种。结论深圳市可能属于我国流感病毒变异较早的地区之一,甲3亚型流感病毒在人群中呈活跃状态;常规季节性流感监测与病毒分子变异分析结合,能为毒株的演变及其流行病学意义提供及时、重要的信息。 展开更多
关键词 深圳市 2005-2007年 h3n2亚型流行性感冒病毒 流行病学 分子变异特征
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解表清里方干预甲型H1N1流行性感冒小鼠的抗病毒作用机制
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作者 马一川 姚睿祺 +2 位作者 明雨 晁燕 张洪春 《世界中医药》 CAS 北大核心 2024年第14期2091-2097,共7页
目的:探讨解表清里方对甲型H1N1流行性感冒小鼠的抗病毒作用机制。方法:用随机数字法将36只7周龄雌性BalB/c小鼠随机分为空白组、模型组、西药组及解表清里方高剂量组、中剂量组、低剂量组,每组6只。空白组给予等量生理盐水滴鼻,其余组... 目的:探讨解表清里方对甲型H1N1流行性感冒小鼠的抗病毒作用机制。方法:用随机数字法将36只7周龄雌性BalB/c小鼠随机分为空白组、模型组、西药组及解表清里方高剂量组、中剂量组、低剂量组,每组6只。空白组给予等量生理盐水滴鼻,其余组小鼠给予甲型流感病毒液于左侧鼻孔滴鼻,每只50μL。造模2 h后,西药组给予0.037 5 g/(kg·d)磷酸奥司他韦灌胃;解表清里方高剂量组、中剂量组、低剂量组分别给予6.05 g/(kg·d)、3.02 g/(kg·d)、1.51 g/(kg·d)解表清里方灌胃。空白组及模型组同时给予生理盐水0.2 mL灌胃,均1次/d,连续5 d。对比各组肺指数、胸腺指数和脾脏指数,肺组织病理变化,肺组织中乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)表达,肺悬液中病毒基因及磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)、蛋白激酶B(AKT)、糖原合酶激酶3β(GSK-3β)mRNA表达,肺组织中PI3K、AKT、GSK-3β蛋白表达。结果:动物实验结果显示,与模型组相比,西药组和中药高剂量组能降低小鼠肺指数(P<0.05),其他组别能降低肺指数、升高胸腺指数和脾脏指数,但差异无统计学意义(P>0.05);解表清里方高、中剂量组能减轻小鼠肺部病变程度,西药组、解表清里方高、中剂量组能降低小鼠肺组织中M、NS2病毒基因复制水平(P<0.01或P<0.05);西药组和解表清里方高剂量组能降低小鼠肺组织中mTOR表达水平;西药组、解表清里方高剂量和中剂量组均能显著下调PI3K、AKT和GSK-3β蛋白和mRNA的表达水平(P<0.01或P<0.05)解表清里方低剂量组在各个方面与模型组相差不显著。结论:解表清里方甲型H1N1流感小鼠有抗病毒作用,其作用机制可能与抑制PI3K/AKT/GSK-3β信号通路中关键蛋白PI3K、AKT、GSK-3β、mTOR表达有关。 展开更多
关键词 解表清里方 甲型h1n1流行性感冒 小鼠 病毒 雷帕霉素靶蛋白 磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B/糖原合酶激酶3β信号通路 细胞自噬 细胞凋亡
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H_3N_2亚型人流行性感冒病毒HA_1的蛋白序列同源性比较、变异规律及结构与功能的分析 被引量:28
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作者 王勇 薛颖 +2 位作者 陈淑霞 金奇 侯云德 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期289-296,共8页
应用生物信息学数据库和工具,结合自身的实验结果,对现有的H3N2亚型人流行性感冒(流感)病毒全球分离株的HA1氨基酸序列和蛋白分子结构进行了分析研究。初步的进化分析结果表明,历史上的分离株大致分为以年代划分为特征的两大谱系,即1968... 应用生物信息学数据库和工具,结合自身的实验结果,对现有的H3N2亚型人流行性感冒(流感)病毒全球分离株的HA1氨基酸序列和蛋白分子结构进行了分析研究。初步的进化分析结果表明,历史上的分离株大致分为以年代划分为特征的两大谱系,即1968~1984/1985年的谱系,时间跨度为18年;1984/1985~1997/2000年的谱系,时间跨度为13~17年。它们分别起源于两类毒株,并在各自的谱系内发展演化,基本上不存在大规模相互交叉渗透的现象。在1984/1985年,两大谱系发生交替转换和过渡,说明流感病毒的起源、发展和演化是有一定规律性的,这可能对流感的监测预报有一定的指导意义。绝大多数毒株的二硫键组成位点和糖基化位点是极其保守的。受体结合位点(RBS)的一部分构成成份保守;其他构成成份发生变异甚至高变,并与某些抗原决定簇位点重合,可能参与了抗原抗体相互作用。5个抗原决定簇位点的变异各有其特点。A和B位点的变异表现最活跃,抗原性最强,但B位点稍弱于A位点。C和D位点的抗原性一般,且D位点的变异性低于C位点。E位点抗原性一般。在各位置的变异中,大多常是相同相近性质或相同种类的氨基酸相互替换。HA1蛋白全序列的熵(entropy)峰值作图的分析表明,HA1蛋白上121~126位等区域或位点可能独立,或参与构成了某些已知或未知? 展开更多
关键词 h3n2亚型 流行性感冒病毒hA1 蛋白序列 同源性比较 变异规律 结构 功能 生物信息学
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中国历年H_3N_2亚型人流行性感冒病毒血凝素基因的序列测定及分析 被引量:13
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作者 王勇 陈淑霞 +3 位作者 薛颖 董杰 金奇 侯云德 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期118-125,共8页
测定了 2 7株中国 196 8~ 2 0 0 0年的人H3 N2 亚型流行性感冒 (流感 )病毒分离株HA1基因的核苷酸全序列 ,其中包括 7株流行代表株 :A3/Beijing/ 1/ 6 8、A3/Guangdong/ 2 4 3/ 72、A3/Beijing/ 39/ 75、A3/Guangdong/ 38/ 77、A3/Beij... 测定了 2 7株中国 196 8~ 2 0 0 0年的人H3 N2 亚型流行性感冒 (流感 )病毒分离株HA1基因的核苷酸全序列 ,其中包括 7株流行代表株 :A3/Beijing/ 1/ 6 8、A3/Guangdong/ 2 4 3/ 72、A3/Beijing/ 39/ 75、A3/Guangdong/ 38/ 77、A3/Beijing/ 2 6 6 / 85、A3/Beijing/ 30 / 95、A3/Shanghai/ 1/ 98。阐明了这些流感病毒分离株的基因结构、变异本质、进化发展过程以及这些毒株与其它分离株之间的遗传进化亲缘关系 ,为应用生物信息学研究流感病毒基因组变异规律等打下了基础。初步的进化分析表明 ,历年来的人流感病毒H3 N2 亚型的起源和进化分为两个分支谱系 ,并在 1984 /1985年进行了交替转换 ;且有一部分人的H3 N2 展开更多
关键词 中国 h3n2亚型 流行性感冒病毒 血凝素基因 序列测定 基因序列 hA1基因
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猪流行性感冒病毒H3N2亚型体外诱导猪肺巨噬细胞发生凋亡 被引量:3
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作者 祁贤 姚火春 陆承平 《微生物与感染》 2009年第2期76-80,共5页
本文旨在探讨H3N2亚型猪流行性感冒病毒(SIV)引起机体免疫抑制的机制。用SIV分离株体外感染猪肺巨噬细胞(PAM),发现SIV可在PAM中进行生产性复制。感染后96h,病毒的血凝效价达到64。琼脂糖凝胶电泳显示,感染细胞的DNA呈"梯样"... 本文旨在探讨H3N2亚型猪流行性感冒病毒(SIV)引起机体免疫抑制的机制。用SIV分离株体外感染猪肺巨噬细胞(PAM),发现SIV可在PAM中进行生产性复制。感染后96h,病毒的血凝效价达到64。琼脂糖凝胶电泳显示,感染细胞的DNA呈"梯样"图谱;流式细胞仪检测显示,细胞在感染后24h出现明显的亚二倍体DNA峰,72h凋亡细胞达25%。光学显微镜和电子显微镜下可见感染细胞的形态发生特征性改变,如细胞皱缩、细胞表面微绒毛消失、胞质内出现大量空泡、细胞核染色体发生浓缩等。结果提示,SIV可在体外诱导PAM凋亡,推测PAM凋亡可能是SIV引起机体免疫抑制的重要因素之一。 展开更多
关键词 流行性感冒病毒 h3n2亚型 猪肺巨噬细胞 凋亡 体外
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1998-2009年浙江省H3N2亚型流行性感冒病毒全序列变异的研究 被引量:2
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作者 赵斐斐 卢亦愚 +2 位作者 冯燕 徐昌平 莫世华 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期612-618,共7页
目的比较1998-2009年浙江省H3N2业型流行性感冒(简称流感)流行株HA基因进化与全基因进化状况的一致性,并探讨全基因组序列上可能存在的潜在抗原区域。方法选择浙江省CDC流感实验室于1998-2009年流感疫情中分离保存的H3N2亚型流感流... 目的比较1998-2009年浙江省H3N2业型流行性感冒(简称流感)流行株HA基因进化与全基因进化状况的一致性,并探讨全基因组序列上可能存在的潜在抗原区域。方法选择浙江省CDC流感实验室于1998-2009年流感疫情中分离保存的H3N2亚型流感流行代表株19株,采用RT—PCR法进行全基因组序列扩增,并将这些毒株与10株同期H3N2亚型流感疫苗株进行全序列及HA1基因的系统进化比较;通过氨基酸替换比较、熵值计算及正向选择位点的筛选,确定各基因上的氨基酸易变位点。结果H3N2亚型流感病毒的全序列长度为4466个氨基酸,其中有137个氨基酸位点发牛稳定变异。在HA基因上第144和158位氨基酸分别经历了4次和3次替换,NA基因的第93、143、307、370、372位氨基酸和NP基因的第450位氨基酸经历了2次替换,且HA基因和NA基因上分别有29%(12/41)和77%(24/31)的变异位点位于已知抗原决定簇之外的区域。氨基酸位点熵值分析显示,HA基因非抗原决定簇的3、225、361位,NA基因非抗原决定簇的93、143、147、150、372位,PB1基因的113、576、586位,朋基因的101、256、382、421、437位,NP基因的377、450位,M1基因的218位及M2基因的31位氨基酸均为易变位点。结论浙江省1998-2009年H3N2业型流感病毒在HA和NA已知抗原决定簇之外的区域与部分内部基因上,可能存在着一些尚未被发现或者新形成的抗原位点。与HA基因的系统进化比较,全序列能更为伞面地反映出流感流行株之间的亲缘关系与进化规律。 展开更多
关键词 流感病毒A型 h3n2亚型 序列同源性 变异(遗传学)
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在疫苗免疫选择压力下H_9N_2亚型禽流行性感冒病毒HA基因的遗传变异 被引量:31
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作者 刘红旗 黄勇 +4 位作者 程坚 彭大新 贾立军 张如宽 刘秀梵 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期149-154,共6页
为了解H9N2 亚型禽流行性感冒 (流感 )病毒在同亚型灭活疫苗的选择压力下的遗传变异情况 ,对某鸡场的感染鸡群进行连续 4年的跟踪监测 ,对使用疫苗前和持续使用疫苗后不同时段分离到的H9N2 亚型禽流感病毒的HA基因进行全序列分析。结果... 为了解H9N2 亚型禽流行性感冒 (流感 )病毒在同亚型灭活疫苗的选择压力下的遗传变异情况 ,对某鸡场的感染鸡群进行连续 4年的跟踪监测 ,对使用疫苗前和持续使用疫苗后不同时段分离到的H9N2 亚型禽流感病毒的HA基因进行全序列分析。结果表明 ,在使用第一次分离的病毒株制备的疫苗后 8个月分离到的病毒株 ,其HA基因仅发生一个氨基酸的差异 ;但在继续使用该疫苗的第二个和第三个年头分离的病毒株 ,它们的HA基因则一直在发生较大的变化。这一发现对进一步研究禽流感病毒在不断使用疫苗的选择压力下发生变异的规律 。 展开更多
关键词 疫苗免疫选择压力 h9n2亚型流行性感冒病毒 hA基因 遗传变异
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鸡源H_9N_2亚型流行性感冒病毒神经氨酸酶基因序列分析 被引量:13
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作者 刘金华 史为民 +1 位作者 吴清民 郭玉璞 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期237-241,共5页
对1996~2001年间自中国部分养鸡场发病鸡或死亡鸡分离鉴定的8株H9N2亚型禽流感病毒的神经氨酸酶基因(NA),进行了扩增和序列测定,并分析和比较了其核苷酸和氨基酸的同源性。结果表明,NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为97 1%~99 8%和95... 对1996~2001年间自中国部分养鸡场发病鸡或死亡鸡分离鉴定的8株H9N2亚型禽流感病毒的神经氨酸酶基因(NA),进行了扩增和序列测定,并分析和比较了其核苷酸和氨基酸的同源性。结果表明,NA基因核苷酸和氨基酸同源性分别为97 1%~99 8%和95 7%~99 7%,说明NA基因稳定遗传,高度保守。与A/chicken/HongKong/G9/97相比较,发现中国大陆鸡源H9N2分离株的神经氨酸酶蛋白在其茎部的第63、64、65位点上都有3个氨基酸的丢失,而与中国邻近的韩国、巴基斯坦鸡源H9N2分离株的神经氨酸酶没有氨基酸的丢失,因此这些部位的氨基酸丢失可初步认为是中国大陆H9N2流感病毒分离株的一个标记。系统进化树分析表明,该8株病毒的NA基因属于相同的进化分支,即A/duck/HongKong/Y280/97-like分支,尚未发现NA基因属于A/quail/HongKong/G1/97-like分支的分离株。中国的H9N2分离株与韩国、巴基斯坦等地的H9N2分离株隶属于不同的进化亚分支,说明H9N2亚型禽流感的发生与流行和地域有一定的相关性。 展开更多
关键词 流行性感冒病毒 h9n2亚型 神经氨酸酶 基因 序列分析
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两株H_9N_2亚型禽流行性感冒病毒HA基因序列分析 被引量:4
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作者 程坚 刘红旗 +2 位作者 彭大新 张如宽 刘秀梵 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期285-287,共3页
The complete cDNA sequences of HA genes of two AIV isolates were presented in this paper The result of comparative sequence analysis seemed to suggest that these two isolates may be identical to three other AIV strain... The complete cDNA sequences of HA genes of two AIV isolates were presented in this paper The result of comparative sequence analysis seemed to suggest that these two isolates may be identical to three other AIV strains(H 9N 2) isolated from HongKong recently and these five strains may have the same origin in that the identity of the HA protein sequences of these AIV isolates is higher than 95% 展开更多
关键词 h9n2亚型 流行性感冒病毒 hA基因 序列分析 禽流感病毒 血凝素基因
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H3N2亚型犬流感病毒实验感染模型的建立
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作者 黄程 杨龙峰 +11 位作者 孙鹏 程慧敏 杨志远 林健 祝洪伟 刘立新 孙厚民 李加凤 赵际成 段会娟 潘洁 刘月焕 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第13期2620-2628,共9页
【目的】建立H3N2亚型犬流感病毒(canine influenza virus,CIV)实验感染模型,了解犬流感的发病特征,为疫苗效力评价奠定基础。【方法】6—13月龄CIV血凝抑制(haemagglutination inhibition,HI)抗体阴性(HI<1﹕10)比格犬26只,其中3只... 【目的】建立H3N2亚型犬流感病毒(canine influenza virus,CIV)实验感染模型,了解犬流感的发病特征,为疫苗效力评价奠定基础。【方法】6—13月龄CIV血凝抑制(haemagglutination inhibition,HI)抗体阴性(HI<1﹕10)比格犬26只,其中3只鼻腔喷雾PBS作为阴性对照,另23只分5组(10、103、105、106、107 EID50/只),分别为3、5、5、5、5只/组,每只犬各鼻腔喷雾H3N2亚型CIV(A/canine/China/Huabei-170607/2017(H3N2),简称HB株)病毒液1mL。观察临床症状、肺脏病变和肺脏组织病理学变化,计算肺实变率,检测病毒和HI抗体效价。【结果】10 EID50剂量感染组,3只犬均未出现明显临床症状,肺脏均无明显眼观病变,肺脏实变率0%,无组织病理学变化,病毒检测均为阴性,HI抗体效价几何平均值(geometric mean titer,GMT)为1﹕15.9;103 EID50剂量感染组,5只犬中有4只喘息、流鼻汁和咳嗽,1只犬未表现出临床症状,2只犬肺脏出现轻微实变,实变率平均为1.4%,4只犬病毒分离阳性,HI抗体效价GMT为1﹕320;105 EID50剂量感染组,5只犬在攻毒后5 d开始出现流鼻汁和咳嗽等临床症状,肺脏均有实变,实变率平均为4.2%,肺泡间隔增宽,病毒分离均为阳性,HI抗体效价GMT为1﹕2940.7;106 EID50剂量感染组,5只犬在攻毒后4 d体温升高、流鼻汁、咳嗽,临床症状出现较105 EID50剂量感染组早1 d,肺脏实变程度增加,实变率平均为17.9%,肺泡间隔增宽,病毒分离均为阳性,HI抗体效价GMT为1﹕2228.7;107 EID50剂量感染组,5只犬在攻毒后3 d表现出体温升高、流鼻汁、咳嗽等严重的临床症状,症状出现较106 EID50剂量感染组早1 d,肺脏严重实变,实变率平均为29.0%,肺泡间隔增宽,病毒分离均为阳性,HI抗体效价GMT为1﹕2940.7;对照犬均未出现明显临床症状,肺脏均无明显眼观病变,无组织病理学变化,病毒检测均为阴性,HI抗体效价均<1﹕10。【结论】106 EID50剂量病毒是能引起犬明显发病的最小病毒接种剂量,建立起H3N2亚型CIV实验感染模型。 展开更多
关键词 比格犬 犬流感病毒 h3n2亚型 肺脏 感染模型
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用8质粒病毒拯救系统产生H9N2/WSN重组A型流行性感冒病毒 被引量:9
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作者 卢建红 邵卫星 +4 位作者 刘玉良 贾立军 韦栋平 石火英 刘秀梵 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期48-53,共6页
把禽流行性感冒(流感)病毒A/Chicken/Shanghai/F/98(H9N2)的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因cDNA克隆至polⅠpolⅡ双向转录和表达载体pHW2000,用这两种质粒与8质粒病毒拯救系统中流感病毒A/WSN/33(H1N1)6个内部基因cDNA的质粒组合(6+2重... 把禽流行性感冒(流感)病毒A/Chicken/Shanghai/F/98(H9N2)的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因cDNA克隆至polⅠpolⅡ双向转录和表达载体pHW2000,用这两种质粒与8质粒病毒拯救系统中流感病毒A/WSN/33(H1N1)6个内部基因cDNA的质粒组合(6+2重排),共转染COS 1细胞,产生了能在鸡胚中高滴度增殖的H9N2/WSN重组病毒。用A/WSN/33的8个基因cDNA质粒作对照,也产生了转染子病毒。经过EID50测定和MDCK感染实验,新基因型H9N2/WSN病毒感染鸡胚的能力强(EID50为10-11/0.2ml),而且对鸡胚的毒力弱,在不加胰酶的情况下不使MDCK细胞产生病变。经电镜观察,两个转染子病毒的形态与野生型流感病毒相似。反向遗传操作技术的建立,为对禽流感病毒基因功能和疫苗构建等方面的研究提供了新的手段。 展开更多
关键词 A型流行性感冒病毒 h9n2亚型禽流感病毒 共转染 8质粒系统 反向遗传操作技术 血凝素 神经氨酸酶
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2002年广东省H3N2亚型流感病毒流行的分子基础 被引量:8
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作者 鄢心革 陆家海 +2 位作者 张欣 彭国文 万卓越 《热带医学杂志》 CAS 2003年第1期12-14,共3页
目的 了解广东省2002年H3N2亚型流感病毒流行及抗原性变异情况。方法 用狗肾传代细胞(MDCK)和鸡胚进行流感病毒分离,用交叉血凝抑制实验对毒株进行抗原性分析;提取病毒RNA,用一步法RT-PCR扩增血凝素基因(H3A),产物纯化后,并将其克隆到pM... 目的 了解广东省2002年H3N2亚型流感病毒流行及抗原性变异情况。方法 用狗肾传代细胞(MDCK)和鸡胚进行流感病毒分离,用交叉血凝抑制实验对毒株进行抗原性分析;提取病毒RNA,用一步法RT-PCR扩增血凝素基因(H3A),产物纯化后,并将其克隆到pMD18-T Vector,进行序列测定和分析。结果2002年1~10月共获得流感病毒246株,其中H3N2亚型210株,占85.4%,H1N1亚型2株,占0.8%,B型34株,占13.8%;2002年流感流行的高峰是6月;抗原性分析显示,2002年广东省H3N2亚型流感病毒A/粤/236/2002和2001年流行株A/粤/448/2001以及目前国内代表株A/闽/151/2001的抗原比分别是5.6和4.0;其HA1区氨基酸序列和国际代表株A/悉尼/5/97同源性为94.2%,有19个氨基酸差异,其中发生在抗原决定族A、B、E上的有6个,受体结合部有3个。结论2002年广东省流感病毒以H3N2亚型为主,其流行的分子基础是基因变异导致抗原性发生漂移。 展开更多
关键词 广东 h3n2亚型 流感病毒 流行 分子基础 抗原性 序列分析
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杭州市2013~2014年流感暴发流行期甲型流感病毒H3N2亚型基因特性分析 被引量:7
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作者 杨先知 崔大伟 +2 位作者 谢国良 郑书发 陈瑜 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2015年第8期586-590,共5页
目的分析杭州2013~2014年冬春季流感暴发期间流行的甲型流感病毒H3N2亚型的分子特性。方法选取H3N2阳性标本提取病毒RNA,PCR扩增全基因组并测序,构建血凝素(HA)及神经氨酸酶(NA)分子进化树,对H3N2亚型的病毒进化进行分析。结果 6个... 目的分析杭州2013~2014年冬春季流感暴发期间流行的甲型流感病毒H3N2亚型的分子特性。方法选取H3N2阳性标本提取病毒RNA,PCR扩增全基因组并测序,构建血凝素(HA)及神经氨酸酶(NA)分子进化树,对H3N2亚型的病毒进化进行分析。结果 6个代表株中H3N2未发生片段间的重配。以WHO推荐流感疫苗株A/TEXAS/50/2012为参考,HA1蛋白主要抗原决定区发生N145S氨基酸替换,并有其他多个位点的突变。病毒基质蛋白(M2)的金刚烷胺耐药位点全为S31N,神经氨酸酶抑制剂耐药位点未发生突变。结论 H3N2亚型甲型流感病毒HA1蛋白的氨基酸变异与2013~2014年杭州地区暴发流行有关。另外,病毒已出现对金刚烷胺的耐药突变,而对神经氨酸酶未发生耐药突变。 展开更多
关键词 流感 甲型流感病毒 h3n2亚型 突变 进化分析
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河北省2002~2004年流行期甲3亚型流行性感冒毒株HA_1基因特性分析 被引量:5
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作者 刘兰芬 刘艳芳 +1 位作者 高惠敏 齐顺祥 《中国全科医学》 CAS CSCD 2005年第15期1268-1269,共2页
目的了解河北省2002~2004年两个流行期甲3(H3N2)亚型流行性感冒(流感)病毒株血凝素(HA)基因的特性。方法随机抽取两个流行期分离到的4株甲3亚型流感病毒株,提取病毒核糖核酸(RNA),采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA1基因纯化... 目的了解河北省2002~2004年两个流行期甲3(H3N2)亚型流行性感冒(流感)病毒株血凝素(HA)基因的特性。方法随机抽取两个流行期分离到的4株甲3亚型流感病毒株,提取病毒核糖核酸(RNA),采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增病毒HA1基因纯化产物进行核苷酸序列测定,并用DNASTAR软件进行处理。结果河北省2002~2004年两个流行期共分离到流感毒株92株,甲3亚型流感毒株76株,乙型毒株16株;新分离毒株与2002~2003年国内外分离到的甲3亚型毒株同源性接近,甲3亚型流感病毒活动增强并成为优势株是由于HA1基因发生突变所造成的。结论河北省2002~2004年分离到的4株病毒与A/Johannesbur/64/03属于同一种系,属于两个小分支。 展开更多
关键词 流感病毒 3(h3n2)亚型 血凝素基因 核苷酸序列
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2017-2019年贵州省H3N2亚型流感病毒流行特征及NA基因遗传特性分析
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作者 郑勤妮 庄丽 +1 位作者 任丽娟 万永虎 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期923-928,共6页
目的分析2017-2019年贵州省H3N2亚型流感病毒流行特征及神经氨酸酶(Neuramini dase,NA)基因的遗传特性,为H3N2亚型流感病毒的防控提供科学依据。方法采集2017-2019年贵州省13家国家级流感监测哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本,进行... 目的分析2017-2019年贵州省H3N2亚型流感病毒流行特征及神经氨酸酶(Neuramini dase,NA)基因的遗传特性,为H3N2亚型流感病毒的防控提供科学依据。方法采集2017-2019年贵州省13家国家级流感监测哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本,进行荧光定量PCR的检测,以自然年度为监测周期进行统计分析。H3N2亚型核酸阳性的标本进行狗肾胚细胞(MDCK)分离病毒,收集培养液提取病毒RNA,进行RT-PCR特异性NA基因扩增,扩增产物纯化后进行测序,用MAGE7.0软件和Clustal W2软件进行同源性、遗传进化和耐药位点分析。结果2017-2019年,贵州省采集ILI咽拭子标本分别为15553、15164和15348份,H3N2亚型阳性率分别为5.12%(797/15553)、0.80%(122/15164)和7.67%(1177/15348),呈交替流行趋势;高峰期主要出现在1-3月和10-12月。2017-2019年H3N2亚型NA基因核苷酸同源性为97.5%~100%,在进化树上主要分成2个分支,所有毒株NA基因关键位点均未发生突变。结论贵州省H3N2亚型流感病毒呈年度周期性流行,多发于冬春季节,为更好防控流感,应及时掌握流行趋势,需加强监测并及时分析病毒基因特征变异情况。 展开更多
关键词 流感病毒 h3n2亚型 流行特征 nA基因
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一例甲型H3N2流行性感冒危重症患者的临床救治分析
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作者 孙文青 李磊 《结核病与肺部健康杂志》 2018年第1期79-82,共4页
2009年甲型H1N1流行性感冒(简称“流感”)在世界范围内流行,从此,各型流感疫情受到了前所未有的重视。国家卫生和计划生育委员会(简称“卫计委”)也先后发布了多个版本的流感诊疗方案,其中甲型H3N2流感作为常见的季节性流感,人... 2009年甲型H1N1流行性感冒(简称“流感”)在世界范围内流行,从此,各型流感疫情受到了前所未有的重视。国家卫生和计划生育委员会(简称“卫计委”)也先后发布了多个版本的流感诊疗方案,其中甲型H3N2流感作为常见的季节性流感,人群普遍易感。少数患者也可发展为危重症,每例危重症患者又各具特点,治疗非常复杂。笔者对2017年4月收治的1例甲型H3N2流感危重症患者的救治过程进行回顾性分析,总结该类患者的临床特点,为流感危重症患者的救治积累经验。 展开更多
关键词 危重症患者 流行性感冒 救治分析 h3n2 临床特点 甲型 流感疫情 计划生育委员会
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禽流感病毒H1、H3、H5、N2亚型多重RT-PCR检测方法的初步研究 被引量:8
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作者 韩雪清 林祥梅 +5 位作者 侯义宏 薄清如 廉慧锋 吴绍强 刘建 杨泽晓 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期993-996,共4页
目的根据禽流感病毒H1、H3、H5亚型的HA基因和N2型NA基因的保守序列,设计出四对RT-PCR引物,建立一步法多重RT-PCR对禽流感H1、H3、H5、N2四亚型进行快速检测。方法利用所设计的四对引物,通过对该方法扩增条件的优化,成功建立快速检测禽... 目的根据禽流感病毒H1、H3、H5亚型的HA基因和N2型NA基因的保守序列,设计出四对RT-PCR引物,建立一步法多重RT-PCR对禽流感H1、H3、H5、N2四亚型进行快速检测。方法利用所设计的四对引物,通过对该方法扩增条件的优化,成功建立快速检测禽流感病毒H1、H3、H5、N2四亚型的一步法多重RT-PCR。利用禽流感H1、H3、H5、N2四亚型毒株和其它相关标准毒株进行敏感性和特异性试验。结果与结论所建立的一步法多重RT-PCR具有较高的特异性和敏感性,与禽流感其它亚型和NDV、IBV、ARV?IBDV的核酸均无交叉反应。用该方法检测现场样品395份(4省20多个地区),结果与经典检测方法一致。 展开更多
关键词 禽流感病毒 多重RT-PCR h1亚型 h3亚型 h5亚型 n2亚型
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H3N2亚型猪流感病毒中国分离株的克隆纯化及生物学特性 被引量:17
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作者 李海燕 辛晓光 +4 位作者 于康震 杨焕良 李雁冰 赵朴 毕英佐 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第6期560-563,共4页
以有限稀释克隆法对 2 9株 H3N2亚型猪流感病毒 ( SIV)不同地区分离株进行纯化 ,并对其生物学特性进行了研究。结果 ,8株对鸡呈现中等致病力 ,2 1株对鸡呈现低致病力。不同地区 SIV分离株 (第 5代 )的 EID50 差异较大 ,以安徽分离株最... 以有限稀释克隆法对 2 9株 H3N2亚型猪流感病毒 ( SIV)不同地区分离株进行纯化 ,并对其生物学特性进行了研究。结果 ,8株对鸡呈现中等致病力 ,2 1株对鸡呈现低致病力。不同地区 SIV分离株 (第 5代 )的 EID50 差异较大 ,以安徽分离株最高 ,为 10 - 1 0 .77/ 0 .2 m L,其他毒株在 10 - 5.5~ 10 - 1 0 .56 / 0 .2 m L 之间。黑龙江省分离株和浙江省分离株的L D50 高达 10 - 2 .84 / 0 .1m L ,其他分离株在 10 - 1 .1 7~ 10 - 2 .56 / 0 .1m L之间。经鸡胚分离传代后 ,SIV分离株均能凝集0 .7%人“O”型血、绵羊、兔、豚鼠、小鼠、大鼠及鸡的红细胞 ,其红细胞凝集谱的差异主要表现在对马、牛、驴、猪红细胞的凝集特性上。大部分 SIV分离株为热不稳定型 ,部分毒株表现为中等热稳定型和热稳定型。从其抗原特性看 ,大部分 SIV分离株表现为亲和相 ,对 AIV参考毒株 DKUK6 3和 SIV参考毒株 SWTN77表现出较高的 HI滴度 ;部分分离株经鸡胚传代后 ,出现了相别的变异。 展开更多
关键词 流感 流感病毒 h3n2亚型 中国分离株 克隆 纯化 生物学特性 有限稀释克隆法
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H3N2亚型猪流感病毒实时荧光定量PCR快速检测方法的建立 被引量:10
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作者 陈艳 张春明 +5 位作者 乔传玲 杨焕良 张飞 吴运谱 辛晓光 陈化兰 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期894-899,共6页
根据H3N2亚型猪流感病毒(SIV)血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因保守序列,分别设计并合成了特异性引物和TaqMan MGB探针,利用实时荧光定量PCR技术检测SIV。使用含有选定检测序列的重组质粒pMD18-H3HA、pMD18-... 根据H3N2亚型猪流感病毒(SIV)血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因保守序列,分别设计并合成了特异性引物和TaqMan MGB探针,利用实时荧光定量PCR技术检测SIV。使用含有选定检测序列的重组质粒pMD18-H3HA、pMD18-N2NA标准品绘制标准曲线,其相关系数分别为0.99015(H3HA)和0.99947(N2NA)。检测结果显示,该方法的敏感性可达100 copies/μL,除H3N2亚型SIV外,对H1亚型、H9亚型SIV以及猪传染性胃肠炎病毒、猪流行性腹泻病毒、猪瘟病毒、猪生殖与呼吸综合征病毒和猪2型圆环病毒的检测均为阴性,应用该方法对实验室感染样品进行检测,其结果与病毒分离结果的符合率为95.83%。表明,该方法特异性强、重复性好,有望成为H3N2亚型SIV的一种特异、敏感、快速的定量检测方法。 展开更多
关键词 猪流感病毒 h3n2亚型 TAQ MAn MGB探针 实时荧光定量PCR
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2009~2013年广西H1N1和H3N2亚型猪流感病毒血清学调查 被引量:8
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作者 陈樱 於庆雄 +9 位作者 银凤桂 薛辉 李法凯 莫彦宁 肖雄 杨文娟 韦祖樟 刘芳 蹇慧 黄伟坚 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期155-159,共5页
摘要:【目的】了解广西H1N1和H3N2亚型猪流感病毒(SIV)的存在形势及其流行规律,为下一步有效监测和防控猪流感(SI)提供理论依据和原始溯源。【方法】对2009~2013年于广西11个地级市的屠宰场、规模化养猪场和个体养殖户采集的117... 摘要:【目的】了解广西H1N1和H3N2亚型猪流感病毒(SIV)的存在形势及其流行规律,为下一步有效监测和防控猪流感(SI)提供理论依据和原始溯源。【方法】对2009~2013年于广西11个地级市的屠宰场、规模化养猪场和个体养殖户采集的1170份猪血清进行血凝抑制(Hr)试验检测,统计欧洲禽源H1N1(EA.H1N1)亚型和新型人源重组H3N2(Hu.H3N2)亚型4株毒株(LB144和BB2、NNXD和JGB4)的抗体阳性率,并分析H1N1和H3N2亚型毒株的存在形势及其流行规律。【结果】2009-2013年,EA.H1N1亚型LB144毒株的平均抗体阳性率高达20.68%,且保持稳定,是广西地区主要的流行毒株;Hu.H3N2亚型JGB4毒株从2010年开始流行,且呈逐渐蔓延的趋势,平均抗体阳性率为19.96%。广西北海、南宁、玉林、贺州、桂林、贵港和柳州市受到EA—H1N1和Hu—H3N2亚型毒株多重感染,且感染程度较严重;百色、河池和防城港市的感染程度相对较低。育肥猪最易感染SIV,尤其是BB2和JGB4毒株,其抗体阳性率分别达66.00%和40.00%。EA—H1N1亚型毒株间的交叉感染阳性率(21.52%)略低于Hu—H3N2亚型毒株间的交叉感染阳性率(27.45%),而两株不同亚型毒株交叉感染时以BB2与JGB4毒株的交叉感染阳性率最高(16.23%),3株交叉感染时以BB2、NNXD和JGB4毒株间的交叉感染阳性率最高(11.60%),4株同时交叉感染阳性率也有6.96%。【结论】广西猪群已普遍存在EA-H1N1和Hu.H3N2亚型毒株混合感染的现象,尤其是地处两省边界上的地级市感染更严重,并以育肥猪和保育猪较易感。因此在sI防控工作中,除做好哺乳仔猪和种猪的日常管理外,还应减少保育猪的外来应激,适当调整育肥猪的饲养密度,以减少新型SIV重组毒株的产生。 展开更多
关键词 猪流感病毒(SIV) h1n1亚型 h3n2亚型 血清学调查 重组毒株
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