HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌的应用研究

目的采用HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌，评价其优缺点。方法收集浙江、安徽等地74株临床非结核分枝杆菌，采用HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌，并用16SrRNA基因测序方法对其进行比较和评价。结果74株非结核分枝杆菌HAIN基因分型试剂盒鉴定结果为：31株胞内分枝杆菌，12株脓肿分枝杆菌，8株偶发分枝杆菌，6株堪萨斯分枝杆菌，5株鸟分枝杆菌，3株耻垢分枝杆菌，2株草分枝杆菌，2株瘰疬分枝杆菌，1株戈登分枝杆菌，另外有4株菌株只能鉴定为分枝杆菌属，不能鉴定到种。8株结核分枝杆菌鉴定准确。与16S rRNA基因测序相比较，HAIN基因分型试剂盒除了4株菌株只能鉴定为分枝杆菌属以外，其余70株非结核分枝杆菌均能鉴定到种，鉴定符合率为94．59％；并且它能进一步区分脓肿分枝杆菌和龟分枝杆菌，以及堪萨斯分枝杆菌和胃分枝杆菌。如果单纯鉴定HAIN基因分型试剂盒菌株范围之内的临床最常见非结核分枝杆菌菌株，鉴定符合率为100％。结论HAIN基因分型试剂盒鉴定临床非结核分枝杆菌时间短、操作简单、结果准确，可在临床推广使用。

人类白细胞抗原基因分型检测试剂盒行业标准的修订与验证

目的对2010年发布的YY/T 1180-2010《人类白细胞抗原(HLA)基因分型试剂盒(SSP法)》进行修订并验证。方法按照拟定行业标准的要求,选择不同方法学的人类白细胞抗原(HLA)基因分型试剂盒进行验证。结果外观、参考品符合率、重复性、有效检测范围、检出限、稳定性等性能指标符合要求。结论人类白细胞抗原(HLA)基因分型试剂盒行业标准的修订及时科学合理,适用范围更加全面,有助于规范此类试剂盒的技术要求和检验方法,从而提高此类试剂盒的产品质量,并为其上市前后的监管提供依据。

新型乙型肝炎病毒基因分型检测试剂盒的临床评价

目的评价一种新型乙型肝炎病毒基因分型检测(免疫荧光法)试剂的临床性能。方法收集中国人民解放军三○二医院研究对象的血清383例,与血清对应的血浆50例。乙型肝炎病毒A基因型评价采用北京万泰生物药业股份有限公司试剂盒(荧光免疫层析法),基因序列测定为对照方法;乙型肝炎病毒B、C、D基因型评价使用北京万泰生物药业股份有限公司试剂盒(荧光免疫层析法),上海之江生物科技试剂盒(荧光定量PCR法)为对照试剂。验证试剂和对照试剂同时检测同一例标本,若结果不一致,2种方法分别进行复测,结果以复测为准,如仍不一致进行基因测序,以测序结果为准,对结果进行Kappa一致性检验,计算2种方法的检测一致率。另通过验证试剂检测对应的血浆标本,评价验证试剂对血清、血浆标本检测能力的一致性。结果 A基因型验证试剂检出15例,对照方法检出12例,2种方法的符合率为12/15。B基因型验证试剂相对对照试剂的阳性符合率为98.00%(49/50),阴性符合率为99.06%(315/318),总符合率为98.91%(364/368),Kappa值为0.954。C基因型验证试剂相对对照试剂的阳性符合率为98.78%(242/245),阴性符合率为86.99%(107/123),总符合率为94.84%(349/368),Kappa值为0.881。D基因型验证试剂相对对照试剂的阳性符合率为87.50%(7/8),阴性符合率为100.00%(360/360),总符合率为99.73%(367/368),Kappa值为0.932。验证试剂对50例对应的血清/血浆标本检测,结果均为5例乙型肝炎病毒B基因型,44例C基因型,1例未分型。结论该新型试剂盒对乙型肝炎病毒的A、B、C、D型分型效果较好,可用于感染病毒分型的临床检测。

安捷伦科技推出新型PCR试剂盒——SureDirect血液PCR试剂盒可用于扩展的基因分型和病原体检测研究

安捷伦科技公司近日推出新型SureDirect血液PCR（聚合酶链反应）试剂盒．该试剂盒拓宽了公司PCR产品线，扩展了血源性疾病的基础和临床研究者在基因分型和病原体检测方法的应用．

早期筛查宫颈癌的HPV基因分型检测试剂盒问世

广东潮州凯普生物化学有限公司研制出世界首个人乳头状瘤病毒（HPV）基因分型检测试剂盒，采用这种检测法最快在3个半小时内就可得出被检者是否感染HPV的结论。

中德生物STR荧光ZDgenetype9+1基因分型试剂盒应用结果分析

目的:确证中德生物STR荧光ZDgenetype 9+1基因分型试剂盒应用于个体基因分型的准确性和重复性。方法:应用中德生物ZDgenetype 9+1 STR荧光基因分型试剂盒扩增100例无关个体样本,建立扩增产物在ABI 310遗传分析仪上基因分型的方法,相同样本扩增结果与AmpFLSTR Identifiler基因分型结果进行比较。结果:ZDgenetype 9+1荧光基因分型试剂盒对100例无关个体血样进行复合扩增并实现了在ABI 310遗传分析仪上进行基因分型,其结果与AmpFLSTR Identifile扩增相同样本的基因分型结果吻合率为100%。结论:中德生物ZDgenetype 9+1 STR荧光基因分型试剂盒适用于法庭科学日常办案和科研使用。

国产HCV RNA分型试剂盒检测结果分析

目的分析丙型肝炎病毒(HCV)RNA分型试剂盒检测深圳市抗-HCV阳性献血者结果。方法收集2014-2015年158份深圳市抗-HCV阳性献血者血液样本,应用聚合酶链反应(PCR)-荧光探针法进行HCV RNA定量检测,病毒载量>1.0×103 IU/mL的样本经HCV RNA分型试剂盒检测HCV基因型,分析不同基因型所占比例,病毒基因型与载量之间的相关性。结果 158份抗-HCV阳性献血者PCR-荧光探针法检出HCV RNA阳性样本54例,病毒载量>1.0×103 IU/mL的45例,全部得到分型结果,HCV 1b型、2型、3型、6型分别占57.78%(26/45)、6.67%(3/45)、8.89%(4/45)、26.67%(12/45)。单因素方差分析结果显示,1b型与2型病毒载量差异有统计学意义(F=2.861,P<0.05);不同性别间HCV RNA定量检测结果及抗-HCV S/CO值结果差异有统计学意义(P<0.05);不同年龄段各基因型分布比例经Fisher精确检验,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 HCV 1b型、6型仍为深圳市无偿献血人群感染HCV的主要基因型,而HCV 2型和3型比例有所减少。

寡核苷酸微阵列芯片在人乳头瘤病毒基因分型检测中的应用评估

目的探讨寡核苷酸微阵列芯片技术在人乳头瘤病毒(HPV)检测中的实用价值。方法使用HPV寡核苷酸微阵列芯片试剂盒对227例宫颈拭子样本进行16种高危型(HPV-16,18,31,33,35,39,45,51,52,53,56,58,59,66,68,CP8304)和5种低危型(6,11,42,43和44)检测,所检测的样本为HC2探针捕捉法检测所得到的HPV高危型和低危型样本,用以评估该DNA微阵列试剂的性能。结果190例经HC2法检测为高危型HPV阳性以及30例被HC2法检测为低危型的样品被寡核苷酸微阵列芯片试剂盒检测出具体的高危和低危HPV型别,总共检测出13种高危型和5种低位危型HPV亚型,在高危亚型中,各型检出率分别是16型26.01%、58型20.18%、52型14.71%、68型7.59%、31型7.13%、33型6.37%、66型6.24%、18型4.05%、59型2.18%、39型1.10%、56型1.50%、45型1.40%、51型1.07%;在低危亚型中,各型检出率分别为6型45.43%、11型29.70%、42型14.11%、43型5.89%和44型5.00%。单一HPV亚型感染及2种、3种HPV亚型混合感染分别为60.46%、29.89%、9.65%。7例经HC2检测为高危型,但寡核苷酸微阵列芯片试剂盒未能检测出HPV的具体型别,寡核苷酸微阵列芯片试剂盒与HC2法高危型HPV检测结果的符合率为96.92%(220/227)。结论HPV寡核苷酸微阵列芯片试剂盒与HC2法高危型HPV检测阳性符合率高,并可以明确具体分析21种HPV型别,是一种准确、高效、经济的HPV型别检测方法,可用于HPV的常规基因型分型诊断及人群筛查。

DNATyper^(TM)15与Identifiler^(TM)试剂盒对陈旧骨骼、牙齿和指甲样本检验结果的比较分析

目的通过国产DNATyperTM15和进口IdentifilerTM试剂盒对陈旧骨骼、牙齿和指甲样本的检验结果比对分析,了解国产试剂盒对降解检材的检验效果,探讨在案件检验中应用的可行性。方法提取陈旧骨骼、牙齿和指甲样本的DNA后,用DNATyperTM15及IdentifilerTM试剂盒同步扩增,并用检出率、杂合子基因座上等位基因均衡性(PHR)和等位基因分型结果一致性,对DNATyperTM15和IdentifilerTM试剂盒进行比较。结果 45例陈旧骨骼、牙齿和指甲样本,DNATyperTM15试剂盒成功检出399例,检出率88.7%,IdentifilerTM试剂盒成功检出404例,检出率89.8%;DNATyperTM15试剂盒和IdentifilerTM试剂盒共同检出398例,在这398例样本中,PHR≤0.5分别为128个和117个;同一样本中,相同基因座上两种试剂盒检出的等位基因分型结果完全一致。经统计学分析,两种试剂盒的检出率和杂合子基因座上等位基因均衡性的检测结果均无统计学差异(P>0.05)。结论国产DNATyperTM15试剂盒可有效应用于实际案件中陈旧骨骼、牙齿及指甲样本的检验。

法医DNA试剂盒在人员血样检验中应用

目的验证法医DNA试剂盒在人员血样检验中的分型效果。方法提取DNA扩增或直接扩增,AB公司3500XL或3130测序仪电泳检测,GeneMapperID-X软件进行等位基因分型。结果 7种商业化的法医DNA试剂盒在人员血样DNA检验中均获得满意的STR分型。结论使用文中介绍DNA试剂盒,可以满足法医DNA人员血样检验需求。

国产STR荧光复合试剂盒DNAtyper15应用结果分析

DNAtyper15是公安部第二研究所研制的STR荧光试剂盒,为检验应用该试剂盒检测样本基因分型的准确性和稳定性,本文对日常案件中的样本进行处理,在实验室内和实验室之间进行基因分型结果比较,并与PE公司Identifiler试剂盒基因分型结果一致性进行调查.……

安捷伦科技推出新型PCR试剂盒

4月30日，北京安捷伦科技公司宣布推出新型Sure Direct血液PCR（聚合酶链反应）试剂盒。该试剂盒拓宽了公司PCR产品线，扩展了血源性疾病的基础和临床研究者在基因分型和病原体检测方法的应用。

HCV基因分型试剂盒评价血清盘的构建与应用

目的构建HCV基因分型试剂盒评价血清盘,对国内HCV基因分型试剂盒进行评价与应用,以评估我国HCV基因分型试剂盒的质量。方法收集全国不同省份、不同人群疑似HCV的样本,首先对样本进行筛查试验和病毒载量检测,选取样本的病毒载量大于1 000 IU/ml,再用测序法确定样本的HCV基因型,对确定基因型的样本进行分析,每个基因亚型选择2支,再加上2支病毒载量为阴性的样本,构建成1套HCV基因型试剂盒评价盘,分装并评价其稳定性,并利用评价盘对HCV基因分型试剂盒进行质量评估。结果 HCV NS5B区、CORE区测序基因型结果与血清盘参考预期结果的准确性均为100%(7/7);828份样本中共检测出7种基因亚型,分别为1a、1b、2a、3a、3b、6a、6n,未检测到其他罕见型别(4型、5型),综合考虑各方面因素,每个基因亚型选择2支样本再加上2支HCV阴性样本共16支样本,组成HCV基因型试剂盒评价盘;经反复冻融3次后检测基因型,其稳定性无影响;利用构建的HCV基因型评价盘对分型试剂盒进行评价,其基因型检出准确性为9/14,其中试剂盒检测范围之内的5种型别有1个样本未检测(3b),而对于检测范围之外的基因型(1a、6n),将基因型1a均错判为1b(2/2)。结论本实验室构建的HCV基因分型评价盘充分考虑了我国HCV基因型的流行情况及国内HCV基因分型试剂盒的检测范围,能够对国内HCV基因分型试剂盒的质量进行有效评价。

供者携带的C*03:100等位基因的测序分析1例

目的检测与分析1例志愿捐献者携带的等位基因HLA-C*03∶100。方法采用快速DNA提取试剂盒从全血标本中提取基因组DNA,经HLA-C基因商品化测序分型试剂盒扩增,纯化后的扩增产物作为模板,由试剂盒配套的第2、3和4外显子正反向测序引物,及自行研制的第5外显子正反向、第6外显子正向和第7外显子反向测序,经乙醇/醋酸钠/EDTA纯化的测序反应产物,于ABI PrismTM3730测序仪电泳检测,相关的分析软件进行HLA基因分型。结果将电泳后的数据导入Assign-SBT3.5.1.45(Conexio Genomies,Western Australia)分析软件,得出的分型结果为C*03∶02∶02,03∶100。

人类粒细胞抗原系统基因测序方法的建立

目的人类粒细胞特异性抗原在不同人群中表现出高度的多态性,输注后由于个体抗原的差异,可以刺激不同的机体产生免疫反应,从而引发某些不良反应。本研究拟建立1种基于DNA扩增和测序分型(PCR sequencing-based typ-ing,PCR-SBT)的HNA-1、HNA-3到HNA-5和HNA-2a(G/C)抗原系统的基因分型技术。方法选择参与本单位献血人员的随机标本400例,采用DNA抽提试剂盒,抽提标本基因组DNA,严格按试剂说明书进行操作,参照数据库中人类HNA-1～HNA-5基因序列,采用计算机软件设计引物,并在引物5’端添加M13序列,5对引物分别扩增HNA-1～HNA-5基因序列,

亲子鉴定中牙釉质基因扩增X片段缺失1例报告

1资料本案例属常规母子、父子、儿子间三联体亲子关系鉴定。现场采集3人指血,按照《法庭科学DNA实验室检验规范》（GA/T383-2014）中chelex-100法提取DNA,采用GlobalFilerTM试剂盒（美国life technologies公司1501013）检测,ABI-3500完成产物电泳和基因分型,

HCV基因分型试剂临床应用评价

目的运用直接测序法和丙型肝炎病毒(HCV)基因分型试剂盒两种方法,诊断HCV基因型并比对它们的结果,以评价HCV基因分型试剂盒的临床使用效果。方法选取购买的2套商业HCV基因型血清盘和收集的45份HCV核糖核酸(RNA)阳性临床样本,用巢式聚合酶链反应(PCR)扩增HCV CORE区、NS5B区,对扩增的序列进行测序以确定基因型别;再通过HCV基因分型试剂盒检测样本以确定基因型,对所得结果进行统计分析。结果 HCV NS5B区、CORE区检测商业HCV基因型血清盘,分别检测出16例(16/19)、15例(15/19);对于HCV基因分型试剂盒检测中国常见的五种型别1b、2a、3a、3b、6a的样本,HCV基因分型试剂盒的准确性为7/7。45份HCV RNA阳性的临床样本中,所检测出的基因型有1a(4份)、1b(6份)、2a(5份)、3a(5份)、3b(14份)、6a(7份)、6n(4份),测序法结果属于五种亚型(1b、2a、3a、3b、6a)的有37份标本,试剂盒检测的结果与测序法一致的有29份,8份标本未检出,一致率为29/37。五种亚型以外的8份标本,测序法与试剂盒检测结果均不一致。结论通过此次对比结果可以看出,所用HCV基因分型试剂盒能够准确检测出国内常见的基因型,并且该方法操作简便,检测时间短,具有较大的临床应用价值。