HCV基因型和HCVRNA检测在丙型肝炎病毒母婴传播中的意义

从流行病学角度来探讨丙肝病毒母婴垂直传播的可能性 ,并探讨此传播途径在丙肝流行中的作用。利用 RT- nested PCR方法检测感染率和基因分型 ,采用双脱氧链终止法测定 HCV- PCR产物序列。抗 - HCV阳性 45例母血中 HCV- RNA阳性 38例 (84.44% )。抗 - HCV阳性 30例脐血中 HCV- RNA阳性 1 4例 (46.67% ) ,这 1 4例抗 - HCV阳性的母婴 HCV- RNA均阳性 ,1 4对母婴的基因分型完全一致。以上结果可以表明母婴垂直传播是

芯片技术对南昌地区HIV-HCV合并感染者的HCV基因型研究

目的了解芯片技术对南昌地区HIV-HCV合并感染者的HCV基因型分布。方法 2008年10月至2013年11月期间,在南昌地区就诊的285例HIV感染患者进行HCV筛查,并对HCV阳性患者的基因型进行芯片技术检测,将其检测结果与测序结果进行比对;同时对HIV-HCV合并感染者进行流行病学调查。结果芯片技术可检测出约900拷贝/ml的丙型肝炎病毒的基因型,HIV感染者中,HCV阳性比率为19.3%,HIV-HCV合并感染者的HCV基因型分布情况为1b型41例,2a型9例;3b型1例,6型1例,还有1 b+2a型3例;芯片检测结果与基因测序结果完全一致。结论芯片技术灵敏度高,准确性好,HCV基因型分布以1b基因型为主,其次为2a型;HIV感染者的感染传播途径有了新变化,性传播感染HIV比例在增加,但性传播合并感染的比例较低。

郑州地区不同人群HCV感染及HCV基因型研究

目的 :了解郑州地区不同人群 HCV感染情况及基因分型。方法 :应用酶联免疫检测技术 (EL ISA)检测郑州地区 2 6 6 5例不同人群血清的抗 - HCV情况 ,再对 6 4例抗 - HCV阳性血清用逆转录 -套式多聚酶链反应检测 HCV-RNA。然后对其中 5 3例 HCV- RNA阳性者用限制性片段长度多态性分析法进行基因分型。结果 :抗 - HCV阳性在郑州地区总人口中的发生率是 0 .5 6 %～ 0 .78% ,原发性肝癌患者抗 - HCV的发生率明显高于其他各组。HCV基因型分布HCV- ,HCV- 和 HCV- / ,分别为 90 .5 6 % ,5 .6 6 %和 1.89%。结论 :原发性肝癌患者其 HCV的感染危险较高 ;HCV- 型是本地区的优势株 ;HCV各基因型在不同人口中的分布没有明显差异。(P>0 .0 5 ) HCV基因型可能与丙型肝炎病情轻重有关。

新疆地区维吾尔族人群HCV感染状况及HCV基因型分布调查

对采自新疆地区维吾尔族自然人群、职业献血员、肝硬化、肝细胞癌患者血清分别进行了抗－ＨＣＶＥＬＩＳＡ和ＨＣＶＲＮＡ基因型检测。结果显示：该地区自然人群、职业献血员、肝硬化、肝细胞癌患者抗－ＨＣＶ阳性率分别为２．０％、３５．７％、４２．５％、２０．８％，ＨＣＶ感染者中多数具有输血及献血史，职业献血员、肝硬化和肝细胞癌患者ＨＣＶ感染比例较高。该人群ＨＣＶ基因型以混合型感染（占４９．７％）为主，单一基因型感染以Ⅱ型（占２６．２％）为主，提示当地可能存在严重的不同基因型ＨＣＶ的混合感染。

HCV基因型与丙肝病毒含量及转氨酶的关系

HCV基因型的分布随地区而异 ,同时HCV基因型具有重要临床意义。HCV基因型与感染途径、疾病的严重性及感染后的转归等有关。HCV基因型与HCVRNA含量有明显的相关性 ,HCV基因Ⅰ、Ⅱ型感染者血清HCVRNA含量显著高于HCV基因Ⅲ型感染者。HCV基因Ⅱ型患者肝功能损害明显 ,血清ALT上升水平高 ,此与HCV基因Ⅱ型感染者血清HCVRNA含量显著高于HCV基因Ⅲ型感染者 。

HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型分析

目的使用二代测序技术检测广州地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/丙型肝炎病毒(HCV)混合感染者和HCV感染者HCV基因型,了解本地区HCV基因型的流行特点。方法在233例HCV感染者中,包括95例HIV/HCV混合感染者和138例HCV感染者,使用Illumina Miseq平台PE300模式对HCV Core和NS5B片段进行测序,采用生物信息学分析确定HCV基因型,对测序结果提示混合基因型感染的样本,使用NS5A基因型特异引物进行验证。结果HIV/HCV混合感染者静脉吸毒感染构成比显著高于HCV感染者(77.7%对19.6%P<0.001),HCV感染者输血感染的构成比显著高于HIV/HCV混合感染者(48.6%对3.2%P<0.001);HIV/HCV混合感染者HCV Core基因片段平均数据量为(15456±6689)reads,HCV感染者为(14323±5321)reads,两组无显著差异(P>0.05);HIV/HCV混合感染者HCV NS5B基因片段平均数据量为(16432±3467)reads,HCV感染者为(17611±5632)reads,也无显著差异(P>0.05);本组228例(97.9%)HCV感染者为单一HCV基因型感染,HIV/HCV混合感染者HCV 6a型和3b型感染率显著高于HCV感染者(分别为47.4%对26.8%,P=0.001和13.7%对3.6%,P=0.005),HCV 1b型感染率显著低于HCV感染者(20.0%对59.4%,P<0.001);在233例入组的HCV感染者中,发现5例(2.1%)为混合基因型感染,其中4例为HIV/HCV混合感染者,1例为HCV感染者。结论广州地区HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型构成比存在差异,其临床意义还需要探讨。

广西肝癌高发区壮族自然人群及肝病患者中感染的HCV基因型的对比研究

在广西肝癌高发区壮族自然人群中采集血清标本１７７６人份，同时在该地医院中收集壮族肝病患者血清４５人份。采用ＥＬＩＳＡ方法检测抗－ＨＣＶ、ＰＣＲ技术检测ＨＣＶ－ＲＮＡ，并对其阳性标本（分别为６９、１１份）采用ＨＣＷ型特异性引物进行基因分型。结果显示：当地自然人群中流行的ＨＣＶ基因型以Ⅰ型或Ⅰ型与其它型别的混合感染为主，而病人中则是以Ⅱ型及与Ⅰ型的混合感染为主。此结果表明在不同特征的人群中ＨＣＶ基因型的分布明显不同。

HIV感染药瘾者体内的丙肝病毒难以清除与HCV基因型无关

据Medscape．com10月17日报道（原载J Infect Dis2005：192：1245-1248），西班牙研究组在观察患有HIV的静脉注射毒品人群时发现，同时感染多种丙型肝炎病毒株（HCV）没有使干扰素治疗的疗效降低。

奥比帕利联合达塞布韦治疗基因1b型慢性丙型肝炎患者疗效研究

目的探讨应用奥比帕利联合达塞布韦治疗基因1b型慢性丙型肝炎(CHC)患者的疗效。方法2020年1月~2022年1月我院收治的106例基因1b型CHC患者,其中观察组53例接受奥比帕利联合达塞布韦治疗,对照组53例接受达塞布韦单药治疗,两组治疗持续12周。采用实时荧光定量RT-PCR法检测血清HCV RNA载量,考核超快速病毒学应答(SRVR)、快速病毒学应答(RVR)、治疗结束病毒学应答(ETVR)和随访12周时持续病毒学应答(SVR)。结果观察组SRVR、RVR、ETVR和SVR分别为88.7%、94.3%、100.0%和100.0%,显著高于对照组(67.9%、75.4%、83.0%和90.5%,P<0.05);在治疗12周结束时,观察组血清ALT和AST水平分别为(30.8±4.6)U/L和(29.7±2.4)U/L,均显著低于对照组【分别为(52.2±5.1)U/L和(48.1±3.6)U/L,P<0.05】;在治疗期间,观察组不良反应发生率为18.7%,显著高于对照组的9.4%(P<0.05)。结论应用奥比帕利联合达塞布韦治疗基因1b型CHC患者疗效确切,可有效改善肝功能,提高血清HCV RNA转阴率,且安全性尚可。

不同感染途径慢性丙型肝炎患者HCV基因型分布的差异

目的 探讨丙型肝炎病毒 (HCV)基因型在中国部分城市输血与非输血途径感染者之间的分布。方法 对来自中国南北地区 9个城市的慢性HCV肝炎患者的血清 ,用 5′非编码区酶切分型方法进行HCV基因分型 ,分析HCV基因型在不同地区和感染途径之间的分布差异。结果 在 2 19例慢性HCV肝炎血清中 ,有 2 14例 (97 7% )检测出HCV基因型 ,其中 197例为单基因型HCV感染 ,主要的HCV流行株为 1b(76 6 4 % )和 2a(18 2 2 % ) ,并有 5 14 %的患者感染基因 3b型 ,且首次在中国检测出 4a型。HCV在中国南北地区城市的分布差异无显著意义 ,但输血感染者和非输血感染者之间的HCV基因型分布差异有显著意义 ,输血感染者中 ,93 88%为单基因型HCV感染 ,1b占 76 87% ,高于非输血途径感染患者中单基因型HCV感染百分率 (86 5 7% )和 1b的感染百分率 (5 8 2 1% ) ,非输血感染者中的混合HCV基因型比例 (13 4 3% )高于输血感染者 (6 12 % )。结论 中国南北部分地区的HCV基因型分布差异无显著意义 ,但经输血感染和非输血感染的慢性丙型肝炎患者之间的HCV基因型分布差异有显著意义。

云南和山西无偿献血人群HCV部分基因的核苷酸序列测定及基因分型

目的了解云南和山西2地无偿献血人群丙型肝炎病毒(HCV)的基因型分布及其差异。方法采用荧光定量PCR(Q-PCR),对所收集的203份ELISA检测抗-HCV阳性的无偿献血者标本(云南102份,山西101份)做核酸检测,对核酸阳性的标本做E1基因扩增和测序;E1基因阴性者,进一步做NS5B基因扩增;采用DNASTAR、Bi-oedit和Mega4等软件对E1、NS5B基因进行分析及分子进化研究。结果203份ELISA检测抗-HCV阳性的无偿献血者标本中,云南102份标本经Q-PCR检测出核酸阳性55份,从中扩增出E1基因43份,补做NS5B基因扩增获得阳性结果8份;山西省101份标本经Q-PCR检测出阳性46份,从中扩增出E1基因33份,补做NS5B基因扩增获得阳性结果6份。云南省献血者HCV基因型(亚型)可分为7种:1b[7.84%(4/51)]、2a[13.73%(7/51)]、3a[17.65%(9/51)]、3b[41.18%(21/51)]、6a[7.84%(4/51)]、6n[9.80%(5/51)]和6v[1.96%(1/51)];山西省献血者HCV基因型(亚型)较简单,可分为3种:1b[89.74%(35/39)]、2a[7.69%(3/39)]和3b[2.56%(1/39)]。结论我国云南和山西2地无偿献血人群中的HCV基因型(亚型)的分布存在明显的差异。

HCV不同基因型对慢性丙型肝炎抗病毒治疗疗效的影响

目的探讨干扰素联合利巴韦林治疗慢性丙型肝炎患者临床疗效的相关影响因素.方法对110例慢性丙型肝炎患者进行PEG-IFNα-2a 180μg/周联合RBV 800~1200 mg/d的标准治疗,并完成治疗后24周随访,同时分析HCV基因型、HCV-RNA定量对持续病毒学应答（SVR）的影响.应用罗氏试剂检测丙肝病毒定量,应用反转录-套式聚合酶链反应（PT-PCR）法检测HCV基因型.结果在110例进行标准联合治疗、并完成治疗后24周随访的慢性丙型肝炎患者中,68例患者获得SVR.其中,HCV基因1b型感染者SVR率为51.4%（37/72）,HCV基因N-1b型感染者SVR率为81.5%（31/38）;基线HCV-RNA水平〈1.0×10~5IU/m L的患者SVR率为71.2%（42/59）,基线HCV-RNA水平≥1.0×10~5IU/m L的患者SVR率为50.9%（26/51）.结论非1b基因型SVR率高于1b基因型;基线低病毒RNA水平（血清HCV-RNA水平〈1.0×10~5IU/m L）SVR率高于基线高病毒RNA水平（血清HCV-RNA水平≥1.0×10~5IU/m L）.

深度测序法在检测HCV不同基因型/亚型混合感染中的应用

目的将深度测序法用于HCV感染者中不同基因型/亚型混合感染的检测。方法 2例HCV RNA阳性血浆标本(标记为1和2号标本),以NS5B和E1编码区为目的基因,经RT-PCR扩增后做sanger核苷酸序列测定,对其做基因分型发现2个编码区的分型结果后,重复3次NS5B基因PCR扩增;合并3次PCR产物用Ion TorrentTM半导体测序仪做深度测序。获得的序列用Geneious软件的"The map to reference algorithm"和"De novo assembly"2种方法做序列分析和比对,并用Mega 5构建进化树。结果 sanger测序:1、2号标本NS5B基因分型均为1b,E1基因分型均为2a;深度测序:2个标本均为HCV 1b与2a混合感染,其中The map to reference algorithm(Geneious)方法显示,1号标本中1b占92.7%、2a占3.8%、没有比对到的序列(unused seq)占3.5%,2号标本相应为84.3%、5.4%,没有比对到的序列占10.3%;De novo assembly(Geneious)方法显示,1号标本中1b占96.3%、2a占3.7%,2号标本相应为94.1%、5.9%。结论深度测序技术可以精确地获得HCV混合感染的不同基因型/亚型信息,De novo assembly(Geneious)分析HCV的深度测序数据更为精确和直观。

我国HCV感染株基因分型及其意义的研究

应用型特异性探针杂交法及型特异性引物法两种ＨＣＶ基因分型方法对我国ＨＣＶ 感染株基因型别构成特点及其意义进行了初步研究。结果表明，１．我国 ＨＣＶ基因型表现为多种型别共存，但以 Ｋ１（１ｂ）型和Ｋ２（２）型为主，混合型比例亦较高；２．结合临床背景分析，Ｋ１型似与活动性肝病关系密切，慢性迁延性肝病及所谓合格献血员以Ｋ２型为主，混合型多与多次受血、透析有关；３．输血－受血配对研究结果提示，受血者ＨＣＶ基因型与所输注污染的血液或血制品ＨＣＶ基因型有良好的一致性，基因分型方法可以作为调查ＨＣＶ传播途径的重要手段。

HCV基因分型研究进展

HCV基因型无论是对 HCV的基础研究、临床治疗还是预防 ,都有着重要的意义。HCV的基因分型方法有很多 ,但都不是完善的 ,唯一的参比标准是 HCV基因组测序。但各种方法对不同 HCV领域的工作仍是必要的 ,目前 HCV可分为 11个基因型 。

经核酸试验确认HCV RNA阳性HCV抗体阴性波兰献血者的基因型及亚型频率

背景 从2002年起，波兰对献血员不仅仅要进行HCV抗体检测，还要检测HCVRNA或HCV核心抗原。这可鉴别无症状的近期感染还无HCV抗体的(窗口期)献血者。本研究旨在比较窗口期献血者、HCV抗体阳性献血者和慢性丙型肝炎病人HCV基因型及亚型的分布状态。研究设计和方法总共对237万献血者进行了HCVRNA检测，对34万献血者进行了HCV核心抗原检测。

哈尔滨地区HCV RNA基因分型

自从1989年choo等首先建立了血清抗-HCV特异性检测方法以来,仅短短几年,HCV分子生物学的研究已有了长足的进展。经基因序列分析,根据毒株核苷酸序列的差异,可区分HCV的不同基因型。为了解哈尔滨地区的HCV基因型,我们对115份HCV RNA阳性血清聚合酶链反应产物进行酶切分析,兹将检测结果报告如下。

吡格列酮联合治疗合并胰岛素抵抗的HCV基因1型感染患者

临床上对于存在胰岛素抵抗的慢性丙型肝炎患者，抗病毒治疗效果差，因此也加速了其肝纤维化的进程。研究表明，对于HCV基因4型感染合并胰岛素抵抗的患者来说，吡格列酮联合聚乙二醇干扰素／利巴韦林给药可以增强胰岛素敏感性，提高病毒学应答率，但这一研究结果是否适用于HCV基因型1型感染的患者尚不明确。