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HCV p7蛋白反式调节基因p7TP2的克隆化及生物信息学分析
被引量:
6
1
作者
袁菊
郭江
+5 位作者
成军
陶明亮
蓝贤勇
洪源
靳亚平
毛羽
《世界华人消化杂志》
CAS
北大核心
2006年第6期581-587,共7页
目的:克隆HCV p7蛋白反式调节未知功能新基因p7TP2,构建其真核表达载体,并应用生物信息学初步探讨其结构及功能.方法:应用PCR技术从HepG2细胞提取的 cDNA扩增p7TP2基因,选用pGEM-T载体进行TA克隆,通过PCR,限制性酶切分析及测序进行鉴定...
目的:克隆HCV p7蛋白反式调节未知功能新基因p7TP2,构建其真核表达载体,并应用生物信息学初步探讨其结构及功能.方法:应用PCR技术从HepG2细胞提取的 cDNA扩增p7TP2基因,选用pGEM-T载体进行TA克隆,通过PCR,限制性酶切分析及测序进行鉴定,再将其亚克隆到真核表达载体 pcDNATM3.1/myc-His A,通过PCR,限制酶切分析进行鉴定,并应用生物信息学初步分析其物理化学性质、蛋白质结构域、功能及染色体定位.结果:成功从HepG2细胞提取的cDNA中扩增出p7TP2基因,编码区为495核苷酸(nt),编码产物为164氨基酸残基(aa),经核苷酸序列数据库(GenBank)同源序列的搜寻,与已知基因序列和蛋白序列之间没有显著同源性,属于未知功能新基因,并成功进行TA克隆,酶切、测序均正确,并进一步亚克隆至pcDNATM3.1/ myc-His A真核表达载体,生物信息学分析此基因位于8q24.3,Mr17 146.5,理论pI:9.26,半衰期为30 h(体外哺乳类网状细胞),属于不稳定蛋白,疏水指数较高,含有潜在的三个螺旋区域,四个β折叠,四个蛋白激酶C磷酸化位点, 一个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,5个N-肉豆蔻酰位点,预测可能为具有不紧密的球蛋白结构,具有信号肽及两个跨膜结构域.结论:发现了HCV p7反式调节新的靶基因, 构建了pcDNATM3.1/myc-HisA真核表达载体.
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关键词
hcv
p7
蛋白
反式调节基因
克隆化
生物
信息学分析
下载PDF
职称材料
丙型肝炎病毒P7蛋白体外原核表达状况的研究
被引量:
1
2
作者
陈可
胡接力
+5 位作者
胡源
张文露
王增产
汤华
黄爱龙
蔡雪飞
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期262-265,共4页
目的:扩增丙型肝炎病毒(Hepatitis Cvirus,HCV)P7蛋白基因,克隆到多个原核表达系统,观察P7蛋白在体外表达的情况,获取具有生物学活性的HCVP7重组蛋白。方法:设计扩增全长HCVP7基因片段的特异引物,以H/FL质粒DNA(含HCV1acDNA全长序列)为...
目的:扩增丙型肝炎病毒(Hepatitis Cvirus,HCV)P7蛋白基因,克隆到多个原核表达系统,观察P7蛋白在体外表达的情况,获取具有生物学活性的HCVP7重组蛋白。方法:设计扩增全长HCVP7基因片段的特异引物,以H/FL质粒DNA(含HCV1acDNA全长序列)为模板,通过PCR扩增全长HCV P7基因,定向克隆到pQE30、pGEX 4T-2、pET32a(+)3种不同类型的原核表达载体中。将重组后包含HCVP7基因的原核表达载体转化表达型大肠杆菌BL21(DE3)pLysS或SG13009(PREP4),并做异丙基硫化-β-D-半乳糖苷(Isopropyl-beta-D-thiogalactoside,IPTG)诱导表达,通过SDS-PAGE和Western blot鉴定HCV P7蛋白原核表达的情况。结论:获得可溶性的重组蛋白GST-HCVP7和Trx-HCVP7,为进一步研究P7蛋白的生物学功能奠定基础。
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关键词
丙型肝炎病毒
p7
蛋白
原核表达
下载PDF
职称材料
题名
HCV p7蛋白反式调节基因p7TP2的克隆化及生物信息学分析
被引量:
6
1
作者
袁菊
郭江
成军
陶明亮
蓝贤勇
洪源
靳亚平
毛羽
机构
北京地坛医院传染病研究所
西北农林科技大学动物科技学院
出处
《世界华人消化杂志》
CAS
北大核心
2006年第6期581-587,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目
No.30371288国家重点基础研究973项目
No.2004CB518908~~
文摘
目的:克隆HCV p7蛋白反式调节未知功能新基因p7TP2,构建其真核表达载体,并应用生物信息学初步探讨其结构及功能.方法:应用PCR技术从HepG2细胞提取的 cDNA扩增p7TP2基因,选用pGEM-T载体进行TA克隆,通过PCR,限制性酶切分析及测序进行鉴定,再将其亚克隆到真核表达载体 pcDNATM3.1/myc-His A,通过PCR,限制酶切分析进行鉴定,并应用生物信息学初步分析其物理化学性质、蛋白质结构域、功能及染色体定位.结果:成功从HepG2细胞提取的cDNA中扩增出p7TP2基因,编码区为495核苷酸(nt),编码产物为164氨基酸残基(aa),经核苷酸序列数据库(GenBank)同源序列的搜寻,与已知基因序列和蛋白序列之间没有显著同源性,属于未知功能新基因,并成功进行TA克隆,酶切、测序均正确,并进一步亚克隆至pcDNATM3.1/ myc-His A真核表达载体,生物信息学分析此基因位于8q24.3,Mr17 146.5,理论pI:9.26,半衰期为30 h(体外哺乳类网状细胞),属于不稳定蛋白,疏水指数较高,含有潜在的三个螺旋区域,四个β折叠,四个蛋白激酶C磷酸化位点, 一个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,5个N-肉豆蔻酰位点,预测可能为具有不紧密的球蛋白结构,具有信号肽及两个跨膜结构域.结论:发现了HCV p7反式调节新的靶基因, 构建了pcDNATM3.1/myc-HisA真核表达载体.
关键词
hcv
p7
蛋白
反式调节基因
克隆化
生物
信息学分析
Keywords
hcv p7 protein
Transregulation
Cloning
Bioinforrnatics analysis
分类号
R373.21 [医药卫生—病原生物学]
下载PDF
职称材料
题名
丙型肝炎病毒P7蛋白体外原核表达状况的研究
被引量:
1
2
作者
陈可
胡接力
胡源
张文露
王增产
汤华
黄爱龙
蔡雪飞
机构
重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室
出处
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第3期262-265,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(编号:81000732
30600405)
重庆市教委科学技术资助项目(编号:KJ100309)
文摘
目的:扩增丙型肝炎病毒(Hepatitis Cvirus,HCV)P7蛋白基因,克隆到多个原核表达系统,观察P7蛋白在体外表达的情况,获取具有生物学活性的HCVP7重组蛋白。方法:设计扩增全长HCVP7基因片段的特异引物,以H/FL质粒DNA(含HCV1acDNA全长序列)为模板,通过PCR扩增全长HCV P7基因,定向克隆到pQE30、pGEX 4T-2、pET32a(+)3种不同类型的原核表达载体中。将重组后包含HCVP7基因的原核表达载体转化表达型大肠杆菌BL21(DE3)pLysS或SG13009(PREP4),并做异丙基硫化-β-D-半乳糖苷(Isopropyl-beta-D-thiogalactoside,IPTG)诱导表达,通过SDS-PAGE和Western blot鉴定HCV P7蛋白原核表达的情况。结论:获得可溶性的重组蛋白GST-HCVP7和Trx-HCVP7,为进一步研究P7蛋白的生物学功能奠定基础。
关键词
丙型肝炎病毒
p7
蛋白
原核表达
Keywords
hcv
p7
protein
prokaryotic expression
分类号
Q571.2 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HCV p7蛋白反式调节基因p7TP2的克隆化及生物信息学分析
袁菊
郭江
成军
陶明亮
蓝贤勇
洪源
靳亚平
毛羽
《世界华人消化杂志》
CAS
北大核心
2006
6
下载PDF
职称材料
2
丙型肝炎病毒P7蛋白体外原核表达状况的研究
陈可
胡接力
胡源
张文露
王增产
汤华
黄爱龙
蔡雪飞
《重庆医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
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