贵州省新型甲型H1N1(2009)流感病毒HA-1基因分析

目的建立并完善贵州省新型甲型H1N1流感病毒基因分析检测技术平台,了解贵州省新型甲型H1N1(2009)流感病毒HA1片断与WHO公布的流行株有否发生变异。方法收集16株新型甲型H1N1流感病毒毒株,提取病毒核酸RNA,通过RT-PCR扩增HA1片断,用电泳观察PCR产物目的条带大小,经过纯化、测序,用Biodeit、MEGA4相关软件进行序列比对,同源性及差异性分析,构建系统发育树。结果贵州省(2009)代表株与中俄代表株A/Habarovak/01/2009(H1N1)和墨西哥第一株甲型H1N1流感A/Mexio City/001/2009(H1N1)同属一个谱系,亲缘关系较近,同源性在93.2%～95.8%之间。结论贵州省(2009)代表株与WHO公布的流行株在核苷酸水平上有一定程度的变异。

贵州省2012年度禽流感病毒H5N1亚型HA-1基因分析

目的建立并完善贵州省禽流感病毒基因分析检测技术平台,了解贵州省禽流感病毒H5N1亚型HA1片断与WHO公布的流行株比对有否发生变异。方法收集禽流感H5N1亚型病毒毒株,提取病毒核酸RNA,通过RT-PCR扩增HA1片断,用电泳观察PCR产物目的条带大小,经过纯化、测序,用Biodeit、MEGA4相关软件进行序列比对,进行差异性分析,构建系统发育树。结果贵州省禽流感病毒H5N1亚型中鸭来源的禽流感病毒组成一个分支,组内差异性在0.00～5.00之间;鸡来源的禽流感病毒组成另外一个分支,组内高度同源,差异性为零。结论贵州省禽流感病毒在物种之间存在一定的种属特异性。并且与湖南省的禽流感病毒亲缘关系较近,这与两省之间地理交界有关。