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广东人禽流感H5N1毒株M基因特性、进化和变异
被引量:
3
1
作者
黄平
邹丽容
+4 位作者
方苓
李晖
陈秋霞
俞守义
柯昌文
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期371-376,共6页
通过对人禽流感H5N1毒株M基因序列的变异分析,揭示毒株M基因特征与进化。检测广东地区人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株M基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列进行比...
通过对人禽流感H5N1毒株M基因序列的变异分析,揭示毒株M基因特征与进化。检测广东地区人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株M基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析。结果发现,1997-2006年53株毒株M1基因和51株毒株M2核苷酸序列同源性均分成两组,1997年毒株为第一组(GⅠ),2003-2006年香港、越南、泰国、印尼、中国大陆、土耳其、伊拉克、阿塞拜疆、埃及毒株为第二组(GⅡ)。M1基因20个氨基酸位点置换,占7.94%(20/252),其中2003-2006年毒株M1基因有9个氨基酸位点不同于1997年毒株;M2基因22个氨基酸置换,占22.7%,其中2003-2006年毒株M2基因有4个氨基酸不同于1997年毒株。M2基因Ks值为26.8×10^-6~42.6×10^-6Nt/d,Ka值为4.39×10^-6~6.98×10^-6Nt/d;而M1基因的同义突变速度均远高于错义突变速度,显示M1基因受到机体免疫压力较小;检验发现M1基因进化存在负选择性压力。2003-2006年毒株M1基因通过氨基酸S224N置换,增加一个糖基化位点NSS224-226;而来自印尼的8株毒株M2基因发生C50F置换,引起蛋白二级结构改变。1997年中国香港人禽流感毒株自当时出现后,便未在以后人禽流感疫情中出现。2003-2006年毒株M1基因增加糖基化位点NSS224-226,可能与毒株致病性有关。人禽流感H5N1毒株M基因在自然界变异频繁,可能影响H5N1毒株的人-人传播能力。
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关键词
人禽流感
h5ni毒株
M基因
特性
进化
变异
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题名
广东人禽流感H5N1毒株M基因特性、进化和变异
被引量:
3
1
作者
黄平
邹丽容
方苓
李晖
陈秋霞
俞守义
柯昌文
机构
广东省疾病预防控制中心广东省应急病原学检测重点实验室
南方医科大学流行病学系
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期371-376,共6页
基金
广东省重点科技项目(2003B60127)
广东省科技项目(2004A2090102)
文摘
通过对人禽流感H5N1毒株M基因序列的变异分析,揭示毒株M基因特征与进化。检测广东地区人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列,同时检索全球人禽流感H5N1毒株M基因序列,采用DNAStar5.0软件对检索的人禽流感H5N1毒株M基因核苷酸序列进行比对和分析;并结合流行病学资料对变异毒株进行进化速度分析。结果发现,1997-2006年53株毒株M1基因和51株毒株M2核苷酸序列同源性均分成两组,1997年毒株为第一组(GⅠ),2003-2006年香港、越南、泰国、印尼、中国大陆、土耳其、伊拉克、阿塞拜疆、埃及毒株为第二组(GⅡ)。M1基因20个氨基酸位点置换,占7.94%(20/252),其中2003-2006年毒株M1基因有9个氨基酸位点不同于1997年毒株;M2基因22个氨基酸置换,占22.7%,其中2003-2006年毒株M2基因有4个氨基酸不同于1997年毒株。M2基因Ks值为26.8×10^-6~42.6×10^-6Nt/d,Ka值为4.39×10^-6~6.98×10^-6Nt/d;而M1基因的同义突变速度均远高于错义突变速度,显示M1基因受到机体免疫压力较小;检验发现M1基因进化存在负选择性压力。2003-2006年毒株M1基因通过氨基酸S224N置换,增加一个糖基化位点NSS224-226;而来自印尼的8株毒株M2基因发生C50F置换,引起蛋白二级结构改变。1997年中国香港人禽流感毒株自当时出现后,便未在以后人禽流感疫情中出现。2003-2006年毒株M1基因增加糖基化位点NSS224-226,可能与毒株致病性有关。人禽流感H5N1毒株M基因在自然界变异频繁,可能影响H5N1毒株的人-人传播能力。
关键词
人禽流感
h5ni毒株
M基因
特性
进化
变异
Keywords
h
uman
h
5
N1 avian influenza
h
5
N1 strain
M gene
c
h
aracteristics
evolution
variation
分类号
R373.1 [医药卫生—病原生物学]
R392 [医药卫生—免疫学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广东人禽流感H5N1毒株M基因特性、进化和变异
黄平
邹丽容
方苓
李晖
陈秋霞
俞守义
柯昌文
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
3
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