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基于RNA-seq的HBSS诱导细胞自噬的组学分析及实验验证
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作者 阮晨 曹敬博 +2 位作者 吴冉 王来友 贾永鹏 《西北师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2023年第5期88-95,共8页
为寻找Hank’s平衡盐溶液(HBSS)诱导细胞自噬的调控蛋白,对HBSS诱导大鼠肾上皮(NRK)细胞株的细胞自噬现象进行转录组分析和实验验证.用HBSS分别处理细胞不同时长,结合LC3B-Ⅱ蛋白表达量和细胞存活率确定最佳诱导时间.根据最佳诱导时间... 为寻找Hank’s平衡盐溶液(HBSS)诱导细胞自噬的调控蛋白,对HBSS诱导大鼠肾上皮(NRK)细胞株的细胞自噬现象进行转录组分析和实验验证.用HBSS分别处理细胞不同时长,结合LC3B-Ⅱ蛋白表达量和细胞存活率确定最佳诱导时间.根据最佳诱导时间制作细胞样品,进行转录组测序(RNA-seq),原始数据质控过滤后进行注释和分析.选取表达差异变化排序靠前的基因进行敲降实验,筛选具有潜在调控功能的蛋白质,接着用荧光定量PCR实验对该蛋白质的上游基因表达情况进行辅助验证.结果发现,HBSS诱导细胞自噬的最佳诱导时间为3 h;在转录组结果中共鉴定到32305个基因,477个差异表达基因,差异基因的GO和KEGG富集分析结果显示这些基因主要参与代谢底物分解、氨基酸转运以及蛋白质修饰调控等信号调控通路;免疫印迹结果表明干扰基因Sat1的表达可以降低细胞内LC3B-Ⅱ的表达水平.本研究围绕HBSS诱导细胞自噬进行转录组学测序分析,并通过实验发现了影响LC3B-Ⅱ表达的潜在功能调控基因Sat1.综合考虑所有实验结果,Sat1可能通过GO和KEGG显著富集的信号通路影响HBSS诱导的细胞自噬,这些发现可以为细胞自噬相关机制的深入挖掘提供参考. 展开更多
关键词 转录组测序 Hank’s平衡盐溶液 自噬 表达基因 免疫印迹
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HMGB1参与HBSS诱导的Lewis细胞凋亡及其相关机制研究 被引量:2
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作者 孔凡芝 苏兆亮 +4 位作者 倪萍 徐鑫鑫 张盼 佘鹏 许化溪 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1065-1068,共4页
目的探讨HBSS饥饿缓冲液能否诱导肺癌细胞(Lewis)凋亡及可能的机制。方法 Hank′s平衡溶液(HBSS)饥饿缓冲液作用于Lewis细胞12 h后采用Annexin V/PI流式双染检测细胞凋亡。Lewis细胞在HBSS处理30 min后流式检测ROS的产生,4、8、12 h后... 目的探讨HBSS饥饿缓冲液能否诱导肺癌细胞(Lewis)凋亡及可能的机制。方法 Hank′s平衡溶液(HBSS)饥饿缓冲液作用于Lewis细胞12 h后采用Annexin V/PI流式双染检测细胞凋亡。Lewis细胞在HBSS处理30 min后流式检测ROS的产生,4、8、12 h后通过免疫印迹检测HMGB1蛋白的表达。另外,HBSS刺激Lewis细胞12 h后采用Caspase-3活性检测试剂盒检测Caspase-3的表达。结果 HBSS饥饿缓冲液作用于Lewis细胞12 h后与对照组相比凋亡百分比明显增多。流式结果表明Lewis细胞在HBSS处理30 min后ROS表达量明显上升,免疫印迹检测发现HBSS作用Lewis细胞3 h后HMGB1表达增加,6 h后在细胞培养上清中检测到HMGB1的分泌。另外,HBSS刺激12 h后Caspase-3表达也显著增加,且有统计学意义。结论 HBSS饥饿缓冲液能诱导肺癌细胞(Lewis)凋亡,且凋亡可能依赖于ROS-HMGB1-Caspase-3通路。 展开更多
关键词 hbss Lewis细胞 ROS HMGB1
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Benefits of Simple Exchange Transfusion in Sickle Cell Disease (HbSS) with Vaso-Occlusive Crisis Not Responding to Standard Therapy
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作者 Dibyajyoti Sahoo Rabindra Kumar Jena +1 位作者 Sudha Sethy Sambit Kumar Behera 《International Journal of Clinical Medicine》 2016年第1期101-105,共5页
Sickle cell disease is an autosomal recessive genetic disease. Vaso occlusive crisis (VOC) is frequently seen in such patients. Painful VOC is usually recurrent, of variable severity due to many factors and its manage... Sickle cell disease is an autosomal recessive genetic disease. Vaso occlusive crisis (VOC) is frequently seen in such patients. Painful VOC is usually recurrent, of variable severity due to many factors and its management poses important challenge in the clinical practice. Few patients do not respond to standard therapies and continue to suffer severe pain for prolonged period or land to serious life threatening situation. The red cell exchange by aphaeresis is presumed to be one efficient alternative in this situation which can reduce the level of HbS below 40% - 50%. However, it is costly and not available everywhere. Both circumstances are common in our state where incidence of sickle cell disease is quite high. In such situations simple red cell exchange i.e. removing 1 unit (350 ml) of blood manually (by phlebotomy) and replacement with one unit normal red cell is effective. All of our four cases of SCA with severe acute VOC, are not responding to standard therapy but responded efficiently to this simple red cell exchange transfusion. Our present observation may pave the way of one simple, affordable, and effective measure to reduce the pain of severe acute VOC not responding to standard therapy. Moderate reduction of HbS by 8% - 14% by simple red cell exchange transfusion was associated with relief of pain of acute VOC;a new observation was reported in all our 4 cases which need to be validated by larger controlled studies. 展开更多
关键词 Vaso Occlusive Crisis Simple Red Cell Exchange Transfusion SCA (hbss)
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高效液相色谱法考察大黄素在HBSS溶液中的溶解度及其稳定性 被引量:4
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作者 刘薇 叶玲 +2 位作者 赵洁 夏笔军 刘中秋 《中国卫生检验杂志》 CAS 2009年第8期1775-1777,共3页
目的:考察大黄素在HBSS溶液中的溶解度和稳定性。方法:将大黄素按照不同浓度溶于有机溶剂和HBSS溶液中,用高效液相法比较两者溶解度的差别。再考察不同时间点,不同pH值下的大黄素的稳定性。结果:大黄素在HB-SS溶液中溶解度较低,在可溶... 目的:考察大黄素在HBSS溶液中的溶解度和稳定性。方法:将大黄素按照不同浓度溶于有机溶剂和HBSS溶液中,用高效液相法比较两者溶解度的差别。再考察不同时间点,不同pH值下的大黄素的稳定性。结果:大黄素在HB-SS溶液中溶解度较低,在可溶范围内和有机相中的溶解度无显著性差异,大黄素极不稳定,1天之后已经降解,用螯合剂和抗氧剂可以明显增强其稳定性。结论:大黄素HBSS溶液可以用于灌流实验。 展开更多
关键词 大黄素 高效液相色谱法 hbss溶液
原文传递
湖南汉族人群FⅦ基因M1/M2多态性与冠心病血瘀证的遗传流行病学研究 被引量:13
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作者 李杰 袁肇凯 +5 位作者 黄献平 陈伶利 胡志希 孙贵香 莫莉 陈清华 《中国中医急症》 2009年第2期253-255,共3页
目的利用单体型相对风险分析(HHRR)和连锁不平衡检验(TDT)方法在冠心病血瘀证家系中探讨凝血因子Ⅶ(FⅦ)基因多态性是否为冠心病血瘀证的遗传易患因素。方法2003年10月~2006年11月收集先证者一级亲属中至少有1例冠心病患者的家系40个... 目的利用单体型相对风险分析(HHRR)和连锁不平衡检验(TDT)方法在冠心病血瘀证家系中探讨凝血因子Ⅶ(FⅦ)基因多态性是否为冠心病血瘀证的遗传易患因素。方法2003年10月~2006年11月收集先证者一级亲属中至少有1例冠心病患者的家系40个和健康人家系10个,属CH D血瘀证家系组25个家系81例,其中核心家系18个共60例。PCR-RFLP方法鉴定FⅦ基因M1/M2多态性基因座基因型。在对FⅦ基因多态与冠心病血瘀证基因存在关联的基础上进行HHRR和分析。结果CHD家系FⅦ基因的基因型、等位基因均未见偏离H ardy-Weinberg平衡。在HHRR中,FⅦ的M1基因可能与冠心病血瘀证相关联;对13个满足要求的核心家系进行TDT检验,杂合子父母传递给患病子代的M 1等位基因频率未显著偏离50%。结论在冠心病血瘀证家系中发现FⅦ基因M1/M2多态性与冠心病血瘀证存在关联,但与疾病基因座不存在连锁,说明该基因座可能不是湖南汉族人群冠心病血瘀证的遗传易患基因,而是冠心病血瘀证的发病危险因素之一。 展开更多
关键词 冠心病 血瘀 汉族 湖南 遗传易感性 凝血因子Ⅶ基因 多态性
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双氢青蒿素在Hank's平衡盐溶液中的溶解性和稳定性变化 被引量:2
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作者 曾宝 吴安国 +3 位作者 王春玲 黄孟秋 陈建南 赖小平 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期879-881,共3页
目的考察双氢青蒿素在不同pH、温度、光照环境下,在Hank's平衡盐溶液(Hank's Balanced Salt Solution,HBSS)中的溶解性和稳定性,为其体外吸收与代谢研究提供依据。方法采用反相高效液相色谱法(RP-HPLC)测定含量。结果双氢青蒿素... 目的考察双氢青蒿素在不同pH、温度、光照环境下,在Hank's平衡盐溶液(Hank's Balanced Salt Solution,HBSS)中的溶解性和稳定性,为其体外吸收与代谢研究提供依据。方法采用反相高效液相色谱法(RP-HPLC)测定含量。结果双氢青蒿素在4%甲醇HBSS中有较高的溶解浓度,37℃下,在pH 1,3,5,7.4的HBSS中的溶解浓度大于400μmol/L,pH1,3,5的样品,2 h之内稳定,pH 7.4的样品4 h之内稳定;在碱性HBSS中的稳定性差,容易降解;-20℃下,30 d稳定;避光可以提高其稳定性。结论实验制备的双氢青蒿素HBSS酸性或中性溶液,它们的溶解性和稳定性可以满足体外吸收与代谢研究要求。 展开更多
关键词 双氢青蒿素 溶解性 稳定性 反相高效液相色谱
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血小板活化与冠心病及冠心病血瘀证相关性的现代研究概况 被引量:7
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作者 吴松林 姚祖培 《辽宁中医药大学学报》 CAS 2011年第2期210-212,共3页
血小板活化在冠心病的发生发展中起重要作用,是冠心病血瘀证产生的重要机制之一,P-选择素、GPⅡb/Ⅲa是血小板活化的特异性分子标志物,能较灵敏地反映冠心病的发生发展过程,对冠心病的早期诊断、病情进展、预后判断及抗血栓药物的评估... 血小板活化在冠心病的发生发展中起重要作用,是冠心病血瘀证产生的重要机制之一,P-选择素、GPⅡb/Ⅲa是血小板活化的特异性分子标志物,能较灵敏地反映冠心病的发生发展过程,对冠心病的早期诊断、病情进展、预后判断及抗血栓药物的评估起辅助作用。血瘀证是临床最常见中医证候之一,其指标的增高,可作为冠心病血瘀证的微观辨证指标之一,对中医"胸痹"的诊治有一定的临床意义。 展开更多
关键词 血小板活化 P-选择素 GPⅡb/Ⅲa 冠心病 冠心病血瘀证
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