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胃癌组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化修饰相关长链非编码RNA预后模型的构建与验证
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作者 胡震 祁玉忠 +3 位作者 赵绍基 王光熙 孙开宇 吴文辉 《消化肿瘤杂志(电子版)》 2024年第2期183-193,共11页
目的 探索胃癌组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化(trimethylation of lysine 4 on histone H3,H3K4me3)修饰相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)特征,构建相关预后模型并预测胃癌免疫治疗疗效。方法 从癌症基因组图谱数据库下... 目的 探索胃癌组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化(trimethylation of lysine 4 on histone H3,H3K4me3)修饰相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)特征,构建相关预后模型并预测胃癌免疫治疗疗效。方法 从癌症基因组图谱数据库下载胃癌相关转录组测序数据和对应的患者临床资料,通过构建H3K4me3相关调节因子基因与LncRNA的共表达网络识别H3K4me3修饰相关LncRNA,并将癌症基因组图谱数据库中370例符合筛选标准的胃癌患者样本(整体组)按1:1随机抽样划分为训练组(n=185)和验证组(n=185)。随后基于单因素Cox回归、Lasoo回归分析构建H3K4me3相关LncRNA预后风险评分模型并进行内部验证。Kaplan-Meier生存分析和受试者操作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)被用于验证模型的预测性能。通过单因素和多因素Cox回归分析评估风险评分等临床指标的预后预测价值。结合风险评分、年龄和肿瘤TNM分期构建预测胃癌患者总生存率的列线图模型,ROC曲线与校准图被用于评估列线图的预测准确性。借助共识聚类识别异质性聚类亚群并进行免疫治疗疗效预测。结果 基于共表达网络关系识别了14个具有预后价值的H3K4me3相关LncRNA并构建了相关风险模型及评价体系。根据训练组预后风险评分模型获得的中位风险评分将训练组、验证组和整体组胃癌患者划分为高、低风险,Kaplan-Meier生存曲线显示低风险患者的总体生存情况要优于高风险患者(P<0.05)。此外,该模型在训练组中预测胃癌患者1、3、5年总生存率的曲线下面积(area under curve,AUC)分别为0.708、0.730、0.770,在验证组中分别为0.690、0.648、0.713,而在整体组中分别为0.697、0.670、0.724。多因素Cox回归分析显示基于H3K4me3相关LncRNA构建的风险评分模型是预测胃癌患者预后的独立因素(P<0.001)。构建的列线图预测胃癌患者1、2、3年总生存率的AUC分别为0.727、0.780、0.717,且其校准曲线与理想曲线相接近。基于共识聚类算法进一步识别了2种具有异质性免疫特征的H3K4me3-LncRNA亚群,其中亚组Ⅱ具有更高的免疫细胞浸润水平和更强的免疫应答潜力,并对5-氟尿嘧啶、奥沙利铂等显示出更高的药物敏感性,而亚组Ⅰ则可能对磷脂酰肌醇3-激酶特异性抑制剂具有更高的敏感性。结论 本研究构建了一个H3K4me3-LncRNA风险评分模型以预测胃癌患者的预后,并揭示了其异质性微观特征及在预测免疫治疗疗效方面的潜在价值。 展开更多
关键词 胃癌 组蛋白H3第4位赖氨酸的三甲基化修饰 组蛋白修饰 长链非编码RNA 免疫治疗
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硫酸胆固醇对桥本氏甲状腺炎小鼠模型的治疗效果及相关机制研究 被引量:1
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作者 何林烨 邱焕迪 +2 位作者 何巍 胡以国 李志辉 《西安交通大学学报(医学版)》 CSCD 北大核心 2024年第1期105-111,共7页
目的观察硫酸胆固醇(CS)对桥本氏甲状腺炎小鼠的治疗效果。方法选取NOD.H-2^(h4)雌性小鼠饮0.05%碘化钠水持续不同时间,并通过持续2周腹腔注射CS对诱导小鼠进行治疗。HE染色观察淋巴细胞浸润情况并进行甲状腺炎症程度评分;测定血清抗甲... 目的观察硫酸胆固醇(CS)对桥本氏甲状腺炎小鼠的治疗效果。方法选取NOD.H-2^(h4)雌性小鼠饮0.05%碘化钠水持续不同时间,并通过持续2周腹腔注射CS对诱导小鼠进行治疗。HE染色观察淋巴细胞浸润情况并进行甲状腺炎症程度评分;测定血清抗甲状腺球蛋白抗体(TgAb)、甲状腺过氧化物酶抗体(TPOAb)以及甲状腺功能水平;免疫荧光染色流式细胞仪分析B淋巴细胞、调节性T细胞(Treg)、Th17、Th1、Th2细胞比例的变化。结果HE染色结果显示,在8周组和16周组中,经过CS的腹腔注射后,小鼠甲状腺组织炎性评分显著下降(P<0.05)。而在64周组中,治疗组与诱导组之间无显著差别(P=0.31)。血清学分析显示,经过CS干预后,高碘溶液诱导8周和16周的小鼠体内TgAb、TPOAb水平均显著降低(P<0.05),而小鼠的甲状腺功能(TSH、T4水平)仅在16周组出现显著变化。流式细胞术分析显示,在8周组中,经过CS干预后,小鼠体内B淋巴细胞以及Th1、Th2、Th17和Treg细胞比例均出现显著变化(P<0.05)。结论CS对于桥本氏甲状腺炎早中期的疾病进展具有明显的治疗及缓解效果。 展开更多
关键词 NOD.H-2 h4小鼠 桥本氏甲状腺炎 硫酸胆固醇 调节性T细胞 TH17细胞
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血清抑瘤素M联合组蛋白H4在脓毒症诊断及预后评估中的意义
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作者 包志远 李从圣 +4 位作者 杨静 胡承志 丁斌 聂开政 倪婳 《安徽医药》 CAS 2024年第5期949-952,共4页
目的探讨血清抑瘤素M(OSM)联合组蛋白H4在脓毒症诊断及预后评估中的意义。方法选择2020年9月至2021年8月合肥市第一人民医院41例脓毒症病人为研究对象,使用酶联免疫吸附(ELISA)法测定脓毒症病人血清中抑瘤素M及组蛋白H4水平,选取年龄、... 目的探讨血清抑瘤素M(OSM)联合组蛋白H4在脓毒症诊断及预后评估中的意义。方法选择2020年9月至2021年8月合肥市第一人民医院41例脓毒症病人为研究对象,使用酶联免疫吸附(ELISA)法测定脓毒症病人血清中抑瘤素M及组蛋白H4水平,选取年龄、性别相似的健康者40例为健康对照组;依据脓毒症病人28 d预后分为生存组和死亡组,使用统计学软件分析临床资料,比较两组血清抑瘤素M及组蛋白H4的差异。结果脓毒症组、脓毒性休克组病人血清OSM[55.49(41.96,63.09)ng/L、108.03(58.22,86.44)ng/L比40.85(27.92,51.26)ng/L]及H4[29.93(25.09,31.74)μg/L、34.81(28.03,36.16)μg/L比25.85(22.50,28.23)μg/L]水平均高于健康对照组(P<0.05)。与脓毒症组相比,脓毒性休克组中血清OSM及H4水平更高(P<0.05);ROC曲线分析,H4、OSM及二者联合对脓毒症的诊断的AUC为0.79、0.76、0.83,两者联合效能高于两者单独检测;与存活组相比,死亡组病人血清OSM[108.98(53.59,103.32)ng/L比52.01(42.26,62.05)ng/L]和H4[36.94(29.96,40.58)μg/L比27.45(25.37,28.59)μg/L]水平更高(P<0.05)。OSM、H4及联合分别绘制ROC曲线计算AUC分别为0.76(0.61.0.92)、0.82(0.69,0.95)和0.89(0.79,0.99)。结论抑瘤素M和组蛋白H4能用于对脓毒症早期诊断和预后评估,两者联合对脓毒症病人诊断效能及近期预后评估的能力有所提升。 展开更多
关键词 脓毒症 抑瘤素M 组蛋白H4 预后
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HIST1H4F基因mRNA区DNA甲基化水平及其在肺癌组织中的诊断价值
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作者 朱玲 任德旺 +2 位作者 马润阳 梁国威 窦学军 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2024年第19期2726-2732,共7页
目的探讨H4成簇组蛋白6(HIST1H4F)基因mRNA区6个CpG位点的DNA甲基化水平及其在肺癌组织中的诊断价值。方法15例肺癌及癌旁配对正常肺组织的DNA甲基化水平采用焦磷酸测序检测。在初步评价基础上,建立甲基化敏感的限制性内切酶-荧光定量PC... 目的探讨H4成簇组蛋白6(HIST1H4F)基因mRNA区6个CpG位点的DNA甲基化水平及其在肺癌组织中的诊断价值。方法15例肺癌及癌旁配对正常肺组织的DNA甲基化水平采用焦磷酸测序检测。在初步评价基础上,建立甲基化敏感的限制性内切酶-荧光定量PCR(MSRE-qPCR)方法,分别检测测试组(肺腺癌60例、鳞癌38例、良性疾病30例和正常肺组织26例)及验证组(肺腺癌36例、鳞癌16例、良性疾病21例和正常肺组织23例)的DNA甲基化水平,采用ROC曲线评价其诊断价值。结果焦磷酸测序结果显示肺癌甲基化水平显著高于癌旁配对正常肺组织(P<0.005)。MSRE-q PCR检测结果显示,测试组和验证组诊断肺癌的ROC曲线下面积分别为0.894和0.888,敏感度为76.5%和73.1%,特异度为92.9%和97.7%。在肺癌患者中,甲基化水平与吸烟显著相关(r=0.273,P<0.01)。结论HIST1H4F基因mRNA区的6个CpG位点可作为肺癌诊断的生物标记物,为临床肺癌诊断提供了新的分子靶标。 展开更多
关键词 H4成簇组蛋白6 甲基化 肺癌 组织 诊断
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黄芪多糖对自身免疫性甲状腺炎NOD.2^(h4)小鼠血清炎症因子及甲状腺组织的影响
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作者 邱子洋 文艺 高天舒 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期2362-2368,共7页
目的观察黄芪多糖(APS)对自身免疫性甲状腺炎(AIT)NOD.2^(h4)小鼠血清炎症因子、甲状腺抗体和甲状腺组织病理形态的影响。方法选取90只6~8周龄SPF级雌性NOD.H-2^(h4)小鼠,体质量(25±5)g,随机分为空白对照组、模型组、硒制剂组及黄... 目的观察黄芪多糖(APS)对自身免疫性甲状腺炎(AIT)NOD.2^(h4)小鼠血清炎症因子、甲状腺抗体和甲状腺组织病理形态的影响。方法选取90只6~8周龄SPF级雌性NOD.H-2^(h4)小鼠,体质量(25±5)g,随机分为空白对照组、模型组、硒制剂组及黄芪多糖低、中、高剂量组,共6组,每组15只。黄芪多糖低、中、高剂量组每日分别予以200,400,800mg·kg^(-1)黄芪多糖灌胃,硒制剂组每日予以0.26mg·kg^(-1)亚硒酸钠片灌胃,空白对照组及模型剂组每日予以等体积蒸馏水灌胃,连续灌胃给药8周。观察小鼠一般状况,酶联免疫试剂盒(Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay,ELISA)检测各组小鼠血清中白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-10(IL-10)、白细胞介素-12(IL-12)、白细胞介素-17(IL-17)、转化生长因子β1(TGF-β1)、抗甲状腺球蛋白抗体(TgAb)、促甲状腺激素(TSH)水平,HE染色观察各组小鼠甲状腺淋巴细胞浸润情况。结果与空白对照组比较,模型组血清IL-6、IL-12、IL-17、TgAb显著升高,其余各治疗组均有所降低,且差异具有统计学意义(P<0.001)。与空白对照组比较,模型组血清IL-10、TGF-β1水平显著下降,其余各治疗组均有所升高,且差异具有统计学意义(P<0.001)。与空白对照组比较,其余组小鼠血清TSH均有所升高,但各组间差异没有统计学意义,证实非甲亢、甲减期。HE染色可见AIT组小鼠甲状腺淋巴细胞浸润显著,各治疗组甲状腺淋巴细胞浸润情况均有所恢复。结论黄芪多糖可能通过调节甲状腺自身免疫功能,抑制促炎细胞因子释放,减轻甲状腺淋巴细胞炎症浸润程度,起到延缓AIT发生的作用。 展开更多
关键词 自身免疫性甲状腺炎 黄芪多糖 炎症因子 免疫功能 NOD.H-2^(h4)小鼠 甲状腺形态学
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组蛋白去甲基化酶KDM5A调控H3K4me3参与神经管畸形发生的分子机制
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作者 李建婷 解琪 +5 位作者 谷小龙 曹志华 彭志伟 赵虹 刘志贞 解军 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期629-637,共9页
神经管畸形(NTDs)的病因与防治是出生缺陷领域研究的重点,叶酸可以预防神经管畸形但其机制不明。本文借助低叶酸细胞模型和低叶酸NTDs小鼠模型通过染色质免疫共沉淀、Cut&Tag等技术,探讨了组蛋白去甲基化酶lysine demethylase 5A(KD... 神经管畸形(NTDs)的病因与防治是出生缺陷领域研究的重点,叶酸可以预防神经管畸形但其机制不明。本文借助低叶酸细胞模型和低叶酸NTDs小鼠模型通过染色质免疫共沉淀、Cut&Tag等技术,探讨了组蛋白去甲基化酶lysine demethylase 5A(KDM5A)及其调控的下游组蛋白H3K4me3修饰在叶酸缺乏导致的NTDs发生中的潜在分子机制。结果显示,低叶酸的细胞模型中,qRT-PCR、Western印迹结果显示,KDM5A分子表达明显下降(P<0.05)。作为组蛋白H3K4me3调控的上游关键酶,进一步通过染色质免疫共沉淀ChIP、ChIP-qPCR实验证实,叶酸缺乏下组蛋白H3K4me3在神经发育基因Axin 2和Atoh 1基因启动子区富集增加(P<0.05)。通过构建KDM5A基因敲除细胞模型,借助Cut&Tag试验证实,KDM5A基因敲除后H3K4me3主要富集在神经发育基因上。最后在低叶酸导致的NTDs小鼠模型的脑组织中,RT-qPCR、Western印迹以及ChIP-qPCR实验显示,E9.5 d的NTDs胎鼠脑组织中KDM5A表达下降(P<0.05),Axin2、Atoh1表达升高(P<0.05),Axin2、Atoh 1基因启动子区的H3K4me3富集增多(P<0.05)。综上所述,KDM5A蛋白在叶酸缺乏导致的NTDs中发挥重要作用,其可通过调控下游H3K4me3进而调控神经发育靶基因Axin2、Atoh 1异常表达,介导NTDs的发生。本研究从叶酸缺乏介导KDM5A调控组蛋白修饰来探讨NTDs的发病机制,为降低出生缺陷,促进生殖健康提供依据。 展开更多
关键词 神经管畸形 叶酸 组蛋白去甲基化酶5A 组蛋白H3K4me3
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美拉德反应中间体2,3-二氢-3,5-二羟基-6-甲基-4(H)吡喃-4-酮的研究进展 被引量:3
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作者 白冰 何静 +4 位作者 杨静 赵明林 王清福 陈芝飞 王秋领 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期326-333,共8页
2,3-二氢-3,5-二羟基-6-甲基-4(H)吡喃-4-酮(2,3-dihydro-3,5-dihydroxy-6-methyl-4H-pyran-4-one,DDMP),是美拉德反应关键中间体之一,在美拉德反应产物调控中起到重要作用。DDMP属于烯醇酮类化合物,广泛存在于天然尤其是热加工食品,具... 2,3-二氢-3,5-二羟基-6-甲基-4(H)吡喃-4-酮(2,3-dihydro-3,5-dihydroxy-6-methyl-4H-pyran-4-one,DDMP),是美拉德反应关键中间体之一,在美拉德反应产物调控中起到重要作用。DDMP属于烯醇酮类化合物,广泛存在于天然尤其是热加工食品,具有抗氧化、抗菌、心脏保护等作用。当前,随着对食品安全、风味和活性功能关注度的不断提升,学者对DDMP进行了广泛而深入的研究。该文基于近年来相关文献,对DDMP的存在、形成及降解、生物活性及感官特性等方面的研究进展进行全面系统的总结,旨在为DDMP在食品、医药、香料领域的基础和应用研究提供参考。 展开更多
关键词 二氢-3 5-二羟基-6-甲基-4(H)吡喃-4-酮 热加工食品 抗氧化 降解 香味
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基于生物信息学探究NR1H4在慢性萎缩性胃炎及药物预测中的作用
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作者 彭晓婷 王文素 +2 位作者 何典城 詹亚梅 游绍伟 《中国现代医生》 2024年第4期5-10,23,共7页
目的通过生物信息学方法获得慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的差异基因,预测治疗CAG的小分子药物。方法通过基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库获取2份CAG芯片(GSE27411、GSE116312)基因表达样本,利用R... 目的通过生物信息学方法获得慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的差异基因,预测治疗CAG的小分子药物。方法通过基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库获取2份CAG芯片(GSE27411、GSE116312)基因表达样本,利用R语言筛选出CAG差异表达基因,获得CAG免疫相关基因进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,筛选出核心基因,进一步研究核心基因的免疫浸润,预测其小分子化合物,通过MOE2022进行分子对接,通过GEPIA2网站进行生存分析。结果基于GEO数据库筛选出差异基因517个。GO富集分析发现主要涉及粒细胞趋化性、白细胞趋化性、中性粒细胞趋化性等生物过程。KEGG富集分析显示主要富集于细胞因子-细胞因子受体相互作用通路、核因子κB信号通路、白细胞介素-17信号通路。PPI网络筛选前6个核心基因即NR1H4、CCK、CCL20、CXCL1、LCN2、SAA1,通过相关验证,NR1H4作为核心基因。免疫细胞浸润分析结果显示中央记忆CD8 T细胞、效应记忆CD4 T细胞、γδT细胞、自然杀伤细胞、中性粒细胞等免疫细胞可能参与CAG的发生发展,而中性粒细胞与NR1H4呈正相关。分子对接显示柯里拉京、豆甾醇、栀子苷、桔皮素、鹅去氧胆酸、表没食子儿茶素-3-没食子酸酯6种小分子药物与NR1H4有较好的结合力。结论本研究初步探讨CAG的潜在机制,NR1H4作为关键基因与中性粒细胞可能在CAG“炎-癌转化”进程中具有重要意义,可为CAG的“炎–癌转化”机制研究提供一定的参考依据。 展开更多
关键词 慢性萎缩性胃炎 生物信息学 NR1H4 差异基因 免疫浸润
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HIST1H4F基因甲基化在三阴性乳腺癌中的预后价值
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作者 严珊珊 雷雯 +1 位作者 李帅杰 王永南 《岭南现代临床外科》 2024年第1期54-58,共5页
目的探讨HIST1H4F基因甲基化在三阴性乳腺癌中的意义。方法收集31例乳腺癌新鲜的癌组织标本及正常乳腺组织标本,提取DNA后使用亚硫酸盐进行甲基化转化处理,荧光定量PCR进行HIST1H4F基因甲基化检测,分析癌组织标本和正常乳腺组织中的HIST... 目的探讨HIST1H4F基因甲基化在三阴性乳腺癌中的意义。方法收集31例乳腺癌新鲜的癌组织标本及正常乳腺组织标本,提取DNA后使用亚硫酸盐进行甲基化转化处理,荧光定量PCR进行HIST1H4F基因甲基化检测,分析癌组织标本和正常乳腺组织中的HIST1H4F基因甲基化差异情况,并分析三阴性乳腺癌的HIST1H4F基因甲基化情况。同时收集37例三阴性乳腺癌的石蜡标本,提取DNA后同样方法处理再进行HIST1H4F基因甲基化检测,分析HIST1H4F基因甲基化与三阴性乳腺癌预后的关系。结果新鲜组织标本中周围正常乳腺组织和癌组织中HIST1H4F甲基化阳性率均为74.2%(23/31),两者的HIST1H4F甲基化阳性率无明显区别(χ^(2)=0000,P=1.000),分析发现三阴性乳腺癌组织中HIST1H4F甲基化阳性率高于非三阴性乳腺癌(93.8%vs.53.3%,P=0.015),HIST1H4F甲基化阳性乳腺癌的组织学分级Ⅲ级和ER阴性的乳腺癌中比率高于HIST1H4F甲基化阴性乳腺癌(60.9%vs.12.5%,P=0.037;69.6%vs.25.0%,P=0.043)。在三阴性乳腺癌的石蜡组织标本进行HIST1H4F甲基化检测,发现HIST1H4F甲基化阳性率为27.0%,且HIST1H4F甲基化阳性组和阴性组的DFS(50.0%vs.66.7%,χ^(2)=1.141,P=0.285)和OS(90.0%vs.96.3%,χ^(2)=1.635,P=0.201)在统计学上均无明显区别。结论在新鲜组织标本中三阴性乳腺癌中检测HIST1H4F基因甲基化阳性率高,HIST1H4F基因甲基化阳性乳腺癌的组织学Ⅲ级和ER阴性比率高,而在三阴乳腺癌石蜡组织标本中检测的HIST1H4F甲基化阳性率较低,尚不能确定HIST1H4F甲基化与三阴性乳腺癌预后是否相关,仍有待于进一步研究。 展开更多
关键词 乳腺癌 HIST1H4F 甲基化
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茶树PAL、C4H与4CL基因家族的全基因组鉴定及表达分析
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作者 张力岚 杨军 王让剑 《茶叶学报》 2024年第3期34-46,共13页
【目的】分析茶树PAL、C4H和4CL基因家族成员的基本特征,探索它们与苯乙醇樱草糖苷含量性状之间的因果关系,对于深入研究PAL、C4H和4CL基因家族在茶树上的生物学功能具有重要意义。【方法】基于生物信息学方法及转录组测序技术,分析PAL... 【目的】分析茶树PAL、C4H和4CL基因家族成员的基本特征,探索它们与苯乙醇樱草糖苷含量性状之间的因果关系,对于深入研究PAL、C4H和4CL基因家族在茶树上的生物学功能具有重要意义。【方法】基于生物信息学方法及转录组测序技术,分析PAL、C4H和4CL基因成员在茶树基因组中的分布、理化性质、基因结构、系统发育关系、启动子顺式作用元件与表达特性,以及探索茶树PAL、C4H和4CL基因成员在苯乙醇樱草糖苷含量差异显著的茶树新品系(高糖苷和低糖苷品系)新梢中的表达差异。【结果】7个CsPAL、4个CsC4H与4个Cs4CL基因分布在9条染色体上。所有CsPAL均只有1个内含子;除CsC4H4外,其他CsC4H成员均含有2个内含子;Cs4CL成员均含有多个内含子。系统进化分析表明,它们与杨树PAL、C4H和4CL蛋白的亲缘关系较近。基因结构和保守基序分析显示,亲缘关系较近的基因,其基因结构和保守基序的组成也较为相似。启动子顺式作用元件预测发现,CsPAL、CsC4H与Cs4CL基因成员的启动子区域内含有多种顺式元件,包括逆境胁迫响应、生长发育相关以及激素响应等多种顺式元件。转录组分析发现,大多数CsPAL、CsC4H与Cs4CL的成员表现为组织特异性表达,且会受到激素、低温、干旱及高盐的诱导。CsPAL7、CsC4H4与Cs4CL3在苯乙醇樱草糖苷含量明显差异的品系中存在表达差异,CsPAL7在高糖苷品系中的表达量要大于低糖苷品系,CsC4H4与Cs4CL3在低糖苷品系中的表达量均显著高于高糖苷品系,推测这3个家族基因的表达可能对茶树新梢中苯乙醇樱草糖苷的形成起不同的作用。【结论】本研究为PAL、C4H和4CL基因的功能分析提供了有用的信息,其家族成员可作为茶树分子育种的候选基因。 展开更多
关键词 茶树 PAL基因家族 C4H基因家族 4CL基因家族 表达分析
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IDH2 and GLUD1 depletion arrests embryonic development through an H4K20me3 epigenetic barrier in porcine parthenogenetic embryos
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作者 Cheng-Lin Zhan Qin-Yue Lu +7 位作者 Song-Hee Lee Xiao-Han Li Ji-Dam Kim Gyu-Hyun Lee Jae-Min Sim Hyeon-Ji Song Ying-Yan Jin Xiang-Shun Cui 《Zoological Research》 SCIE CSCD 2024年第6期1175-1187,共13页
Isocitrate dehydrogenase 2(IDH2)and glutamate dehydrogenase 1(GLUD1)are key enzymes involved in the production ofα-ketoglutarate(α-KG),a metabolite central to the tricarboxylic acid cycle and glutamine metabolism.In... Isocitrate dehydrogenase 2(IDH2)and glutamate dehydrogenase 1(GLUD1)are key enzymes involved in the production ofα-ketoglutarate(α-KG),a metabolite central to the tricarboxylic acid cycle and glutamine metabolism.In this study,we investigated the impact of IDH2 and GLUD1 on early porcine embryonic development following IDH2 and GLUD1 knockdown(KD)via doublestranded RNA(dsRNA)microinjection.Results showed that KD reducedα-KG levels,leading to delayed embryonic development,decreased blastocyst formation,increased apoptosis,reduced blastomere proliferation,and pluripotency.Additionally,IDH2 and GLUD1 KD induced abnormally high levels of trimethylation of lysine 20 of histone H4(H4K20me3)at the 4-cell stage,likely resulting in transcriptional repression of embryonic genome activation(EGA)-related genes.Notably,KD of lysine methyltransferase 5C(KMT5C)and supplementation with exogenousα-KG reduced H4K20me3 expression and partially rescued these defects,suggesting a critical role of IDH2 and GLUD1 in the epigenetic regulation and proper development of porcine embryos.Overall,this study highlights the significance of IDH2 and GLUD1 in maintaining normal embryonic development through their influence onα-KG production and subsequent epigenetic modifications. 展开更多
关键词 A-ketoglutarate H4K20me3 IDH2 GLUD1 Embryonic development
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喹唑啉酮衍生物及白桦叶提取物生物活性
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作者 史全稳 刘志明 王海英 《广东化工》 CAS 2024年第16期25-27,共3页
采用气相色谱-质谱(GC-MS)法分析白桦木醋液、白桦叶提取物成分,实验结果表明精制白桦木醋液主要成分为二甲醚(相对含量11.33%)、草酸(相对含量4.07%)、3-(2-氯-5-羟基苯基)-2-甲基-4(3H)-喹唑啉酮(相对含量1.76%)等。白桦叶提取物主要... 采用气相色谱-质谱(GC-MS)法分析白桦木醋液、白桦叶提取物成分,实验结果表明精制白桦木醋液主要成分为二甲醚(相对含量11.33%)、草酸(相对含量4.07%)、3-(2-氯-5-羟基苯基)-2-甲基-4(3H)-喹唑啉酮(相对含量1.76%)等。白桦叶提取物主要成分为环丁醇(相对含量3.09%)、甲酸乙烯酯(相对含量2.53%)等。抗氧化实验结果表明白桦木醋液和白桦叶提取物均对DPPH自由基清除率效果较好,白桦木醋液半数抑制浓度IC50为(37.093±0.511)g/L,白桦叶提取物半数抑制浓度IC50为(0.193±0.002)g/L。3-(2-氯-5-羟基苯基)-2-甲基-4(3H)-喹唑啉酮是白桦木醋液中具有开发潜力的喹唑啉酮衍生物。 展开更多
关键词 木醋液 气相色谱-质谱(GC-MS) 3-(2-氯-5-羟基苯基)-2-甲基-4(3H)-喹唑啉酮 抗氧化 DPPH自由基清除率
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基于生物信息学方法和动物实验方法获取多房棘球蚴病组蛋白H3K4ME1的生物学功能和信号通路信息
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作者 朱鑫琳 陈佳昕 任利 《中国高原医学与生物学杂志》 CAS 2024年第2期124-130,共7页
目的基于生物信息学方法和动物实验方法获取多房棘球蚴病组蛋白H3K4ME1的生物学功能和信号通路信息。方法1.提取冻存组织细胞核。2.构建cut&tag文库。3.分析生物信息:1)评估多房棘球蚴病组蛋白H3K4ME1的测序数据;2)确定reads在基因... 目的基于生物信息学方法和动物实验方法获取多房棘球蚴病组蛋白H3K4ME1的生物学功能和信号通路信息。方法1.提取冻存组织细胞核。2.构建cut&tag文库。3.分析生物信息:1)评估多房棘球蚴病组蛋白H3K4ME1的测序数据;2)确定reads在基因组上的分布;3)分析单个样本富集区间信息;4)分析peak转录因子;5)分析与Peak关联基因的GO功能富集、KEGG通路富集情况;6)分析差异关联基因基本情况;7)分析差异关联基因的GO功能富集情况;8)分析差异关联基因的KEGG通路富集情况。结果1.提取冻存组织细胞核:在显微镜下观察到细胞核计数>100000,表示细胞核提取成功。2.测序文库构建后,用qubit软件检查测序文库,结果显示合格。3.生物信息分析结果:1)实验组与参考基因库之间的数据相似程度>98%(测序数据良好),可进行下一步检测;2)多房棘球蚴病组和健康小鼠组的reads在TSS明显起峰;3)通过单个样本的富集,筛选出显著性Peak;4)与peak关联的转录因子主要集中在zf-C2H2、Homeobox和BHLH等;5)与Peak关联基因的GO功能主要富集在细胞蛋白大分子定位、细胞发育调节、解剖结构形态调控等生物学过程,与peak关联基因的KEGG通路主要富集在MAPK、cGMP-PKG、Hippo等信号通路;6)多房棘球蚴病组与健康小鼠组的组蛋白H3K4ME1存在5547个差异关联基因,其中上调基因2556个、下调基因2929个;7)组蛋白H3K4ME1差异关联基因GO功能富集分析的生物过程主要有细胞投射组织的正向调节、GTPase的活性调节等,细胞组分主要有细胞投影膜、突触等,分子功能主要有肌动蛋白结合、细胞黏附分子结合等;8)组蛋白H3K4ME1差异关联基因KEGG通路富集分析主要分布在MAPK、Wnt、Rap1等信号通路上。结论获得了多房棘球蚴病组蛋白H3K4ME1的生物学功能和信号通路信息。 展开更多
关键词 多房棘球蚴病 组蛋白H3K4ME1 生物学 信号通路
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代谢活化作用对多溴代联苯类污染物类/抗甲状腺激素活性的影响 被引量:6
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作者 刘芸 李剑 +3 位作者 马梅 王子健 饶凯锋 张玉秀 《生态毒理学报》 CAS CSCD 2008年第1期27-33,共7页
选用大鼠肝匀浆(S9)和鼠肝癌细胞(H4ⅡE)两种体系代谢活化多溴代联苯醚混标(BDEs)和十溴联苯醚(BDE209),采用重组甲状腺激素受体基因酵母检测BDEs和BDE209母体及其代谢产物的类/抗甲状腺激素效应.结果表明,BDEs和BDE209母体均不表现甲... 选用大鼠肝匀浆(S9)和鼠肝癌细胞(H4ⅡE)两种体系代谢活化多溴代联苯醚混标(BDEs)和十溴联苯醚(BDE209),采用重组甲状腺激素受体基因酵母检测BDEs和BDE209母体及其代谢产物的类/抗甲状腺激素效应.结果表明,BDEs和BDE209母体均不表现甲状腺激素效应(p>0.05);但是经S9和H4ⅡE细胞代谢活化后,其代谢产物表现出明显的类甲状腺激素活性和抗甲状腺激素活性(p<0.05),BDEs和BDE209的干扰甲状腺激素效应需要经过代谢活化步骤.比较不同代谢活化体系,重组酵母细胞本身的代谢活化作用并不显著,而H4ⅡE细胞和S9代谢活化体系均能够导致活性中间体. 展开更多
关键词 多溴联苯醚 重组酵母 S9 h4be 甲状腺激素受体 体外代谢
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腹膜透析患者治疗后腹膜溶质转运速率升高危险因素分析
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作者 白梦婷 李思宇 程力 《陕西医学杂志》 CAS 2024年第7期944-948,共5页
目的:探究影响腹膜透析治疗后腹膜溶质转运速率(PSTR)升高的危险因素。方法:回顾性纳入接受腹膜透析治疗的终末期肾病患者209例,随访观察腹膜透析治疗1年后腹膜转运特征分布;复查腹膜平衡实验,观察4 h腹膜透析液与2 h血肌酐比值(D/Pcr)... 目的:探究影响腹膜透析治疗后腹膜溶质转运速率(PSTR)升高的危险因素。方法:回顾性纳入接受腹膜透析治疗的终末期肾病患者209例,随访观察腹膜透析治疗1年后腹膜转运特征分布;复查腹膜平衡实验,观察4 h腹膜透析液与2 h血肌酐比值(D/Pcr)相比基线的变化情况,分为PSTR升高组和降低组。基于人口学特征和实验室指标,通过Logistic回归分析影响PSTR升高的危险因素。结果:入组209例腹膜透析患者,基线腹膜转运特征以低平均转运和高平均转运为主,基线D/Pcr为0.64±0.15。腹膜透析治疗1年时,约64.1%患者PSTR升高,D/Pcr值为0.73±0.12,明显高于基线D/Pcr值,差异有统计学意义(t=-6.773,P<0.05)。PSTR升高组D/Pcr、糖尿病肾病比例及透析时间大于PSTR降低组,基线D/Pcr值及基线血清白蛋白和血镁水平低于PSTR降低组,差异具有统计学意义(均P<0.05)。Logistic回归分析,基线D/Pcr值、糖尿病肾病、透析时间越长及基线血清白蛋白水平是影响PSTR升高的独立危险因素(均P<0.05)。结论:随着腹膜透析治疗时间延长,D/Pcr值逐渐升高,患者腹膜溶质转运速率呈增高趋势;基线低D/Pcr、透析时间越长、糖尿病肾病及基线血清白蛋白水平降低是影响腹膜透析治疗后腹膜溶质转运速率升高的独立危险因素。 展开更多
关键词 终末期肾病 腹膜透析 腹膜转运特征 4 h腹膜透析液与2 h血肌酐比值 腹膜溶质转运速率 透析时间 血清白蛋白水平
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血清lncRNA CBSLR及ITIH4检测在老年早期胃癌诊断中的临床价值
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作者 马沁妍 顾国青 王惠 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第14期1665-1669,1674,共6页
目的探究血清长链非编码RNA(lncRNA)CBSLR、α胰蛋白酶H4重链(ITIH4)对老年早期胃癌的诊断价值。方法选取2020-2022年该院诊治的90例老年早期胃癌患者为早期胃癌组,选取同期诊治的45例慢性萎缩性胃炎患者作为萎缩性胃炎组,同期健康体检... 目的探究血清长链非编码RNA(lncRNA)CBSLR、α胰蛋白酶H4重链(ITIH4)对老年早期胃癌的诊断价值。方法选取2020-2022年该院诊治的90例老年早期胃癌患者为早期胃癌组,选取同期诊治的45例慢性萎缩性胃炎患者作为萎缩性胃炎组,同期健康体检的45例健康人群为健康对照组。采用荧光定量PCR及酶联免疫吸附试验检测各组血清lncRNA CBSLR、ITIH4水平。采用Pearson相关分析血清lncRNA CBSLR、ITIH4水平与肿瘤标志物癌胚抗原(CEA)、糖类抗原(CA)19-9的相关性。比较不同临床病理特征血清lncRNA CBSLR、ITIH4水平差异。采用受试者工作特征曲线分析血清lncRNA CBSLR、ITIH4对老年早期胃癌的诊断价值。结果早期胃癌组血清lncRNA CBSLR、ITIH4、CEA、CA19-9水平均高于萎缩性胃炎组及健康对照组(均P<0.05)。早期胃癌患者血清lncRNA CBSLR、ITIH4与CEA、CA19-9水平均呈正相关(r=0.601~0.751,均P<0.05)。早期胃癌患者血清lncRNA CBSLR、ITIH4水平与肿瘤最大径、浸润深度、分化类型及淋巴结转移有关(均P<0.05),与患者年龄、性别、肿瘤位置、大体类型无关(均P>0.05)。血清lncRNA CBSLR、ITIH4、CEA、CA19-94项联合检测诊断早期胃癌的曲线下面积(0.912,95%CI:0.858~0.949)高于血清lncRNA CBSLR(0.833,95%CI:0.784~0.879),ITIH4(0.806,95%CI:0.760~0.847),CEA(0.791,95%CI:0.742~0.830),CA19-9(0.766,95%CI:0.710~0.815)单项指标检测(Z=4.482、5.130、5.231、6.117,均P<0.05)。结论老年早期胃癌患者血清lncRNA CBSLR、ITIH4水平升高,与胃癌不良临床病理特征有关,血清lncRNA CBSLR、ITIH4、CEA、CA19-94项联合对老年早期胃癌具有较高的诊断价值。 展开更多
关键词 早期胃癌 长链非编码RNA CBSLR α胰蛋白酶H4重链 临床病理特征 诊断价值
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ASP、ITIH4在急性失代偿性心力衰竭患者中的表达及其与炎症因子的相关性
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作者 薛亚威 张玉斌 +2 位作者 孙丹 刘芳卉 许倩 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第12期1530-1533,共4页
目的探讨急性失代偿性心力衰竭患者白脂素(ASP)、α胰蛋白酶抑制剂重链H4(ITIH4)的表达及其与炎症因子的相关性。方法选取2023年1-5月于定州市人民医院就诊的72例急性失代偿性心力衰竭患者为研究对象,根据患者是否存在主要不良心血管事... 目的探讨急性失代偿性心力衰竭患者白脂素(ASP)、α胰蛋白酶抑制剂重链H4(ITIH4)的表达及其与炎症因子的相关性。方法选取2023年1-5月于定州市人民医院就诊的72例急性失代偿性心力衰竭患者为研究对象,根据患者是否存在主要不良心血管事件(MACE),分为MACE组(34例)和非MACE组(38例)。收集所有研究对象性别、年龄、体重指数、体温等临床资料;全自动生化分析仪分析测定血常规指标,酶联免疫吸附试验测定患者ASP、ITIH4水平及炎症因子肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-6(IL-6)、超敏C-反应蛋白(hs-CRP)水平。比较MACE组和非MACE组临床资料及ITIH4、ASP、炎症因子水平。Pearson相关分析急性失代偿性心力衰竭患者ITIH4、ASP水平与炎症因子的相关性。多因素Logistic回归分析急性失代偿性心力衰竭患者发生MACE的影响因素。结果非MACE组LVEDD及ASP水平低于MACE组(P<0.05),ITIH4水平明显高于MACE组(P<0.05)。MACE组炎症因子IL-6、TNF-α、hs-CRP水平均高于非MACE组(均P<0.05)。急性失代偿性心力衰竭患者血清ITIH4水平与炎症因子IL-6、TNF-α、hs-CRP均呈负相关(均P<0.05),ASP水平与炎症因子IL-6、TNF-α、CRP均呈正相关(均P<0.05)。ITIH4、ASP为急性失代偿性心力衰竭患者发生MACE的影响因素(均P<0.05)。结论急性失代偿性心力衰竭并发MACE患者ASP水平升高,ITIH4水平降低,二者均与炎症因子相关且为MACE发生的影响因素。 展开更多
关键词 白脂素 α胰蛋白酶抑制剂重链H4 急性失代偿性心力衰竭 炎症因子
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泰安市部分地区产蛋鸡群高致病性禽流感抗体检测分析与防控
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作者 任骅玮 刘晓梅 +1 位作者 孟凡亮 刘思当 《山东畜牧兽医》 2024年第8期18-19,共2页
为了解泰安地区产蛋鸡群高致病性禽流感的免疫情况及感染风险,本研究采用血凝及血凝抑制试验对从泰安市三个地区共九家规模化蛋鸡场产蛋鸡群采集的144份血清样本进行抗体检测。检测结果显示,144份血清样本中,H5-14亚型抗体滴度在6~12之... 为了解泰安地区产蛋鸡群高致病性禽流感的免疫情况及感染风险,本研究采用血凝及血凝抑制试验对从泰安市三个地区共九家规模化蛋鸡场产蛋鸡群采集的144份血清样本进行抗体检测。检测结果显示,144份血清样本中,H5-14亚型抗体滴度在6~12之间,平均滴度8.17,场和样品合格率均为100%;H7-4亚型抗体滴度在4~12之间,平均滴度7.10,场合格率为77.78%,样品合格率95.14%,其中H5-14亚型禽流感的抗体滴度平均值较H7-4亚型高。上述结果表明,泰安部分地区产蛋鸡群高致病性禽流感免疫效果较好,未见抗体水平过高及离散度过大的疑似感染鸡群。但个别鸡场H7亚型抗体水平存在偏低的情况,应加强抗体水平检测,评估鸡群免疫状态及感染风险,以期为疫苗选择及免疫程序制定提供参考依据。 展开更多
关键词 高致病性禽流感 H5-14亚型 H7-4亚型 抗体检测 免疫防控
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早熟机采棉H33-1-4特征特性及高产栽培技术
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作者 邵丽萍 王云 姚炎帝 《中国棉花》 2024年第3期4-6,F0004,共4页
H33-1-4是由新疆合信科技发展有限公司选育的非转基因早熟常规品种(审定编号:国审棉20190017),具有丰产性好,品质优良,高抗枯萎病,耐黄萎病等特点。在2016―2017年西北内陆棉区早熟品种区域试验中,2年平均666.7 m^(2)籽棉、皮棉和霜前... H33-1-4是由新疆合信科技发展有限公司选育的非转基因早熟常规品种(审定编号:国审棉20190017),具有丰产性好,品质优良,高抗枯萎病,耐黄萎病等特点。在2016―2017年西北内陆棉区早熟品种区域试验中,2年平均666.7 m^(2)籽棉、皮棉和霜前皮棉产量分别为363.3 kg、151.0 kg和143.4 kg,分别比对照新陆早36号增产10.1%、10.9%和9.1%。2020-2022年,H33-1-4在新疆博尔塔拉蒙古自治州、石河子垦区等早熟植棉区示范种植效益显著。概述了H33-1-4选育过程、特征特性、适宜种植地区、制种要求及栽培技术要点。 展开更多
关键词 棉花 H33-1-4 品种选育 特征特性 栽培技术 抗病性 抗虫性
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用于H_(2)PO_(4)^(-)检测的比率型荧光探针合成及性能研究
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作者 郭昌晟 陈君霞 +3 位作者 刘忆茹 卢钰盛 董智云 席福贵 《化学试剂》 CAS 2024年第6期33-38,共6页
设计合成了一种基于吖啶-苯并咪唑鎓的大环受体ABIM,可作为H_(2)PO_(4)^(-)的荧光比率传感器。借助荧光光谱研究了受体ABIM对H_(2)PO_(4)^(-)的选择性识别,在大环受体ABIM的乙腈溶液中加入H_(2)PO_(4)^(-)后,在426 nm处荧光发射明显“... 设计合成了一种基于吖啶-苯并咪唑鎓的大环受体ABIM,可作为H_(2)PO_(4)^(-)的荧光比率传感器。借助荧光光谱研究了受体ABIM对H_(2)PO_(4)^(-)的选择性识别,在大环受体ABIM的乙腈溶液中加入H_(2)PO_(4)^(-)后,在426 nm处荧光发射明显“关闭”,506 nm处荧光发射明显“打开”,溶液荧光颜色由蓝色变为蓝绿色,新的荧光发射峰可能是由于H_(2)PO_(4)^(-)诱导两个受体中的吖啶环之间形成Excimer产生的。ABIM与H_(2)PO_(4)^(-)以1∶1的化学计量比结合,结合常数为(7.13±0.48)×10^(6)L/mol,检出限为2.38×10-7 mol/L,最佳响应时间为2 min。回收实验表明,ABIM可应用于样品中H_(2)PO_(4)^(-)的检测。 展开更多
关键词 吖啶 苯并咪唑鎓 H 2PO-4 大环 比率型荧光探针
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