慢性乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染引起的原发性肝癌涉及多种基因、转录本和蛋白质的相互作用及调控。从单个基因的角度来看,某个基因的表达量的改变只能对肝癌发生发展的局部作出解释而无法从整体行为进行深入和全面的探索...慢性乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染引起的原发性肝癌涉及多种基因、转录本和蛋白质的相互作用及调控。从单个基因的角度来看,某个基因的表达量的改变只能对肝癌发生发展的局部作出解释而无法从整体行为进行深入和全面的探索,无法满足高度复杂性的调控研究需要。筛选乙肝相关性肝癌的基因芯片数据获取差异表达基因后,应用加权基因共表达网络分析算法构建基因共表达网络,识别与肝癌发生相关的模块,利用可视化筛选枢纽基因,并针对枢纽基因进行基因本体富集分析和初步验证。富集分析和文献挖掘一致发现,某些枢纽基因确实与多种癌症的发生与发展存在显著的关联。权重基因共表达网络分析方法被证明是一个高效的系统生物学方法,应用该方法发现了新的HBV相关性肝癌枢纽基因。经实验验证,发现枢纽基因SHARPIN促进细胞迁移。该研究对肝癌发生的调控机制以及发现HBV慢性感染导致肝癌的新型诊断标志物和(或)药物作用靶点提供了新的视野。展开更多
目的在非HBV和非HCV感染肝癌(HCC)患者中探索影响肝癌患者生存的风险因素。方法选择328名自2010年1月至2012年12月在我院进行了肝切除治疗的原发性肝癌患者,其中非HBV和非HCV感染(NBNCHCC)组为69名肝癌患者,病毒性(HBV or HCV)HCC组为25...目的在非HBV和非HCV感染肝癌(HCC)患者中探索影响肝癌患者生存的风险因素。方法选择328名自2010年1月至2012年12月在我院进行了肝切除治疗的原发性肝癌患者,其中非HBV和非HCV感染(NBNCHCC)组为69名肝癌患者,病毒性(HBV or HCV)HCC组为259名肝癌患者。收集肝癌病人的基线临床信息并随访至术后五年的生存状况。两组间术后生存期的比较使用Kaplan-Meier方法,采用多变量Cox比例风险模型评估影响NBNC-HCC肝癌预后独立的因素。结果 NBNC-HCC和病毒性HCC患者间五年总生存期的生存曲线虽并无统计学差异性(Log-rank Chi square=3.45,P=0.063),但在随访三年后,生存期已呈现差异趋势。两组间无癌生存曲线的比较显示,NBNC-HCC患者比病毒性HCC患者有更长的无癌生存期(Log-rank Chi square=15.65,P<0.001)。多变量Cox比例回归分析发现肝脏疾病状态(肝硬化和慢性肝炎患者对比肝相对正常患者),癌细胞血管浸润(阳性对比阴性患者)、病理分级(从Ⅰ到Ⅳ级)均为导致NBNC-HCC患者总生存期降低的危险因素,死亡风险分别增加0.31、0.49和0.19倍。细胞血管浸润(阳性对比阴性患者)、病理分级(从Ⅰ到Ⅳ级)可降低NBNC-HCC患者无癌生存期,风险分别增加0.43和0.17倍。结论 NBNC-HCC比病毒性HCC患者有更长的五年无癌生存期,肝癌细胞血管浸润和高级别病理分级均为导致NBNC-HCC患者总生存期和无癌生存期降低的风险因素。展开更多
目的探讨人工神经网络(artificial neural network,ANN)智能预测方法结合中医证候特征预测老年乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)相关原发性肝癌患者临床预后。方法以408例老年HBV相关原发性肝癌患者为研究对象,收集数据资料并进行...目的探讨人工神经网络(artificial neural network,ANN)智能预测方法结合中医证候特征预测老年乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)相关原发性肝癌患者临床预后。方法以408例老年HBV相关原发性肝癌患者为研究对象,收集数据资料并进行中医证候辨证。以KNIME数据分析平台、数据特征提取算法进行筛选确认,以单时间点神经网络模型预测患者每年时间点(1~5年)预后。根据ROC曲线下面积及其精准度,评估神经网络模型在预测死亡概率方面与患者实际死亡率在各预测时间点的一致性。结果本研究获得该模型的敏感性和特异性分别为86.6%和92.7%。神经网络模型在预测患者死亡概率方面与患者实际死亡率在所有时间点高度一致。结论神经网络模型可提供简便快捷、准确的方法结合中医辨证判定老年HBV相关原发性肝癌患者的预后。展开更多
文摘慢性乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染引起的原发性肝癌涉及多种基因、转录本和蛋白质的相互作用及调控。从单个基因的角度来看,某个基因的表达量的改变只能对肝癌发生发展的局部作出解释而无法从整体行为进行深入和全面的探索,无法满足高度复杂性的调控研究需要。筛选乙肝相关性肝癌的基因芯片数据获取差异表达基因后,应用加权基因共表达网络分析算法构建基因共表达网络,识别与肝癌发生相关的模块,利用可视化筛选枢纽基因,并针对枢纽基因进行基因本体富集分析和初步验证。富集分析和文献挖掘一致发现,某些枢纽基因确实与多种癌症的发生与发展存在显著的关联。权重基因共表达网络分析方法被证明是一个高效的系统生物学方法,应用该方法发现了新的HBV相关性肝癌枢纽基因。经实验验证,发现枢纽基因SHARPIN促进细胞迁移。该研究对肝癌发生的调控机制以及发现HBV慢性感染导致肝癌的新型诊断标志物和(或)药物作用靶点提供了新的视野。
文摘目的在非HBV和非HCV感染肝癌(HCC)患者中探索影响肝癌患者生存的风险因素。方法选择328名自2010年1月至2012年12月在我院进行了肝切除治疗的原发性肝癌患者,其中非HBV和非HCV感染(NBNCHCC)组为69名肝癌患者,病毒性(HBV or HCV)HCC组为259名肝癌患者。收集肝癌病人的基线临床信息并随访至术后五年的生存状况。两组间术后生存期的比较使用Kaplan-Meier方法,采用多变量Cox比例风险模型评估影响NBNC-HCC肝癌预后独立的因素。结果 NBNC-HCC和病毒性HCC患者间五年总生存期的生存曲线虽并无统计学差异性(Log-rank Chi square=3.45,P=0.063),但在随访三年后,生存期已呈现差异趋势。两组间无癌生存曲线的比较显示,NBNC-HCC患者比病毒性HCC患者有更长的无癌生存期(Log-rank Chi square=15.65,P<0.001)。多变量Cox比例回归分析发现肝脏疾病状态(肝硬化和慢性肝炎患者对比肝相对正常患者),癌细胞血管浸润(阳性对比阴性患者)、病理分级(从Ⅰ到Ⅳ级)均为导致NBNC-HCC患者总生存期降低的危险因素,死亡风险分别增加0.31、0.49和0.19倍。细胞血管浸润(阳性对比阴性患者)、病理分级(从Ⅰ到Ⅳ级)可降低NBNC-HCC患者无癌生存期,风险分别增加0.43和0.17倍。结论 NBNC-HCC比病毒性HCC患者有更长的五年无癌生存期,肝癌细胞血管浸润和高级别病理分级均为导致NBNC-HCC患者总生存期和无癌生存期降低的风险因素。
文摘目的探讨人工神经网络(artificial neural network,ANN)智能预测方法结合中医证候特征预测老年乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)相关原发性肝癌患者临床预后。方法以408例老年HBV相关原发性肝癌患者为研究对象,收集数据资料并进行中医证候辨证。以KNIME数据分析平台、数据特征提取算法进行筛选确认,以单时间点神经网络模型预测患者每年时间点(1~5年)预后。根据ROC曲线下面积及其精准度,评估神经网络模型在预测死亡概率方面与患者实际死亡率在各预测时间点的一致性。结果本研究获得该模型的敏感性和特异性分别为86.6%和92.7%。神经网络模型在预测患者死亡概率方面与患者实际死亡率在所有时间点高度一致。结论神经网络模型可提供简便快捷、准确的方法结合中医辨证判定老年HBV相关原发性肝癌患者的预后。