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HD2基因调控拟南芥下胚轴发育的功能研究
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作者 吴羚阁 陈功春 林娟 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期174-185,共12页
为探究组蛋白去乙酰化酶HD2基因在拟南芥下胚轴发育中的调控作用,本研究采用野生型(Col-0)、HD2突变体以及过表达植株为材料,研究其在1/2MS以及1/2MS+100 mmol/L甘露醇培养中下胚轴的表型特征,并结合转录组测序数据进一步分析.实验结果... 为探究组蛋白去乙酰化酶HD2基因在拟南芥下胚轴发育中的调控作用,本研究采用野生型(Col-0)、HD2突变体以及过表达植株为材料,研究其在1/2MS以及1/2MS+100 mmol/L甘露醇培养中下胚轴的表型特征,并结合转录组测序数据进一步分析.实验结果显示,四种过表达株系下胚轴长度较Col-0长,伸长百分比为7.1%~19.5%,差异显著;甘露醇处理后,过表达植株下胚轴较Col-0更长,伸长百分比为14.6%~32.8%,差异更加显著,缩短幅度也更小.hd2a/hd2b和hd2a/hd2c双基因突变体植株在有无甘露醇时,下胚轴长度均显著短于Col-0,但干旱胁迫后变短幅度无明显增加.转录组数据揭示,HD2基因调控光合系统响应基因影响植株暗形态建成反应,从而影响下胚轴发育.甘露醇处理后,HD2基因诱导产生非生物刺激响应因子,帮助下胚轴抵抗不良环境.综上所述,HD2基因在拟南芥下胚轴发育中承担重要调控作用. 展开更多
关键词 拟南芥 下胚轴 转录组 干旱胁迫 hd2去乙酰化酶基因
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HD2系列轴向柱塞泵的维修与调试 被引量:2
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作者 王文 寇子明 程仰瑞 《煤矿机械》 北大核心 2007年第12期158-160,共3页
分析了单轨吊液压驱动系统HD2系列轴向柱塞泵的结构原理和常见故障及产生原因,给出了柱塞泵关键零部件配流盘、缸体、柱塞和滑靴及变量机构的维修措施,并介绍了修理后柱塞泵的加载调试方法。
关键词 hd2系列轴向柱塞泵 磨损 维修 调试
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水稻组蛋白脱乙酰化酶HD2 HDACs蛋白质的生物信息学分析 被引量:1
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作者 符稳群 林莹 +5 位作者 黄惠玲 张云珊 池华 杨晓琦 张敏敏 张振华 《漳州师范学院学报(自然科学版)》 2009年第4期92-98,114,共8页
HD2 HDACs家族成员是植物特异性的组蛋白脱乙酰化酶并参与基因的转录调控.本研究利用生物信息学方法对水稻组蛋白脱乙酰化酶HD2 HDACs家族成员(HDT701、HDT702、HDT2201和HDT2202)的生物学功能进行研究.结果表明,HD2 HDACs家族成员位于... HD2 HDACs家族成员是植物特异性的组蛋白脱乙酰化酶并参与基因的转录调控.本研究利用生物信息学方法对水稻组蛋白脱乙酰化酶HD2 HDACs家族成员(HDT701、HDT702、HDT2201和HDT2202)的生物学功能进行研究.结果表明,HD2 HDACs家族成员位于不同的染色体上,分布于细胞的不同部位;它们编码的蛋白均含有依赖于cAMP-和cGMP的蛋白激酶、蛋白激酶C、酪蛋白激酶II与酰胺化4个相同的位点;它们均无跨膜区,都为不稳定的亲水性蛋白质,都无信号肽.多序列比对发现粳稻与籼稻HD2 HDACs的同源性非常高;水稻HD2 HDACs蛋白质的结构域比较特殊;这些蛋白可能参与植物的基因复制、信号传导、转录过程和免疫应答等过程. 展开更多
关键词 组蛋白脱乙酰化酶 hd2 HDACS 生物信息学 水稻
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gRNA二级结构对拟南芥HD2基因CRISPR/Cas9编辑率的影响
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作者 黄轩雅 欧艺鹏 +1 位作者 魏淑怡 林娟 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期146-157,共12页
近年来,利用基因编辑工具编辑特定基因逐渐成为一种获得突变体的主要方法。CRISPR/Cas9编辑技术是目前最新和最高效的基因编辑技术。然而,这一技术在植物中的编辑率受到很多因素的影响,例如如何设计gRNA以及如何避免脱靶效应等。为了探... 近年来,利用基因编辑工具编辑特定基因逐渐成为一种获得突变体的主要方法。CRISPR/Cas9编辑技术是目前最新和最高效的基因编辑技术。然而,这一技术在植物中的编辑率受到很多因素的影响,例如如何设计gRNA以及如何避免脱靶效应等。为了探究gRNA的二级结构对拟南芥基因编辑的影响,我们选择了拟南芥基因组中的组蛋白去乙酰化酶(HDACs)基因家族中一个植物特有的亚家族(HD2)为靶基因,通过设计这一亚家族中3个HD2基因不同的CRISPR/Cas9靶点,观察不同gRNA接头二级结构对CIRSPR/Cas9编辑率的影响。结果显示:不同gRNA接头二级结构对基因的编辑率会有一定的影响,当二级结构由一段单链RNA、5个茎环、2个突环和3个发夹环组成的时候,编辑率最高。该研究可为后续人们使用以tRNA为策略设计gRNA的CRISPR/Cas9工具时选择合适的靶点,为提高基因编辑率提供基础。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 gRNA RNA二级结构 hd2基因亚家族 编辑率
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26.4mm厚规格X80HD2管线钢的开发 被引量:1
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作者 刘志刚 《山东冶金》 CAS 2015年第6期9-13,共5页
以低C高Mn为基础,添加Nb、Cr、Ni、Ti、Cu等合金进行合金体系设计,采用洁净钢冶金技术,通过强化并结合两阶段轧制和ACC多路径层流冷却工艺来保证钢板的强度和高韧性,开发了大应变X80HD2管线钢。钢板具有铁素体+贝氏体双相组织,横向屈... 以低C高Mn为基础,添加Nb、Cr、Ni、Ti、Cu等合金进行合金体系设计,采用洁净钢冶金技术,通过强化并结合两阶段轧制和ACC多路径层流冷却工艺来保证钢板的强度和高韧性,开发了大应变X80HD2管线钢。钢板具有铁素体+贝氏体双相组织,横向屈服强度470-568 MP,抗拉强度660-760 MPa,屈强比0.65-0.79;纵向屈服强度455-540 MPa,抗拉强度660-727 MPa,屈强比0.64-0.77;Rt1.5/Rt0.5均〉1.13,Rt2.0/Rt1.0均〉1.06。各项强度指标满足标准要求,各项性能指标呈正态分布。结合新开发的制管工艺,使批量生产的X80HD2抗大变形焊管具有良好的强度、大的均匀伸长率和应力比等优点。 展开更多
关键词 管线钢 X80hd2 厚规格 大应变 双相组织 韧性
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地震断裂带穿越用X80 HD2抗大变形钢管对接环焊缝焊接工艺质量分析及控制 被引量:1
6
作者 吴强 夏翾 《石油工业技术监督》 2017年第7期17-21,共5页
介绍了西气东输三线西段工程X80 HD2抗大变形钢管力学性能、焊接接头技术要求、主要焊接方法及焊接热影响区存在的软化问题。针对X80 HD2抗大变形钢管焊接难点,通过对焊条电弧焊、半自动焊和自动焊,以及上述焊接方法的组合焊接方法、质... 介绍了西气东输三线西段工程X80 HD2抗大变形钢管力学性能、焊接接头技术要求、主要焊接方法及焊接热影响区存在的软化问题。针对X80 HD2抗大变形钢管焊接难点,通过对焊条电弧焊、半自动焊和自动焊,以及上述焊接方法的组合焊接方法、质量特性进行分析,同时结合西气东输三线工程实际,优化选择焊接工艺,确定补强覆盖焊接法为X80 HD2抗大变形钢管对接环焊缝焊接工艺。在焊接质量管理方面,通过焊工资格的审定、上岗资格的认定、上岗资格证管理,开展"双证"管理;在焊接过程质量管理方面,通过对焊接工艺补强覆盖、流水作业模式等影响焊接质量的各个关键环节实施有效控制,并针对补强覆盖存在的问题分析原因、制定措施,使焊接质量达到了预期效果。 展开更多
关键词 X80hd2抗大变形钢管 补强覆盖 焊接工艺 质量控制
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小麦HD2基因家族的全基因组鉴定及热胁迫下的表达模式分析
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作者 李梓彰 丁宁 +3 位作者 田文 郑文杰 张珊 闻珊珊 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期1166-1173,共8页
组蛋白去乙酰化酶(histonedeacetylase,HDAC)负责去除组蛋白上的乙酰基团,在生物体的生长发育和非生物胁迫响应方面具有重要作用。本研究根据其他植物中HD2基因家族序列,利用生物信息学方法对小麦中的HD2基因进行鉴定,并对其基本生物学... 组蛋白去乙酰化酶(histonedeacetylase,HDAC)负责去除组蛋白上的乙酰基团,在生物体的生长发育和非生物胁迫响应方面具有重要作用。本研究根据其他植物中HD2基因家族序列,利用生物信息学方法对小麦中的HD2基因进行鉴定,并对其基本生物学特性和调控网络等进行分析。结果表明,有12个小麦HD2基因被鉴定,并根据蛋白质序列C端是否含有锌指结构将其分为Group1和Group2两个亚家族;这些基因的编码蛋白均定位于细胞核内。利用WheatExp数据和RNA-seq数据对小麦HD2基因在不同组织和不同逆境胁迫下的表达模式进行分析,结果表明,小麦HD2基因在不同组织和不同逆境下均存在差异表达。同时,利用qRT-PCR技术对其在小麦12个生长发育时期的叶片中响应热胁迫的表达模式进行分析,结果表明,其在小麦挑旗期和抽穗期表达量明显上升。 展开更多
关键词 小麦 hd2基因家族 全基因组鉴定 热胁迫
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冷却工艺对X80HD2管线钢组织和性能的影响
8
作者 牛延龙 《山东冶金》 CAS 2015年第4期35-38,44,共5页
试验分析了开冷温度、冷却速度和终冷温度对X80HD2管线钢组织和性能的影响,结果表明,在不同开冷温度下,均能得到铁素体和贝氏体双相组织,随开冷温度的降低,铁素体含量增多,M/A含量增加,屈服强度下降,Rt0.5/Rm下降,均匀伸长率降低;随冷... 试验分析了开冷温度、冷却速度和终冷温度对X80HD2管线钢组织和性能的影响,结果表明,在不同开冷温度下,均能得到铁素体和贝氏体双相组织,随开冷温度的降低,铁素体含量增多,M/A含量增加,屈服强度下降,Rt0.5/Rm下降,均匀伸长率降低;随冷却速度提高,贝氏体组织细化,屈服强度增加,Rt0.5/Rm升高,均匀伸长率降低;随终冷温度降低,M/A细化,抗拉强度降低,Rt0.5/Rm升高,加工硬化速率升高,均匀伸长率升高。最佳冷却工艺参数:开冷温度690℃,冷却速度15℃/s,终冷温度400℃。 展开更多
关键词 X80hd2管线钢 组织 力学性能 开冷温度 冷却速度 终冷温度
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Cr-Nb-Cu系X80HD2大应变管线钢冷却转变规律研究
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作者 牛延龙 《宽厚板》 2015年第5期6-10,共5页
研究26.4 mm厚度X80HD2大应变管线钢在未变形和变形条件下的连续冷却转变行为。通过Gleeble-2000热模拟试验机与光学显微镜(OM)、扫描电镜(SEM)、透射电子显微镜(TEM)等相结合的方法,测定未变形和变形奥氏体的连续冷却转变曲线,并对不... 研究26.4 mm厚度X80HD2大应变管线钢在未变形和变形条件下的连续冷却转变行为。通过Gleeble-2000热模拟试验机与光学显微镜(OM)、扫描电镜(SEM)、透射电子显微镜(TEM)等相结合的方法,测定未变形和变形奥氏体的连续冷却转变曲线,并对不同冷速和变形条件下的组织进行观察分析。结果表明:冷速较低时,均得到以粒状贝氏体为主的多相组织,高冷速下得到以板条贝氏体为主的多相组织;Cr、Cu等元素能够增强过冷奥氏体稳定性,抑制先共析铁素体的形成,扩大贝氏体的形成区间;第二相粒子析出强化,晶粒细化、组织类型及比例的变化是显微硬度随冷却速度增大的主要原因。 展开更多
关键词 X80hd2管线钢 连续冷却转变 第二相析出 热变形
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NaCl可促进HD2家族基因对拟南芥根长发育的调控
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作者 陈功春 吴羚阁 林娟 《复旦学报(自然科学版)》 CAS 2024年第3期369-379,共11页
本论文通过拟南芥HD2家族基因突变体和转基因过表达株系研究了该家族成员对主根发育的影响,以及对NaCl处理的响应。结果显示,在正常培养条件下,hd2q突变体可以导致主根缩短5.29%,而HD2过表达株系可以促进主根伸长12.94%~28.24%。100 mmo... 本论文通过拟南芥HD2家族基因突变体和转基因过表达株系研究了该家族成员对主根发育的影响,以及对NaCl处理的响应。结果显示,在正常培养条件下,hd2q突变体可以导致主根缩短5.29%,而HD2过表达株系可以促进主根伸长12.94%~28.24%。100 mmol/L NaCl处理后,上述表型差异更加显著。此外,在主根的根尖处,HD2家族成员均有蛋白积累,经过100 mmol/L NaCl处理后,4个成员在根中的转录水平和蛋白积累水平都有显著提高,其中HD2A最为明显。研究表明,HD2家族成员在正常培养和盐处理条件下均能促进主根的伸长,这可能与HD2影响分生区细胞的分裂和伸长区细胞的伸长有关。该研究为进一步探究HD2家族基因在植物根系发育和逆境响应中的作用提供了基础。 展开更多
关键词 hd2家族 组蛋白去乙酰化酶 根发育 盐处理
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HD2^+,H3^+和D3^+与固体相互作用和三体尾流效应 被引量:6
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作者 朱洲森 缪竞威 +2 位作者 袁学东 师免恭 廖雪花 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第10期6240-6248,共9页
从分子离子H3+及其氘化同位素分子离子D3+和HD2+与超薄固体膜相互作用发生库仑爆炸为基础,分析讨论了H3+,D3+和HD2+三种分子离子的形成机理,根据产物能谱分布,利用库仑爆炸技术确定了同位素分子离子HD2+的结构形式,给出具体核间距数值.... 从分子离子H3+及其氘化同位素分子离子D3+和HD2+与超薄固体膜相互作用发生库仑爆炸为基础,分析讨论了H3+,D3+和HD2+三种分子离子的形成机理,根据产物能谱分布,利用库仑爆炸技术确定了同位素分子离子HD2+的结构形式,给出具体核间距数值.并确定在实验中不存在线状结构的HD2+.提出一种三原子分子离子和固体相互作用中尾流效应的处理方式,通过和实验结果做比较发现这是一种非常理想的处理三体尾流效应的模式,并用之进一步确认了HD2+的结构形状.文章对H3+,D3+和HD2+三种分子离子的实验结果做了对比和讨论. 展开更多
关键词 微团簇hd2^+ H3^+和D3^+ 库仑爆炸 三体尾流势 团簇结构
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预应变量和时效对X80HD2钢厚壁大变形直缝焊管低温冲击性能的影响 被引量:4
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作者 李亮 杨力能 +3 位作者 张庶鑫 秦长毅 卫尊义 张华 《金属热处理》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期86-91,共6页
通过拉伸、冲击试验研究了预应变量和时效温度对厚壁X80HD2大变形直缝埋弧焊管低温冲击韧性的影响,测定了不同应变时效条件下的夏比冲击吸收能量和剪切断面率,用扫描电镜观察了不同温度下冲击断口形貌。结果表明,随着预应变量的提高和... 通过拉伸、冲击试验研究了预应变量和时效温度对厚壁X80HD2大变形直缝埋弧焊管低温冲击韧性的影响,测定了不同应变时效条件下的夏比冲击吸收能量和剪切断面率,用扫描电镜观察了不同温度下冲击断口形貌。结果表明,随着预应变量的提高和时效温度的增加,夏比冲击吸收能量和剪切断面率逐渐减小,增加预应变量对低温冲击韧性的恶化效果高于提高时效温度;此外,增加预应变量将加大断口分离的倾向性,提高时效温度则对断口分离倾向性的影响不显著;增加预应变量和提高时效温度均使冲击断口发生准解理断裂的倾向增加。 展开更多
关键词 X80hd2钢焊管 预应变量 时效温度 冲击性能 断口形貌
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Combinations of Hd2 and Hd4 genes determine rice adaptability to Heilongjiang Province, northern limit of China 被引量:13
13
作者 Xiufeng Li Huazhao Liu +8 位作者 Maoqing Wang Hualong Liu Xiaojie Tian Wenjia Zhou Tianxiao Lü Zhenyu Wang Chengcai Chu Jun Fang Qingyun Bu 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2015年第8期698-707,共10页
Heading date is a key trait in rice domestication and adaption, and a number of quantitative trait loci(QTLs)have been identified. The rice(Oryza sativa L.) cultivars in the Heilongjiang Province, the northernmost... Heading date is a key trait in rice domestication and adaption, and a number of quantitative trait loci(QTLs)have been identified. The rice(Oryza sativa L.) cultivars in the Heilongjiang Province, the northernmost region of China,have to flower extremely early to fulfill their life cycle.However, the critical genes or different gene combinations controlling early flowering in this region have not been determined. QTL and candidate gene analysis revealed that Hd2/Ghd7.1/Os PRR37 plays a major role in controlling rice distribution in Heilongjiang. Further association analysis with a collection of rice cultivars demonstrated that another three major QTL genes(Hd4/Ghd7, Hd5/DTH8/Ghd8, and Hd1)also participate in regulating heading date under natural long day(LD) conditions. Hd2/Ghd7.1/Os PRR37 and Hd4/Ghd7 are two major QTLs and function additively. With the northward rice cultivation, the Hd2/Ghd7.1/Os PRR37 and Hd4/Ghd7 haplotypes became non-functional alleles. Hd1 might be non-functional in most Heilongjiang rice varieties,implying that recessive hd1 were selected during local rice breeding. Non-functional Hd5/DTH8/Ghd8 is very rare, but constitutes a potential target for breeding extremely early flowering cultivars. Our results indicated that diverse genetic combinations of Hd1, Hd2, Hd4, and Hd5 determined the different distribution of rice varieties in this northernmost province of China. 展开更多
关键词 RICE heading date HDL hd2 Hd4 Hd5
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HD200型钢桥在桥梁施工中的应用 被引量:3
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作者 江国兴 《公路》 北大核心 2004年第4期79-80,共2页
对 HD2 0 0型装配式公路钢桥与“32 1”钢桥对结构、受力特性做了比较、分析 ,说明 HD2 0 0型钢桥在桥梁施工中具有广泛的应用空间。
关键词 hd2OO型钢桥 桥梁施工 应用 受力特性 结构
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ProTools HD2音频工作站在影视制作中的应用
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作者 李瑞海 《音响技术》 2003年第3期52-53,共2页
计算机数字音频处理技术作为20世纪90年代新出现的声音制作手段,刚一出现就显示出强大的生命力,迅速渗透到传统影视媒体制作领域,成为当代媒体声音制作的重要的先进手段.数字音频工作站(Digital Audio Workstation简称DAW)是一种用来处... 计算机数字音频处理技术作为20世纪90年代新出现的声音制作手段,刚一出现就显示出强大的生命力,迅速渗透到传统影视媒体制作领域,成为当代媒体声音制作的重要的先进手段.数字音频工作站(Digital Audio Workstation简称DAW)是一种用来处理、交换音频信息的计算机系统,它是随着数字音频技术的发展和计算机技术的突飞猛进将两者相结合的新型设备. 展开更多
关键词 数字音频工作站 影视制作 应用 ProTools|hd2 声音编辑 影片混录
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Blockchain-Based Cognitive Computing Model for Data Security on a Cloud Platform
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作者 Xiangmin Guo Guangjun Liang +1 位作者 Jiayin Liu Xianyi Chen 《Computers, Materials & Continua》 SCIE EI 2023年第12期3305-3323,共19页
Cloud storage is widely used by large companies to store vast amounts of data and files,offering flexibility,financial savings,and security.However,information shoplifting poses significant threats,potentially leading... Cloud storage is widely used by large companies to store vast amounts of data and files,offering flexibility,financial savings,and security.However,information shoplifting poses significant threats,potentially leading to poor performance and privacy breaches.Blockchain-based cognitive computing can help protect and maintain information security and privacy in cloud platforms,ensuring businesses can focus on business development.To ensure data security in cloud platforms,this research proposed a blockchain-based Hybridized Data Driven Cognitive Computing(HD2C)model.However,the proposed HD2C framework addresses breaches of the privacy information of mixed participants of the Internet of Things(IoT)in the cloud.HD2C is developed by combining Federated Learning(FL)with a Blockchain consensus algorithm to connect smart contracts with Proof of Authority.The“Data Island”problem can be solved by FL’s emphasis on privacy and lightning-fast processing,while Blockchain provides a decentralized incentive structure that is impervious to poisoning.FL with Blockchain allows quick consensus through smart member selection and verification.The HD2C paradigm significantly improves the computational processing efficiency of intelligent manufacturing.Extensive analysis results derived from IIoT datasets confirm HD2C superiority.When compared to other consensus algorithms,the Blockchain PoA’s foundational cost is significant.The accuracy and memory utilization evaluation results predict the total benefits of the system.In comparison to the values 0.004 and 0.04,the value of 0.4 achieves good accuracy.According to the experiment results,the number of transactions per second has minimal impact on memory requirements.The findings of this study resulted in the development of a brand-new IIoT framework based on blockchain technology. 展开更多
关键词 Blockchain Internet of Things(IoT) blockchain based cognitive computing Hybridized Data Driven Cognitive Computing(hd2C) Federated Learning(FL) Proof of Authority(PoA)
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利用CRISPR/Cas9创造早熟香味水稻 被引量:21
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作者 周文甲 田晓杰 +6 位作者 任月坤 魏祥进 高扬 谢黎虹 刘华招 卜庆云 李秀峰 《土壤与作物》 2017年第2期146-152,共7页
黑龙江省是我国最大的水稻种植区,近年来水稻种植面积不断增加,为加快高纬度、低积温的地区品种选育进程,本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术对第二积温带主栽品种绥粳14的抽穗期基因Hd2、香味基因Badh2进行编辑。通过T_1代的分子鉴定,... 黑龙江省是我国最大的水稻种植区,近年来水稻种植面积不断增加,为加快高纬度、低积温的地区品种选育进程,本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术对第二积温带主栽品种绥粳14的抽穗期基因Hd2、香味基因Badh2进行编辑。通过T_1代的分子鉴定,Hd2和Badh2基因被敲除而且基因型纯合。田间鉴定表明,转基因抗性标记也被成功剔除的两个株系,绥粳14-d1和绥粳14-d2,比绥粳14提早13天左右。利用咀嚼法、氢氧化钾浸泡法和气相色谱-质谱联用技术(GCMS)测定香味,结果显示绥粳14-d1和绥粳14-d2中香味物质2-乙酰-1-吡咯啉(2-AP)含量显著高于绥粳14。综合以上结果,本研究利用基因编辑技术,成功获得了改良的抽穗期缩短香米品种,为早熟、优质水稻品种的选育提供了理论指导,加速了育种进程。 展开更多
关键词 水稻 香味 Badh2 抽穗期 hd2 CRISPR/Cas9
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论DVBS系统局地文件与ARC/INFO软件平台的技术整合方案
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作者 刘劲松 施立红 +1 位作者 王卫 张磊 《河北遥感》 2008年第2期13-16,共4页
经DVBS数据接收系统投影处理后,FYlD和NOAA影像被存储为LDF格式的局地文件,MODIS影像被存为HD2格式文件,这两种格式的数据文件不能为AgCINFO、EBDAS等软件直接读取,制约相关地学分析工作的展开。本文综合运用DVBSImg、ENVl4.2、EBD... 经DVBS数据接收系统投影处理后,FYlD和NOAA影像被存储为LDF格式的局地文件,MODIS影像被存为HD2格式文件,这两种格式的数据文件不能为AgCINFO、EBDAS等软件直接读取,制约相关地学分析工作的展开。本文综合运用DVBSImg、ENVl4.2、EBDASIMAGINE8.6和AgC/GIS8.1等软件,摸索出一套将DVBS局地文件转换为具有特定投影参数的IMAGE格式的技术路线,实现了MODIS、FYlD和NOAA等影像数据与ARC/INFO、EBDAS等地理信息系统软件平台的技术整合,为不同学科组对卫星影像数据的后续开发、成果交流及综合创造了有利条件。 展开更多
关键词 DVBS hd2 LDF IMAGE 格式转换
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水稻OsHDT703基因的可变剪接体分析 被引量:2
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作者 邹志明 邹海霞 +3 位作者 张焕 李绍波 王鑫 欧阳解秀 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2019年第4期9-15,共7页
为了克隆水稻HD2蛋白基因OsHDT703,并分析其存在的可变剪接体。利用生物信息学分析,结合RT-PCR、TA克隆和测序等方法,鉴定1个水稻中全新的HD2蛋白成员(OsHDT703)。结构域分析发现,在其N端含有HD2家族的NPL保守结构域。选取来源于7个物种... 为了克隆水稻HD2蛋白基因OsHDT703,并分析其存在的可变剪接体。利用生物信息学分析,结合RT-PCR、TA克隆和测序等方法,鉴定1个水稻中全新的HD2蛋白成员(OsHDT703)。结构域分析发现,在其N端含有HD2家族的NPL保守结构域。选取来源于7个物种的16个HD2蛋白,构建蛋白进化树,结果发现,OsHDT703蛋白与OsHDT702蛋白处于同一分支;OsHDT701则处于另一分支,说明水稻中HD2家族蛋白可能存在功能分化。根据预测的不同剪接体设计4对特异性引物,以粳稻中花11叶片和幼穗cDNA为模板,利用RT-PCR扩增,结合TA克隆,通过测序比对,成功鉴定到4种不同可变剪接体序列。由于3号(OsHDT703.3)和4号(OsHDT703.4)剪接体的CDS序列完全相同,所以证明OsHDT703至少存在4种不同可变剪接体。综上所述,鉴定到水稻中1个全新的HD2蛋白,命名为OsHDT703,并且鉴定出至少4种存在可变剪接体,为后续深入研究该基因生物学功能奠定基础。 展开更多
关键词 水稻 组蛋白去乙酰化酶(HDAC) hd2蛋白家族 可变剪接 生物信息学
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盐胁迫下拟南芥去乙酰化酶基因的转录组分析 被引量:1
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作者 欧艺鹏 黄轩雅 +1 位作者 陈功春 林娟 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期180-188,共9页
为了探究盐胁迫下拟南芥HD2去乙酰化酶调控的下游基因,本研究以拟南芥野生型WT和四突(hd2q,HD2四个基因的突变体)为材料,采用RNA-seq技术和生物信息学方法,对生长10 d的幼苗在高盐(150 mmol/L NaCl)处理前和后进行比较转录组分析,并结... 为了探究盐胁迫下拟南芥HD2去乙酰化酶调控的下游基因,本研究以拟南芥野生型WT和四突(hd2q,HD2四个基因的突变体)为材料,采用RNA-seq技术和生物信息学方法,对生长10 d的幼苗在高盐(150 mmol/L NaCl)处理前和后进行比较转录组分析,并结合实时荧光定量PCR验证转录组数据的可靠性.结果显示:在高盐处理前WT和hd2q共有25个差异基因,其中上调基因2个,下调基因23个.在高盐处理后,WT和hd2q共有1407个差异基因,其中上调基因772个,下调基因635个.GO和KEGG分析显示,对照组的差异基因主要富集在胞外区域和响应脱落酸上,盐处理组的差异基因主要富集在胞外区域和细胞壁上,并且发现有41个与盐响应途径相关的差异基因(27个上调基因,14个下调基因).结果表明拟南芥HD2去乙酰化酶调控下游盐响应基因从而使拟南芥适应盐胁迫环境. 展开更多
关键词 拟南芥 幼苗 转录组 盐处理 hd2去乙酰化酶
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